Waitt Advanced Biophotonics Center

Forschung

Salk Institute for Biological Studies – Waitt Advanced Biophotonics Center – Forschung

PUBLIKATIONEN 2021


alle Veröffentlichungen


Gage, FH Adulte Neurogenese bei neurologischen Erkrankungen. [Veröffentlicht] (2021) Science. 374(6571):1049-1050. DOI: 10.1126/science.abm7468

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Heard, KJ, Shokhirev, MN, Becronis, C., Fredlender, C., Zahid, N., Le, AT, Ji, Y., Skime, M., Nelson, T., Hall-Flavin, D., Weinshilboum , R., Gage, FH, Vadodaria, KC Chronisches Cortisol wirkt sich unterschiedlich auf aus Stammzellen gewonnene Astrozyten von Patienten mit schwerer Depression aus. (2021) Transl Psychiatrie. 11(1):608. DOI: 10.1038/s41398-021-01733-9

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Wagner, M., Bartol, TM, Sejnowski, TJ, Cauwenberghs, G. Markov-Ketten-Abstraktionen der elektrochemischen Reaktionsdiffusion in der synaptischen Übertragung für neuromorphes Computing. (2021) Grenzen in den Neurowissenschaften. 15:698635. DOI: 10.3389/fnins.2021.698635

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Mendelsohn, R., Garcia, GC, Bartol, TM, Lee, CT, Khandelwal, P., Liu, E., Spencer, DJ, Husar, A., Bushong, EA, Phan, S., Perkins, G., Ellisman, MH, Skupin, A., Sejnowski, TJ, Rangamani, P. Morphologische Prinzipien neuronaler Mitochondrien. (2021) Journal für vergleichende Neurologie. DOI: 10.1002/cne.25254

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Liu, H., Zhou, J., Tian, ​​W., Luo, C., Bartlett, A., Aldridge, A., Lucero, J., Osteen, JK, Nery, JR, Chen, H., Rivkin, A., Castanon, RG, Clock, B., Li, YE, Hou, X., Poirion, OB, Preissl, S., Pinto-Duarte, A., O'Connor, C., Boggeman, L., Fitzpatrick , C., Nunn, M., Mukamel, EA, Zhang, Z., Callaway, EM, Ren, B., Dixon, JR, Behrens, MM, Ecker, JR DNA-Methylierungsatlas des Mausgehirns in Einzelzellauflösung. (2021) Natur. 598(7879):120-128. DOI: 10.1038/s41586-020-03182-8

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Zhang, Z., Zhou, J., Tan, P., Pang, Y., Rivkin, AC, Kirchgessner, MA, Williams, E., Lee, CT, Liu, H., Franklin, AD, Miyazaki, PA, Bartlett, A., Aldridge, AI, Vu, M., Boggeman, L., Fitzpatrick, C., Nery, JR, Castanon, RG, Rashid, M., Jacobs, MW, Ito-Cole, T., O' Connor, C., Pinto-Duartec, A., Dominguez, B., Smith, JB, Niu, SY, Lee, KF, Jin, X., Mukamel, EA, Behrens, MM, Ecker, JR, Callaway, EM Epigenomische Diversität kortikaler Projektionsneuronen im Gehirn von Mäusen. (2021) Natur. 598(7879):167-173. DOI: 10.1038/s41586-021-03223-w

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Davis, ZW, Benigno, GB, Fletterman, C., Desbordes, T., Steward, C., Sejnowski, TJ, Reynolds, JH, Muller, L. Spontane Wanderwellen entstehen auf natürliche Weise aus horizontalen Faserzeitverzögerungen und wandern durch lokal asynchron-unregelmäßige Zustände. (2021) Nature Communications. 12(1):6057. DOI: 10.1038/s41467-021-26175-1

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Li, Y., Kim, R., Sejnowski, TJ Erlernen der synaptischen und intrinsischen Membrandynamik, die dem Arbeitsgedächtnis in Spiking-Modellen neuronaler Netzwerke zugrunde liegt. (2021) Neuronale Berechnung.:1-24 DOI: 10.1162/neco_a_01409

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Lainscsek, C., Cash, SS, Sejnowski, TJ, Kurths, J. Dynamische Ergodizität DDA enthüllt kausale Struktur in Zeitreihen. (2021) Chaos. 31(10):103108. DOI: 10.1063/5.0063724

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Kirchgessner, MA, Franklin, AD, Callaway, EM Deutliche „treibende“ versus „modulatorische“ Einflüsse verschiedener visueller kortikothalamischer Bahnen. (2021) Aktuelle Biologie DOI: 10.1016/j.cub.2021.09.025

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Gorbunova, V., Seluanov, A., Mita, P., McKerrow, W., Fenyö, D., Boeke, JD, Linker, SB, Gage, FH, Kreiling, JA, Petrashen, AP, Woodham, TA, Taylor , JR, Helfand, SL, Sedivy, JM Die Rolle retrotransponierbarer Elemente beim Altern und altersbedingten Krankheiten. https://rdcu.be/ct1i3 Volltext bereitgestellt von der Content-Sharing-Initiative Springer Nature SharedIt [Veröffentlicht] (2021) Natur. 596(7870):43-53. DOI: 10.1038/s41586-021-03542-y

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Shadel, GS, Adams, PD, Berggren, WT, Diedrich, JK, Diffenderfer, KE, Gage, FH, Hah, N., Hansen, M., Hetzer, MW, Molina, AJA, Manor, U., Marek, K ., O'Keefe, DD, Pinto, AFM, Sacco, A., Sharpee, TO, Shokriev, MN, Zambetti, S. Das San Diego Nathan Shock Center: Bekämpfung der Heterogenität des Alterns. (2021) Gerowissenschaften. DOI: 10.1007 / s11357-021-00426-x

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Amin, ND, Senturk, G., Costaguta, G., Driscoll, S., O'Leary, B., Bonanomi, D., Pfaff, SL Eine versteckte Schwelle in Motoneuron-Gennetzwerken, die durch Modulation der miR-218-Dosis aufgedeckt wurde. (2021) Neuron. DOI: 10.1016 / j.neuron.2021.07.028

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Hayes, TL, Krishnan, GP, Bazhenov, M., Siegelmann, HT, Sejnowski, TJ, Kanan, C. Wiederholung im Deep Learning: Aktuelle Ansätze und fehlende biologische Elemente. (2021) Neuronale Berechnung.:1-44 DOI: 10.1162/neco_a_01433

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Johnston, S., Parylak, S., Kim, S., Mac, N., Lim, C., Gallina, I., Bloyd, C., Newberry, A., Saavedra, CD, Novak, O., Goncalves , JT, Gage, FH, Shtrahman, M. AAV hemmt die Neurogenese im Hippocampus der erwachsenen Maus. (2021) Elife. 10. DOI: 10.7554/eLife.59291

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Nakahira, Y., Liu, Q., Sejnowski, TJ, Doyle, JC Durch Diversität ermöglichte Sweet Spots in Schichtarchitekturen und Kompromisse zwischen Geschwindigkeit und Genauigkeit bei der sensomotorischen Steuerung. (2021) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 118(22). DOI: 10.1073/pnas.1916367118

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Tan, K., Kim, ME, Song, HW, Skarbrevik, D., Babajanian, E., Bedrosian, TA, Gage, FH, Wilkinson, MF Der Rhox-Gencluster unterdrückt die Keimbahn-LINE1-Transposition. (2021) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 118(23). DOI: 10.1073/pnas.2024785118

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Faulkner, RL, Wall, NR, Callaway, EM, Cline, HT Anwendung des rekombinanten Tollwutvirus auf das Gehirn von Xenopus-Kaulquappen. (2021) eNeuro. DOI: 10.1523/ENEURO.0477-20.2021

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Schafer, ST, Gage, FH Essen oder nicht essen, das ist hier die Frage: Neuronale Stammzellen entgehen bei Autismus mit Makrozephalie der Phagozytose. (2021) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 118(19). DOI: 10.1073/pnas.2104888118


Compans, B., Camus, C., Kallergi, E., Sposini, S., Martineau, M., Butler, C., Kechkar, A., Klaassen, RV, Retailleau, N., Sejnowski, TJ, Smit, AB, Sibarita, JB, Bartol, TM, Perrais, D., Nikoletopoulou, V., Choquet, D., Hosy, E. Eine NMDAR-abhängige Langzeitdepression ist mit einer erhöhten kurzfristigen Plastizität durch den autophagiebedingten Verlust von PSD-95 verbunden. (2021) Nature Communications. 12(1):2849. DOI: 10.1038/s41467-021-23133-9

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Dias, GP, Murphy, T., Stangl, D., Ahmet, S., Morisse, B., Nix, A., Aimone, LJ, Aimone, JB, Kuro-O, M., Gage, FH, Thuret, S. Intermittierendes Fasten verbessert die Konsolidierung des Langzeitgedächtnisses, die Neurogenese im adulten Hippocampus und die Expression des Langlebigkeitsgens Klotho. (2021) Molecular Psychiatry. DOI: 10.1038/s41380-021-01102-4

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Hsu, WM, Kastner, DB, Baccus, SA, Sharpee, TO Wie hemmende Neuronen die Informationsübertragung unter Schwellenmodulation erhöhen. (2021) Zellenberichte 35(8):109158. DOI: 10.1016/j.celrep.2021.109158

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Reid, DA, Reed, PJ, Schlachetzki, JCM, Nitulescu, II, Chou, G., Tsui, Chandran, S., Jones, JR, Lu, AT, McClain, CA, Ooi, JH, Wang, TW, Lana, Linker, SB, Ricciardulli, AS, Lau, S., Schafer, S., Horvath, S., Dixon, JR, Hah, N., Glass, CK, Gage, FH Der Einbau eines Nukleosidanalogons kartiert Genomreparaturstellen in postmitotischen menschlichen Neuronen. (2021) Science. 372(6537):91-94. DOI: 10.1126/science.abb9032

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Huang, Y., Happonen, KE, Burrola, PG, O'Connor, C., Hah, N., Huang, L., Nimmerjahn, A., Lemke, G. Mikroglia nutzen TAM-Rezeptoren, um Amyloid-β-Plaques zu erkennen und zu verschlingen. (2021) Naturimmunologie. DOI: 10.1038/s41590-021-00913-5

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Osseward, PJ, Amin, ND, Moore, JD, Temple, BA, Barriga, BK, Bachmann, LC, Beltran, F., Gullo, M., Clark, RC, Driscoll, SP, Pfaff, SL, Hayashi, M. Konservierte genetische Signaturen unterteilen kardinale Spinalneuronenklassen in lokale und Projektionsteilmengen. (2021) Science. 372(6540):385-393. DOI: 10.1126/science.abe0690

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Mertens, J., Herdy, JR, Traxler, L., Schafer, ST, Schlachetzki, JCM, Böhnke, L., Reid, DA, Lee, H., Zangwill, D., Fernandes, DP, Agarwal, RK, Lucciola , R., Zhou-Yang, L., Karbacher, L., Edenhofer, F., Stern, S., Horvath, S., Paquola, ACM, Glass, CK, Yuan, SH, Ku, M., Szücs, A., Goldstein, LSB, Galasko, D., Gage, FH Altersabhängige Instabilität des Schicksals reifer Neuronen in induzierten Neuronen von Alzheimer-Patienten. (2021) Cell Stammzelle. DOI: 10.1016/j.stem.2021.04.004

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Schafer, ST, Gage, FH Das Wann und Wo: Molekulare und zelluläre Konvergenz bei Autismus. (2021) Biologische Psychiatrie. 89(5):419-420. DOI: 10.1016/j.biopsych.2020.12.016


Mishra, HK, Ying, NM, Luis, A., Wei, H., Nguyen, M., Nakhla, T., Vandenburgh, S., Alda, M., Berrettini, WH, Brennand, KJ, Calabrese, JR, Coryell, WH, Frye, MA, Gage, FH, Gershon, ES, McInnis, MG, Nievergelt, CM, Nurnberger, JI, Shilling, PD, Oedegaard, KJ, Zandi, PP, , Kelsoe, JR, Welsh, DK, McCarthy , MJ Zirkadiane Rhythmen in von Patienten mit bipolarer Störung stammenden Neuronen sagen die Lithiumreaktion voraus: vorläufige Studien. (2021) Molecular Psychiatry. DOI: 10.1038/s41380-021-01048-7

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Zhou, Y., Sharpee, TO Hyperbolische Geometrie der Genexpression. (2021) iWissenschaft. 24(3):102225. DOI: 10.1016/j.isci.2021.102225

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Nakatsuka, N., Heard, KJ, Faillétaz, A., Momotenko, D., Vörös, J., Gage, FH, Vadodaria, KC Erkennung von Serotonin, das von menschlichen serotonergen Neuronen ausgeschüttet wird, mithilfe von Aptamer-modifizierten Nanopipetten. (2021) Molecular Psychiatry. DOI: 10.1038/s41380-021-01066-5

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Bedrosian, TA, Houtman, J., Eguiguren, JS, Ghassemzadeh, S., Rund, N., Novaresi, NM, Hu, L., Parylak, SL, Denli, AM, Randolph-Moore, L., Namba, T ., Gage, FH, Toda, T. Der Rückgang von Lamin B1 liegt dem altersbedingten Verlust der Hippocampus-Neurogenese bei Erwachsenen zugrunde. (2021) EMBO-Journal. 40(3):e105819. DOI: 10.15252/embj.2020105819

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Fukuda, S., Varshney, A., Fowler, BJ, Wang, SB, Narendran, S., Ambati, K., Yasuma, T., Magagnoli, J., Leung, H., Hirahara, S., Nagasaka, Y., Yasuma, R., Apicella, I., Pereira, F., Makin, RD, Magner, E., Liu, X., Sun, J., Wang, M., Baker, K., Marion, KM , Huang, Tolstonog, GV, Held, U., Erwin, JA, Paquola, ACM, Herdy, JR, Ogura, Y., Terasaki, H., Oshika, T., Darwish, S., Singh, RK, Mozaffari, S., Bhattarai, D., Kim, KB, Hardin, JW, Bennett, CL, Hinton, DR, Hanson, TE, Röver, C., Parang, K., Kerur, N., Liu, J., Werner, BC, Sutton , SS, Sadda, SR, Schumann, GG, Gelfand, BD, Gage, FH, Ambati, J. Zytoplasmatische Synthese endogener komplementärer DNA mittels reverser Transkription und Auswirkungen auf die altersbedingte Makuladegeneration. (2021) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 118(6). DOI: 10.1073/pnas.2022751118

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Singh, N., Bartol, T., Levine, H., Sejnowski, T., Nadkarni, S. Das präsynaptische endoplasmatische Retikulum reguliert die kurzfristige Plastizität in Hippocampus-Synapsen. (2021) Kommunikationsbiologie. 4(1):241. DOI: 10.1038/s42003-021-01761-7

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Vadodaria, KC, Mendes, APD, Mei, A., Racha, V., Erikson, G., Shokhirev, MN, Oefner, R., Heard, KJ, McCarthy, MJ, Eyler, L., Kelsoe, JR, Santos , R., Marchetto, MC, Gage, FH Veränderte neuronale Unterstützung und Entzündungsreaktion bei von Patienten mit bipolarer Störung stammenden Astrozyten. (2021) Stammzellberichte. DOI: 10.1016/j.stemcr.2021.02.004

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Santos, R., Linker, SB, Stern, S., Mendes, APD, Shokhirev, MN, Erikson, G., Randolph-Moore, L., Racha, V., Kim, Y., Kelsoe, JR, Bang, AG, Alda, M., Marchetto, MC, Gage, FH Eine mangelhafte LEF1-Expression ist mit Lithiumresistenz und Übererregbarkeit in Neuronen von Patienten mit bipolarer Störung verbunden. (2021) Molecular Psychiatry. DOI: 10.1038/s41380-020-00981-3

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Zholudeva, LV, Abraira, VE, Satkunendrarajah, K., McDevitt, TC, Goulding, MD, Magnuson, DSK, Lane, MA Spinale Interneurone als Torwächter der Neuroplastizität nach Verletzung oder Krankheit. (2021) Journal of Neuroscience. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.1654-20.2020

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Trujillo, CA, Adams, JW, Negraes, PD, Carromeu, C., Tejwani, L., Acab, A., Tsuda, B., Thomas, CA, Sodhi, N., Fichter, KM, Romero, S., Zanella, F., Sejnowski, TJ, Ulrich, H., Muotri, AR Pharmakologische Umkehrung der Synapsen- und Netzwerkpathologie in menschlichen MECP2-KO-Neuronen und kortikalen Organoiden. (2021) EMBO Molekulare Medizin. 13(1):e12523. DOI: 10.15252/emmm.202012523

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