Centro Waitt de Biofotónica Avanzada

Investigación

Instituto Salk de Estudios Biológicos - Center Avanzado de Biofotónica Waitt - Investigación

2021 PUBLICATIONS


Todas las publicaciones


Gage, F.H. Neurogénesis adulta en enfermedades neurológicas. [Pubmed] (2021) Ciencia. 374(6571):1049-1050. DOI: 10.1126/science.abm7468

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Heard, K.J., Shokhirev, M.N., Becronis, C., Fredlender, C., Zahid, N., Le, A.T., Ji, Y., Skime, M., Nelson, T., Hall-Flavin, D., Weinshilboum, R., Gage, F.H., Vadodaria, K.C. El cortisol crónico impacta de manera diferencial las astrocitos derivadas de células madre de pacientes con trastorno depresivo mayor. (2021) Psiquiatría Traducida. 11(1):608. DOI: 10.1038/s41398-021-01733-9

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Wagner, M., Bartol, T.M., Sejnowski, T.J., Cauwenberghs, G. Markov Chain Abstractions of Electrochemical Reaction-Diffusion in Synaptic Transmission for Neuromorphic Computing. (2021) Fronteras en Neurociencia. 15:698635. DOI: 10.3389/fnins.2021.698635

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Mendelsohn, R., Garcia, G.C., Bartol, T.M., Lee, C.T., Khandelwal, P., Liu, E., Spencer, D.J., Husar, A., Bushong, E.A., Phan, S., Perkins, G., Ellisman, M.H., Skupin, A., Sejnowski, T.J., Rangamani, P. Morphological principles of neuronal mitochondria. (2021) Journal of Comparative Neurology. DOI: 10.1002/cne.25254

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Liu, H., Zhou, J., Tian, W., Luo, C., Bartlett, A., Aldridge, A., Lucero, J., Osteen, J.K., Nery, J.R., Chen, H., Rivkin, A., Castanon, R.G., Clock, B., Li, Y.E., Hou, X., Poirion, O.B., Preissl, S., Pinto-Duarte, A., O'Connor, C., Boggeman, L., Fitzpatrick, C., Nunn, M., Mukamel, E.A., Zhang, Z., Callaway, E.M., Ren, B., Dixon, J.R., Behrens, M.M., Ecker, J.R. DNA methylation atlas of the mouse brain at single-cell resolution. (2021) Naturaleza. 598(7879):120-128. DOI: 10.1038/s41586-020-03182-8

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Zhang, Z., Zhou, J., Tan, P., Pang, Y., Rivkin, A.C., Kirchgessner, M.A., Williams, E., Lee, C.T., Liu, H., Franklin, A.D., Miyazaki, P.A., Bartlett, A., Aldridge, A.I., Vu, M., Boggeman, L., Fitzpatrick, C., Nery, J.R., Castanon, R.G., Rashid, M., Jacobs, M.W., Ito-Cole, T., O'Connor, C., Pinto-Duartec, A., Dominguez, B., Smith, J.B., Niu, S.Y., Lee, K.F., Jin, X., Mukamel, E.A., Behrens, M.M., Ecker, J.R., Callaway, E.M. Epigenomic diversity of cortical projection neurons in the mouse brain. (2021) Naturaleza. 598(7879):167-173. DOI: 10.1038/s41586-021-03223-w

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Davis, Z.W., Benigno, G.B., Fletterman, C., Desbordes, T., Steward, C., Sejnowski, T.J., Reynolds, J.H., Muller, L. Spontaneous traveling waves naturally emerge from horizontal fiber time delays and travel through locally asynchronous-irregular states. (2021) Nature Communications. 12(1):6057. DOI: 10.1038/s41467-021-26175-1

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Li, Y., Kim, R., Sejnowski, T.J. Learning the Synaptic and Intrinsic Membrane Dynamics Underlying Working Memory in Spiking Neural Network Models. (2021) Computación neuronal.:1-24 DOI: 10.1162/neco_a_01409

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Lainscsek, C., Cash, S.S., Sejnowski, T.J., Kurths, J. Dynamical ergodicity DDA reveals causal structure in time series. (2021) Chaos. 31(10):103108. DOI: 10.1063/5.0063724

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Kirchgessner, M.A., Franklin, A.D., Callaway, E.M. Distinct "driving" versus "modulatory" influences of different visual corticothalamic pathways. (2021) Biología Actual. DOI: 10.1016/j.cub.2021.09.025

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Gorbunova, V., Seluanov, A., Mita, P., McKerrow, W., Fenyö, D., Boeke, J.D., Linker, S.B., Gage, F.H., Kreiling, J.A., Petrashen, A.P., Woodham, T.A., Taylor, J.R., Helfand, S.L., Sedivy, J.M. El papel de los elementos retrotransponibles en el envejecimiento y las enfermedades asociadas a la edad. https://rdcu.be/ct1i3 Texto completo proporcionado por la iniciativa de intercambio de contenido Springer Nature SharedIt [Pubmed] (2021) Naturaleza. 596(7870):43-53. DOI: 10.1038/s41586-021-03542-Y

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Shadel, G.S., Adams, P.D., Berggren, W.T., Diedrich, J.K., Diffenderfer, K.E., Gage, F.H., Hah, N., Hansen, M., Hetzer, M.W., Molina, A.J.A., Manor, U., Marek, K., O'Keefe, D.D., Pinto, A.F.M., Sacco, A., Sharpee, T.O., Shokriev, M.N., Zambetti, S. El Centro Nathan Shock de San Diego: abordando la heterogeneidad del envejecimiento. (2021) Gerociencia. DOI: 10.1007/s11357-021-00426-x

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Amin, N.D., Senturk, G., Costaguta, G., Driscoll, S., O'Leary, B., Bonanomi, D., Pfaff, S.L. A hidden threshold in motor neuron gene networks revealed by modulation of miR-218 dose. (2021) Neurona. DOI: 10.1016/j.neuron.2021.07.028

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Hayes, T.L., Krishnan, G.P., Bazhenov, M., Siegelmann, H.T., Sejnowski, T.J., Kanan, C. Replay in Deep Learning: Current Approaches and Missing Biological Elements. (2021) Computación neuronal.:1-44 DOI: 10.1162/neco_a_01433

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Johnston, S., Parylak, S., Kim, S., Mac, N., Lim, C., Gallina, I., Bloyd, C., Newberry, A., Saavedra, C.D., Novak, O., Goncalves, J.T., Gage, F.H., Shtrahman, M. AAV abla la neurogénesis en el hipocampo murino adulto. (2021) Elife. 10. DOI: 10.7554/eLife.59291

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Nakahira, Y., Liu, Q., Sejnowski, T.J., Doyle, J.C. Diversity-enabled sweet spots in layered architectures and speed-accuracy trade-offs in sensorimotor control. (2021) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 118(22). DOI: 10.1073/pnas.1916367118

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Tan, K., Kim, M.E., Song, H.W., Skarbrevik, D., Babajanian, E., Bedrosian, T.A., Gage, F.H., Wilkinson, M.F. El clúster de genes Rhox suprime la transposición de la línea germinal LINE1. (2021) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 118(23). DOI: 10.1073/pnas.2024785118

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Faulkner, R.L., Wall, N.R., Callaway, E.M., Cline, H.T. Application of Recombinant Rabies Virus to Xenopus Tadpole Brain. (2021) eNeuro. DOI: 10.1523/ENEURO.0477-20.2021

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Schafer, S.T., Gage, F.H. Comer o no comer, esa es la cuestión: las células madre neurales escapan a la fagocitosis en el autismo con macrocefalia. (2021) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 118(19). DOI: 10.1073/pnas.2104888118


Compans, B., Camus, C., Kallergi, E., Sposini, S., Martineau, M., Butler, C., Kechkar, A., Klaassen, R.V., Retailleau, N., Sejnowski, T.J., Smit, A.B., Sibarita, J.B., Bartol, T.M., Perrais, D., Nikoletopoulou, V., Choquet, D., Hosy, E. NMDAR-dependent long-term depression is associated with increased short term plasticity through autophagy mediated loss of PSD-95. (2021) Nature Communications. 12(1):2849. DOI: 10.1038/s41467-021-23133-9

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Dias, G.P., Murphy, T., Stangl, D., Ahmet, S., Morisse, B., Nix, A., Aimone, L.J., Aimone, J.B., Kuro-O, M., Gage, F.H., Thuret, S. El ayuno intermitente mejora la consolidación de la memoria a largo plazo, la neurogénesis del hipocampo en adultos y la expresión del gen de longevidad Klotho. (2021) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038/s41380-021-01102-4

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Hsu, W.M., Kastner, D.B., Baccus, S.A., Sharpee, T.O. How inhibitory neurons increase information transmission under threshold modulation. (2021) Cell Reports. 35(8):109158. DOI: 10.1016/j.celrep.2021.109158

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Reid, D.A., Reed, P.J., Schlachetzki, J.C.M., Nitulescu, I.I., Chou, G., Tsui, Chandran, S., Jones, J.R., Lu, A.T., McClain, C.A., Ooi, J.H., Wang, T.W., Lana, Linker, S.B., Ricciardulli, A.S., Lau, S., Schafer, S., Horvath, S., Dixon, J.R., Hah, N., Glass, C.K., Gage, F.H. La incorporación de un análogo de nucleósido mapea sitios de reparación del genoma en neuronas humanas postmitóticas. (2021) Ciencia. 372(6537):91-94. DOI: 10.1126/science.abb9032

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Huang, Y., Happonen, K.E., Burrola, P.G., O'Connor, C., Hah, N., Huang, L., Nimmerjahn, A., Lemke, G. Microglia use TAM receptors to detect and engulf amyloid β plaques. (2021) Naturaleza Inmunológica. DOI: 10.1038/s41590-021-00913-5

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Osseward, P.J., Amin, N.D., Moore, J.D., Temple, B.A., Barriga, B.K., Bachmann, L.C., Beltran, F., Gullo, M., Clark, R.C., Driscoll, S.P., Pfaff, S.L., Hayashi, M. Conserved genetic signatures parcellate cardinal spinal neuron classes into local and projection subsets. (2021) Ciencia. 372(6540):385-393. DOI: 10.1126/science.abe0690

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Mertens, J., Herdy, J.R., Traxler, L., Schafer, S.T., Schlachetzki, J.C.M., Böhnke, L., Reid, D.A., Lee, H., Zangwill, D., Fernandes, D.P., Agarwal, R.K., Lucciola, R., Zhou-Yang, L., Karbacher, L., Edenhofer, F., Stern, S., Horvath, S., Paquola, A.C.M., Glass, C.K., Yuan, S.H., Ku, M., Szücs, A., Goldstein, L.S.B., Galasko, D., Gage, F.H. Inestabilidad dependiente de la edad del destino neuronal maduro en neuronas inducidas de pacientes con Alzheimer. (2021) Células Madre. DOI: 10.1016/j.stem.2021.04.004

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Schafer, S.T., Gage, F.H. El cuándo y el dónde: Convergencia molecular y celular en el autismo. (2021) Psiquiatría Biológica. 89(5):419-420. DOI: 10.1016/j.biopsych.2020.12.016


Mishra, H.K., Ying, N.M., Luis, A., Wei, H., Nguyen, M., Nakhla, T., Vandenburgh, S., Alda, M., Berrettini, W.H., Brennand, K.J., Calabrese, J.R., Coryell, W.H., Frye, M.A., Gage, F.H., Gershon, E.S., McInnis, M.G., Nievergelt, C.M., Nurnberger, J.I., Shilling, P.D., Oedegaard, K.J., Zandi, P.P., , Kelsoe, J.R., Welsh, D.K., McCarthy, M.J. Los ritmos circadianos en neuronas derivadas de pacientes con trastorno bipolar predicen la respuesta al litio: estudios preliminares. (2021) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038/s41380-021-01048-7

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Zhou, Y., Sharpee, T.O. Hyperbolic geometry of gene expression. (2021) iCiencia. 24(3):102225. DOI: 10.1016/j.isci.2021.102225

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Nakatsuka, N., Heard, K.J., Faillétaz, A., Momotenko, D., Vörös, J., Gage, F.H., Vadodaria, K.C. Detección de serotonina secretada por neuronas serotoninérgicas humanas utilizando nanopipetas modificadas con aptámeros. (2021) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038/s41380-021-01066-5

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Bedrosian, T.A., Houtman, J., Eguiguren, J.S., Ghassemzadeh, S., Rund, N., Novaresi, N.M., Hu, L., Parylak, S.L., Denli, A.M., Randolph-Moore, L., Namba, T., Gage, F.H., Toda, T. La disminución de la Lamin B1 subyace a la pérdida relacionada con la edad de la neurogénesis hipocampal adulta. (2021) Revista EMBO. 40(3):e105819. DOI: 10.15252/embj.2020105819

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Fukuda, S., Varshney, A., Fowler, B.J., Wang, S.B., Narendran, S., Ambati, K., Yasuma, T., Magagnoli, J., Leung, H., Hirahara, S., Nagasaka, Y., Yasuma, R., Apicella, I., Pereira, F., Makin, R.D., Magner, E., Liu, X., Sun, J., Wang, M., Baker, K., Marion, K.M., Huang, X., Baghdasaryan, E., Ambati, M., Ambati, V.L., Pandey, A., Pandya, L., Cummings, T., Banerjee, D., Huang, P., Yerramothu, P., Tolstonog, G.V., Held, U., Erwin, J.A., Paquola, A.C.M., Herdy, J.R., Ogura, Y., Terasaki, H., Oshika, T., Darwish, S., Singh, R.K., Mozaffari, S., Bhattarai, D., Kim, K.B., Hardin, J.W., Bennett, C.L., Hinton, D.R., Hanson, T.E., Röver, C., Parang, K., Kerur, N., Liu, J., Werner, B.C., Sutton, S.S., Sadda, S.R., Schumann, G.G., Gelfand, B.D., Gage, F.H., Ambati, J. Síntesis citoplasmática de ADN complementario endógeno mediante transcripción inversa e implicaciones en la degeneración macular asociada a la edad. (2021) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 118(6). DOI: 10.1073/pnas.2022751118

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Singh, N., Bartol, T., Levine, H., Sejnowski, T., Nadkarni, S. Presynaptic endoplasmic reticulum regulates short-term plasticity in hippocampal synapses. (2021) Comunicaciones Biología. 4(1):241. DOI: 10.1038/s42003-021-01761-7

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Vadodaria, K.C., Mendes, A.P.D., Mei, A., Racha, V., Erikson, G., Shokhirev, M.N., Oefner, R., Heard, K.J., McCarthy, M.J., Eyler, L., Kelsoe, J.R., Santos, R., Marchetto, M.C., Gage, F.H. Soporte Neuronal Alterado y Respuesta Inflamatoria en Astrocitos Derivados de Pacientes con Trastorno Bipolar. (2021) Stem Cell Reports. DOI: 10.1016/j.stemcr.2021.02.004

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Santos, R., Linker, S.B., Stern, S., Mendes, A.P.D., Shokhirev, M.N., Erikson, G., Randolph-Moore, L., Racha, V., Kim, Y., Kelsoe, J.R., Bang, A.G., Alda, M., Marchetto, M.C., Gage, F.H. La expresión deficiente de LEF1 se asocia con resistencia al litio e hiperexcitabilidad en neuronas derivadas de pacientes con trastorno bipolar. (2021) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038/s41380-020-00981-3

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Zholudeva, L.V., Abraira, V.E., Satkunendrarajah, K., McDevitt, T.C., Goulding, M.D., Magnuson, D.S.K., Lane, M.A. Spinal Interneurons as Gatekeepers to Neuroplasticity after Injury or Disease. (2021) Diario de Neurociencia. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.1654-20.2020

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Trujillo, C.A., Adams, J.W., Negraes, P.D., Carromeu, C., Tejwani, L., Acab, A., Tsuda, B., Thomas, C.A., Sodhi, N., Fichter, K.M., Romero, S., Zanella, F., Sejnowski, T.J., Ulrich, H., Muotri, A.R. Pharmacological reversal of synaptic and network pathology in human MECP2-KO neurons and cortical organoids. (2021) EMBO Molecular Medicine. 13(1):e12523. DOI: 10.15252/emmm.202012523

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