Centro Waitt de Biofotónica Avanzada

Zhou, J., Zhang, Z., Wu, M., Liu, H., Pang, Y., Bartlett, A., Peng, Z., Ding, W., Rivkin, A., Lagos, W.N., Williams, E., Lee, C.T., Miyazaki, P.A., Aldridge, A., Zeng, Q., Salinda, J.L.A., Claffey, N., Liem, M., Fitzpatrick, C., Boggeman, L., Yao, Z., Smith, K.A., Tasic, B., Altshul, J., Kenworthy, M.A., Valadon, C., Nery, J.R., Castanon, R.G., Patne, N.S., Vu, M., Rashid, M., Jacobs, M., Ito, T., Osteen, J., Emerson, N., Lee, J., Cho, S., Rink, J., Huang, H.H., Pinto-Duartec, A., Dominguez, B., Smith, J.B., O'Connor, C., Zeng, H., Chen, S., Lee, K.F., Mukamel, E.A., Jin, X., Margarita Behrens, M., Ecker, J.R., Callaway, E.M. Brain-wide correspondence of neuronal epigenomics and distant projections. (2023) Naturaleza. 624(7991):355-365. DOI: 10.1038/s41586-023-06823-w

Zemke, N.R., Armand, E.J., Wang, W., Lee, S., Zhou, J., Li, Y.E., Liu, H., Tian, W., Nery, J.R., Castanon, R.G., Bartlett, A., Osteen, J.K., Li, D., Zhuo, X., Xu, V., Chang, L., Dong, K., Indralingam, H.S., Rink, J.A., Xie, Y., Miller, M., Krienen, F.M., Zhang, Q., Taskin, N., Ting, J., Feng, G., McCarroll, S.A., Callaway, E.M., Wang, T., Lein, E.S., Behrens, M.M., Ecker, J.R., Ren, B. Conserved and divergent gene regulatory programs of the mammalian neocortex. (2023) Naturaleza. 624(7991):390-402. DOI: 10.1038/s41586-023-06819-6

Patiño, M., Lagos, W.N., Patne, N.S., Miyazaki, P.A., Bhamidipati, S.K., Collman, F., Callaway, E.M. Postsynaptic cell type and synaptic distance do not determine efficiency of monosynaptic rabies virus spread measured at synaptic resolution. (2023) Elife. 12. DOI: 10.7554/eLife.89297

Chung, B., Zia, M., Thomas, K.A., Michaels, J.A., Jacob, A., Pack, A., Williams, M.J., Nagapudi, K., Teng, L.H., Arrambide, E., Ouellette, L., Oey, N., Gibbs, R., Anschutz, P., Lu, J., Wu, Y., Kashefi, M., Oya, T., Kersten, R., Mosberger, A.C., O'Connell, S., Wang, R., Marques, H., Mendes, A.R., Lenschow, C., Kondakath, G., Kim, J.J., Olson, W., Quinn, K.N., Perkins, P., Gatto, G., Thanawalla, A., Coltman, S., Kim, T., Smith, T., Binder-Markey, B., Zaback, M., Thompson, C.K., Giszter, S., Person, A., Goulding, M., Azim, E., Thakor, N., O'Connor, D., Trimmer, B., Lima, S.Q., Carey, M.R., Pandarinath, C., Costa, R.M., Pruszynski, J.A., Bakir, M., Sober, S.J. Myomatrix arrays for high-definition muscle recording. (2023) Elife. 12. DOI: 10.7554/eLife.88551

Lainscsek, C., Salami, P., Carvalho, V.R., Mendes, E.M.A.M., Fan, M., Cash, S.S., Sejnowski, T.J. Network-motif delay differential analysis of brain activity during seizures. (2023) Chaos. 33(12). DOI: 10.1063/5.0165904

Garrison, M.A., Jang, Y., Bae, T., Cherskov, A., Emery, S.B., Fasching, L., Jones, A., Moldovan, J.B., Molitor, C., Pochareddy, S., Peters, M.A., Shin, J.H., Wang, Y., Yang, X., Akbarian, S., Chess, A., Gage, F.H., Gleeson, J.G., Kidd, J.M., McConnell, M., Mills, R.E., Moran, J.V., Park, P.J., Sestan, N., Urban, A.E., Vaccarino, F.M., Walsh, C.A., Weinberger, D.R., Wheelan, S.J., Abyzov, A. Recursos de datos genómicos de la Red de Mosaicismo Somático Cerebral para enfermedades neuropsiquiátricas. (2023) Datos científicos. 10(1):813. DOI: 10.1038/s41597-023-02645-7

Tsuda, B., Richmond, B.J., Sejnowski, T.J. Exploring strategy differences between humans and monkeys with recurrent neural networks. (2023) PLOS Biología Computacional. 19(11):e1011618. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1011618

Manole, A., Wong, T., Rhee, A., Novak, S., Chin, S.M., Tsimring, K., Paucar, A., Williams, A., Newmeyer, T.F., Schafer, S.T., Rosh, I., Kaushik, S., Hoffman, R., Chen, S., Wang, G., Snyder, M., Cuervo, A.M., Andrade, L., Manor, U., Lee, K., Jones, J.R., Stern, S., Marchetto, M.C., Gage, F.H. Las mutaciones de NGLY1 causan agregación de proteínas en neuronas humanas. (2023) Cell Reports. 42(12):113466. DOI: 10.1016/j.celrep.2023.113466

Alvarez-Kuglen, M., Rodriguez, D., Qin, H., Ninomiya, K., Fiengo, L., Farhy, C., Hsu, W.M., Havas, A., Feng, G.S., Roberts, A.J., Anderson, R.M., Serrano, M., Adams, P.D., Sharpee, T.O., Terskikh, A.V. Imaging-based chromatin and epigenetic age, ImAge, quantitates aging and rejuvenation. (2023) Res. Cuadrado. DOI: 10.21203/rs.3.rs-3479973/v1

Jorstad, N.L., Close, J., Johansen, N., Yanny, A.M., Barkan, E.R., Travaglini, K.J., Bertagnolli, D., Campos, J., Casper, T., Crichton, K., Dee, N., Ding, S.L., Gelfand, E., Goldy, J., Hirschstein, D., Kiick, K., Kroll, M., Kunst, M., Lathia, K., Long, B., Martin, N., McMillen, D., Pham, T., Rimorin, C., Ruiz, A., Shapovalova, N., Shehata, S., Siletti, K., Somasundaram, S., Sulc, J., Tieu, M., Torkelson, A., Tung, H., Callaway, E.M., Hof, P.R., Keene, C.D., Levi, B.P., Linnarsson, S., Mitra, P.P., Smith, K., Hodge, R.D., Bakken, T.E., Lein, E.S. Transcriptomic cytoarchitecture reveals principles of human neocortex organization. (2023) Ciencia. 382(6667):eadf6812. DOI: 10.1126/science.adf6812

Lainscsek, C., Mendes, E.M.A.M., Salgado, G.H.O., Sejnowski, T.J. Transformations that preserve the uniqueness of the differential form for Lorenz-like systems. (2023) Chaos. 33(10). DOI: 10.1063/5.0156237

Klug, J.R., Yan, X., Hoffman, H.A., Engelhardt, M.D., Osakada, F., Callaway, E.M., Jin, X. Las proyecciones corticales asimétricas a las vías directa e indirecta del cuerpo estriado controlan las acciones de forma distinta. (2023) bioRxiv. DOI: 10.1101/2023.10.02.560589

Daboussi, L., Costaguta, G., Gullo, M., Jasinski, N., Pessino, V., O'Leary, B., Lettieri, K., Driscoll, S., Pfaff, S.L. Mitf is a Schwann cell sensor of axonal integrity that drives nerve repair. (2023) Cell Reports. 42(11):113282. DOI: 10.1016/j.celrep.2023.113282

Garcia, G.C., Gupta, K., Bartol, T.M., Sejnowski, T.J., Rangamani, P. Mitochondrial morphology governs ATP production rate. (2023) J Gen Physiol. 155(9). DOI: 10.1085/jgp.202213263

Globig, A.M., Zhao, S., Roginsky, J., Maltez, V.I., Guiza, J., Avina-Ochoa, N., Heeg, M., Araujo Hoffmann, F., Chaudhary, O., Wang, J., Senturk, G., Chen, D., O'Connor, C., Pfaff, S., Germain, R.N., Schalper, K.A., Emu, B., Kaech, S.M. The β-adrenergic receptor links sympathetic nerves to T cell exhaustion. (2023) Naturaleza. DOI: 10.1038/s41586-023-06568-6

Li, J.S., Sarma, A.A., Sejnowski, T.J., Doyle, J.C. Internal feedback in the cortical perception-action loop enables fast and accurate behavior. (2023) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 120(39):e2300445120. DOI: 10.1073/pnas.2300445120

Wang, H., Dey, O., Lagos, W.N., Behnam, N., Callaway, E.M., Stafford, B.K. Parallel pathways carrying direction and orientation selective retinal signals to layer 4 of mouse visual cortex. (2023) bioRxiv. DOI: 10.1101/2023.09.18.558281

Mizrahi, L., Choudhary, A., Ofer, P., Goldberg, G., Milanesi, E., Kelsoe, J.R., Gurwitz, D., Alda, M., Gage, F.H., Stern, S. Los genes de inmunoglobulina expresados en líneas celulares de linfoblastoides discernen y predicen la respuesta a litio en pacientes con trastorno bipolar. (2023) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038/s41380-023-02183-z

Traxler, L., Lucciola, R., Herdy, J.R., Jones, J.R., Mertens, J., Gage, F.H. Cambios en el estado de las células neuronales y pérdida de su destino en el envejecimiento y enfermedades relacionadas con la edad. (2023) Nat Rev Neurol. DOI: 10.1038/s41582-023-00815-0

Schafer, S.T., Mansour, A.A., Schlachetzki, J.C.M., Pena, M., Ghassemzadeh, S., Mitchell, L., Mar, A., Quang, D., Stumpf, S., Ortiz, I.S., Lana, A.J., Baek, C., Zaghal, R., Glass, C.K., Nimmerjahn, A., Gage, F.H. Un modelo de organoide neuroinmune in vivo para estudiar fenotipos de microglía humana. (2023) Móvil. 186(10):2111-2126.e20. DOI: 10.1016/j.cell.2023.04.022

Arlotta, P., Gage, F.H. Organoides neuronales y la búsqueda para comprender y tratar enfermedades psiquiátricas. (2023) Psiquiatría Biológica. 93(7):588-589. DOI: 10.1016/j.biopsych.2023.01.021

Zemke, N.R., Armand, E.J., Wang, W., Lee, S., Zhou, J., Li, Y.E., Liu, H., Tian, W., Nery, J.R., Castanon, R.G., Bartlett, A., Osteen, J.K., Li, D., Zhuo, X., Xu, V., Miller, M., Krienen, F.M., Zhang, Q., Taskin, N., Ting, J., Feng, G., McCarroll, S.A., Callaway, E.M., Wang, T., Behrens, M.M., Lein, E.S., Ecker, J.R., Ren, B. Comparative single cell epigenomic analysis of gene regulatory programs in the rodent and primate neocortex. (2023) bioRxiv. DOI: 10.1101/2023.04.08.536119

Kobayashi, Y., Shigyo, M., Platoshyn, O., Marsala, S., Kato, T., Takamura, N., Yoshida, K., Kishino, A., Bravo-Hernandez, M., Juhas, S., Juhasova, J., Studenovska, H., Proks, V., Driscoll, S.P., Glenn, T.D., Pfaff, S.L., Ciacci, J.D., Marsala, M. Expandable Sendai-Virus-Reprogrammed Human iPSC-Neuronal Precursors: Post-Grafting Safety Characterization in Rats and Adult Pig. (2023) Cell Transplantation. 32:9636897221107009. DOI: 10.1177/09636897221107009

Mishra, H.K., Wei, H., Rohr, K.E., Ko, I., Nievergelt, C.M., Maihofer, A.X., Shilling, P.D., Alda, M., Berrettini, W.H., Brennand, K.J., Calabrese, J.R., Coryell, W.H., Frye, M., Gage, F., Gershon, E., McInnis, M.G., Nurnberger, J., Oedegaard, K.J., Zandi, P.P., Kelsoe, J.R., McCarthy, M.J. Contribuciones de los genes del reloj circadiano a la supervivencia celular en modelos de fibroblastos de trastorno bipolar sensible al litio. (2023) Eur Neuropsychopharmacol. 74:1-14. DOI: 10.1016/j.euroneuro.2023.04.009

Shekhtmeyster, P., Duarte, D., Carey, E.M., Ngo, A., Gao, G., Olmstead, J.A., Nelson, N.A., Nimmerjahn, A. Trans-segmental imaging in the spinal cord of behaving mice. (2023) Nature Biotechnology. DOI: 10.1038/s41587-023-01700-3

Kempermann, G., Song, H., Gage, F.H. Neurogénesis adulta en el hipocampo. (2023) Hipocampo. DOI: 10.1002/hipo.23525

Shekhtmeyster, P., Carey, E.M., Duarte, D., Ngo, A., Gao, G., Nelson, N.A., Clark, C.L., Nimmerjahn, A. Multiplex translaminar imaging in the spinal cord of behaving mice. (2023) Nature Communications. 14(1):1427. DOI: 10.1038/s41467-023-36959-2

Zador, A., Escola, S., Richards, B., Ölveczky, B., Bengio, Y., Boahen, K., Botvinick, M., Chklovskii, D., Churchland, A., Clopath, C., DiCarlo, J., Ganguli, S., Hawkins, J., Körding, K., Koulakov, A., LeCun, Y., Lillicrap, T., Marblestone, A., Olshausen, B., Pouget, A., Savin, C., Sejnowski, T., Simoncelli, E., Solla, S., Sussillo, D., Tolias, A.S., Tsao, D. Catalyzing next-generation Artificial Intelligence through NeuroAI. (2023) Nature Communications. 14(1):1597. DOI: 10.1038/s41467-023-37180-x

Niemsiri, V., Rosenthal, S.B., Nievergelt, C.M., Maihofer, A.X., Marchetto, M.C., Santos, R., Shekhtman, T., Alliey-Rodriguez, N., Anand, A., Balaraman, Y., Berrettini, W.H., Bertram, H., Burdick, K.E., Calabrese, J.R., Calkin, C.V., Conroy, C., Coryell, W.H., DeModena, A., Eyler, L.T., Feeder, S., Fisher, C., Frazier, N., Frye, M.A., Gao, K., Garnham, J., Gershon, E.S., Goes, F.S., Goto, T., Harrington, G.J., Jakobsen, P., Kamali, M., Kelly, M., Leckband, S.G., Lohoff, F.W., McCarthy, M.J., McInnis, M.G., Craig, D., Millett, C.E., Mondimore, F., Morken, G., Nurnberger, J.I., Donovan, C.O., Øedegaard, K.J., Ryan, K., Schinagle, M., Shilling, P.D., Slaney, C., Stapp, E.K., Stautland, A., Tarwater, B., Zandi, P.P., Alda, M., Fisch, K.M., Gage, F.H., Kelsoe, J.R. La adhesión focal se asocia con la respuesta al litio en el trastorno bipolar: evidencia de un análisis multi-ómico basado en redes. (2023) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038/s41380-022-01909-9

Little, J.C., Kaaronen, R.O., Hukkinen, J.I., Xiao, S., Sharpee, T., Farid, A.M., Nilchiani, R., Barton, C.M. Earth Systems to Anthropocene Systems: An Evolutionary, System-of-Systems, Convergence Paradigm for Interdependent Societal Challenges. (2023) Environ Sci Technol. DOI: 10.1021/acs.est.2c06203

Ren, X., Liu, S., Virlogeux, A., Kang, S.J., Brusch, J., Liu, Y., Dymecki, S.M., Han, S., Goulding, M., Acton, D. Identification of an essential spinoparabrachial pathway for mechanical itch. (2023) Neurona. DOI: 10.1016/j.neuron.2023.03.013

Hayashi, M., Gullo, M., Senturk, G., Di Costanzo, S., Nagasaki, S.C., Kageyama, R., Imayoshi, I., Goulding, M., Pfaff, S.L., Gatto, G. A spinal synergy of excitatory and inhibitory neurons coordinates ipsilateral body movements. (2023) bioRxiv. DOI: 10.1101/2023.03.21.533603

Sejnowski, T.J. Large Language Models and the Reverse Turing Test. (2023) Computación neuronal.:1-34 DOI: 10.1162/neco_a_01563

Parylak, S.L., Qiu, F., Linker, S.B., Gallina, I.S., Lim, C.K., Preciado, D., McDonald, A.H., Zhou, X., Gage, F.H. La transcripción relacionada con la actividad neuronal se ve atenuada en las células granulares del giro dentado inmaduras en comparación con las maduras. (2023) Hipocampo. DOI: 10.1002/hipo.23515

Yang, J.Y., O'Connell, T.F., Hsu, W.M., Bauer, M.S., Dylla, K.V., Sharpee, T.O., Hong, E.J. Restructuring of olfactory representations in the fly brain around odor relationships in natural sources. (2023) bioRxiv. DOI: 10.1101/2023.02.15.528627

Bermperidis, T., Schafer, S., Gage, F.H., Sejnowski, T., Torres, E.B. Interrogación Dinámica de Trayectorias Transcriptómicas Estocásticas Usando Genes Asociados a Enfermedades Revela Orígenes Distintos de Trastornos Neurológicos y Psiquiátricos. (2023) Fronteras en Neurociencia. 16:884707. DOI: 10.3389/fnins.2022.884707

Fischer, K.B., Collins, H.K., Pang, Y., Roy, D.S., Zhang, Y., Feng, G., Li, S.J., Kepecs, A., Callaway, E.M. Monosynaptic restriction of the anterograde herpes simplex virus strain H129 for neural circuit tracing. (2023) Journal of Comparative Neurology. DOI: 10.1002/cne.25451

Perez-Garcia, G., Bicak, M., Haure-Mirande, J.V., Perez, G.M., Otero-Pagan, A., Gama Sosa, M.A., De Gasperi, R., Sano, M., Barlow, C., Gage, F.H., Readhead, B., Ehrlich, M.E., Gandy, S., Elder, G.A. BCI-838, un profármaco oralmente activo antagonista del receptor mGluR2/3, rescata déficits de comportamiento de aprendizaje en el modelo de ratón PS19 MAPT de tauopatía. (2023) Neurosci Lett.:137080 DOI: 10.1016/j.neulet.2023.137080

Wang, M., Gage, F.H., Schafer, S.T. Estrategias de trasplante para mejorar la madurez y la complejidad celular en organoides cerebrales. (2023) Psiquiatría Biológica. DOI: 10.1016/j.biopsych.2023.01.004