Centro de Biofotónica Avanzada de Waitt

Investigación

Instituto Salk de Estudios Biológicos - Centro de Biofotónica Avanzada Waitt - Investigación

PUBLICACIONES 2024


Pașca, SP, Arlotta, P., Bateup, HS, Camp, JG, Cappello, S., Gage, FH, Knoblich, JA, Kriegstein, AR, Lancaster, MA, Ming, GL, Novarino, G., Okano, H., Parmar, M., Park, IH, Reiner, O., Song, H., Studer, L., Takahashi, J., Temple, S., Testa, G., Treutlein, B., Vaccarino, FM, Vanderhaeghen, P., Young-Pearse, T. Un marco para estudios de organoides neuronales, ensambleides y trasplantes. (2024) Naturaleza. DOI: 10.1038/s41586-024-08487-6

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Praturu, A., Sharpee, TO Incorporación de datos adaptativos para espacios curvos. (2024) iCiencia. 27(12):111266. DOI: 10.1016/j.isci.2024.111266

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Hirakis, SP, Bartol, TM, Autin, L., Amaro, RE, Sejnowski, TJ Remodelación cardíaca electrofísica a nivel molecular: información sobre la activación del receptor de rianodina y la liberación de calcio inducida por calcio a partir de un modelo estocástico de partículas explícitas. (2024) Revista biofísica. DOI: 10.1016/j.bpj.2024.09.029

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Patel, D., Sejnowski, T., Siegelmann, H. Optimización de los costos de atención y control cognitivo mediante arquitecturas en capas temporales. (2024) Computación neuronal.:1-30 DOI: 10.1162/neco_a_01718

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Hijo, G., Na, Y., Kim, Y., Hijo, JH, Clemenson, GD, Schafer, ST, Yoo, JY, Parylak, SL, Paquola, A., Do, H., Kim, D., Ahn, I., Ju, M., Kang, CS, Ju, Y., Jung, E., McDonald, AH, Park, Y., Kim, G., Paik, SB, Hur, J., Kim, J ., Han, YM, Lee, SH, Gage, FH, Kim, JS, Han, J. miR-124 coordina los reguladores metabólicos que actúan en las primeras etapas de la neurogénesis humana. (2024) Biología de las Comunicaciones. 7(1):1393. DOI: 10.1038/s42003-024-07089-2

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Barykina, NV, Carey, EM, Oliinyk, OS, Nimmerjahn, A., Verkhusha, VV Los nanocuerpos fluorescentes de infrarrojo cercano desestabilizados permiten la orientación sin fondo de biosensores basados ​​en GFP para la obtención de imágenes y manipulación. (2024) Nature Communications. 15(1):7788. DOI: 10.1038/s41467-024-51857-x

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Muller, L., Churchland, PS, Sejnowski, TJ Transformadores y ondas corticales: codificadores para contextualizar a través del tiempo. (2024) Tendencias en las neurociencias. DOI: 10.1016/j.tins.2024.08.006

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Comstock, L., Carvalho, VR, Lainscsek, C., Fallah, A., Sejnowski, TJ La estimulación magnética transcraneal facilita la decodificación neuronal del habla. (2024) Cerebro sci. 14(9). DOI: 10.3390/cerebrosci14090895

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Patiño, M., Rossa, MA, Lagos, WN, Patne, NS, Callaway, EM Especificidad del tipo de célula transcriptómica de los circuitos corticales locales. (2024) Neuron. DOI: 10.1016 / j.neuron.2024.09.003

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Fernandes, S., Revanna, J., Pratt, J., Hayes, N., Marchetto, MC, Gage, FH Modelado de la enfermedad de Alzheimer utilizando organoides cerebrales derivados de células humanas y modelos 3D. (2024) Fronteras en neurociencia. 18:1434945. DOI: 10.3389/fnins.2024.1434945

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Minhas, PS, Jones, JR, Latif-Hernandez, A., Sugiura, Y., Durairaj, AS, Wang, Q., Mhatre, SD, Uenaka, T., Crapser, J., Conley, T., Ennerfelt, H., Jung, YJ, Liu, L., Prasad, P., Jenkins, BC, Ay, YA, Matrongolo, M., Goodman, R., Newmeyer, T., Heard, K., Kang, A., Wilson, EN, Yang, T., Ullian, EM, Serrano, GE, Beach, TG, Wernig, M., Rabinowitz, JD, Suematsu, M., Longo, FM, McReynolds, MR, Gage, FH, Andreasson, KI Restaurar el metabolismo de la glucosa en el hipocampo rescata la cognición en las patologías de la enfermedad de Alzheimer. (2024) Ciencia. 385(6711):eabm6131. DOI: 10.1126/ciencia.abm6131

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Álvarez-Kuglen, M., Ninomiya, K., Qin, H., Rodríguez, D., Fiengo, L., Farhy, C., Hsu, WM, Kirk, B., Havas, A., Feng, GS, Roberts, AJ, Anderson, RM, Serrano, M., Adams, PD, Sharpee, TO, Terskikh, AV ImAge cuantifica el envejecimiento y el rejuvenecimiento. (2024) Envejecimiento natural. DOI: 10.1038/s43587-024-00685-1

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Su, Y., Xu, J., Zhu, Z., Chin, J., Xu, L., Yu, H., Nudell, V., Dash, B., Moya, EA, Ye, L., Nimmerjahn , A., Sol, X. Las neuronas Dbh del tronco encefálico controlan la hiperreactividad de las vías respiratorias inducida por alérgenos. (2024) Naturaleza. DOI: 10.1038/s41586-024-07608-5

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Pérez García, G., Bicak, M., Buros, J., Haure-Mirande, JV, Pérez, GM, Otero-Pagan, A., Gama Sosa, MA, De Gasperi, R., Sano, M., Gage , FH, Barlow, C., Dudley, JT, Glicksberg, BS, Wang, Y., Readhead, B., Ehrlich, ME, Elder, GA, Gandy, S. Efectos beneficiosos del ejercicio físico y un profármaco antagonista mGluR2/3 activo por vía oral sobre la neurogénesis y el comportamiento en un modelo de amiloidosis de Alzheimer. (2024) Demento frontal. 2:1198006. DOI: 10.3389/frdem.2023.1198006

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Schmidt, TT, Tyer, C., Rughani, P., Haggblom, C., Jones, JR, Dai, X., Frazer, KA, Gage, FH, Juul, S., Hickey, S., Karlseder, J. La secuenciación de telómeros de lectura larga de alta resolución revela mecanismos dinámicos en el envejecimiento y el cáncer. (2024) Nature Communications. 15(1):5149. DOI: 10.1038/s41467-024-48917-7

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Chen, Y., Zhang, H., Cameron, M., Sejnowski, T. Aprendizaje de secuencias predictivas en la formación del hipocampo. (2024) Neuron. DOI: 10.1016 / j.neuron.2024.05.024

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Phang, HJ, Heimler, SR, Scandalis, LM, Wing, D., Moran, R., Nichols, JF, Moreno, D., Shadel, GS, Gage, FH, Molina, AJA Protocolo para la cohorte clínica del Centro Nathan Shock de San Diego: un nuevo recurso para estudios del envejecimiento humano. (2024) BMJ abierto. 14(6):e082659. DOI: 10.1136/bmjopen-2023-082659

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Herdy, JR, Mertens, J., Gage, FH La senescencia neuronal puede impulsar el envejecimiento cerebral. ENLACE AL TEXTO COMPLETO GRATUITO https://www.science.org/stoken/author-tokens/ST-1962/full [Publicado] (2024) Ciencia. 384(6703):1404-1406. DOI: 10.1126/ciencia.adi3450

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Minhas, PS, Jones, JR, Latif-Hernandez, A., Sugiura, Y., Durairaj, AS, Uenaka, T., Wang, Q., Mhatre, SD, Liu, L., Conley, T., Ennerfelt, H., Jung, YJ, Prasad, P., Jenkins, BC, Goodman, R., Newmeyer, T., Heard, K., Kang, A., Wilson, EN, Ullian, EM, Serrano, GE, Beach, TG, Rabinowitz, JD, Wernig, M., Suematsu, M., Longo, FM, McReynolds, MR, Gage, FH, Andreasson, KI Restaurar el metabolismo de la glucosa en el hipocampo rescata la cognición en las patologías de la enfermedad de Alzheimer. (2024) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2024.06.23.598940

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Stern, S., Zhang, L., Wang, M., Wright, R., Rosh, I., Hussein, Y., Stern, T., Choudhary, A., Tripathi, U., Reed, P., Sadis, H., Nayak, R., Shemen, A., Agarwal, K., Cordeiro, D., Peles, D., Hang, Y., Mendes, APD, Baul, TD, Roth, JG, Coorapati, S ., Boks, MP, McCombie, WR, Hulshoff Pol, H., Brennand, KJ, Réthelyi, JM, Kahn, RS, Marchetto, MC, Gage, FH Los gemelos monocigóticos discordantes en cuanto a esquizofrenia difieren en la maduración y la transmisión sináptica. (2024) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038/s41380-024-02561-1

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Wu, Y., Temple, BA, Sevilla, N., Zhang, J., Zhu, H., Zolotavin, P., Jin, Y., Duarte, D., Sanders, E., Azim, E., Nimmerjahn , A., Pfaff, SL, Luan, L., Xie, C. Electrodos ultraflexibles para registrar la actividad neuronal en la médula espinal del ratón durante el comportamiento motor. (2024) Informes de celda. 43(5):114199. DOI: 10.1016/j.celrep.2024.114199

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Tripathi, U., Rosh, I., Ben Ezer, R., Nayak, R., Hussein, Y., Choudhary, A., Djamus, J., Manole, A., Houlden, H., Gage, FH, popa, s. Genes ECM regulados positivamente y mayor actividad sináptica en neuronas DA humanas con Parkinson con mutaciones PINK1/PRKN. (2024) Enfermedad de Parkinson NPJ. 10(1):103. DOI: 10.1038/s41531-024-00715-0

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Mi, X., Chen, AB, Duarte, D., Carey, E., Taylor, CR, Braaker, PN, Bright, M., Almeida, RG, Lim, JX, Rutten, VM, Zheng, W., Wang , M., Reitman, ME, Wang, Y., Poskanzer, KE, Lyons, DA, Nimmerjahn, A., Ahrens, MB, Yu, G. Plataforma de análisis de datos rápida, precisa y versátil para la cuantificación de señales espaciotemporales moleculares. (2024) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2024.05.02.592259

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Zocher, S., McCloskey, A., Karasinsky, A., Schulte, R., Friedrich, U., Lesche, M., Rund, N., Gage, FH, Hetzer, MW, Toda, T. Persistencia de por vida de los ARN nucleares en el cerebro del ratón. (2024) Ciencia. 384(6691):53-59. DOI: 10.1126/ciencia.adf3481

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Samavat, M., Bartol, TM, Harris, KM, Sejnowski, TJ Capacidad de almacenamiento de información sináptica medida con la teoría de la información. (2024) Computación neuronal. 36(5):781-802. DOI: 10.1162/neco_a_01659

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Husar, A., Ordyan, M., García, GC, Yancey, JG, Saglam, AS, Faeder, JR, Bartol, TM, Kennedy, MB, Sejnowski, TJ MCell4 con BioNetGen: un simulador Monte Carlo de sistemas de reacción-difusión basados ​​en reglas con interfaz Python. (2024) PLOS Biología Computacional. 20(4):e1011800. DOI: 10.1371/diario.pcbi.1011800

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Adusei, M., Callaway, EM, Usrey, WM, Briggs, F. Corrientes paralelas de retroalimentación corticogénica directa desde la corteza extraestriada de nivel medio en el mono macaco. (2024) eNeuro. DOI: 10.1523 / ENEURO.0364-23.2024

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Podvin, S., Jones, J., Kang, A., Goodman, R., Reed, P., Lietz, CB, Then, J., Lee, KC, Eyler, LT, Jeste, DV, Gage, FH, Gancho, V. El modelo neuronal iN humano de esquizofrenia muestra una desregulación de la cromogranina B y las firmas de transmisores de neuropéptidos relacionados. (2024) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038 / s41380-024-02422-x

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Toda, T., Bedrosian, TA, Schafer, ST, Cuoco, MS, Linker, SB, Ghassemzadeh, S., Mitchell, L., Whiteley, JT, Novaresi, N., McDonald, AH, Gallina, IS, Yoon, H., Hester, ME, Peña, M., Lim, C., Suljic, E., AlFatah Mansour, A., Boulard, M., Parylak, SL, Gage, FH Los elementos nucleares intercalados durante mucho tiempo protegen a los progenitores neuronales de una diferenciación precoz. (2024) Informes de celda. 43(2):113774. DOI: 10.1016/j.celrep.2024.113774

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Bartol, TM, Ordyan, M., Sejnowski, TJ, Rangamani, P., Kennedy, MB Un modelo espacial de autofosforilación de CaMKII en una columna glutamatérgica sugiere un mecanismo cinético impulsado por una red para cambios biestables en la fuerza sináptica. (2024) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2024.02.02.578696

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Rosh, I., Tripathi, U., Hussein, Y., Rike, WA, Djamus, J., Shklyar, B., Manole, A., Houlden, H., Winkler, J., Gage, FH, Stern, S. Disfunción sináptica y desregulación de la matriz extracelular en neuronas dopaminérgicas de pacientes con enfermedad de Parkinson esporádica y E326K-GBA1. (2024) Enfermedad de Parkinson NPJ. 10(1):38. DOI: 10.1038/s41531-024-00653-x

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Wang, H., Dey, O., Lagos, WN, Behnam, N., Callaway, EM, Stafford, BK Vías paralelas que transportan señales retinianas selectivas de dirección y orientación a la capa 4 de la corteza visual del ratón. (2024) Informes de celda. 43(3):113830. DOI: 10.1016/j.celrep.2024.113830

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Miao, S., Fourgeaud, L., Burrola, PG, Stern, S., Zhang, Y., Happonen, KE, Novak, SW, Gage, FH, Lemke, G. Tyro3 promueve la maduración de las sinapsis glutamatérgicas. (2024) Fronteras en neurociencia. 18:1327423. DOI: 10.3389/fnins.2024.1327423

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Wang, M., Zhang, L., Novak, SW, Yu, J., Gallina, IS, Xu, LL, Lim, CK, Fernandes, S., Shokhirev, MN, Williams, AE, Saxena, MD, Coorapati, S., Parylak, SL, Quintero, C., Molina, E., Andrade, LR, Manor, U., Gage, FH Diversificación morfológica y maduración funcional de astrocitos humanos en organoides corticales enriquecidos en glía trasplantados en cerebro de ratón. (2024) Biotecnología de la naturaleza. DOI: 10.1038/s41587-024-02157-8

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Sameni, S., Bartol, TM, Corey-Bloom, J., Sejnowski, TJ. Las simulaciones por computadora predicen el impacto de la atrofia neuronal en la dinámica del calcio en la enfermedad de Huntington. (2024) Nexo PNAS. 3(1):pgad443. DOI: 10.1093/pnasnexus/pgad443

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Samavat, M., Bartol, TM, Bromer, C., Hubbard, DD, Hanka, DC, Kuwajima, M., Mendenhall, JM, Parker, PH, Bowden, JB, Abraham, WC, Sejnowski, TJ, Harris, KM La potenciación a largo plazo produce una expansión sostenida de la capacidad de almacenamiento de información sináptica en el hipocampo de ratas adultas. (2024) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2024.01.12.574766

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Zhang, LA, Li, P., Callaway, EM Identificación laminar de alta resolución en la corteza visual primaria de macacos mediante sondas de neuropíxeles. (2024) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2024.01.23.576944

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