Waitt Advanced Biophotonics Center

Forschung

Salk Institute for Biological Studies – Waitt Advanced Biophotonics Center – Forschung

PUBLIKATIONEN 2011


alle Veröffentlichungen


Marshel, JH, Garrett, ME, Nauhaus, I., Callaway, EM Funktionelle Spezialisierung von sieben visuellen kortikalen Bereichen der Maus. (2011) Neuron. 72(6):1040-1054. DOI: 10.1016/j.neuron.2011.12.004

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Mu, Y., Gage, FH Neurogenese des Hippocampus bei Erwachsenen und ihre Rolle bei der Alzheimer-Krankheit. (2011) Mol Neurodegener. 6:85. DOI: 10.1186/1750-1326-6-85

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Volman, V., Behrens, MM, Sejnowski, TJ Die Herunterregulierung von Parvalbumin an kortikalen GABA-Synapsen verringert die Gamma-Oszillationsaktivität des Netzwerks. (2011) Journal of Neuroscience. 31(49):18137-48. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.3041-11.2011

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Coufal, NG, Garcia-Perez, JL, Peng, GE, Marchetto, MC, Muotri, AR, Mu, Y., Carson, CT, Macia, A., Moran, JV, Gage, FH Ataxia telangiectasia mutated (ATM) moduliert die Retrotransposition von lang eingestreutem Element-1 (L1) in menschlichen neuralen Stammzellen. (2011) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 108(51):20382-7. DOI: 10.1073/pnas.1100273108

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Coggan, JS, Ocker, GK, Sejnowski, TJ, Prescott, SA Erklärung pathologischer Veränderungen der axonalen Erregbarkeit durch dynamische Analyse leitfähigkeitsbasierter Modelle. (2011) J Neural Eng. 8(6):065002. DOI: 10.1088/1741-2560/8/6/065002

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Brennand, KJ, Gage, FH Kurzer Rückblick: Das Versprechen von Studien zur Schizophrenie auf der Basis menschlicher induzierter pluripotenter Stammzellen. (2011) Stammzellen. 29(12):1915-22. DOI: 10.1002/Stamm.762

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Choi, J., Callaway, EM Monosynaptische Eingänge zu ErbB4-exprimierenden inhibitorischen Neuronen im primären somatosensorischen Kortex der Maus. (2011) Journal für vergleichende Neurologie. 519(17):3402-3414. DOI: 10.1002/cne.22680

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Kuwabara, T., Kagalwala, MN, Onuma, Y., Ito, Y., Warashina, M., Terashima, K., Sanosaka, T., Nakashima, K., Gage, FH, Asashima, M. Insulinbiosynthese in neuronalen Vorläufern, die aus dem erwachsenen Hippocampus und dem Riechkolben stammen. (2011) EMBO Molekulare Medizin. 3(12):742-54. DOI: 10.1002/emmm.201100177

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Tremblay, M., Stevens, B., Sierra, A., Wake, H., Bessis, A., Nimmerjahn, A. Die Rolle von Mikroglia im gesunden Gehirn. (2011) Journal of Neuroscience. 31(45):16064-9. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.4158-11.2011

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Wei, H., Bonjean, M., Petry, HM, Sejnowski, TJ, Bickford, ME Thalamus-Burst-Feuerneigung: ein Vergleich der dorsalen seitlichen Kniehöcker- und Pulvinarkerne bei der Spitzmaus. (2011) Journal of Neuroscience. 31(47):17287-17299. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.6431-10.2011

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Brenner, S., Sejnowski, TJ Das menschliche Gehirn verstehen. (2011) Science. 334(6056):567. DOI: 10.1126/science.1215674


Fitzgerald, JD, Rowekamp, ​​RJ, Sincich, LC, Sharpee, TO Dimensionsreduktion zweiter Ordnung unter Verwendung von Minimum- und Maximum-Mutual-Information-Modellen. (2011) PLOS Computational Biology. 7(10):e1002249. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002249

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Bai, G., Pfaff, SL Proteaseregulation: das Yin und Yang der neuronalen Entwicklung und Krankheit. (2011) Neuron. 72(1):9-21. DOI: 10.1016/j.neuron.2011.09.012

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Kawakami, Y., Marti, M., Kawakami, H., Itou, J., Quach, T., Johnson, A., Sahara, S., O'Leary, DD, Nakagawa, Y., Lewandoski, M. , Pfaff, S., Evans, SM, Izpisua Belmonte, JC Die durch Islet1 vermittelte Aktivierung des β-Catenin-Signalwegs ist für die Initiierung der Hinterbeine bei Mäusen erforderlich. (2011) Entwicklung. 138(20):4465-73. DOI: 10.1242/dev.065359

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Marchetto, MC, Brennand, KJ, Boyer, LF, Gage, FH Induzierte pluripotente Stammzellen (iPSCs) und neurologische Krankheitsmodellierung: Fortschritte und Versprechen. (2011) Humane Molekulargenetik. 20(R2):R109-15. DOI: 10.1093/hmg/ddr336

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Volman, V., Sejnowski, TJ, Bazhenov, M. Topologische Grundlagen der Epileptogenese in einem Modell eines schweren kortikalen Traumas. (2011) Journal für Neurophysiologie. 106(4):1933-1942. DOI: 10.1152/jn.00458.2011

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Sharpee, TO, Nagel, KI, Doupe, AJ Zweidimensionale Anpassung im auditorischen Vorderhirn. (2011) Journal für Neurophysiologie. 106(4):1841-61. DOI: 10.1152/jn.00905.2010

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Sharpee, TO, Atencio, CA, Schreiner, CE Hierarchische Darstellungen im auditorischen Kortex. (2011) Aktuelle Meinung in Neurobiologie. 21(5):761-7. DOI: 10.1016/j.conb.2011.05.027

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Hester, ME, Murtha, MJ, Song, S., Rao, M., Miranda, CJ, Meyer, K., Tian, ​​J., Boulting, G., Schaffer, DV, Zhu, MX, Pfaff, SL, Gage , FH, Kaspar, BK Schnelle und effiziente Erzeugung funktioneller Motoneuronen aus menschlichen pluripotenten Stammzellen mithilfe von Genen bereitgestellter Transkriptionsfaktorcodes. (2011) Mol.-Nr. Da. 19(10):1905-12. DOI: 10.1038/mt.2011.135

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Yu, T., Sejnowski, TJ, Cauwenberghs, G. Biophysikalische neuronale Spitzen-, Bursting- und Erregbarkeitsdynamik in rekonfigurierbaren analogen VLSI. (2011) IEEE Trans Biomed Circuits Syst. 5(5):420-429. DOI: 10.1109/TBCAS.2011.2169794

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Zhu, Q., Pao, GM, Huynh, AM, Suh, H., Tonnu, N., Nederlof, PM, Gage, FH, Verma, IM Die Unterdrückung des BRCA1-Tumors erfolgt durch Heterochromatin-vermittelte Stummschaltung. (2011) Natur. 477(7363):179-84. DOI: 10.1038/nature10371

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Volman, V., Bazhenov, M., Sejnowski, TJ Das Traumamuster bestimmt die Schwelle für epileptische Aktivität in einem Modell der kortikalen Deafferenzierung. (2011) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 108(37):15402-15407. DOI: 10.1073/pnas.1112066108

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Ghosh, KK, Burns, LD, Cocker, ED, Nimmerjahn, A., Ziv, Y., Gamal, AE, Schnitzer, MJ Miniaturisierte Integration eines Fluoreszenzmikroskops. (2011) Naturmethoden. 8(10):871-8. DOI: 10.1038/nmeth.1694

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Dang-Vu, TT, Bonjean, M., Schabus, M., Boly, M., Darsaud, A., Desseilles, M., Degueldre, C., Balteau, E., Phillips, C., Luxen, A. , Sejnowski, TJ, Maquet, P. Zusammenspiel zwischen spontaner und induzierter Gehirnaktivität während des menschlichen Schlafs mit nicht schnellen Augenbewegungen. (2011) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 108(37):15438-15443. DOI: 10.1073/pnas.1112503108

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Toups, JV, Fellous, JM, Thomas, PJ, Sejnowski, TJ, Tiesinga, PH Ermitteln der Ereignisstruktur neuronaler Spike-Trains. (2011) Neuronale Berechnung. 23(9):2169-2208. DOI: 10.1162/NECO_a_00173

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Osakada, F., Mori, T., Cetin, AH, Marshel, JH, Virgen, B., Callaway, EM Neue Tollwutvirus-Varianten zur Überwachung und Manipulation der Aktivität und Genexpression in definierten neuronalen Schaltkreisen. (2011) Neuron. 71(4):617-631. DOI: 10.1016/j.neuron.2011.07.005

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Shen, B., Xiang, Z., Miller, B., Louie, G., Wang, W., Noel, JP, Gage, FH, Wang, L. Genetische Kodierung unnatürlicher Aminosäuren in neuralen Stammzellen und optische Meldung spannungsempfindlicher Domänenänderungen in differenzierten Neuronen. (2011) Stammzellen. 29(8):1231-40. DOI: 10.1002/Stamm.679

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Rowekamp, ​​RJ, Sharpee, TO Analyse mehrkomponentiger rezeptiver Felder neuronaler Reaktionen auf natürliche Reize. (2011) Netzwerk. 22(1-4):45-73. DOI: 10.3109/0954898X.2011.566303

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Alaynick, WA, Jessell, TM, Pfaff, SL Schnappschuss: Entwicklung des Rückenmarks. (2011) Zelle 146(1):178-178.e1. DOI: 10.1016/j.cell.2011.06.038


Woods, NB, Parker, AS, Moraghebi, R., Lutz, MK, Firth, AL, Brennand, KJ, Berggren, WT, Raya, A., Izpisúa Belmonte, JC, Gage, FH, Verma, IM Kurzbericht: Effiziente Erzeugung hämatopoetischer Vorläufer und Vorläufer aus humanen pluripotenten Stammzelllinien. (2011) Stammzellen. 29(7):1158-64. DOI: 10.1002/Stamm.657

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Liang, X., Song, MR, Xu, Z., Lanuza, GM, Liu, Y., Zhuang, T., Chen, Y., Pfaff, SL, Evans, SM, Sun, Y. Isl1 ist für mehrere Aspekte der Entwicklung von Motoneuronen erforderlich. (2011) Molekulare und zelluläre Neurowissenschaften. 47(3):215-22. DOI: 10.1016/j.mcn.2011.04.007

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Bonjean, M., Baker, T., Lemieux, M., Timofeev, I., Sejnowski, T., Bazhenov, M. Kortikothalamisches Feedback steuert die Dauer der Schlafspindel in vivo. (2011) Journal of Neuroscience. 31(25):9124-9134. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.0077-11.2011

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Aimone, JB, Deng, W., Gage, FH Neue Erinnerungen auflösen: ein kritischer Blick auf den Gyrus dentatus, die Neurogenese bei Erwachsenen und die Mustertrennung. (2011) Neuron. 70(4):589-96. DOI: 10.1016/j.neuron.2011.05.010

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Callaway, EM, Borrell, V. Entwicklungsformung der dendritischen Morphologie von Schicht-4-Neuronen im visuellen Kortex: Einfluss des retinalen Inputs. (2011) Journal of Neuroscience. 31(20):7456-7470. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.5222-10.2011

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Brennand, KJ, Simone, A., Jou, J., Gelboin-Burkhart, C., Tran, N., Sangar, S., Li, Y., Mu, Y., Chen, G., Yu, D. , McCarthy, S., Sebat, J., Gage, FH Modellierung der Schizophrenie mithilfe humaninduzierter pluripotenter Stammzellen. (2011) Natur. 473(7346):221-5. DOI: 10.1038/nature09915

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Bruno, IG, Karam, R., Huang, L., Bhardwaj, A., Lou, CH, Shum, EY, Song, HW, Corbett, MA, Gifford, WD, Gecz, J., Pfaff, SL, Wilkinson, MF Identifizierung einer microRNA, die die Genexpression aktiviert, indem sie den durch Nonsense vermittelten RNA-Zerfall unterdrückt. (2011) Molekulare Zelle. 42(4):500-10. DOI: 10.1016/j.molcel.2011.04.018

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Miyamichi, K., Amat, F., Moussavi, F., Wang, C., Wickersham, I., Wall, NR, Taniguchi, H., Tasic, B., Huang, ZJ, He, Z., Callaway, EM, Horowitz, MA, Luo, L. Kortikale Darstellungen des olfaktorischen Inputs durch transsynaptische Verfolgung. (2011) Natur. 472(7342):191-196. DOI: 10.1038/nature09714

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Fitzgerald, JD, Sincich, LC, Sharpee, TO Minimale Modelle mehrdimensionaler Berechnungen. (2011) PLOS Computational Biology. 7(3):e1001111. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1001111

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Mu, Y., Zhao, C., Gage, FH Dopaminerge Modulation kortikaler Inputs während der Reifung von im Erwachsenenalter geborenen Zahnkörnerzellen. (2011) Journal of Neuroscience. 31(11):4113-23. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.4913-10.2011

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Aimone, JB, Gage, FH Modellierung neuer Neuronenfunktionen: eine Geschichte des Einsatzes computergestützter Neurowissenschaften zur Untersuchung der Neurogenese bei Erwachsenen. (2011) Europäische Zeitschrift für Neurowissenschaften. 33(6):1160-9. DOI: 10.1111/j.1460-9568.2011.07615.x

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Winner, B., Kohl, Z., Gage, FH Neurodegenerative Erkrankungen und adulte Neurogenese. (2011) EUR. J. Neurosci. 33(6):1139-51. DOI: 10.1111/j.1460-9568.2011.07613.x

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Macfarlan, TS, Gifford, WD, Agarwal, S., Driscoll, S., Lettieri, K., Wang, J., Andrews, SE, Franco, L., Rosenfeld, MG, Ren, B., Pfaff, SL Endogene Retroviren und benachbarte Gene werden durch LSD1/KDM1A koordiniert unterdrückt. (2011) Gene & Entwicklung. 25(6):594-607. DOI: 10.1101/gad.2008511

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Winner, B., Jappelli, R., Maji, SK, Desplats, PA, Boyer, L., Aigner, S., Hetzer, C., Loher, T., Vilar, M., Campioni, S., Tzitzilonis, C., Soragni, A., Jessberger, S., Mira, H., Consiglio, A., Pham, E., Masliah, E., Gage, FH, Riek, R. In-vivo-Nachweis, dass Alpha-Synuclein-Oligomere toxisch sind. (2011) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 108(10):4194-9. DOI: 10.1073/pnas.1100976108

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Winner, B., Melrose, HL, Zhao, C., Hinkle, KM, Yue, M., Kent, C., Braithwaite, AT, Ogholikhan, S., Aigner, R., Winkler, J., Farrer, MJ , Gage, FH Die adulte Neurogenese und das Neuritenwachstum sind bei LRRK2 G2019S-Mäusen beeinträchtigt. (2011) Neurobiol. Dis. 41(3):706-16. DOI: 10.1016/j.nbd.2010.12.008

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Romani, S., Sejnowski, TJ, Tsodyks, M. Intrazelluläre Dynamik virtueller Ortszellen. (2011) Neuronale Berechnung. 23(3):651-5. DOI: 10.1162/NECO_a_00087

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Yuan, SH, Martin, J., Elia, J., Flippin, J., Paramban, RI, Hefferan, MP, Vidal, JG, Mu, Y., Killian, RL, Israel, MA, Emre, N., Marsala , S., Marsala, M., Gage, FH, Goldstein, LS, Carson, CT Zelloberflächenmarkersignaturen zur Isolierung neuronaler Stammzellen, Gliazellen und Neuronen, die aus menschlichen pluripotenten Stammzellen stammen. (2011) Plus eins. 6(3):e17540. DOI: 10.1371/journal.pone.0017540

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Garudadri, S., Gallarda, B., Pfaff, S., Alaynick, W. Elektrophysiologie des Rückenmarks II: Herstellung extrazellulärer Saugelektroden. (2011) J Vis Exp.(48) DOI: 10.3791/2580

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Jeanne, JM, Thompson, JV, Sharpee, TO, Gentner, TQ Entstehung erlernter kategorialer Darstellungen innerhalb eines auditorischen Vorderhirnschaltkreises. (2011) Journal of Neuroscience. 31(7):2595-606. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.3930-10.2011

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Kim, JE, O'Sullivan, ML, Sanchez, CA, Hwang, M., Israel, MA, Brennand, K., Deerinck, TJ, Goldstein, LS, Gage, FH, Ellisman, MH, Ghosh, A. Untersuchung der Synapsenbildung und -funktion mithilfe menschlicher pluripotenter Neuronen aus Stammzellen. (2011) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 108(7):3005-10. DOI: 10.1073/pnas.1007753108

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Bai, G., Chivatakarn, O., Bonanomi, D., Lettieri, K., Franco, L., Xia, C., Stein, E., Ma, L., Lewcock, JW, Pfaff, SL Für die Axonführung ist eine Presenilin-abhängige Rezeptorverarbeitung erforderlich. (2011) Zelle 144(1):106-18. DOI: 10.1016/j.cell.2010.11.053

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Meng, X., Arocena, M., Penninger, J., Gage, FH, Zhao, M., Song, B. PI3K-vermittelte Elektrotaxis embryonaler und adulter neuronaler Vorläuferzellen in Gegenwart von Wachstumsfaktoren. (2011) Exp. Neurol. 227(1):210-7. DOI: 10.1016/j.expneurol.2010.11.002

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Peterson, DA, Lotz, DT, Halgren, E., Sejnowski, TJ, Poizner, H. Choice moduliert die neuronale Dynamik der Vorhersagefehlerverarbeitung während des belohnten Lernens. (2011) Neuroimage. 54(2):1385-1394. DOI: 10.1016/j.neuroimage.2010.09.051

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