Centro Avançado de Biofotônica Waitt

Pesquisa

Salk Institute for Biological Studies - Waitt Advanced Biophotonics Center - Research

PUBLICAÇÕES 2024


todas as publicações


Paşca, SP, Arlotta, P., Bateup, HS, Camp, JG, Cappello, S., Gage, FH, Knoblich, JA, Kriegstein, AR, Lancaster, MA, Ming, GL, Novarino, G., Okano, H., Parmar, M., Park, IH, Reiner, O., Song, H., Studer, L., Takahashi, J., Temple, S., Testa, G., Treutlein, B., Vaccarino, FM, Vanderhaeghen, P., Young-Pearse, T. Uma estrutura para estudos de organoides neurais, assembloides e transplantes. (2024) Natureza. DOI: 10.1038/s41586-024-08487-6

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Praturu, A., Sharpee, TO Incorporação adaptável de dados para espaços curvos. (2024) iCiência. 27(12):111266. DOI: 10.1016/j.isci.2024.111266

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Hirakis, SP, Bartol, TM, Autin, L., Amaro, RE, Sejnowski, TJ Remodelação cardíaca eletrofísica no nível molecular: insights sobre a ativação do receptor de rianodina e a liberação de cálcio induzida pelo cálcio a partir de um modelo estocástico de partículas explícitas. (2024) Revista Biofísica. DOI: 10.1016/j.bpj.2024.09.029

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Patel, D., Sejnowski, T., Siegelmann, H. Otimizando os custos de atenção e controle cognitivo usando arquiteturas em camadas temporais. (2024) Computação Neural.:1-30 DOI: 10.1162/neco_a_01718

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Filho, G., Na, Y., Kim, Y., Filho, JH, Clemenson, GD, Schafer, ST, Yoo, JY, Parylak, SL, Paquola, A., Do, H., Kim, D., Ahn, I., Ju, M., Kang, CS, Ju, Y., Jung, E., McDonald, AH, Park, Y., Kim, G., Paik, SB, Hur, J., Kim, J ., Han, YM, Lee, SH, Gage, FH, Kim, JS, Han, J. O miR-124 coordena reguladores metabólicos que atuam nos estágios iniciais da neurogênese humana. (2024) Biologia da Comunicação. 7(1):1393. DOI: 10.1038/s42003-024-07089-2

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Barykina, NV, Carey, EM, Oliinyk, OS, Nimmerjahn, A., Verkhusha, VV Nanocorpos fluorescentes desestabilizados no infravermelho próximo permitem o direcionamento sem fundo de biossensores baseados em GFP para geração de imagens e manipulação. (2024) Nature Communications. 15(1):7788. DOI: 10.1038/s41467-024-51857-x

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Muller, L., Churchland, PS, Sejnowski, TJ Transformadores e ondas corticais: codificadores para extrair contexto ao longo do tempo. (2024) Tendências em neurociências. DOI: 10.1016/j.tins.2024.08.006

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Comstock, L., Carvalho, VR, Lainscsek, C., Fallah, A., Sejnowski, TJ A estimulação magnética transcraniana facilita a decodificação da fala neural. (2024) Brain Sci. 14(9). DOI: 10.3390/brainsci14090895

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Patiño, M., Rossa, MA, Lagos, WN, Patne, NS, Callaway, EM Especificidade transcriptômica do tipo celular dos circuitos corticais locais. (2024) Neurônio. DOI: 10.1016 / j.neuron.2024.09.003

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Fernandes, S., Revanna, J., Pratt, J., Hayes, N., Marchetto, MC, Gage, FH Modelagem da doença de Alzheimer usando organoides cerebrais derivados de células humanas e modelos 3D. (2024) Fronteiras em Neurociência. 18:1434945. DOI: 10.3389/fnins.2024.1434945

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Minhas, PS, Jones, JR, Latif-Hernandez, A., Sugiura, Y., Durairaj, AS, Wang, Q., Mhatre, SD, Uenaka, T., Crapser, J., Conley, T., Ennerfelt, H., Jung, YJ, Liu, L., Prasad, P., Jenkins, BC, Ay, YA, Matrongolo, M., Goodman, R., Newmeyer, T., Heard, K., Kang, A., Wilson, EN, Yang, T., Ullian, EM, Serrano, GE, Beach, TG, Wernig, M., Rabinowitz, JD, Suematsu, M., Longo, FM, McReynolds, MR, Gage, FH, Andreasson, KI A restauração do metabolismo da glicose no hipocampo resgata a cognição nas patologias da doença de Alzheimer. (2024) Ciência. 385(6711):eabm6131. DOI: 10.1126/science.abm6131

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Alvarez-Kuglen, M., Ninomiya, K., Qin, H., Rodriguez, D., Fiengo, L., Farhy, C., Hsu, WM, Kirk, B., Havas, A., Feng, GS, Roberts, AJ, Anderson, RM, Serrano, M., Adams, PD, Sharpee, TO, Terskikh, AV O ImAge quantifica o envelhecimento e o rejuvenescimento. (2024) Nat Envelhecimento. DOI: 10.1038/s43587-024-00685-1

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Su, Y., Xu, J., Zhu, Z., Chin, J., Xu, L., Yu, H., Nudell, V., Dash, B., Moya, EA, Ye, L., Nimmerjahn , A., Sol, X. Neurônios Dbh do tronco cerebral controlam a hiperreatividade das vias aéreas induzida por alérgenos. (2024) Natureza. DOI: 10.1038/s41586-024-07608-5

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Perez Garcia, G., Bicak, M., Buros, J., Haure-Mirande, JV, Perez, GM, Otero-Pagan, A., Gama Sosa, MA, De Gasperi, R., Sano, M., Gage , FH, Barlow, C., Dudley, JT, Glicksberg, BS, Wang, Y., Readhead, B., Ehrlich, ME, Elder, GA, Gandy, S. Efeitos benéficos do exercício físico e de uma pró-droga antagonista de mGluR2/3 oralmente ativa na neurogênese e no comportamento em um modelo de amiloidose de Alzheimer. (2024) Demento frontal. 2:1198006. DOI: 10.3389/frdem.2023.1198006

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Carvalho, VR, Mendes, EMAM, Fallah, A., Sejnowski, TJ, Comstock, L., Lainscsek, C. Decodificação de fala imaginada com análise diferencial de atraso. (2024) Fronteiras em Neurociência Humana. 18:1398065. DOI: 10.3389/fnhum.2024.1398065

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Schmidt, TT, Tyer, C., Rughani, P., Haggblom, C., Jones, JR, Dai, X., Frazer, KA, Gage, FH, Juul, S., Hickey, S., Karlseder, J. O sequenciamento de telômeros de leitura longa e de alta resolução revela mecanismos dinâmicos no envelhecimento e no câncer. (2024) Nature Communications. 15(1):5149. DOI: 10.1038/s41467-024-48917-7

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Chen, Y., Zhang, H., Cameron, M., Sejnowski, T. Aprendizagem de sequência preditiva na formação do hipocampo. (2024) Neurônio. DOI: 10.1016 / j.neuron.2024.05.024

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Phang, HJ, Heimler, SR, Scandalis, LM, Wing, D., Moran, R., Nichols, JF, Moreno, D., Shadel, GS, Gage, FH, Molina, AJA Protocolo para a Coorte Clínica do San Diego Nathan Shock Center: um novo recurso para estudos do envelhecimento humano. (2024) BMJ Open. 14(6):e082659. DOI: 10.1136/bmjopen-2023-082659

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Herdy, JR, Mertens, J., Gage, FH A senescência neuronal pode levar ao envelhecimento cerebral. LINK PARA O TEXTO COMPLETO GRATUITO https://www.science.org/stoken/author-tokens/ST-1962/full [Publicado] (2024) Ciência. 384(6703):1404-1406. DOI: 10.1126/science.adi3450

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Minhas, PS, Jones, JR, Latif-Hernandez, A., Sugiura, Y., Durairaj, AS, Uenaka, T., Wang, Q., Mhatre, SD, Liu, L., Conley, T., Ennerfelt, H., Jung, YJ, Prasad, P., Jenkins, BC, Goodman, R., Newmeyer, T., Heard, K., Kang, A., Wilson, EN, Ullian, EM, Serrano, GE, Beach, TG, Rabinowitz, JD, Wernig, M., Suematsu, M., Longo, FM, McReynolds, MR, Gage, FH, Andreasson, KI A restauração do metabolismo da glicose no hipocampo resgata a cognição nas patologias da doença de Alzheimer. (2024) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2024.06.23.598940

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Stern, S., Zhang, L., Wang, M., Wright, R., Rosh, I., Hussein, Y., Stern, T., Choudhary, A., Tripathi, U., Reed, P., Sadis, H., Nayak, R., Shemen, A., Agarwal, K., Cordeiro, D., Peles, D., Hang, Y., Mendes, APD, Baul, TD, Roth, JG, Coorapati, S ., Boks, MP, McCombie, WR, Hulshoff Pol, H., Brennand, KJ, Réthelyi, JM, Kahn, RS, Marchetto, MC, Gage, FH Gêmeos monozigóticos discordantes para esquizofrenia diferem na maturação e na transmissão sináptica. (2024) Psiquiatria Molecular. DOI: 10.1038/s41380-024-02561-1

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Wu, Y., Temple, BA, Sevilla, N., Zhang, J., Zhu, H., Zolotavin, P., Jin, Y., Duarte, D., Sanders, E., Azim, E., Nimmerjahn , A., Pfaff, SL, Luan, L., Xie, C. Eletrodos ultraflexíveis para registrar a atividade neural na medula espinhal de camundongos durante o comportamento motor. (2024) Relatórios de células 43(5):114199. DOI: 10.1016/j.celrep.2024.114199

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Tripathi, U., Rosh, I., Ben Ezer, R., Nayak, R., Hussein, Y., Choudhary, A., Djamus, J., Manole, A., Houlden, H., Gage, FH, Stern, S. Genes ECM regulados positivamente e atividade sináptica aumentada em neurônios DA humanos de Parkinson com mutações PINK1/PRKN. (2024) Distúrbio de Parkinson NPJ. 10(1):103. DOI: 10.1038/s41531-024-00715-0

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Mi, X., Chen, AB, Duarte, D., Carey, E., Taylor, CR, Braaker, PN, Bright, M., Almeida, RG, Lim, JX, Rutten, VM, Zheng, W., Wang , M., Reitman, ME, Wang, Y., Poskanzer, KE, Lyons, DA, Nimmerjahn, A., Ahrens, MB, Yu, G. Plataforma de análise de dados rápida, precisa e versátil para quantificação de sinais espaço-temporais moleculares. (2024) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2024.05.02.592259

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Zocher, S., McCloskey, A., Karasinsky, A., Schulte, R., Friedrich, U., Lesche, M., Rund, N., Gage, FH, Hetzer, MW, Toda, T. Persistência ao longo da vida de RNAs nucleares no cérebro de camundongos. (2024) Ciência. 384(6691):53-59. DOI: 10.1126/science.adf3481

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Samavat, M., Bartol, TM, Harris, KM, Sejnowski, TJ Capacidade de armazenamento de informações sinápticas medida com a teoria da informação. (2024) Computação Neural. 36(5):781-802. DOI: 10.1162/neco_a_01659

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Husar, A., Ordyan, M., Garcia, GC, Yancey, JG, Saglam, AS, Faeder, JR, Bartol, TM, Kennedy, MB, Sejnowski, TJ MCell4 com BioNetGen: Um simulador Monte Carlo de sistemas de reação-difusão baseados em regras com interface Python. (2024) Biologia Computacional PLOS. 20(4):e1011800. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1011800

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Adusei, M., Callaway, EM, Usrey, WM, Briggs, F. Fluxos paralelos de feedback corticogeniculado direto do córtex extraestriado de nível médio no macaco. (2024) eNeuro. DOI: 10.1523/ENEURO.0364-23.2024

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Podvin, S., Jones, J., Kang, A., Goodman, R., Reed, P., Lietz, CB, Then, J., Lee, KC, Eyler, LT, Jeste, DV, Gage, FH, Gancho, V. O modelo neuronal humano iN de esquizofrenia apresenta desregulação da cromogranina B e assinaturas de transmissores neuropeptídicos relacionados. (2024) Psiquiatria Molecular. DOI: 10.1038 / s41380-024-02422-x

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Toda, T., Bedrosian, TA, Schafer, ST, Cuoco, MS, Linker, SB, Ghassemzadeh, S., Mitchell, L., Whiteley, JT, Novaresi, N., McDonald, AH, Gallina, IS, Yoon, H., Hester, ME, Pena, M., Lim, C., Suljic, E., AlFatah Mansour, A., Boulard, M., Parylak, SL, Gage, FH Elementos nucleares longos intercalados protegem os progenitores neurais da diferenciação precoce. (2024) Relatórios de células 43(2):113774. DOI: 10.1016/j.celrep.2024.113774

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Bartol, TM, Ordyan, M., Sejnowski, TJ, Rangamani, P., Kennedy, MB Um modelo espacial de autofosforilação de CaMKII em uma coluna glutamatérgica sugere um mecanismo cinético orientado por rede para mudanças biestáveis ​​na força sináptica. (2024) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2024.02.02.578696

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Rosh, I., Tripathi, U., Hussein, Y., Rike, WA, Djamus, J., Shklyar, B., Manole, A., Houlden, H., Winkler, J., Gage, FH, Stern, S. Disfunção sináptica e desregulação da matriz extracelular em neurônios dopaminérgicos de pacientes com doença de Parkinson esporádica e E326K-GBA1. (2024) Distúrbio de Parkinson NPJ. 10(1):38. DOI: 10.1038/s41531-024-00653-x

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Wang, H., Dey, O., Lagos, WN, Behnam, N., Callaway, EM, Stafford, BK Caminhos paralelos que transportam sinais retinais seletivos de direção e orientação para a camada 4 do córtex visual do camundongo. (2024) Relatórios de células 43(3):113830. DOI: 10.1016/j.celrep.2024.113830

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Miao, S., Fourgeaud, L., Burrola, PG, Stern, S., Zhang, Y., Happonen, KE, Novak, SW, Gage, FH, Lemke, G. Tyro3 promove a maturação das sinapses glutamatérgicas. (2024) Fronteiras em Neurociência. 18:1327423. DOI: 10.3389/fnins.2024.1327423

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Wang, M., Zhang, L., Novak, SW, Yu, J., Gallina, IS, Xu, LL, Lim, CK, Fernandes, S., Shokhirev, MN, Williams, AE, Saxena, MD, Coorapati, S., Parylak, SL, Quintero, C., Molina, E., Andrade, LR, Manor, U., Gage, FH Diversificação morfológica e maturação funcional de astrócitos humanos em organoides corticais enriquecidos com glia transplantados em cérebro de camundongo. (2024) Biotecnologia da Natureza. DOI: 10.1038/s41587-024-02157-8

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Sameni, S., Bartol, TM, Corey-Bloom, J., Sejnowski, TJ. Simulações computacionais prevêem o impacto da atrofia neuronal na dinâmica do cálcio na doença de Huntington. (2024) Nexus PNAS. 3(1):pgad443. DOI: 10.1093/pnasnexus/pgad443

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Samavat, M., Bartol, TM, Bromer, C., Hubbard, DD, Hanka, DC, Kuwajima, M., Mendenhall, JM, Parker, PH, Bowden, JB, Abraham, WC, Sejnowski, TJ, Harris, KM A potencialização de longo prazo produz uma expansão sustentada da capacidade de armazenamento de informações sinápticas no hipocampo de ratos adultos. (2024) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2024.01.12.574766

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Zhang, LA, Li, P., Callaway, EM Identificação laminar de alta resolução no córtex visual primário de macacos usando sondas de neuropixels. (2024) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2024.01.23.576944

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