Centro Avançado de Biofotônica Waitt

Pesquisa

Salk Institute for Biological Studies - Waitt Advanced Biophotonics Center - Research

PUBLICAÇÕES 2013


todas as publicações


Lainscsek, C., Weyhenmeyer, J., Hernandez, ME, Poizner, H., Sejnowski, TJ Classificação dinâmica não linear de séries temporais curtas do sistema rössler em regimes de alto ruído. (2013) Fronteiras em Neurologia. 4:182. DOI: 10.3389/fneur.2013.00182

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Lainscsek, C., Hernandez, ME, Weyhenmeyer, J., Sejnowski, TJ, Poizner, H. Análise dinâmica não linear de séries temporais de EEG distingue pacientes com doença de Parkinson de indivíduos saudáveis. (2013) Fronteiras em Neurologia. 4:200. DOI: 10.3389/fneur.2013.00200

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Pfaff, S., Shaham, S. Desenvolvimento de neurônios e células gliais. (2013) Opinião atual em Neurobiologia. 23 (6): 901-2.


Grindberg, RV, Yee-Greenbaum, JL, McConnell, MJ, Novotny, M., O'Shaughnessy, AL, Lambert, GM, Araúzo-Bravo, MJ, Lee, J., Fishman, M., Robbins, GE, Lin , X., Venepally, P., Badger, JH, Galbraith, DW, Gage, FH, Lasken, RS Sequenciamento de RNA de núcleos únicos. (2013) Anais da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos da América. 110(49):19802-7. DOI: 10.1073/pnas.1319700110

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Borowska, J., Jones, CT, Zhang, H., Blacklaws, J., Goulding, M., Zhang, Y. Subpopulações funcionais de interneurônios V3 na medula espinhal de camundongos maduros. (2013) Journal of Neuroscience. 33(47):18553-65. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.2005-13.2013

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Del Barrio, MG, Bourane, S., Grossmann, K., Schüle, R., Britsch, S., O'Leary, DD, Goulding, M. Um código de fator de transcrição define nove subtipos de interneurônios sensoriais na área mecanossensorial da medula espinhal. (2013) PLOS Um. 8(11):e77928. DOI: 10.1371/journal.pone.0077928

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Reilly, MT, Faulkner, GJ, Dubnau, J., Ponomarev, I., Gage, FH O papel dos elementos transponíveis na saúde e nas doenças do sistema nervoso central. (2013) Journal of Neuroscience. 33(45):17577-86. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.3369-13.2013

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McConnell, MJ, Lindberg, MR, Brennand, KJ, Piper, JC, Voet, T., Cowing-Zitron, C., Shumilina, S., Lasken, RS, Vermeesch, JR, Hall, IM, Gage, FH Variação do número de cópias do mosaico em neurônios humanos. (2013) Ciência. 342(6158):632-7. DOI: 10.1126/science.1243472

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Marchetto, MCN, Narvaiza, I., Denli, AM, Benner, C., Lazzarini, TA, Nathanson, JL, Paquola, ACM, Desai, KN, Herai, RH, Weitzman, MD, Yeo, GW, Muotri, AR, Gage, FH Regulação diferencial de L1 em ​​células-tronco pluripotentes de humanos e macacos. (2013) Natureza. 503(7477):525-529. DOI: 10.1038/nature12686

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Bekinschtein, P., Kent, BA, Oomen, CA, Clemenson, GD, Gage, FH, Saksida, LM, Bussey, TJ O BDNF no giro denteado é necessário para a consolidação de memórias "separadas por padrões". (2013) Relatórios de células 5(3):759-68. DOI: 10.1016/j.celrep.2013.09.027

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Miller, JA, Nathanson, J., Franjic, D., Shim, S., Dalley, RA, Shapouri, S., Smith, KA, Sunkin, SM, Bernard, A., Bennett, JL, Lee, CK, Hawrylycz , MJ, Jones, AR, Amaral, DG, Šestan, N., Gage, FH, Lein, ES Assinaturas moleculares conservadas da neurogênese na zona subgranular do hipocampo de roedores e primatas. (2013) Desenvolvimento. 140(22):4633-44. DOI: 10.1242/dev.097212

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Gage, FH, Temple, S. Células-tronco neurais: gerando e regenerando o cérebro. (2013) Neurônio. 80(3):588-601. DOI: 10.1016/j.neuron.2013.10.037

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Deshmukh, VA, Tardif, V., Lyssiotis, CA, Green, CC, Kerman, B., Kim, HJ, Padmanabhan, K., Swoboda, JG, Ahmad, I., Kondo, T., Gage, FH, Theofilopoulos , AN, Lawson, BR, Schultz, PG, Lairson, LL Uma abordagem regenerativa para o tratamento da esclerose múltipla. (2013) Natureza. 502(7471):327-332. DOI: 10.1038/nature12647

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Devor, A., Bandettini, PA, Boas, DA, Bower, JM, Buxton, RB, Cohen, LB, Dale, AM, Einevoll, GT, Fox, PT, Franceschini, MA, Friston, KJ, Fujimoto, JG, Geyer , MA, Greenberg, JH, Halgren, E., Hämäläinen, MS, Helmchen, F., Hyman, BT, Jasanoff, A., Jernigan, TL, Judd, LL, Kim, SG, Kleinfeld, D., Kopell, NJ , Kutas, M., Kwong, KK, Larkum, ME, Lo, EH, Magistretti, PJ, Mandeville, JB, Masliah, E., Mitra, PP, Mobley, WC, Moskowitz, MA, Nimmerjahn, A., Reynolds, JH, Rosen, BR, Salzberg, BM, Schaffer, CB, Silva, GA, So, PT, Spitzer, NC, Tootell, RB, Van Essen, DC, Vanduffel, W., Vinogradov, SA, Wald, LL, Wang, LV, Weber, B., Yodh, AG O desafio de ligar os pontos no CÉREBRO (2013) Neurônio. 80(2):270-4. DOI: 10.1016/j.neuron.2013.09.008

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Cortes, JM, Desroches, M., Rodrigues, S., Veltz, R., Muñoz, MA, Sejnowski, TJ A plasticidade sináptica de curto prazo no modelo determinístico de Tsodyks-Markram leva a uma dinâmica de rede imprevisível. (2013) Anais da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos da América. 110(41):16610-5. DOI: 10.1073/pnas.1316071110

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Herzog, CD, Brown, L., Kruegel, BR, Wilson, A., Tansey, MG, Gage, FH, Johnson, EM, Bartus, RT Distribuição neurotrófica aprimorada, sinalização celular e neuroproteção após administração de substância negra versus estriatal de AAV2-NRTN (CERE-120). (2013) Neurobiol. Dis. 58:38-48. DOI: 10.1016/j.nbd.2013.04.011

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Aljadeff, J., Segev, R., Berry, MJ, Sharpee, TO Spike desencadeou covariância em estímulos gaussianos fortemente correlacionados. (2013) Biologia Computacional PLOS. 9(9):e1003206. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1003206

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Ruiz, O., Lustig, BR, Nassi, JJ, Cetin, A., Reynolds, JH, Albright, TD, Callaway, EM, Stoner, GR, Roe, AW Optogenética através de janelas no cérebro no primata não humano. (2013) Jornal de Neurofisiologia. 110(6):1455-67. DOI: 10.1152/jn.00153.2013

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Hsu, CC, White, NM, Hayashi, M., Lin, EC, Poon, T., Banerjee, I., Chen, J., Pfaff, SL, Macagno, ER, Dorrestein, PC A espectrometria de massa de cima para baixo da ionização do ambiente de microscopia revela padrões de desenvolvimento. (2013) Anais da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos da América. 110(37):14855-60. DOI: 10.1073/pnas.1310618110

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Timofeev, I., Sejnowski, TJ, Bazhenov, M., Chauvette, S., Grand, LB Dependência da idade da epileptogênese neocortical induzida por trauma. (2013) Fronteiras em Neurociência Celular. 7:154. DOI: 10.3389/fncel.2013.00154

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Tang, X., Zhou, L., Wagner, AM, Marchetto, MC, Muotri, AR, Gage, FH, Chen, G. Células astrogliais regulam a linha do tempo de desenvolvimento de neurônios humanos diferenciados de células-tronco pluripotentes induzidas. (2013) Investigação sobre células estaminais. 11(2):743-57. DOI: 10.1016/j.scr.2013.05.002

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Osakada, F., Callaway, EM Desenho e geração de vetores recombinantes do vírus da raiva. (2013) Protocolos da Natureza. 8(8):1583-1601. DOI: 10.1038/nprot.2013.094

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Lister, R.*, Mukamel, EA, Nery, JR, Urich, M., Puddifoot, CA, Johnson, ND, Lucero, J., Huang, Y., Dwork, AJ, Schultz, MD, Yu, M., Tonti-Filippini, J., Heyn, H., Hu, S., Wu, JC, Rao, A., Esteller, M., He, C., Haghighi, FG, Sejnowski, TJ, Behrens, MM*, Ecker , JR* Reconfiguração epigenômica global durante o desenvolvimento do cérebro de mamíferos. (2013) Ciência. 341(6146):1237905. DOI: 10.1126/science.1237905

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Francius, C., Harris, A., Rucchin, V., Hendricks, TJ, Stam, FJ, Barber, M., Kurek, D., Grosveld, FG, Pierani, A., Goulding, M., Clotman, F . Identificação de múltiplos subconjuntos de interneurônios ventrais e distribuição diferencial ao longo do eixo rostrocaudal da medula espinhal em desenvolvimento. (2013) PLOS Um. 8(8):e70325. DOI: 10.1371/journal.pone.0070325

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Sung, TC, Chen, Z., Thuret, S., Vilar, M., Gage, FH, Riek, R., Lee, KF P45 forma um complexo com FADD e promove a sobrevivência de células neuronais após lesão da medula espinhal. (2013) PLOS Um. 8(7):e69286. DOI: 10.1371/journal.pone.0069286

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Sharpee, TO Identificação computacional de campos receptivos. (2013) Revisão Anual da Neurociência. 36:103-20. DOI: 10.1146/annurev-neuro-062012-170253

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Nienborg, H., Hasenstaub, A., Nauhaus, I., Taniguchi, H., Huang, ZJ, Callaway, EM Dependência de contraste e contribuições diferenciais de neurônios que expressam somatostatina e parvalbumina para integração espacial em camundongo V1. (2013) Journal of Neuroscience. 33(27):11145-11154. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.5320-12.2013

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Wall, NR, De La Parra, M., Callaway, EM, Kreitzer, AC Inervação diferencial de neurônios de projeção estriatal de via direta e indireta. (2013) Neurônio. 79(2):347-360. DOI: 10.1016/j.neuron.2013.05.014

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Sharpee, TO, Kouh, M., Reynolds, JH Trade-off entre ajuste de curvatura e invariância de posição na área visual V4. (2013) Anais da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos da América. 110(28):11618-23. DOI: 10.1073/pnas.1217479110

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Kaardal, J., Fitzgerald, JD, Berry, MJ, Sharpee, TO Identificação de bases funcionais para computações neurais multidimensionais. (2013) Computação Neural. 25(7):1870-90. DOI: 10.1162/NECO_a_00465

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Golomb, BA, Brenner, S., Chalfie, M., Glashow, SL, Glauber, RJ, Hubel, DH, Maskin, ES, Greengard, P., Gross, DJ, Roberts, R., Tonegawa, S., Wilczek , FA, Brown, EM, Sejnowski, TJ Hábitos de chocolate dos ganhadores do prêmio Nobel. (2013) Natureza. 499(7459):409. DOI: 10.1038/499409a


Lainscsek, C., Sejnowski, TJ Classificação do eletrocardiograma usando equações diferenciais de atraso. (2013) Caos. 23(2):023132. DOI: 10.1063/1.4811544

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Nandy, AS, Sharpee, TO, Reynolds, JH, Mitchell, JF A estrutura fina de ajuste de forma na área V4. (2013) Neurônio. 78(6):1102-15. DOI: 10.1016/j.neuron.2013.04.016

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Yu, DX, Marchetto, MC, Gage, FH Tradução terapêutica de iPSCs para o tratamento de doenças neurológicas. (2013) Célula-tronco. 12(6):678-88. DOI: 10.1016/j.stem.2013.05.018

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Vilchez, D., Boyer, L., Lutz, M., Merkwirth, C., Morantte, I., Tse, C., Spencer, B., Page, L., Masliah, E., Berggren, WT, Gage , FH, Dillin, A. FOXO4 é necessário para a diferenciação neural de células-tronco embrionárias humanas. (2013) Célula de Envelhecimento. 12(3):518-22. DOI: 10.1111/acel.12067

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Ji, B., Wang, X., Pinto-Duarte, A., Kim, M., Caldwell, S., Young, JW, Behrens, MM, Sejnowski, TJ, Geyer, MA, Zhou, X. Efeitos prolongados da cetamina em camundongos hipomórficos Sp4: simulando fenótipos de esquizofrenia. (2013) PLOS Um. 8(6):e66327. DOI: 10.1371/journal.pone.0066327

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Chukoskie, L., Snider, J., Mozer, MC, Krauzlis, RJ, Sejnowski, TJ Aprender onde procurar um alvo oculto. (2013) Anais da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos da América. 110 Suplemento: 10438-10445. DOI: 10.1073/pnas.1301216110

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Egawa, N., Kitaoka, S., Tsukita, K., Naitoh, M., Takahashi, K., Yamamoto, T., Adachi, F., Kondo, T., Okita, K., Asaka, I., Aoi, T., Watanabe, A., Yamada, Y., Morizane, A., Takahashi, J., Ayaki, T., Ito, H., Yoshikawa, K., Yamawaki, S., Suzuki, S., Watanabe, D., Hioki, H., Kaneko, T., Makioka, K., Okamoto, K., Takuma, H., Tamaoka, A., Hasegawa, K., Nonaka, T., Hasegawa, M., Kawata, A., Yoshida, M., Nakahata, T., Takahashi, R., Marchetto, MC, Gage, FH, Yamanaka, S., Inoue, H. Resposta ao comentário sobre "Triagem de drogas para ELA usando células-tronco pluripotentes induzidas específicas do paciente". (2013) Medicina Translacional da Ciência. 5(188):188lr2. DOI: 10.1126/scitranslmed.3005697

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Li, Y., Stam, FJ, Aimone, JB, Goulding, M., Callaway, EM, Gage, FH As células associadas ao caminho perfurante da camada molecular contribuem para a inibição de feed-forward no giro denteado adulto. (2013) Anais da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos da América. 110(22):9106-11. DOI: 10.1073/pnas.1306912110

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Stiefel, KM, Englitz, B., Sejnowski, TJ Origem do disparo irregular intrínseco nos interneurônios corticais. (2013) Anais da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos da América. 110(19):7886-7891. DOI: 10.1073/pnas.1305219110

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Gifford, WD, Pfaff, SL, Macfarlan, TS Elementos transponíveis como substratos reguladores genéticos no desenvolvimento inicial. (2013) Tendências em Biologia Celular. 23(5):218-26. DOI: 10.1016/j.tcb.2013.01.001

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Yin, L., Geng, Y., Osakada, F., Sharma, R., Cetin, AH, Callaway, EM, Williams, DR, Merigan, WH Respostas à luz de imagem de células ganglionares da retina no olho de camundongo vivo. (2013) Jornal de Neurofisiologia. 109(9):2415-2421. DOI: 10.1152/jn.01043.2012

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Gire, DH, Restrepo, D., Sejnowski, TJ, Greer, C., De Carlos, JA, Lopez-Mascaraque, L. Processamento temporal no sistema olfativo: podemos ver um cheiro? (2013) Neurônio. 78(3):416-432. DOI: 10.1016/j.neuron.2013.04.033

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Rangel, LM, Quinn, LK, Chiba, AA, Gage, FH, Aimone, JB Uma hipótese para a codificação temporal de células granulares jovens e maduras. (2013) Fronteiras em Neurociência. 7:75. DOI: 10.3389/fnins.2013.00075

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Saremi, S., Sejnowski, TJ, Sharpee, TO Os filtros double-gabor são componentes independentes de pequenas manchas de imagem invariantes à tradução. (2013) Computação Neural. 25(4):922-39. DOI: 10.1162/NECO_a_00418

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Wang, X., Pinto-Duarte, A., Sejnowski, TJ, Behrens, MM Como a NADPH oxidase contendo Nox2 afeta os circuitos corticais no modelo de antagonista do receptor NMDA da esquizofrenia. (2013) Antioxidantes e Sinalização Redox. 18(12):1444-62. DOI: 10.1089/ars.2012.4907

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Jeanne, JM, Sharpee, TO, Gentner, TQ A aprendizagem associativa melhora a codificação da população invertendo os padrões de correlação interneuronal. (2013) Neurônio. 78(2):352-63. DOI: 10.1016/j.neuron.2013.02.023

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Regner, BM, Vučinić, D., Domnisoru, C., Bartol, TM, Hetzer, MW, Tartakovsky, DM, Sejnowski, TJ Difusão anômala de partículas únicas no citoplasma. (2013) Revista Biofísica. 104(8):1652-60. DOI: 10.1016/j.bpj.2013.01.049

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Wang, X., Zhao, Y., Zhang, X., Badie, H., Zhou, Y., Mu, Y., Loo, LS, Cai, L., Thompson, RC, Yang, B., Chen, Y., Johnson, PF, Wu, C., Bu, G., Mobley, WC, Zhang, D., Gage, FH, Ranscht, B., Zhang, YW, Lipton, SA, Hong, W., Xu, H. A perda de classificação da nexina 27 contribui para a disfunção sináptica excitatória modulando a reciclagem do receptor de glutamato na síndrome de Down. (2013) Nature Medicine. 19(4):473-80. DOI: 10.1038/nm.3117

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Deng, W., Mayford, M., Gage, FH Seleção de populações distintas de células granulares dentadas em resposta a entradas como um mecanismo para separação de padrão em camundongos. (2013) Vida. 2:e00312. DOI: 10.7554/eLife.00312

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Hinckley, CA, Pfaff, SL Imagens de conjuntos de neurônios espinhais ativos durante a locomoção com indicadores de cálcio codificados geneticamente. (2013) Ann. NY Acad. Sci. 1279:71-9. DOI: 10.1111/nyas.12092

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Rowe, HM, Kapopoulou, A., Corsinotti, A., Fasching, L., Macfarlan, TS, Tarabay, Y., Viville, S., Jakobsson, J., Pfaff, SL, Trono, D. A repressão TRIM28 de intensificadores baseados em retrotransposon é necessária para preservar a dinâmica da transcrição em células-tronco embrionárias. (2013) Pesquisa do Genoma. 23(3):452-61. DOI: 10.1101/gr.147678.112

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Alivisatos, AP, Andrews, AM, Boyden, ES, Chun, M., Church, GM, Deisseroth, K., Donoghue, JP, Fraser, SE, Lippincott-Schwartz, J., Looger, LL, Masmanidis, S., McEuen, PL, Nurmikko, AV, Park, H., Peterka, DS, Reid, C., Roukes, ML, Scherer, A., Schnitzer, M., Sejnowski, TJ, Shepard, KL, Tsao, D., Turrigiano , G., Weiss, PS, Xu, C., Yuste, R., Zhuang, X. Nanoferramentas para neurociência e mapeamento da atividade cerebral. (2013) ACS Nano. 7(3):1850-66. DOI: 10.1021/nn4012847

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Alivisatos, AP, Chun, M., Church, GM, Deisseroth, K., Donoghue, JP, Greenspan, RJ, McEuen, PL, Roukes, ML, Sejnowski, TJ, Weiss, PS, Yuste, R. Neurociência. O mapa da atividade cerebral. (2013) Ciência. 339(6125):1284-5. DOI: 10.1126/science.1236939


Liang, Y., Franks, TM, Marchetto, MC, Gage, FH, Hetzer, MW Associação dinâmica de NUP98 com o genoma humano. (2013) Genética PLOS. 9(2):e1003308. DOI: 10.1371/journal.pgen.1003308

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Saremi, S., Sejnowski, TJ Modelo hierárquico de imagens naturais e origem da invariância de escala. (2013) Anais da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos da América. 110(8):3071-3076. DOI: 10.1073/pnas.1222618110

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Tanaka, H., Sejnowski, TJ Computação da dinâmica de alcance no córtex motor com coordenadas espaciais cartesianas. (2013) Jornal de Neurofisiologia. 109(4):1182-1201. DOI: 10.1152/jn.00279.2012

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Kinney, JP, Spacek, J., Bartol, TM, Bajaj, CL, Harris, KM, Sejnowski, TJ Folhas e túneis extracelulares modulam a difusão do glutamato no neurópilo do hipocampo. (2013) Jornal de Neurologia Comparativa. 521(2):448-464. DOI: 10.1002/cne.23181

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Srinivasan, L., Asaad, WF, Ginat, DT, Gale, JT, Dougherty, DD, Williams, ZM, Sejnowski, TJ, Eskandar, EN Iniciação da ação no córtex cingulado anterior dorsal humano. (2013) PLOS Um. 8(2):e55247. DOI: 10.1371/journal.pone.0055247

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Shimozaki, K., Clemenson, GD, Gage, FH A proteína 1 homeobox relacionada pareada é um regulador de stemness em células-tronco/progenitoras neurais adultas. (2013) Journal of Neuroscience. 33(9):4066-75. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.4586-12.2013

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Volman, V., Bazhenov, M., Sejnowski, TJ Divida e conquiste: a segregação funcional de entradas sinápticas por microdomínios astrocíticos pode aliviar a atividade paroxística após trauma cerebral. (2013) Biologia Computacional PLOS. 9(1):e1002856. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002856

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Kurian, L., Sancho-Martinez, I., Nivet, E., Aguirre, A., Moon, K., Pendaries, C., Volle-Challier, C., Bono, F., Herbert, JM, Pulecio, J., Xia, Y., Li, M., Montserrat, N., Ruiz, S., Dubova, I., Rodriguez, C., Denli, AM, Boscolo, FS, Thiagarajan, RD, Gage, FH, Loring , JF, Laurent, LC, Izpisua Belmonte, JC Conversão de fibroblastos humanos em células progenitoras semelhantes a angioblastos. (2013) Métodos da natureza. 10(1):77-83. DOI: 10.1038/nmeth.2255

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