Centro Avançado de Biofotônica Waitt

Pesquisa

Salk Institute for Biological Studies - Waitt Advanced Biophotonics Center - Research

PUBLICAÇÕES 2022


todas as publicações


Herdy, JR, Traxler, L., Agarwal, RK, Karbacher, L., Schlachetzki, JCM, Boehnke, L., Zangwill, D., Galasko, D., Glass, CK, Mertens, J., Gage, FH O aumento da senescência pós-mitótica em neurônios humanos envelhecidos é uma característica patológica da doença de Alzheimer. (2022) Célula-tronco. 29(12):1637-1652.e6. DOI: 10.1016/j.stem.2022.11.010

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Fu, C., Ngo, J., Zhang, S., Lu, L., Miron, A., Schafer, S., Gage, FH, Jin, F., Schumacher, FR, Wynshaw-Boris, A. Nova análise correlativa identifica múltiplas variações genômicas que impactam o TEA com macrocefalia. (2022) Genética Molecular Humana. DOI: 10.1093/hmg/ddac300

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Ronzano, R., Skarlatou, S., Barriga, BK, Bannatyne, BA, Bhumbra, GS, Foster, JD, Moore, JD, Lancelin, C., Pocratsky, AM, Özyurt, MG, Smith, CC, Todd, AJ , Maxwell, DJ, Murray, AJ, Pfaff, SL, Brownstone, RM, Zampieri, N., Beato, M. Os interneurônios pré-motores espinhais que controlam os músculos antagonistas estão espacialmente misturados. (2022) Vida. 11. DOI: 10.7554/eLife.81976

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Wilson, MN, Thunemann, M., Liu, X., Lu, Y., Puppo, F., Adams, JW, Kim, JH, Ramezani, M., Pizzo, DP, Djurovic, S., Andreassen, OA, Mansour, AA, Gage, FH, Muotri, AR, Devor, A., Kuzum, D. O monitoramento multimodal de organoides corticais humanos implantados em camundongos revela conexão funcional com o córtex visual. (2022) Nature Communications. 13(1):7945. DOI: 10.1038/s41467-022-35536-3

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Zhang, H., Rich, PD, Lee, AK, Sharpee, TO As representações espaciais do hipocampo exibem uma geometria hiperbólica que se expande com a experiência. (2022) Nature Neuroscience. DOI: 10.1038/s41593-022-01212-4

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Rungratsameetaweemana, N., Lainscsek, C., Cash, SS, Garcia, JO, Sejnowski, TJ, Bansal, K. A dinâmica da rede cerebral codifica a heterogeneidade na evolução das crises. (2022) Cérebro Comun. 4(5):fcac234. DOI: 10.1093/braincomms/fcac234

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Linker, SB, Narvaiza, I., Hsu, JY, Wang, M., Qiu, F., Mendes, APD, Oefner, R., Kottilil, K., Sharma, A., Randolph-Moore, L., Mejia , E., Santos, R., Marchetto, MC, Gage, FH Regulação específica do ser humano da maturação neural identificada por transcriptômica cruzada de primatas. (2022) Biologia atual. DOI: 10.1016 / j.cub.2022.09.028

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Martins, LF, Brambilla, I., Motta, A., de Pretis, S., Bhat, GP, Badaloni, A., Malpighi, C., Amin, ND, Imai, F., Almeida, RD, Yoshida, Y ., Pfaff, SL, Bonanomi, D. Os neurônios motores usam sinais push-pull para direcionar a remodelação vascular, crítica para sua conectividade. (2022) Neurônio. DOI: 10.1016 / j.neuron.2022.09.021

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van den Hurk, M., Lau, S., Marchetto, MC, Mertens, J., Stern, S., Corti, O., Brice, A., Winner, B., Winkler, J., Gage, FH, Bardi, C. Vias transcriptômicas drogáveis ​​reveladas em neurônios do mesencéfalo derivados de pacientes com Parkinson. (2022) Distúrbio de Parkinson NPJ. 8(1):134. DOI: 10.1038/s41531-022-00400-0

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Li, P., Garg, AK, Zhang, LA, Rashid, MS, Callaway, EM Os domínios funcionais oponentes do cone no córtex visual primário combinam sinais para mecanismos de aparência de cores. (2022) Nature Communications. 13(1):6344. DOI: 10.1038/s41467-022-34020-2

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Wang, H., Dey, O., Lagos, WN, Callaway, EM Diversidade na frequência espacial, frequência temporal e ajuste de velocidade nas áreas e camadas corticais visuais do mouse. (2022) Jornal de Neurologia Comparativa. DOI: 10.1002/cne.25404

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Pașca, SP, Arlotta, P., Bateup, HS, Camp, JG, Cappello, S., Gage, FH, Knoblich, JA, Kriegstein, AR, Lancaster, MA, Ming, GL, Muotri, AR, Park, IH, Reiner, O., Song, H., Studer, L., Temple, S., Testa, G., Treutlein, B., Vaccarino, FM Um consenso de nomenclatura para organóides e assembóides do sistema nervoso. (2022) Natureza. 609(7929):907-910. DOI: 10.1038/s41586-022-05219-6

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Stern, S., Lau, S., Manole, A., Rosh, I., Percia, MM, Ben Ezer, R., Shokhirev, MN, Qiu, F., Schafer, S., Mansour, AA, Mangan, KP, Stern, T., Ofer, P., Stern, Y., Diniz Mendes, AP, Djamus, J., Moore, LR, Nayak, R., Laufer, SH, Aicher, A., Rhee, A., Wong, TL, Nguyen, T., Linker, SB, Winner, B., Freitas, BC, Jones, E., Sagi, I., Bardy, C., Brice, A., Winkler, J., Marchetto, MC , Medidor, FH Atividade sináptica reduzida e vias da matriz extracelular desreguladas em neurônios do mesencéfalo de pacientes com doença de Parkinson. (2022) Distúrbio de Parkinson NPJ. 8(1):103. DOI: 10.1038/s41531-022-00366-z

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Traxler, L., Herdy, JR, Stefanoni, D., Eichhorner, S., Pelucchi, S., Szücs, A., Santagostino, A., Kim, Y., Agarwal, RK, Schlachetzki, JCM, Glass, CK , Lagerwall, J., Galasko, D., Gage, FH, D'Alessandro, A., Mertens, J. A transformação metabólica semelhante a Warburg está subjacente à degeneração neuronal na doença de Alzheimer esporádica. (2022) Metabolismo celular. DOI: 10.1016 / j.cmet.2022.07.014

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Ghaninia, M., Zhou, Y., Knauer, AC, Schiestl, FP, Sharpee, TO, Smith, BH Misturas hiperbólicas de odorantes como base para uma sinalização mais eficiente entre plantas com flores e abelhas. (2022) PLOS Um. 17(7):e0270358. DOI: 10.1371/journal.pone.0270358

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van Niekerk, EA, Kawaguchi, R., Marques de Freria, C., Groeniger, K., Marchetto, MC, Dupraz, S., Bradke, F., Geschwind, DH, Gage, FH, Tuszynski, MH Métodos para cultivar neurônios adultos do SNC revelam um efeito de condicionamento do SNC. (2022) Métodos de representação celular. 2(7):100255. DOI: 10.1016/j.crmeth.2022.100255

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Bae, T., Fasching, L., Wang, Y., Shin, JH, Suvakov, M., Jang, Y., Norton, S., Dias, C., Mariani, J., Jourdon, A., Wu , F., Panda, A., Pattni, R., Chahine, Y., Yeh, R., Roberts, RC, Huttner, A., Kleinman, JE, Hyde, TM, Straub, RE, Walsh, CA, , Urban, AE, Leckman, JF, Weinberger, DR, Vaccarino, FM, Abyzov, A., Walsh, CA, Park, PJ, Sestan, N., Weinberger, D., Moran, JV, Gage, FH, Vaccarino, FM , Gleeson, J., Mathern, G., Courchesne, E., Roy, S., Chess, AJ, Akbarian, S., Bizzotto, S., Coulter, M., Dias, C., D'Gama, A ., Ganz, J., Hill, R., Huang, AY, Khoshkhoo, S., Kim, S., Lee, A., Lodato, M., Maury, EA, Miller, M., Borges-Monroy, R ., Rodin, R., Zhou, Z., Bohrson, C., Chu, C., Cortes-Ciriano, I., Dou, Y., Galor, A., Gulhan, D., Kwon, M., Luquette , J., Sherman, M., Viswanadham, V., Jones, A., Rosenbluh, C., Cho, S., Langmead, B., Thorpe, J., Erwin, J., Jaffe, A., McConnell , M., Narurkar, R., Paquola, A., Shin, J., Straub, R., Abyzov, A., Bae, T., Jang, Y., Wang, Y., Molitor, C., Peters , M., Linker, S., Reed, P., Wang, M., Urban, A., Zhou, B., Zhu, X., Pattni, R., Serres Amero, A., Juan, D., Lobon, I., Marques-Bonet, T., Solis Moruno, M., Garcia Perez, R., Povolotskaya, I., Soriano, E., Antaki, D., Averbuj, D., Ball, L., Breuss , M., Yang, X., Chung, C., Emery, SB, Flasch, DA, Kidd, JM, Kopera, HC, Kwan, KY, Mills, RE, Moldovan, JB, Sun, C., Zhao, X ., Zhou, W., Frisbie, TJ, Cherskov, A., Fasching, L., Jourdon, A., Pochareddy, S., Scuderi, S. A análise de mutações somáticas em 131 cérebros humanos revela hipermutabilidade associada ao envelhecimento. (2022) Ciência. 377(6605):511-517. DOI: 10.1126/science.abm6222

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Lecoin, L., Dempsey, B., Garancher, A., Bourane, S., Ruffault, PL, Morin-Surun, MP, Rocques, N., Goulding, M., Eychène, A., Pouponnot, C., Fortin, G., Champagnat, J. A atividade GABAérgica dependente de Mafa promove apnéias neonatais em camundongos. (2022) Nature Communications. 13(1):3284. DOI: 10.1038/s41467-022-30825-3

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Ward, S., Riley, C., Carey, EM, Nguyen, J., Esener, S., Nimmerjahn, A., Sirbuly, DJ Microsondas coaxiais eletro-ópticas mecanicamente flexíveis para interface minimamente invasiva com circuitos neurais intrínsecos. (2022) Nature Communications. 13(1):3286. DOI: 10.1038/s41467-022-30275-x

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Zhang, Y., Roy, DS, Zhu, Y., Chen, Y., Aida, T., Hou, Y., Shen, C., Lea, NE, Schroeder, ME, Skaggs, KM, Sullivan, HA, Fischer, KB, Callaway, EM, Wickersham, IR, Dai, J., Li, XM, Lu, Z., Feng, G. O direcionamento de circuitos talâmicos resgata déficits motores e de humor em camundongos com DP. (2022) Natureza. DOI: 10.1038 / s41586-022-04806-x

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Chen, Y., Rosen, BQ, Sejnowski, TJ A covariância diferencial dinâmica recupera a estrutura de rede direcional em sistemas neurais multiescala. (2022) Anais da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos da América. 119(24):e2117234119. DOI: 10.1073/pnas.2117234119

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Grün, S., Li, J., McNaughton, B., Petersen, C., McCormick, D., Robson, D., Buzsáki, G., Harris, K., Sejnowski, T., Mrsic-Flogel, T ., Linden, H., Roland, PE Princípios emergentes do espaço-tempo no cérebro: Relatório de reunião sobre neurodinâmica espacial. (2022) Neurônio. 110(12):1894-1898. DOI: 10.1016/j.neuron.2022.05.018

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Chen, Y., Bukhari, Q., Lin, TW, Sejnowski, TJ Conectividade funcional de fMRI usando covariância diferencial prevê conectividade estrutural e tempos de reação comportamental. (2022) Neurociência em rede. 6(2):614-633. DOI: 10.1162/netn_a_00239

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Zhou, Y., Sharpee, TO Usando t-SNE Global para Preservar a Estrutura de Dados Intercluster. (2022) Computação Neural.:1-15 DOI: 10.1162/neco_a_01504

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Tadokoro, T., Bravo-Hernandez, M., Agashkov, K., Kobayashi, Y., Platoshyn, O., Navarro, M., Marsala, S., Miyanohara, A., Yoshizumi, T., Shigyo, M. ., Krotov, V., Juhas, S., Juhasova, J., Nguyen, D., Skalnikova, HK, Motlik, J., Studenovska, H., Proks, V., Reddy, R., Driscoll, SP, Glenn, TD, Kemthong, T., Malaivijitnond, S., Tomori, Z., Vanicky, I., Kakinohana, M., Pfaff, SL, Ciacci, J., Belan, P., Marsala, M. Interruptor funcional induzido pela entrega de genes espinhais de precisão em neurônios nociceptivos reverte a dor neuropática. (2022) Terapia Molecular. DOI: 10.1016/j.ymthe.2022.04.023

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Garcia, JW, Bartol, TM, Sejnowski, TJ Modelagem multiescala da dinâmica pré-sináptica de molecular a mesoescala. (2022) Biologia Computacional PLOS. 18(5):e1010068. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1010068

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Li, J., Pinto-Duarte, A., Zander, M., Cuoco, MS, Lai, CY, Osteen, J., Fang, L., Luo, C., Lucero, JD, Gomez-Castanon, R. , Nery, JR, Silva-Garcia, I., Pang, Y., Sejnowski, TJ, Powell, SB, Ecker, JR, Mukamel, EA, Behrens, MM O nocaute de Dnmt3a em neurônios excitatórios prejudica a maturação da sinapse pós-natal e aumenta a modificação repressiva da histona H3K27me3. (2022) Vida. 11. DOI: 10.7554/eLife.66909

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Patiño, M., Lagos, WN, Patne, NS, Tasic, B., Zeng, H., Callaway, EM Classificação transcriptômica unicelular de neurônios corticais infectados pela raiva. (2022) Anais da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos da América. 119(22):e2203677119. DOI: 10.1073/pnas.2203677119

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Oliinyk, OS, Baloban, M., Clark, CL, Carey, E., Pletnev, S., Nimmerjahn, A., Verkhusha, VV Proteína de infravermelho próximo de domínio único fornece um andaime para nanocorpos fluorescentes dependentes de antígeno. (2022) Métodos da natureza. DOI: 10.1038/s41592-022-01467-6

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Nimmerjahn, A., Hirrlinger, J. Regulação dos astrócitos da função do circuito neural e comportamento animal. (2022) Glia. DOI: 10.1002/glia.24223


Shi, Y., Evans, RM, Gage, FH O ácido oleico regula a neurogênese do hipocampo como um ligante TLX. (2022) Anais da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos da América. 119(15):e2203038119. DOI: 10.1073/pnas.2203038119

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Amin, ND, Senturk, G., Hayashi, M., Driscoll, SP, Pfaff, SL Detecção de efeitos regulatórios de genes mediados por microRNA em subpopulações neuronais murinas. (2022) Protocolo STAR. 3(1):101130. DOI: 10.1016/j.xpro.2022.101130

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Cook, JR, Li, H., Nguyen, B., Huang, HH, Mahdavian, P., Kirchgessner, MA, Strassmann, P., Engelhardt, M., Callaway, EM, Jin, X. O córtex auditivo secundário medeia um mecanismo sensório-motor para o tempo de ação. (2022) Nature Neuroscience. 25(3):330-344. DOI: 10.1038/s41593-022-01025-5

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Hirrlinger, J., Nimmerjahn, A. Uma perspectiva sobre a regulação dos astrócitos da função do circuito neural e do comportamento animal. (2022) Glia. DOI: 10.1002/glia.24168

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Zhang, Z., Cisneros, E., Lee, HY, Vu, JP, Chen, Q., Benadof, CN, Whitehill, J., Rouzbehani, R., Sy, DT, Huang, JS, Sejnowski, TJ, Jankovic , J., Factor, S., Goetz, CG, Barbano, RL, Perlmutter, JS, Jinnah, HA, Berman, BD, Richardson, SP, Stebbins, GT, Comella, CL, Peterson, DA Mantenha essa pose: capturando a gravidade do desvio da cabeça da distonia cervical do vídeo. (2022) Ann Clin Transl Neurol. DOI: 10.1002/acn3.51549

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Budzinski, RC, Nguyen, TT, Đoàn, J., Mináč, J., Sejnowski, TJ, Muller, LE A geometria une sincronia, quimeras e ondas em redes de osciladores não lineares. (2022) Caos. 32(3):031104. DOI: 10.1063/5.0078791

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Nowotny, T., van Albada, SJ, Fellous, JM, Haas, JS, Jolivet, RB, Metzner, C., Sharpee, T. Editorial: Avanços em Neurociência Computacional. (2022) Fronteiras em Neurociência Computacional. 15:824899. DOI: 10.3389/fncom.2021.824899


Abdelfattah, AS, Ahuja, S., Akkin, T., Allu, SR, Brake, J., Boas, DA, Buckley, EM, Campbell, RE, Chen, AI, Cheng, X., Čižmár, T., Costantini , I., De Vittorio, M., Devor, A., Doran, PR, El Khatib, M., Emiliani, V., Fomin-Thunemann, N., Fainman, Y., Fernandez-Alfonso, T., Ferri , CGL, Gilad, A., Han, X., Harris, A., Hillman, EMC, Hochgeschwender, U., Holt, MG, Ji, N., Kılıç, K., Lake, EMR, Li, L., Li, T., Mächler, P., Miller, EW, Mesquita, RC, Nadella, KMNS, Nägerl, UV, Nasu, Y., Nimmerjahn, A., Ondráčková, P., Pavone, FS, Perez Campos, C. , Peterka, DS, Pisano, F., Pisanello, F., Puppo, F., Sabatini, BL, Sadegh, S., Sakadzic, S., Shoham, S., Shroff, SN, Silver, RA, Sims, RR , Smith, SL, Srinivasan, VJ, Thunemann, M., Tian, ​​L., Tian, ​​L., Troxler, T., Valera, A., Vaziri, A., Vinogradov, SA, Vitale, F., Wang, LV, Uhlířová, H., Xu, C., Yang, C., Yang, MH, Yellen, G., Yizhar, O., Zhao, Y. Ferramentas neurofotônicas para medições e manipulação microscópicas: relatório de status. (2022) Neurofotônica. 9(Supl 1):013001. DOI: 10.1117/1.NPh.9.S1.013001

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