Waitt Advanced Biophotonics Center

Forschung

Salk Institute for Biological Studies – Waitt Advanced Biophotonics Center – Forschung

PUBLIKATIONEN 2022


alle Veröffentlichungen


Herdy, JR, Traxler, L., Agarwal, RK, Karbacher, L., Schlachetzki, JCM, Boehnke, L., Zangwill, D., Galasko, D., Glass, CK, Mertens, J., Gage, FH Eine erhöhte postmitotische Seneszenz in gealterten menschlichen Neuronen ist ein pathologisches Merkmal der Alzheimer-Krankheit. (2022) Cell Stammzelle. 29(12):1637-1652.e6. DOI: 10.1016/j.stem.2022.11.010

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Fu, C., Ngo, J., Zhang, S., Lu, L., Miron, A., Schafer, S., Gage, FH, Jin, F., Schumacher, FR, Wynshaw-Boris, A. Neuartige Korrelationsanalyse identifiziert mehrere genomische Variationen, die ASD mit Makrozephalie beeinflussen. (2022) Humane Molekulargenetik. DOI: 10.1093/hmg/ddac300

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Ronzano, R., Skarlatou, S., Barriga, BK, Bannatyne, BA, Bhumbra, GS, Foster, JD, Moore, JD, Lancelin, C., Pocratsky, AM, Özyurt, MG, Smith, CC, Todd, AJ , Maxwell, DJ, Murray, AJ, Pfaff, SL, Brownstone, RM, Zampieri, N., Beato, M. Prämotorische Interneurone der Wirbelsäule, die antagonistische Muskeln steuern, sind räumlich vermischt. (2022) Elife. 11. DOI: 10.7554/eLife.81976

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Wilson, MN, Thunemann, M., Liu, X., Lu, Y., Puppo, F., Adams, JW, Kim, JH, Ramezani, M., Pizzo, DP, Djurovic, S., Andreassen, OA, Mansour, AA, Gage, FH, Muotri, AR, Devor, A., Kuzum, D. Multimodale Überwachung menschlicher kortikaler Organoide, die Mäusen implantiert wurden, zeigt funktionellen Zusammenhang mit dem visuellen Kortex. (2022) Nature Communications. 13(1):7945. DOI: 10.1038/s41467-022-35536-3

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Zhang, H., Rich, PD, Lee, AK, Sharpee, TO Die räumlichen Darstellungen des Hippocampus weisen eine hyperbolische Geometrie auf, die sich mit der Erfahrung erweitert. (2022) Nature Neurologie. DOI: 10.1038/s41593-022-01212-4

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Rungratsameetaweemana, N., Lainscsek, C., Cash, SS, Garcia, JO, Sejnowski, TJ, Bansal, K. Die Dynamik des Gehirnnetzwerks kodifiziert die Heterogenität in der Anfallsentwicklung. (2022) Gehirnkommun. 4(5):fcac234. DOI: 10.1093/braincomms/fcac234

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Linker, SB, Narvaiza, I., Hsu, JY, Wang, M., Qiu, F., Mendes, APD, Oefner, R., Kottilil, K., Sharma, A., Randolph-Moore, L., Mejia , E., Santos, R., Marchetto, MC, Gage, FH Menschenspezifische Regulierung der neuralen Reifung, identifiziert durch Cross-Primaten-Transkriptomik. (2022) Aktuelle Biologie DOI: 10.1016/j.cub.2022.09.028

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Martins, LF, Brambilla, I., Motta, A., de Pretis, S., Bhat, GP, Badaloni, A., Malpighi, C., Amin, ND, Imai, F., Almeida, RD, Yoshida, Y ., Pfaff, SL, Bonanomi, D. Motoneuronen nutzen Push-Pull-Signale, um den Gefäßumbau zu steuern, der für ihre Konnektivität entscheidend ist. (2022) Neuron. DOI: 10.1016 / j.neuron.2022.09.021

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van den Hurk, M., Lau, S., Marchetto, MC, Mertens, J., Stern, S., Corti, O., Brice, A., Winner, B., Winkler, J., Gage, FH, Bardy, C. Mit Medikamenten behandelbare transkriptomische Wege, die in von Parkinson-Patienten stammenden Mittelhirnneuronen entdeckt wurden. (2022) NPJ Parkinsons Dis. 8(1):134. DOI: 10.1038/s41531-022-00400-0

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Li, P., Garg, AK, Zhang, LA, Rashid, MS, Callaway, EM Funktionsdomänen des Zapfengegners im primären visuellen Kortex kombinieren Signale für Farberscheinungsmechanismen. (2022) Nature Communications. 13(1):6344. DOI: 10.1038/s41467-022-34020-2

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Wang, H., Dey, O., Lagos, WN, Callaway, EM Vielfalt in der räumlichen Frequenz, der zeitlichen Frequenz und der Geschwindigkeitsabstimmung in den visuellen kortikalen Bereichen und Schichten der Maus. (2022) Journal für vergleichende Neurologie. DOI: 10.1002/cne.25404

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Pașca, SP, Arlotta, P., Bateup, HS, Camp, JG, Cappello, S., Gage, FH, Knoblich, JA, Kriegstein, AR, Lancaster, MA, Ming, GL, Muotri, AR, Park, IH, Reiner, O., Song, H., Studer, L., Temple, S., Testa, G., Treutlein, B., Vaccarino, FM Ein Nomenklaturkonsens für Organoide und Assembloide des Nervensystems. (2022) Natur. 609(7929):907-910. DOI: 10.1038/s41586-022-05219-6

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Stern, S., Lau, S., Manole, A., Rosh, I., Percia, MM, Ben Ezer, R., Shokhirev, MN, Qiu, F., Schafer, S., Mansour, AA, Mangan, KP, Stern, T., Ofer, P., Stern, Y., Diniz Mendes, AP, Djamus, J., Moore, LR, Nayak, R., Laufer, SH, Aicher, A., Rhee, A., Wong, TL, Nguyen, T., Linker, SB, Winner, B., Freitas, BC, Jones, E., Sagi, I., Bardy, C., Brice, A., Winkler, J., Marchetto, MC , Gage, FH Reduzierte synaptische Aktivität und fehlregulierte extrazelluläre Matrixbahnen in Mittelhirnneuronen von Parkinson-Patienten. (2022) NPJ Parkinsons Dis. 8(1):103. DOI: 10.1038/s41531-022-00366-z

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Traxler, L., Herdy, JR, Stefanoni, D., Eichhorner, S., Pelucchi, S., Szücs, A., Santagostino, A., Kim, Y., Agarwal, RK, Schlachetzki, JCM, Glass, CK , Lagerwall, J., Galasko, D., Gage, FH, D'Alessandro, A., Mertens, J. Eine Warburg-ähnliche Stoffwechseltransformation liegt der neuronalen Degeneration bei sporadischer Alzheimer-Krankheit zugrunde. (2022) Zellstoffwechsel DOI: 10.1016 / j.cmet.2022.07.014

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Ghaninia, M., Zhou, Y., Knauer, AC, Schiestl, FP, Sharpee, TO, Smith, BH Hyperbolische Duftstoffmischungen als Grundlage für eine effizientere Signalübertragung zwischen Blütenpflanzen und Bienen. (2022) Plus eins. 17(7):e0270358. DOI: 10.1371/journal.pone.0270358

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van Niekerk, EA, Kawaguchi, R., Marques de Freria, C., Groeniger, K., Marchetto, MC, Dupraz, S., Bradke, F., Geschwind, DH, Gage, FH, Tuszynski, MH Methoden zur Kultivierung erwachsener ZNS-Neuronen zeigen einen ZNS-Konditionierungseffekt. (2022) Cell Rep-Methoden. 2(7):100255. DOI: 10.1016/j.crmeth.2022.100255

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Bae, T., Fasching, L., Wang, Y., Shin, JH, Suvakov, M., Jang, Y., Norton, S., Dias, C., Mariani, J., Jourdon, A., Wu , F., Panda, A., Pattni, R., Chahine, Y., Yeh, R., Roberts, RC, Huttner, A., Kleinman, JE, Hyde, TM, Straub, RE, Walsh, CA, , Urban, AE, Leckman, JF, Weinberger, DR, Vaccarino, FM, Abyzov, A., Walsh, CA, Park, PJ, Sestan, N., Weinberger, D., Moran, JV, Gage, FH, Vaccarino, FM , Gleeson, J., Mathern, G., Courchesne, E., Roy, S., Chess, AJ, Akbarian, S., Bizzotto, S., Coulter, M., Dias, C., D'Gama, A ., Ganz, J., Hill, R., Huang, AY, Khoshkhoo, S., Kim, S., Lee, A., Lodato, M., Maury, EA, Miller, M., Borges-Monroy, R ., Rodin, R., Zhou, Z., Bohrson, C., Chu, C., Cortes-Ciriano, I., Dou, Y., Galor, A., Gulhan, D., Kwon, M., Luquette , J., Sherman, M., Viswanadham, V., Jones, A., Rosenbluh, C., Cho, S., Langmead, B., Thorpe, J., Erwin, J., Jaffe, A., McConnell , M., Narurkar, R., Paquola, A., Shin, J., Straub, R., Abyzov, A., Bae, T., Jang, Y., Wang, Y., Molitor, C., Peters , M., Linker, S., Reed, P., Wang, M., Urban, A., Zhou, B., Zhu, X., Pattni, R., Serres Amero, A., Juan, D., Lobon, I., Marques-Bonet, T., Solis Moruno, M., Garcia Perez, R., Povolotskaya, I., Soriano, E., Antaki, D., Averbuj, D., Ball, L., Breuss , M., Yang, X., Chung, C., Emery, SB, Flasch, DA, Kidd, JM, Kopera, HC, Kwan, KY, Mills, RE, Moldovan, JB, Sun, C., Zhao, ., Zhou, W., Frisbie, TJ, Cherskov, A., Fasching, L., Jourdon, A., Pochareddy, S., Scuderi, S. Die Analyse somatischer Mutationen in 131 menschlichen Gehirnen zeigt altersbedingte Hypermutabilität. (2022) Science. 377(6605):511-517. DOI: 10.1126/science.abm6222

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Lecoin, L., Dempsey, B., Garancher, A., Bourane, S., Ruffault, PL, Morin-Surun, MP, Rocques, N., Goulding, M., Eychène, A., Pouponnot, C., Fortin, G., Champagnat, J. Mafa-abhängige GABAerge Aktivität fördert neonatale Apnoen bei Mäusen. (2022) Nature Communications. 13(1):3284. DOI: 10.1038/s41467-022-30825-3

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Ward, S., Riley, C., Carey, EM, Nguyen, J., Esener, S., Nimmerjahn, A., Sirbuly, DJ Elektrooptische, mechanisch flexible koaxiale Mikrosonden für die minimalinvasive Anbindung an intrinsische neuronale Schaltkreise. (2022) Nature Communications. 13(1):3286. DOI: 10.1038/s41467-022-30275-x

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Zhang, Y., Roy, DS, Zhu, Y., Chen, Y., Aida, T., Hou, Y., Shen, C., Lea, NE, Schroeder, ME, Skaggs, KM, Sullivan, HA, Fischer, KB, Callaway, EM, Wickersham, IR, Dai, J., Li, XM, Lu, Z., Feng, G. Die gezielte Behandlung von Thalamusschaltkreisen behebt motorische und stimmungsbedingte Defizite bei PD-Mäusen. (2022) Natur. DOI: 10.1038 / s41586-022-04806-x

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Chen, Y., Rosen, BQ, Sejnowski, TJ Die dynamische differenzielle Kovarianz stellt die gerichtete Netzwerkstruktur in neuronalen Systemen mit mehreren Maßstäben wieder her. (2022) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 119(24):e2117234119. DOI: 10.1073/pnas.2117234119

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Grün, S., Li, J., McNaughton, B., Petersen, C., McCormick, D., Robson, D., Buzsáki, G., Harris, K., Sejnowski, T., Mrsic-Flogel, T ., Lindén, H., Roland, PE Neue Prinzipien der Raumzeit im Gehirn: Tagungsbericht über räumliche Neurodynamik. (2022) Neuron. 110(12):1894-1898. DOI: 10.1016/j.neuron.2022.05.018

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Chen, Y., Bukhari, Q., Lin, TW, Sejnowski, TJ Die funktionale Konnektivität von fMRT mithilfe der differentiellen Kovarianz sagt strukturelle Konnektivität und Verhaltensreaktionszeiten voraus. (2022) Netzwerkneurowissenschaften. 6(2):614-633. DOI: 10.1162/netn_a_00239

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Zhou, Y., Sharpee, TO Verwendung von Global t-SNE zur Erhaltung der Intercluster-Datenstruktur. (2022) Neuronale Berechnung.:1-15 DOI: 10.1162/neco_a_01504

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Tadokoro, T., Bravo-Hernandez, M., Agashkov, K., Kobayashi, Y., Platoshyn, O., Navarro, M., Marsala, S., Miyanohara, A., Yoshizumi, T., Shigyo, M ., Krotov, V., Juhas, S., Juhasova, J., Nguyen, D., Skalnikova, HK, Motlik, J., Studenovska, H., Proks, V., Reddy, R., Driscoll, SP, Glenn, TD, Kemthong, T., Malaivijitnond, S., Tomori, Z., Vanicky, I., Kakinohana, M., Pfaff, SL, Ciacci, J., Belan, P., Marsala, M. Ein präziser, durch die Genabgabe der Wirbelsäule induzierter funktioneller Schalter in nozizeptiven Neuronen kehrt neuropathische Schmerzen um. (2022) Molekulare Therapie. DOI: 10.1016/j.ymthe.2022.04.023

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Garcia, JW, Bartol, TM, Sejnowski, TJ Multiskalenmodellierung der präsynaptischen Dynamik von der molekularen bis zur mesoskaligen Ebene. (2022) PLOS Computational Biology. 18(5):e1010068. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1010068

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Li, J., Pinto-Duarte, A., Zander, M., Cuoco, MS, Lai, CY, Osteen, J., Fang, L., Luo, C., Lucero, JD, Gomez-Castanon, R. , Nery, JR, Silva-Garcia, I., Pang, Y., Sejnowski, TJ, Powell, SB, Ecker, JR, Mukamel, EA, Behrens, MM Dnmt3a-Knockout in erregenden Neuronen beeinträchtigt die postnatale Synapsenreifung und erhöht die repressive Histonmodifikation H3K27me3. (2022) Elife. 11. DOI: 10.7554/eLife.66909

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Patiño, M., Lagos, WN, Patne, NS, Tasic, B., Zeng, H., Callaway, EM Einzelzell-Transkriptomklassifizierung tollwutinfizierter kortikaler Neuronen. (2022) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 119(22):e2203677119. DOI: 10.1073/pnas.2203677119

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Oliinyk, OS, Baloban, M., Clark, CL, Carey, E., Pletnev, S., Nimmerjahn, A., Verkhusha, VV Nahinfrarot-Einzeldomänenprotein bildet ein Gerüst für antigenabhängige fluoreszierende Nanokörper. (2022) Naturmethoden. DOI: 10.1038/s41592-022-01467-6

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Nimmerjahn, A., Hirrlinger, J. Astrozytenregulierung der Funktion neuronaler Schaltkreise und des Verhaltens von Tieren. (2022) Glia. DOI: 10.1002/glia.24223


Shi, Y., Evans, RM, Gage, FH Ölsäure reguliert als TLX-Ligand die Neurogenese des Hippocampus. (2022) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 119(15):e2203038119. DOI: 10.1073/pnas.2203038119


Amin, ND, Senturk, G., Hayashi, M., Driscoll, SP, Pfaff, SL Nachweis von microRNA-vermittelten Genregulationseffekten in murinen neuronalen Subpopulationen. (2022) STAR-Protokoll. 3(1):101130. DOI: 10.1016/j.xpro.2022.101130

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Cook, JR, Li, H., Nguyen, B., Huang, HH, Mahdavian, P., Kirchgessner, MA, Strassmann, P., Engelhardt, M., Callaway, EM, Jin, X. Der sekundäre auditorische Kortex vermittelt einen sensomotorischen Mechanismus für die zeitliche Abstimmung von Aktionen. (2022) Nature Neurologie. 25(3):330-344. DOI: 10.1038/s41593-022-01025-5

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Hirrlinger, J., Nimmerjahn, A. Eine Perspektive auf die Regulierung der Funktion neuronaler Schaltkreise und des Verhaltens von Tieren durch Astrozyten. (2022) Glia. DOI: 10.1002/glia.24168

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Zhang, Z., Cisneros, E., Lee, HY, Vu, JP, Chen, Q., Benadof, CN, Whitehill, J., Rouzbehani, R., Sy, DT, Huang, JS, Sejnowski, TJ, Jankovic , J., Factor, S., Goetz, CG, Barbano, RL, Perlmutter, JS, Jinnah, HA, Berman, BD, Richardson, SP, Stebbins, GT, Comella, CL, Peterson, DA Halten Sie diese Pose: Erfassen Sie den Schweregrad der Kopfabweichung bei zervikaler Dystonie per Video. (2022) Ann Clin Transl Neurol. DOI: 10.1002/acn3.51549

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Budzinski, RC, Nguyen, TT, Đoàn, J., Mináč, J., Sejnowski, TJ, Muller, LE Die Geometrie vereint Synchronität, Chimären und Wellen in nichtlinearen Oszillatornetzwerken. (2022) Chaos. 32(3):031104. DOI: 10.1063/5.0078791

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Nowotny, T., van Albada, SJ, Fellous, JM, Haas, JS, Jolivet, RB, Metzner, C., Sharpee, T. Leitartikel: Fortschritte in der Computational Neuroscience. (2022) Grenzen der Computational Neuroscience. 15:824899. DOI: 10.3389/fncom.2021.824899


Abdelfattah, AS, Ahuja, S., Akkin, T., Allu, SR, Brake, J., Boas, DA, Buckley, EM, Campbell, RE, Chen, AI, Cheng, X., Čižmár, T., Costantini , I., De Vittorio, M., Devor, A., Doran, PR, El Khatib, M., Emiliani, V., Fomin-Thunemann, N., Fainman, Y., Fernandez-Alfonso, T., Ferri , CGL, Gilad, A., Han, X., Harris, A., Hillman, EMC, Hochgeschwender, U., Holt, MG, Ji, N., Kılıç, K., Lake, EMR, Li, L., Li, T., Mächler, P., Miller, EW, Mesquita, RC, Nadella, KMNS, Nägerl, UV, Nasu, Y., Nimmerjahn, A., Ondráčková, P., Pavone, FS, Perez Campos, C. , Peterka, DS, Pisano, F., Pisanello, F., Puppo, F., Sabatini, BL, Sadegh, S., Sakadzic, S., Shoham, S., Shroff, SN, Silver, RA, Sims, RR , Smith, SL, Srinivasan, VJ, Thunemann, M., Tian, ​​L., Tian, ​​L., Troxler, T., Valera, A., Vaziri, A., Vinogradov, SA, Vitale, F., Wang, LV, Uhlířová, H., Xu, C., Yang, C., Yang, MH, Yellen, G., Yizhar, O., Zhao, Y. Neurophotonische Werkzeuge für mikroskopische Messungen und Manipulationen: Statusbericht. (2022) Neurophotonik. 9(Ergänzung 1):013001. DOI: 10.1117/1.NPh.9.S1.013001

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