Risorse e core condivisi
Nucleo di biofotonica avanzata
L'Advanced Biophotonics Core fornisce strumentazione per imaging e analisi, unitamente a personale di supporto tecnico e collaborativo, per la microscopia ottica ed elettronica avanzata di sistemi biologici. I membri del Cancer Center utilizzano la struttura per analisi di imaging ad alto rendimento, imaging ad alta risoluzione di cellule vive e dinamiche tissutali, microscopia a super risoluzione, imaging 3D di grandi volumi di tessuti, analisi di microscopia elettronica della morfologia subcellulare e della distribuzione proteica, nonché elaborazione, visualizzazione e analisi computazionale automatizzata delle immagini. Il Core è inoltre attivamente impegnato nella ricerca e nello sviluppo di nuove metodologie di imaging e analisi all'avanguardia per soddisfare al meglio le esigenze dei ricercatori del Cancer Center, come la microscopia ottica ed elettronica criocorrelativa, l'imaging a foglio di luce di tessuti chiarificati ed espansi e l'elaborazione, la segmentazione e l'analisi basate sull'apprendimento automatico delle immagini di microscopia ottica ed elettronica.
Nucleo di citometria a flusso
Il Flow Cytometry Core offre ai ricercatori del Salk l'accesso a strumentazione all'avanguardia per la citometria a flusso, servizi di alta qualità e consulenza specialistica nella progettazione e implementazione di esperimenti basati sulla citometria a flusso. La struttura è dotata di due separatori cellulari attivati dalla fluorescenza (FACS) gestiti dal personale e di tre strumenti analitici disponibili per l'utilizzo indipendente. Presso il Core sono disponibili formazione e supporto per utenti con tutti i livelli di esperienza. Il personale della struttura promuove un ambiente collaborativo, impegnandosi a fornire una risorsa completa e facilmente accessibile ai ricercatori del Cancer Center e dedicando sforzi all'identificazione di tecnologie o applicazioni emergenti per la citometria a flusso che possano essere utili agli utenti del Core.
Nucleo di sequenziamento di nuova generazione
La missione del Next Generation Sequencing Core è quella di facilitare la ricerca genomica all'avanguardia. A supporto delle attività di ricerca del Cancer Center presso il Salk, il Core mira specificamente a fornire: 1) servizi di sequenziamento ad alto rendimento rapidi ed economici, 2) assistenza specialistica nella progettazione sperimentale, 3) sviluppo di nuovi metodi per abilitare tecnologie di sequenziamento all'avanguardia, 4) preparazione e controllo di qualità di librerie di sequenziamento e 5) servizi di formazione per i membri del Cancer Center sulla preparazione di librerie o altri metodi necessari per i progetti di sequenziamento di nuova generazione.
Trasferimento genico, targeting e nucleo del vettore virale terapeutico
I vettori virali sono comunemente utilizzati per fornire materiale genetico alle cellule bersaglio, sia in vitro e in vivoRappresentano anche candidati interessanti per in vivo terapia genica. Tuttavia, sussistono notevoli problemi di sicurezza quando si lavora con vettori virali di qualità per la ricerca e la loro produzione. Questi problemi di sicurezza si aggravano quando i singoli laboratori di ricerca sono incaricati di stabilire e mantenere la propria infrastruttura e i propri protocolli di sicurezza. Per affrontare queste preoccupazioni, il Salk Institute ha istituito una risorsa centralizzata, il Viral Vector Core. Il Core produce e gestisce un'ampia libreria di vettori virali di uso comune. Inoltre, il Core offre servizi di progettazione e produzione personalizzati per diversi tipi di vettori virali, tra cui lentivirus, retrovirus, adenovirus, virus adeno-associati, virus della rabbia con delezione G e virus della stomatite vescicolare.
Nucleo di Genomica Integrativa e Bioinformatica
Il Core di Genomica Integrativa e Bioinformatica fornisce servizi analitici, computazionali e tecnici per tutti gli aspetti della ricerca genomica e bioinformatica svolta dai membri del Salk Cancer Center. Nell'era dei big data in biologia, l'analisi bioinformatica è fondamentale per ricavare informazioni biologiche da dati ad alto rendimento, grandi e rumorosi. L'obiettivo del Core è quello di offrire ai membri del Cancer Center l'accesso a competenze e supporto bioinformatici all'avanguardia. Il personale del Core assiste i membri del Cancer Center nell'analisi integrata di set di dati di sequenziamento, fornisce software e strumenti che i membri del Cancer Center possono utilizzare per eseguire le proprie analisi, fornisce formazione sull'uso del software e sviluppa strumenti e pipeline personalizzati per analisi all'avanguardia.
Spettrometria di massa Core: proteomica e metabolomica
Il Mass Spectrometry Core fornisce ai membri del Cancer Center supporto per le loro esigenze di proteomica, metabolomica e sintesi peptidica personalizzata. Il Core fornisce consulenza specialistica per la progettazione, l'implementazione e l'analisi di un'ampia gamma di esperimenti, tra cui: identificazione proteica, quantificazione proteica, identificazione di modificazioni post-traduzionali, analisi di proteine/peptidi secreti, profilazione lipidomica non mirata, lipidomica e metabolomica mirate, analisi degli acidi biliari, quantificazione degli amminoacidi, analisi degli acidi grassi e sintesi peptidica personalizzata. Il personale del Core lavora costantemente per implementare nuove tecniche analitiche in questi campi in rapida evoluzione, supportando al contempo i ricercatori nell'analisi dei dati, nella preparazione di manoscritti e nella stesura di progetti di ricerca.
Nucleo transgenico
L'obiettivo principale del Transgenic Core è fornire ai membri del Cancer Center e ad altri ricercatori del Salk Institute l'accesso a tecnologie all'avanguardia per la creazione di modelli murini geneticamente modificati. Queste linee di topi transgenici rappresentano strumenti genetici essenziali che consentono ai ricercatori di modellare malattie umane, analizzare e manipolare funzionalmente geni specifici e testare potenziali interventi terapeutici. Per raggiungere questo obiettivo, il Transgenic Core fornisce servizi di editing genomico all'avanguardia, nonché i servizi necessari per generare e mantenere topi transgenici.