Graham McVicker, Ph.D.

Professeur agrégé
Laboratoire de Génétique
Laboratoire de biologie intégrative

Institut Salk d'études biologiques - Graham McVicker, PhD

Les recherches en cours


Le problème

Les différences génétiques humaines, appelées variants génétiques, rendent chaque individu unique. La variation génétique affecte des caractéristiques comme la couleur des cheveux et des yeux et peut favoriser la santé comme la maladie. Des milliers de variants génétiques ont été associés à des maladies humaines ; cependant, les fonctions de la plupart de ces variants sont inconnues et difficiles à déterminer, car la plupart d'entre eux sont « non codants » et se situent en dehors des gènes (les portions du génome qui codent les protéines). Les recherches suggèrent désormais que, plutôt que d'altérer directement les gènes, ces variants influencent plutôt l'expression des gènes en modifiant leur expression. quand les gènes sont activés et désactivés et le montant des protéines qu'ils produisent dans différents types de cellules et dans différentes conditions. Pour comprendre les fondements génétiques de maladies humaines complexes, il est essentiel de comprendre comment ces variants génétiques non codants altèrent la régulation de l'expression génétique.

L'approche

Le laboratoire de Graham McVicker étudie l'impact de la variation génétique humaine sur la régulation des gènes en combinant des approches expérimentales et des analyses computationnelles. Le volet expérimental du laboratoire est spécialisé dans les perturbations du génome par CRISPR, ainsi que dans les tests génomiques visant à déterminer la structure de la chromatine et l'expression des gènes. Le volet computationnel du laboratoire est spécialisé dans l'analyse de la variation génétique humaine et de grands ensembles de données expérimentales à l'aide de méthodes statistiques et d'apprentissage automatique.


Les innovations et découvertes

En tant que chercheur postdoctoral, McVicker a publié la première étude visant à identifier les loci de traits quantitatifs (QTL) de marques d'histones dans le génome humain, qui sont des variantes génétiques associées à des différences dans les modifications d'histones entre les individus humains.

Le laboratoire de McVicker a développé des techniques et des méthodes d'analyse qui exploitent CRISPR pour analyser les parties non codantes du génome à la recherche de fonctions régulatrices importantes.

Dans le cadre de ses recherches actuelles, le laboratoire de McVicker utilise l’apprentissage automatique pour prédire la fonction régulatrice des variantes génétiques non codantes dans le génome humain.

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Éducation

B.Sc. en informatique, Université de la Colombie-Britannique
Doctorat, sciences du génome, Université de Washington
Chercheur postdoctoral, Université de Chicago
Chercheur postdoctoral, Université de Stanford


Prix ​​et distinctions

  • Prix de l'innovateur génomique de l'Institut national de recherche sur le génome humain, 2021
  • Bourse d'études supérieures du Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie (CRSNG) (PGS-D2), 2007
  • Bourse d'études supérieures du Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie (CRSNG) (PGS-M), 2005