Ye Zheng, doctorado

Profesor

Centro NOMIS de Inmunobiología y Patogénesis Microbiana

Instituto Salk de Estudios Biológicos - Publicaciones

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Liu, Z., Lee, DS, Liang, Y., Zheng, Y., Dixon, JR Foxp3 organiza la reorganización de la arquitectura de la cromatina para establecer la identidad de las células T reguladoras. (2023) Nature Communications. 14(1):6943. DOI: 10.1038/s41467-023-42647-y

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Chen, D., Varanasi, SK, Hara, T., Traina, K., Sun, M., McDonald, B., Farsakoglu, Y., Clanton, J., Xu, S., Garcia-Rivera, L. , Mann, TH, Du, V., Chung, HK, Xu, Z., Tripple, V., Casillas, E., Ma, S., O'Connor, C., Yang, Q., Zheng, Y., Hunter, T., Lemke, G., Kaech, SM El bloqueo de CTLA-4 induce la fagocitosis microglial impulsada por IFNγ de células T CD4 y la función antitumoral en el glioblastoma. (2023) Inmunidad. DOI: 10.1016/j.inmune.2023.07.015

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Liu, Z., Lee, DS, Liang, Y., Zheng, Y., Dixon, JR Foxp3 organiza la reorganización de la arquitectura de la cromatina para establecer la identidad de las células T reguladoras. (2023) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2023.02.22.529589

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Ma, S., Yang, Q., Chen, N., Zheng, A., Abbasi, N., Wang, G., Patel, PR, Cho, BS, Yee, BA, Zhang, L., Chu, H ., Evans, SM, Yeo, GW, Zheng, Y., Huang, WJM La proteína de unión al ARN DDX5 restringe la función supresora de RORγt T para promover la inflamación del intestino. (2023) Avances de la ciencia. 9(5):eadd6165. DOI: 10.1126/sciadv.add6165

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Fu, T., Li, Y., Oh, TG, Cayabyab, F., He, N., Tang, Q., Coulter, S., Truitt, M., Medina, P., He, M., Yu , RT, Atkins, A., Zheng, Y., Liddle, C., Downes, M., Evans, RM FXR media las respuestas intrínsecas de la ILC a la inflamación intestinal. (2022) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 119(51):e2213041119. DOI: 10.1073/pnas.2213041119

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Liu, Z., Hu, X., Liang, Y., Yu, J., Li, H., Shokhirev, MN, Zheng, Y. La señalización de glucocorticoides y las células T reguladoras cooperan para mantener el nicho de células madre del folículo piloso. [Publicado] (2022) Inmunología de la naturaleza. DOI: 10.1038/s41590-022-01244-9

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Choi, J., Oh, TG, Jung, H., Park, KY, Shin, H., Jo, T., Kang, DS, Chanda, D., Hong, S., Kim, J., Hwang, H ., Ji, M., Jung, M., Takashihoji, Matsushima, A., Kim, P., Mun, JY, Paik, MJ, Cho, SJ, Lee, IK, Whitcomb, DC, Greer, P., Blobner , B., Goodarzi, MO, Pandol, SJ, Rotter, JI, Fan, W., Bapat, SP, Zheng, Y., Liddle, C., Yu, RT, Atkins, AR, Downes, M., Yoshihara, E., Evans, RM, Suh, JM El receptor relacionado con estrógenos γ mantiene la función y la identidad de las células acinares pancreáticas mediante la regulación del metabolismo celular. (2022) Gastroenterología. DOI: 10.1053/j.gastro.2022.04.013

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Bapat, SP, Whitty, C., Mowery, CT, Liang, Y., Yoo, A., Jiang, Z., Peters, MC, Zhang, LJ, Vogel, I., Zhou, C., Nguyen, VQ, Li, Z., Chang, C., Zhu, WS, Hastie, AT, He, H., Ren, X., Qiu, W., Gayer, SG, Liu, C., Choi, EJ, Fassett, M. , Cohen, JN, Sturgill, JL, Crotty Alexander, LE, Suh, JM, Liddle, C., Atkins, AR, Yu, RT, Downes, M., Liu, S., Nikolajczyk, BS, Lee, IK, Guttman -Yassky, E., Ansel, KM, Woodruff, PG, Fahy, JV, Sheppard, D., Gallo, RL, Ye, CJ, Evans, RM, Zheng, Y., Marson, A. La obesidad altera la patología y la respuesta al tratamiento en la enfermedad inflamatoria. (2022) Naturaleza. 604(7905):337-342. DOI: 10.1038/s41586-022-04536-0

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Qiu, Z., Zhao, L., Shen, JZ, Liang, Z., Wu, Q., Yang, K., Min, L., Gimple, RC, Yang, Q., Bhargava, S., Jin, C., Kim, C., Hinz, D., Dixit, D., Bernatchez, JA, Prager, BC, Zhang, G., Dong, Z., Lv, D., Wang, X., Kim, LJY, Zhu, Z., Jones, KA, Zheng, Y., Wang, X., Siqueira-Neto, JL, Chávez, L., Fu, XD, Spruck, C., Rich, JN La maquinaria de elongación de la transcripción es una dependencia farmacológica y potencia la inmunoterapia en células madre de glioblastoma. (2021) Descubrimiento del cáncer. DOI: 10.1158/2159-8290.CD-20-1848

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Arnett, A., Moo, KG, Flynn, KJ, Sundberg, TB, Johannessen, L., Shamji, AF, Gray, NS, Decker, T., Zheng, Y., Gersuk, VH, Rahman, ZS, Levy, DE, Marié, IJ, Linsley, PS, Xavier, RJ, Khor, B. El inhibidor de CDK8 DCA promueve un inmunofenotipo químico tolerogénico en las células T CD4 a través de una nueva vía CDK8-GATA3-FOXP3. (2021) Biología Molecular y Celular.:MCB0008521 DOI: 10.1128/MCB.00085-21

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Loo, CS, Gatchalian, J., Liang, Y., Leblanc, M., Xie, M., Ho, J., Venkatraghavan, B., Hargreaves, DC, Zheng, Y. Una pantalla CRISPR de todo el genoma revela un papel para el complejo BAF de remodelación de nucleosomas no canónico en la expresión de Foxp3 y la función de las células T reguladoras. (2020) Inmunidad. DOI: 10.1016/j.inmune.2020.06.011

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Hang, S., Paik, D., Yao, L., Kim, E., Jamma, T., Lu, J., Ha, S., Nelson, BN, Kelly, SP, Wu, L., Zheng, Y., Longman, RS, Rastinejad, F., Devlin, AS, Krout, MR, Fischbach, MA, Littman, DR, Huh, JR Los metabolitos de los ácidos biliares controlan la diferenciación de células T17 y T. (2019) Naturaleza. DOI: 10.1038 / s41586-019, 1785-z

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Bapat, SP, Liang, Y., Zheng, Y. Caracterización de Células Inmunes de Tejido Adiposo. (2019) Protocolos Actuales en Inmunología. 126(1):e86. DOI: 10.1002/cpim.86

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Chang, C., Loo, CS, Zhao, X., Solt, LA, Liang, Y., Bapat, SP, Cho, H., Kamenecka, TM, Leblanc, M., Atkins, AR, Yu, RT, Downes , M., Burris, TP, Evans, RM, Zheng, Y. El receptor nuclear REV-ERBα modula la enfermedad autoinmune mediada por células Th17. (2019) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 116(37):18528-18536. DOI: 10.1073/pnas.1907563116

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Owen, DL, Mahmud, SA, Sjaastad, LE, Williams, JB, Spanier, JA, Simeonov, DR, Ruscher, R., Huang, W., Proekt, I., Miller, CN, Hekim, C., Jeschke, JC, Aggarwal, P., Broeckel, U., LaRue, RS, Henzler, CM, Alegre, ML, Anderson, MS, August, A., Marson, A., Zheng, Y., Williams, CB, Farrar, MA Las células T reguladoras del timo surgen a través de dos programas de desarrollo distintos. (2019) Inmunología de la naturaleza. DOI: 10.1038/s41590-018-0289-6

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Zhang, LJ, Chen, SX, Guerrero-Juarez, CF, Li, F., Tong, Y., Liang, Y., Liggins, M., Chen, X., Chen, H., Li, M., Hata , t, Zheng, Y., Plikus, MV, Gallo, RL La pérdida relacionada con la edad de la función antimicrobiana inmune innata de la grasa dérmica está mediada por el factor de crecimiento transformante beta. (2018) Inmunidad. DOI: 10.1016/j.inmune.2018.11.003

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Klann, JE, Kim, SH, Remedios, KA, He, Z., Metz, PJ, Lopez, J., Tysl, T., Olvera, JG, Ablack, JN, Cantor, JM, Boland, BS, Yeo, G ., Zheng, Y., Lu, LF, Bui, JD, Ginsberg, MH, Petrich, BG, Chang, JT La activación de integrinas controla la tolerancia periférica mediada por células T reguladoras. (2018) Revista de Inmunología. 200(12):4012-4023. DOI: 10.4049/jimmunol.1800112

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Cao, Q., Zhao, X., Bai, J., Gery, S., Sun, H., Lin, DC, Chen, Q., Chen, Z., Mack, L., Yang, H., Deng , R., Shi, X., Chong, LW, Cho, H., Xie, J., Li, QZ, Müschen, M., Atkins, AR, Liddle, C., Yu, RT, Alkan, S., Dijo, JW, Zheng, Y., Downes, M., Evans, RM, Koeffler, HP Las proteínas criptocromáticas del reloj circadiano regulan la autoinmunidad. (2017) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 114(47):12548-12553. DOI: 10.1073/pnas.1619119114

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He, N., Fan, W., Henríquez, B., Yu, RT, Atkins, AR, Liddle, C., Zheng, Y., Downes, M., Evans, RM Control metabólico de la supervivencia y función de las células T reguladoras (Treg) por Lkb1. (2017) Proc. Natl. Acad. Ciencia. EE.UU. 114(47):12542-12547. DOI: 10.1073/pnas.1715363114

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Wang, J., He, N., Zhang, N., Quan, D., Zhang, S., Zhang, C., Yu, RT, Atkins, AR, Zhu, R., Yang, C., Cui, Y., Liddle, C., Downes, M., Xiao, H., Zheng, Y., Auwerx, J., Evans, RM, Leng, Q. NCoR1 restringe la selección negativa tímica al reprimir la expresión de Bim para evitar que los timocitos experimenten una selección positiva. (2017) Nature Communications. 8(1):959. DOI: 10.1038/s41467-017-00931-8

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Klann, JE, Remedios, KA, Kim, SH, Metz, PJ, López, J., Mack, LA, Zheng, Y., Ginsberg, MH, Petrich, BG, Chang, JT Talin juega un papel fundamental en el mantenimiento del conjunto de células T reguladoras. (2017) Revista de Inmunología. 198(12):4639-4651. DOI: 10.4049/jimmunol.1601165

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Chinen, T., Kannan, AK, Levine, AG, Fan, X., Klein, U., Zheng, Y., Gasteiger, G., Feng, Y., Fontenot, JD, Rudensky, AY Un papel esencial para el receptor de IL-2 en la función de las células Treg. (2016) Inmunología de la naturaleza. 17(11):1322-1333. DOI: 10.1038/ni.3540

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Liu, WH, Kang, SG, Huang, Z., Wu, CJ, Jin, HY, Maine, CJ, Liu, Y., Shepherd, J., Sabouri-Ghomi, M., Gonzalez-Martin, A., Xu , S., Hoffman, A., Zheng, Y., Lu, LF, Xiao, N., Fu, G., Xiao, C. Una vía miR-155-Peli1-c-Rel controla la generación y función de las células auxiliares foliculares T. (2016) Revista de Medicina Experimental. 213(9):1901-19. DOI: 10.1084/jem.20160204

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Bapat, SP, Myoung Suh, J., Fang, S., Liu, S., Zhang, Y., Cheng, A., Zhou, C., Liang, Y., LeBlanc, M., Liddle, C., Atkins, AR, Yu, RT, Downes, M., Evans, RM, Zheng, Y. El agotamiento de las células Treg residentes en grasa previene la resistencia a la insulina asociada con la edad. (2015) Naturaleza. 528 (7580): 137-41. DOI: 10.1038/naturaleza16151

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Hernández, JB, Chang, C., LeBlanc, M., Grimm, D., Le Lay, J., Kaestner, KH, Zheng, Y., Montminy, M. La vía CREB/CRTC2 modula la enfermedad autoinmune al promover la diferenciación Th17. (2015) Nature Communications. 6:7216. DOI: 10.1038/ncomms8216

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Zheng, Y., Josefowicz, S., Chaudhry, A., Peng, XP, Forbush, K., Rudensky, AY Papel de los elementos de ADN no codificantes conservados en el gen Foxp3 en el destino de las células T reguladoras. (2010) Naturaleza. 463 (7282): 808-12. DOI: 10.1038/naturaleza08750

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Zheng, Y., Chaudhry, A., Kas, A., deRoos, P., Kim, JM, Chu, TT, Corcoran, L., Treuting, P., Klein, U., Rudensky, AY El programa regulador de supresión de células T coopta el factor de transcripción IRF4 para controlar las respuestas de T(H)2. (2009) Naturaleza. 458 (7236): 351-6. DOI: 10.1038/naturaleza07674

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Wang, J., Wang, X., Hussain, S., Zheng, Y., Sanjabi, S., Ouaaz, F., Beg, AA Distintas funciones de diferentes subunidades NF-kappa B en la regulación de la expresión génica inflamatoria y estimuladora de células T en células dendríticas. (2007) Revista de Inmunología. 178 (11): 6777 88-.

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Zheng, Y., Rudensky, AY Foxp3 en el control del linaje de células T reguladoras. (2007) Inmunología de la naturaleza. 8(5):457-62. DOI: 10.1038/ni1455

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Zheng, Y., Josefowicz, SZ, Kas, A., Chu, TT, Gavin, MA, Rudensky, AY Análisis de todo el genoma de los genes diana Foxp3 en células T reguladoras maduras y en desarrollo. (2007) Naturaleza. 445 (7130): 936-40. DOI: 10.1038/naturaleza05563

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Hsieh, CS, Zheng, Y., Liang, Y., Fontenot, JD, Rudensky, AY Una intersección entre los repertorios de receptores de células T autorreactivos reguladores y no reguladores. (2006) Inmunología de la naturaleza. 7(4):401-10. DOI: 10.1038/ni1318

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Prendes, M., Zheng, Y., Mendigar, AA Regulación de la supervivencia de células B en desarrollo por complejos NF-kappa B que contienen RelA. (2003) Revista de Inmunología. 171 (8): 3963 9-.

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Qu, J., Li, X., Novitch, BG, Zheng, Y., Kohn, M., Xie, JM, Kozinn, S., Bronson, R., Beg, AA, Minden, A. La quinasa PAK4 es esencial para la viabilidad embrionaria y para el correcto desarrollo neuronal. (2003) Biología Molecular y Celular. 23 (20): 7122 33-.

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Tao, X., Xu, Y., Zheng, Y., Beg, AA, Tong, L. Un dímero ampliamente asociado en la estructura del mutante C713S ​​del dominio TIR de TLR2 humano. (2002) Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica. 299(2):216-21. DOI: 10.1016/s0006-291x(02)02581-0

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Ouaaz, F., Arron, J., Zheng, Y., Choi, Y., Beg, AA El desarrollo y la supervivencia de las células dendríticas requieren distintas subunidades NF-kappaB. (2002) Inmunidad. 16 (2): 257 70-.

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Educación

BS, Bioquímica y Biología Molecular, Universidad de Pekín, Pekín, China
Doctorado, Universidad de Columbia
Becario postdoctoral, Universidad de Washington
Investigador del Centro de Cáncer Memorial Sloan-Kettering
Beca Postdoctoral del Instituto de Investigación del Cáncer


Afiliaciones


Premios y honores

  • Premio Académico de la Fundación Rita Allen, 2010-2015

Mi Perfil

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