Axel Nimmerjahn, PhD

Hoogleraar

Waitt Geavanceerd Biofotonicacentrum

Françoise Gilot-Salk-stoel

Salk Instituut voor Biologische Studies - Publicaties

alle publicaties


Duff, MK, Li, MJ, Nimmerjahn, A. Regulatie van de werking van het ruggenmergcircuit door astrocyten. (2026) J Neurochem. 170(2):e70366. DOI: 10.1111/jnc.70366

+ samenvatting uitvouwen


Barykina, NV, Carey, EM, Oliinyk, OS, Mendonça-Gomes, JM, de Oliveira, S., Nimmerjahn, A., Verkhusha, VV Synthetisch, meerkleurig, antigeen-stabiliseerbaar nanobody-platform voor intersectionele labeling en functionele beeldvorming. (2025) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2025.10.27.684934

+ samenvatting uitvouwen


Mi, X., Chen, AB, Duarte, D., Carey, E., Taylor, CR, Braaker, PN, Bright, M., Almeida, RG, Lim, JX, Ruetten, VMS, Wang, Y., Wang, M., Zhang, W., Zheng, W., Reitman, ME, Huang, Y., Wang, X., Li, L., Deng, H., Shi, SH, Poskanzer, KE, Lyon, DA, Nimmerjahn, A., Ahrens, MB, Yu, G. Snel, nauwkeurig en veelzijdig data-analyseplatform voor de kwantificering van moleculaire spatiotemporele signalen. (2025) Cel DOI: 10.1016/j.cel.2025.03.012

+ samenvatting uitvouwen


Barykina, NV, Carey, EM, Oliinyk, OS, Nimmerjahn, A., Verkhusha, VV Gedestabiliseerde, nabij-infrarood fluorescerende nanobodies maken achtergrondvrije targeting van GFP-gebaseerde biosensoren voor beeldvorming en manipulatie mogelijk. (2024) Nature Communications. 15(1):7788. DOI: 10.1038/s41467-024-51857-x

+ samenvatting uitvouwen


Su, Y., Xu, J., Zhu, Z., Chin, J., Xu, L., Yu, H., Nudell, V., Dash, B., Moya, EA, Ye, L., Nimmerjahn, A., Zon, X. Dbh-neuronen in de hersenstam controleren door allergeen geïnduceerde hyperreactiviteit van de luchtwegen. (2024) Natuur. DOI: 10.1038/s41586-024-07608-5

+ samenvatting uitvouwen


Wu, Y., Temple, BA, Sevilla, N., Zhang, J., Zhu, H., Zolotavin, P., Jin, Y., Duarte, D., Sanders, E., Azim, E., Nimmerjahn, A., Pfaff, SL, Luan, L., Xie, C. Ultraflexibele elektroden voor het registreren van neurale activiteit in het ruggenmerg van muizen tijdens motorisch gedrag. (2024) Cell Reports 43(5):114199. DOI: 10.1016/j.celrep.2024.114199

+ samenvatting uitvouwen


Mi, X., Chen, AB, Duarte, D., Carey, E., Taylor, CR, Braaker, PN, Bright, M., Almeida, RG, Lim, JX, Rutten, VM, Zheng, W., Wang , M., Reitman, ME, Wang, Y., Poskanzer, KE, Lyon, DA, Nimmerjahn, A., Ahrens, MB, Yu, G. Snel, nauwkeurig en veelzijdig data-analyseplatform voor de kwantificering van moleculaire spatiotemporele signalen. (2024) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2024.05.02.592259

+ samenvatting uitvouwen


Schafer, ST, Mansour, AA, Schlachetzki, JCM, Pena, M., Ghassemzadeh, S., Mitchell, L., Mar, A., Quang, D., Stumpf, S., Ortiz, IS, Lana, AJ, Baek, C., Zaghal, R., Glas, CK, Nimmerjahn, A., Gage, FH Een in vivo neuro-immuun organoïde model om fenotypes van menselijke microglia te bestuderen. (2023) Cel 186(10):2111-2126.e20. DOI: 10.1016/j.cell.2023.04.022

+ samenvatting uitvouwen


Shekhtmeyster, P., Duarte, D., Carey, EM, Ngo, A., Gao, G., Olmstead, JA, Nelson, NA, Nimmerjahn, A. Transsegmentele beeldvorming in het ruggenmerg van muizen die zich gedragen. (2023) Natuur Biotechnologie. DOI: 10.1038/s41587-023-01700-3

+ samenvatting uitvouwen


Shekhtmeyster, P., Carey, EM, Duarte, D., Ngo, A., Gao, G., Nelson, NA, Clark, CL, Nimmerjahn, A. Multiplex translaminaire beeldvorming in het ruggenmerg van zich gedragende muizen. (2023) Nature Communications. 14(1):1427. DOI: 10.1038/s41467-023-36959-2

+ samenvatting uitvouwen


Ward, S., Riley, C., Carey, EM, Nguyen, J., Esener, S., Nimmerjahn, A., Sirbuly, DJ Elektro-optische mechanisch flexibele coaxiale microsondes voor minimaal invasieve interfacing met intrinsieke neurale circuits. (2022) Nature Communications. 13(1):3286. DOI: 10.1038/s41467-022-30275-x

+ samenvatting uitvouwen


Oliinyk, OS, Baloban, M., Clark, CL, Carey, E., Pletnev, S., Nimmerjahn, A., Verkhusha, VV Single-domein nabij-infrarood eiwit biedt een steiger voor antigeen-afhankelijke fluorescerende nanobodies. (2022) Aardmethoden. DOI: 10.1038/s41592-022-01467-6

+ samenvatting uitvouwen


Nimmerjahn, A., Hirlinger, J. Astrocytenregulatie van neurale circuitfunctie en dierlijk gedrag. (2022) Glia. DOI: 10.1002/glia.24223


Hirrlinger, J., Nimmerjahn, A. Een perspectief op astrocytregulatie van neurale circuitfunctie en diergedrag. (2022) Glia. DOI: 10.1002/glia.24168

+ samenvatting uitvouwen


Abdelfattah, AS, Ahuja, S., Akkin, T., Allu, SR, Brake, J., Boas, DA, Buckley, EM, Campbell, RE, Chen, AI, Cheng, X., Čižmár, T., Costantini , I., De Vittorio, M., Devor, A., Doran, PR, El Khatib, M., Emiliani, V., Fomin-Thunemann, N., Fainman, Y., Fernandez-Alfonso, T., Ferri , CGL, Gilad, A., Han, X., Harris, A., Hillman, EMC, Hochgeschwender, U., Holt, MG, Ji, N., Kılıç, K., Lake, EMR, Li, L., Li, T., Mächler, P., Miller, EW, Mesquita, RC, Nadella, KMNS, Nägerl, UV, Nasu, Y., Nimmerjahn, A., Ondráčková, P., Pavone, FS, Perez Campos, C., Peterka, DS, Pisano, F., Pisanello, F., Puppo, F., Sabatini, BL, Sadegh, S., Sakadzic, S., Shoham , S., Shroff, SN, Silver, RA, Sims, RR, Smith, SL, Srinivasan, VJ, Thunemann, M., Tian, ​​L., Tian, ​​L., Troxler, T., Valera, A., Vaziri , A., Vinogradov, SA, Vitale, F., Wang, LV, Uhlířová, H., Xu, C., Yang, C., Yang, MH, Yellen, G., Yizhar, O., Zhao, Y. Neurofotonische hulpmiddelen voor microscopische metingen en manipulatie: statusrapport. (2022) Neurofotonica. 9(Suppl 1):013001. DOI: 10.1117/1.NPh.9.S1.013001

+ samenvatting uitvouwen


Huang, Y., Happonen, KE, Burrola, PG, O'Connor, C., Hah, N., Huang, L., Nimmerjahn, A., Lemke, G. Microglia gebruiken TAM-receptoren om amyloïde β-plaques te detecteren en te verzwelgen. (2021) Natuur Immunologie. DOI: 10.1038/s41590-021-00913-5

+ samenvatting uitvouwen


Ceto, S., Sekiguchi, KJ, Takashima, Y., Nimmerjahn, A., Tuszynski, MH Neurale stamceltransplantaten vormen uitgebreide synaptische netwerken die integreren met gastheercircuits na ruggenmergletsel. (2020) Celstamcel. DOI: 10.1016/j.stem.2020.07.007

+ samenvatting uitvouwen


Nimmerjahn, A. Bewaking van de neuronale gezondheid. (2020) Science. 367(6477):510-511. DOI: 10.1126/science.aba4472


Patriarchi, T., Cho, JR, Merten, K., Marley, A., Broussard, GJ, Liang, R., Williams, J., Nimmerjahn, A., von Zastrow, M., Gradinaru, V., Tian, ​​L. Beeldvorming van neuromodulatoren met hoge spatiotemporele resolutie met behulp van genetisch gecodeerde indicatoren. (2019) Natuurprotocollen. 14(12):3471–3505. DOI: 10.1038/s41596-019-0239-2

+ samenvatting uitvouwen


Nelson, NA, Wang, X., Cook, D., Carey, EM, Nimmerjahn, A. Beeldvorming van de activiteit van het ruggenmerg bij dieren die zich gedragen. (2019) Experimentele neurologie. 230:112974. DOI: 10.1016/j.expneurol.2019.112974

+ samenvatting uitvouwen


Patriarchi, T., Cho, JR, Merten, K., Howe, MW, Marley, A., Xiong, WH, Folk, RW, Broussard, GJ, Liang, R., Jang, MJ, Zhong, H., Dombeck , D., von Zastrow, M., Nimmerjahn, A., Gradinaru, V., Williams, JT, Tian, ​​L. Ultrasnelle neuronale beeldvorming van dopamine-dynamiek met ontworpen genetisch gecodeerde sensoren. (2018) Science. DOI: 10.1126/science.aat4422

+ samenvatting uitvouwen


Tufail, Y., Cook, D., Fourgeaud, L., Powers, CJ, Merten, K., Clark, CL, Hoffman, E., Ngo, A., Sekiguchi, KJ, O'Shea, CC, Lemke, G., Nimmerjahn, A. Blootstelling aan fosfatidylserine regelt virale aangeboren immuunresponsen door Microglia. (2017) Neuron. 93(3):574-586.e8. DOI: 10.1016/j.neuron.2016.12.021

+ samenvatting uitvouwen


Sekiguchi, KJ, Shekhtmeyster, P., Merten, K., Arena, A., Cook, D., Hoffman, E., Ngo, A., Nimmerjahn, A. Beeldvorming van grootschalige cellulaire activiteit in het ruggenmerg van zich vrij gedragende muizen. (2016) Nature Communications. 7:11450. DOI: 10.1038/ncomms11450

+ samenvatting uitvouwen


Fourgeaud, L., Través, PG, Tufail, Y., Leal-Bailey, H., Lew, ED, Burrola, PG, Callaway, P., Zagórska, A., Rothlin, CV, Nimmerjahn, A., Lemke, G. TAM-receptoren reguleren meerdere kenmerken van microgliale fysiologie. (2016) Natuur. 532(7598):240-244. DOI: 10.1038/natuur17630

+ samenvatting uitvouwen


Nimmerjahn, A., Bergles, DE Grootschalige registratie van astrocytenactiviteit. (2015) Huidige mening in de neurobiologie. 32:95-106. DOI: 10.1016/j.conb.2015.01.015

+ samenvatting uitvouwen


Knowland, D., Arac, A., Sekiguchi, KJ, Hsu, M., Lutz, SE, Perrino, J., Steinberg, GK, Barres, BA, Nimmerjahn, A., Agalliu, D. Stapsgewijze rekrutering van transcellulaire en paracellulaire routes ligt ten grondslag aan de afbraak van de bloed-hersenbarrière bij een beroerte. (2014) Neuron. 82(3):603-17. DOI: 10.1016/j.neuron.2014.03.003

+ samenvatting uitvouwen


Devor, A., Bandettini, PA, Boas, DA, Bower, JM, Buxton, RB, Cohen, LB, Dale, AM, Einevoll, GT, Fox, PT, Franceschini, MA, Friston, KJ, Fujimoto, JG, Geyer , MA, Greenberg, JH, Halgren, E., Hämäläinen, MS, Helmchen, F., Hyman, BT, Jasanoff, A., Jernigan, TL, Judd, LL, Kim, SG, Kleinfeld, D., Kopell, NJ , Kutas, M., Kwong, KK, Larkum, ME, Lo, EH, Magistretti, PJ, Mandeville, JB, Masliah, E., Mitra, PP, Mobley, WC, Moskowitz, MA, Nimmerjahn, A., Reynolds, JH, Rosen, BR, Salzberg, BM, Schaffer, CB, Silva, GA, So, PT, Spitzer, NC, Tootell, RB, Van Essen, DC, Vanduffel, W., Vinogradov, SA, Wald, LL , Wang, LV, Weber, B., Yodh, AG De uitdaging om de punten in de BRAIN met elkaar te verbinden (2013) Neuron. 80(2):270-4. DOI: 10.1016/j.neuron.2013.09.008

+ samenvatting uitvouwen


Nimmerjahn, A. Beeldvorming met twee fotonen van microglia in de muizencortex in vivo. (2012) Cold Spring Harbor-protocollen. 2012(5). DOI: 10.1101/pdb.prot069294

+ samenvatting uitvouwen


Nimmerjahn, A. Optische venstervoorbereiding voor beeldvorming met twee fotonen van microglia bij muizen. (2012) Cold Spring Harbor-protocollen. 2012(5). DOI: 10.1101/pdb.prot069286

+ samenvatting uitvouwen


Nimmerjahn, A. Chirurgische implantatie van een kopplaat bij muizen ter voorbereiding op in vivo twee-fotonen beeldvorming van microglia. (2012) Cold Spring Harbor-protocollen. 2012(5). DOI: 10.1101/pdb.prot069278

+ samenvatting uitvouwen


Nimmerjahn, A., Helmchen, F. In vivo labeling van corticale astrocyten met sulforhodamine 101 (SR101). (2012) Cold Spring Harbor-protocollen. 2012(3):326-34. DOI: 10.1101/pdb.prot068155

+ samenvatting uitvouwen


Kerr, JN, Nimmerjahn, A. Functionele beeldvorming bij vrij bewegende dieren. (2012) Huidige mening in de neurobiologie. 22(1):45-53. DOI: 10.1016/j.conb.2011.12.002

+ samenvatting uitvouwen


Tremblay, M., Stevens, B., Sierra, A., Wake, H., Bessis, A., Nimmerjahn, A. De rol van microglia in de gezonde hersenen. (2011) Journal of Neuroscience. 31(45):16064-9. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.4158-11.2011

+ samenvatting uitvouwen


Ghosh, KK, Burns, LD, Cocker, ED, Nimmerjahn, A., Ziv, Y., Gamal, AE, Schnitzer, MJ Geminiaturiseerde integratie van een fluorescentiemicroscoop. (2011) Aardmethoden. 8(10):871-8. DOI: 10.1038/nmeth.1694

+ samenvatting uitvouwen


Mukamel, EA, Nimmerjahn, A., Schnitzer, MJ Geautomatiseerde analyse van cellulaire signalen van grootschalige calciumbeeldvormingsgegevens. (2009) Neuron. 63(6):747-60. DOI: 10.1016/j.neuron.2009.08.009

+ samenvatting uitvouwen


Nimmerjahn, A., Mukamel, EA, Schnitzer, MJ Motorisch gedrag activeert Bergmann gliale netwerken. (2009) Neuron. 62(3):400-12. DOI: 10.1016/j.neuron.2009.03.019

+ samenvatting uitvouwen


Nimmerjahn, A. Astrocyten gaan live: vorderingen en uitdagingen. (2009) Tijdschrift voor Fysiologie. 587(Pt 8):1639-47. DOI: 10.1113/jphysiol.2008.167171

+ samenvatting uitvouwen


Flusberg, BA, Nimmerjahn, A., Cocker, ED, Mukamel, EA, Barretto, RP, Ko, TH, Burns, LD, Jung, JC, Schnitzer, MJ High-speed, geminiaturiseerde fluorescentiemicroscopie in vrij bewegende muizen. (2008) Aardmethoden. 5(11):935-8. DOI: 10.1038/nmeth.1256

+ samenvatting uitvouwen


Sullivan, heer, Nimmerjahn, A., Sarkisov, DV, Helmchen, F., Wang, SS In vivo calciumbeeldvorming van circuitactiviteit in cerebellaire cortex. (2005) Journal of Neurophysiology. 94(2):1636-44. DOI: 10.1152/jn.01013.2004

+ samenvatting uitvouwen


Nimmerjahn, A., Kirchhoff, F., Helmchen, F. Rustende microgliale cellen zijn zeer dynamische surveillanten van hersenparenchym in vivo. (2005) Science. 308(5726):1314-8. DOI: 10.1126/wetenschap.1110647

+ samenvatting uitvouwen


Dittgen, T., Nimmerjahn, A., Komai, S., Licznerski, P., Waters, J., Margrie, TW, Helmchen, F., Denk, W., Brecht, M., Osten, P. Lentivirus-gebaseerde genetische manipulaties van corticale neuronen en hun optische en elektrofysiologische monitoring in vivo. (2004) Proceedings van de National Academy of Sciences in de Verenigde Staten van Amerika. 101(52):18206-11. DOI: 10.1073/pnas.0407976101

+ samenvatting uitvouwen


Göbel, W., Kerr, JN, Nimmerjahn, A., Helmchen, F. Geminiaturiseerde twee-fotonenmicroscoop gebaseerd op een flexibele coherente vezelbundel en een lensobjectief met gradiëntindex. (2004) Kies Lett. 29 (21) 2521-3.

+ samenvatting uitvouwen


Nimmerjahn, A., Kirchhoff, F., Kerr, JN, Helmchen, F. Sulforhodamine 101 als een specifieke marker van astroglia in de neocortex in vivo. (2004) Aardmethoden. 1(1):31-7. DOI: 10.1038/nmeth706

+ samenvatting uitvouwen


Gobel, W., Nimmerjahn, A., Helmchen, F. Vervormingsvrije levering van nanojoule femtoseconde pulsen van een Ti:saffierlaser door een fotonische kristalvezel met holle kern. (2004) Optische brieven. 29 (11) 1285-7.

+ samenvatting uitvouwen


Kim, J., Dittgen, T., Nimmerjahn, A., Waters, J., Pawlak, V., Helmchen, F., Schlesinger, S., Seeburg, PH, Osten, P. Sindbis-vector SINrep (nsP2S726): een hulpmiddel voor snelle heterologe expressie met verzwakte cytotoxiciteit in neuronen. (2004) Journal of Neuroscience-methoden. 133(1-2):81-90.

+ samenvatting uitvouwen


Educatie

MS, Natuurkunde, Max Planck Instituut voor Medisch Onderzoek/Universiteit van Heidelberg, Duitsland
PhD, Natuurkunde, Max Planck Instituut voor Medisch Onderzoek/Universiteit van Heidelberg, Duitsland
Postdoctoraal onderzoeker, biologie en toegepaste natuurkunde, Stanford University


AFFILIATIE


Prijzen en onderscheidingen

  • National Institutes of Health Brain Initiative U19, 2021-heden
  • Nationale Instituten of Health Brain Initiative Award, 2017-2020
  • Eureka-prijs van de National Institutes of Health, 2013-2018
  • New Innovator Award van de National Institutes of Health Director, 2012-2017
  • Rita Allen Scholar-prijs, 2011-2016
  • Whitehall Foundation-prijs, 2011-2014
  • Human Frontiers Science Program (HFSP) Postdoctorale beurs, 2006-2009
  • Du Bois-Reymond Award van de Duitse Vereniging voor Fysiologie, 2006
  • Otto-Hahn-medaille en onderscheiding van de Max Planck Society, 2006
  • Feodor Lynen Research Fellowship van de Alexander von Humboldt Foundation, 2006
  • Böhringer Ingelheim Fonds (BIF) Predoctoraal mandaat, 2002-2005

Profiel