Initiative de bioinformatique

L'Institut Salk explore l'avenir de la bioinformatique en relevant les défis posés par une recherche de plus en plus gourmande en données en sciences biologiques. Créé en 2003, le Centre Crick-Jacobs de biologie théorique et computationnelle a joué un rôle crucial dans la gestion et l'interprétation d'ensembles de données complexes grâce à des outils informatiques avancés. Avec l'avènement de l'intelligence artificielle et de l'apprentissage automatique (IA/ML), les scientifiques du Salk ont réalisé des avancées majeures dans la recherche sur le vieillissement, la biologie du cancer, l'immunologie, les neurosciences et la biologie végétale. L'institut se tourne désormais vers le cloud computing et noue des partenariats avec des informaticiens pour gérer des tâches qui dépassent les capacités des laboratoires individuels.

Le Salk Institute a recruté des responsables informatiques, des développeurs de logiciels et des experts en bioinformatique dédiés, tout en investissant dans une infrastructure informatique de pointe pour répondre aux besoins futurs. Cette infrastructure reconnaît le rôle crucial des logiciels dans la mise à l'échelle. Elle intègre des architectures telles que la conteneurisation Docker, Kubernetes et Terraform pour la gestion des ressources. L'institut investira également dans du matériel informatique GPU et CPU (en mode hybride avec des ressources sur site et dans le cloud) pour soutenir les applications d'IA/ML, essentielles à l'analyse de grands ensembles de données et à la réalisation de découvertes scientifiques. Ces efforts visent à créer une infrastructure de bioinformatique durable et de classe mondiale, positionnant ainsi le Salk pour les avancées scientifiques futures.

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