Ye Zheng, doctor

Profesor

Centro NOMIS de Inmunobiología y Patogénesis Microbiana

Cátedra Becky y Ralph S. O'Connor

Instituto Salk de Estudios Biológicos - Publicaciones

Todas las publicaciones


Hu, X., Liu, Z., Li, Y., You, Y., Yue, K., Liang, Y., Loo, C.S., Yu, J., Leblanc, M., Wang, D., Li, H., Zheng, Y. REV-ERB regula la especificación y función de las células T reguladoras RORγt+ a través del eje Bhlhe40-c-Maf. (2026) Revista de Medicina Experimental. 223(2). DOI: 10.1084/jem.20241463

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Zheng, Y. El succinato socava la estabilidad de FOXP3 y altera la función de las células T. (2025) Naturaleza Inmunológica. DOI: 10.1038/s41590-025-02167-x


Strutzenberg, T.S., Mann, M.D., Li, X., Shin, H., Kelsey, J., Aiyer, S., Yu, J., Gray, G., Zhang, Z., Shan, Z., Zhou, B., Zheng, Y., Griffin, P.R., Lyumkis, D. La Interacción con el Nucleosoma Regula la Estructura y Dinámica del RORγt. (2025) bioRxiv. DOI: 10.1101/2025.03.10.642251

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Yang, Q., Liang, Y., Inoue-Hatanaka, T., Koh, Z., Ilkenhans, N., Suman, E., Yu, J., Zheng, Y. PPARδ frena la función supresora de las Tregs intratumorales al limitar la expresión de CIITA-MHC II. (2024) bioRxiv. DOI: 10.1101/2024.12.16.628819

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Liu, Z., Lee, D.S., Liang, Y., Zheng, Y., Dixon, J.R. Foxp3 orquesta la reorganización de la arquitectura de la cromatina para establecer la identidad de las células T reguladoras. (2023) Nature Communications. 14(1):6943. DOI: 10.1038/s41467-023-42647-y

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Chen, D., Varanasi, S.K., Hara, T., Traina, K., Sun, M., McDonald, B., Farsakoglu, Y., Clanton, J., Xu, S., Garcia-Rivera, L., Mann, T.H., Du, V., Chung, H.K., Xu, Z., Tripple, V., Casillas, E., Ma, S., O'Connor, C., Yang, Q., Zheng, Y., Hunter, T., Lemke, G., Kaech, S.M. El bloqueo de CTLA-4 induce fagocitosis microglial impulsada por IFNγ en células T CD4 y función antitumoral en glioblastoma. (2023) Inmunidad. DOI: 10.1016/j.immuni.2023.07.015

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Liu, Z., Lee, D.S., Liang, Y., Zheng, Y., Dixon, J.R. Foxp3 orquesta la reorganización de la arquitectura de la cromatina para establecer la identidad de las células T reguladoras. (2023) bioRxiv. DOI: 10.1101/2023.02.22.529589

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Ma, S., Yang, Q., Chen, N., Zheng, A., Abbasi, N., Wang, G., Patel, P.R., Cho, B.S., Yee, B.A., Zhang, L., Chu, H., Evans, S.M., Yeo, G.W., Zheng, Y., Huang, W.J.M. La proteína de unión a ARN DDX5 restringe la función supresora de las células T de RORγt para promover la inflamación intestinal. (2023) Avances en Ciencia. 9(5):eadd6165. DOI: 10.1126/sciadv.add6165

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Fu, T., Li, Y., Oh, T.G., Cayabyab, F., He, N., Tang, Q., Coulter, S., Truitt, M., Medina, P., He, M., Yu, R.T., Atkins, A., Zheng, Y., Liddle, C., Downes, M., Evans, R.M. FXR media respuestas intrínsecas de las ILC a la inflamación intestinal. (2022) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 119(51):e2213041119. DOI: 10.1073/pnas.2213041119

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Liu, Z., Hu, X., Liang, Y., Yu, J., Li, H., Shokhirev, M.N., Zheng, Y. La señalización de glucocorticoides y las células T reguladoras cooperan para mantener el nicho de las células madre del folículo piloso. [Pubmed] (2022) Naturaleza Inmunológica. DOI: 10.1038/s41590-022-01244-9

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Choi, J., Oh, T.G., Jung, H., Park, K.Y., Shin, H., Jo, T., Kang, D.S., Chanda, D., Hong, S., Kim, J., Hwang, H., Ji, M., Jung, M., Takashihoji, Matsushima, A., Kim, P., Mun, J.Y., Paik, M.J., Cho, S.J., Lee, I.K., Whitcomb, D.C., Greer, P., Blobner, B., Goodarzi, M.O., Pandol, S.J., Rotter, J.I., Fan, W., Bapat, S.P., Zheng, Y., Liddle, C., Yu, R.T., Atkins, A.R., Downes, M., Yoshihara, E., Evans, R.M., Suh, J.M. El Receptor Relacionado con el Estrógeno γ mantiene la función e identidad de las células acinares pancreáticas regulando el metabolismo celular. (2022) Gastroenterología. DOI: 10.1053/j.gastro.2022.04.013

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Bapat, S.P., Whitty, C., Mowery, C.T., Liang, Y., Yoo, A., Jiang, Z., Peters, M.C., Zhang, L.J., Vogel, I., Zhou, C., Nguyen, V.Q., Li, Z., Chang, C., Zhu, W.S., Hastie, A.T., He, H., Ren, X., Qiu, W., Gayer, S.G., Liu, C., Choi, E.J., Fassett, M., Cohen, J.N., Sturgill, J.L., Crotty Alexander, L.E., Suh, J.M., Liddle, C., Atkins, A.R., Yu, R.T., Downes, M., Liu, S., Nikolajczyk, B.S., Lee, I.K., Guttman-Yassky, E., Ansel, K.M., Woodruff, P.G., Fahy, J.V., Sheppard, D., Gallo, R.L., Ye, C.J., Evans, R.M., Zheng, Y., Marson, A. La obesidad altera la patología y la respuesta al tratamiento en enfermedades inflamatorias. (2022) Naturaleza. 604(7905):337-342. DOI: 10.1038/s41586-022-04536-0

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Qiu, Z., Zhao, L., Shen, J.Z., Liang, Z., Wu, Q., Yang, K., Min, L., Gimple, R.C., Yang, Q., Bhargava, S., Jin, C., Kim, C., Hinz, D., Dixit, D., Bernatchez, J.A., Prager, B.C., Zhang, G., Dong, Z., Lv, D., Wang, X., Kim, L.J.Y., Zhu, Z., Jones, K.A., Zheng, Y., Wang, X., Siqueira-Neto, J.L., Chavez, L., Fu, X.D., Spruck, C., Rich, J.N. La Maquinaria de Elongación de la Transcripción es una Dependencia que Puede Ser Tratada con Fármacos y Potencia la Inmunoterapia en Células Madre de Glioblastoma. (2021) Descubrimiento del cáncer. DOI: 10.1158/2159-8290.CD-20-1848

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Arnett, A., Moo, K.G., Flynn, K.J., Sundberg, T.B., Johannessen, L., Shamji, A.F., Gray, N.S., Decker, T., Zheng, Y., Gersuk, V.H., Rahman, Z.S., Levy, D.E., Marié, I.J., Linsley, P.S., Xavier, R.J., Khor, B. El inhibidor de CDK8 DCA promueve un fenotipo inmunológico químico tolerogénico en células T CD4 a través de una nueva vía CDK8-GATA3-FOXP3. (2021) Biología Molecular y Celular.:MCB0008521 DOI: 10.1128/MCB.00085-21

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Loo, C.S., Gatchalian, J., Liang, Y., Leblanc, M., Xie, M., Ho, J., Venkatraghavan, B., Hargreaves, D.C., Zheng, Y. Una pantalla CRISPR a nivel del genoma revela un papel para el complejo BAF de remodelación de nucleosomas no canónico en la expresión de Foxp3 y la función de las células T reguladoras. (2020) Inmunidad. DOI: 10.1016/j.immuni.2020.06.011

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Hang, S., Paik, D., Yao, L., Kim, E., Jamma, T., Lu, J., Ha, S., Nelson, B.N., Kelly, S.P., Wu, L., Zheng, Y., Longman, R.S., Rastinejad, F., Devlin, A.S., Krout, M.R., Fischbach, M.A., Littman, D.R., Huh, J.R. Los metabolitos de los ácidos biliares controlan la diferenciación de las células T17 y T. (2019) Naturaleza. DOI: 10.1038/s41586-019-1785-z

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Chang, C., Loo, C.S., Zhao, X., Solt, L.A., Liang, Y., Bapat, S.P., Cho, H., Kamenecka, T.M., Leblanc, M., Atkins, A.R., Yu, R.T., Downes, M., Burris, T.P., Evans, R.M., Zheng, Y. El receptor nuclear REV-ERBα modula la enfermedad autoinmune mediada por células Th17. (2019) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 116(37):18528-18536. DOI: 10.1073/pnas.1907563116

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Owen, D.L., Mahmud, S.A., Sjaastad, L.E., Williams, J.B., Spanier, J.A., Simeonov, D.R., Ruscher, R., Huang, W., Proekt, I., Miller, C.N., Hekim, C., Jeschke, J.C., Aggarwal, P., Broeckel, U., LaRue, R.S., Henzler, C.M., Alegre, M.L., Anderson, M.S., August, A., Marson, A., Zheng, Y., Williams, C.B., Farrar, M.A. Las células T reguladoras tímicas surgen a través de dos programas de desarrollo distintos. (2019) Naturaleza Inmunológica. DOI: 10.1038/s41590-018-0289-6

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Zhang, L.J., Chen, S.X., Guerrero-Juarez, C.F., Li, F., Tong, Y., Liang, Y., Liggins, M., Chen, X., Chen, H., Li, M., Hata, T., Zheng, Y., Plikus, M.V., Gallo, R.L. Pérdida de la función antimicrobiana inmunitaria innata de la grasa dérmica relacionada con la edad mediada por el factor de crecimiento transformante beta. (2018) Inmunidad. DOI: 10.1016/j.immuni.2018.11.003

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Klann, J.E., Kim, S.H., Remedios, K.A., He, Z., Metz, P.J., Lopez, J., Tysl, T., Olvera, J.G., Ablack, J.N., Cantor, J.M., Boland, B.S., Yeo, G., Zheng, Y., Lu, L.F., Bui, J.D., Ginsberg, M.H., Petrich, B.G., Chang, J.T. La activación de integrinas controla la tolerancia periférica mediada por células T reguladoras. (2018) Revista de Inmunología. 200(12):4012-4023. DOI: 10.4049/jimmunol.1800112

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Cao, Q., Zhao, X., Bai, J., Gery, S., Sun, H., Lin, D.C., Chen, Q., Chen, Z., Mack, L., Yang, H., Deng, R., Shi, X., Chong, L.W., Cho, H., Xie, J., Li, Q.Z., Müschen, M., Atkins, A.R., Liddle, C., Yu, R.T., Alkan, S., Said, J.W., Zheng, Y., Downes, M., Evans, R.M., Koeffler, H.P. Las proteínas criptocromo del reloj circadiano regulan la autoinmunidad. (2017) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 114(47):12548-12553. DOI: 10.1073/pnas.1619119114

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Wang, J., He, N., Zhang, N., Quan, D., Zhang, S., Zhang, C., Yu, R.T., Atkins, A.R., Zhu, R., Yang, C., Cui, Y., Liddle, C., Downes, M., Xiao, H., Zheng, Y., Auwerx, J., Evans, R.M., Leng, Q. NCoR1 restringe la selección negativa del timo al reprimir la expresión de Bim para preservar los timocitos que se someten a selección positiva. (2017) Nature Communications. 8(1):959. DOI: 10.1038/s41467-017-00931-8

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Klann, J.E., Remedios, K.A., Kim, S.H., Metz, P.J., Lopez, J., Mack, L.A., Zheng, Y., Ginsberg, M.H., Petrich, B.G., Chang, J.T. Talin juega un papel fundamental en el mantenimiento de las células T reguladoras. (2017) Revista de Inmunología. 198(12):4639-4651. DOI: 10.4049/jimmunol.1601165

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Chinen, T., Kannan, A.K., Levine, A.G., Fan, X., Klein, U., Zheng, Y., Gasteiger, G., Feng, Y., Fontenot, J.D., Rudensky, A.Y. Un papel esencial para el receptor de IL-2 en la función de las células Treg. (2016) Naturaleza Inmunológica. 17(11):1322-1333. DOI: 10.1038/ni.3540

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Liu, W.H., Kang, S.G., Huang, Z., Wu, C.J., Jin, H.Y., Maine, C.J., Liu, Y., Shepherd, J., Sabouri-Ghomi, M., Gonzalez-Martin, A., Xu, S., Hoffmann, A., Zheng, Y., Lu, L.F., Xiao, N., Fu, G., Xiao, C. Una vía miR-155-Peli1-c-Rel controla la generación y función de las células T foliculares auxiliares. (2016) Revista de Medicina Experimental. 213(9):1901-19. DOI: 10.1084/jem.20160204

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Bapat, S.P., Myoung Suh, J., Fang, S., Liu, S., Zhang, Y., Cheng, A., Zhou, C., Liang, Y., LeBlanc, M., Liddle, C., Atkins, A.R., Yu, R.T., Downes, M., Evans, R.M., Zheng, Y. El agotamiento de las células Treg residentes en la grasa previene la resistencia a la insulina asociada a la edad. (2015) Naturaleza. 528(7580):137-41. DOI: 10.1038/nature16151

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Hernandez, J.B., Chang, C., LeBlanc, M., Grimm, D., Le Lay, J., Kaestner, K.H., Zheng, Y., Montminy, M. La vía CREB/CRTC2 modula la enfermedad autoinmune al promover la diferenciación de Th17. (2015) Nature Communications. 6:7216. DOI: 10.1038/ncomms8216

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Li, X., Liang, Y., LeBlanc, M., Benner, C., Zheng, Y. Función de un ciselemento de Foxp3 en la protección de la identidad de las células T reguladoras. (2014) Móvil. 158(4):734-48. DOI: 10.1016/j.cell.2014.07.030

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Zheng, Y., Chaudhry, A., Kas, A., deRoos, P., Kim, J.M., Chu, T.T., Corcoran, L., Treuting, P., Klein, U., Rudensky, A.Y. El programa supresor de células T reguladoras se apropia del factor de transcripción IRF4 para controlar las respuestas T(H)2. (2009) Naturaleza. 458(7236):351-6. DOI: 10.1038/nature07674

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Zheng, Y., Josefowicz, S.Z., Kas, A., Chu, T.T., Gavin, M.A., Rudensky, A.Y. Análisis del genoma completo de genes diana de Foxp3 en células T reguladoras en desarrollo y maduras. (2007) Naturaleza. 445(7130):936-40. DOI: 10.1038/nature05563

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Hsieh, C.S., Zheng, Y., Liang, Y., Fontenot, J.D., Rudensky, A.Y. Una intersección entre los repertorios autorreactivos del receptor de células T reguladoras y no reguladoras. (2006) Naturaleza Inmunológica. 7(4):401-10. DOI: 10.1038/ni1318

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Qu, J., Li, X., Novitch, B.G., Zheng, Y., Kohn, M., Xie, J.M., Kozinn, S., Bronson, R., Beg, A.A., Minden, A. La quinasa PAK4 es esencial para la viabilidad embrionaria y el desarrollo neuronal adecuado. (2003) Biología Molecular y Celular. 23(20):7122-33.

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Ouaaz, F., Arron, J., Zheng, Y., Choi, Y., Beg, A.A. El desarrollo y la supervivencia de las células dendríticas requieren subunidades distintas de NF-kappaB. (2002) Inmunidad. 16(2):257-70.

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Educación

BS, Bioquímica y Biología Molecular, Universidad de Pekín, Pekín, China
Doctorado, Universidad de Columbia
Investigador posdoctoral, Universidad de Washington
Investigador Académico del Memorial Sloan-Kettering Cancer Center
Beca Posdoctoral del Instituto de Investigación del Cáncer


Afiliaciones


Premios y distinciones

  • Premio Rita Allen Foundation Scholar, 2010-2015