Una nueva subvención financiará un esfuerzo colaborativo para construir ensayos reproducibles para modelar el autismo

23 de Septiembre de 2015

Una nueva subvención financiará un esfuerzo colaborativo para construir ensayos reproducibles para modelar el autismo

Con un modelo universal derivado de células madre, los investigadores pueden abordar diversas enfermedades de manera más completa

23 de Septiembre de 2015

LA JOLLA-Los Institutos Nacionales de Salud ha otorgado una subvención de $ 13 millones durante cinco años para desarrollar y difundir nuevas tecnologías y ensayos basados ​​​​en células madre para estudiar trastorno del espectro autista (TEA) y otras enfermedades de salud mental a un consorcio de investigadores del Universidad de California, San Diego y el Instituto Salk de Estudios Biológicos, trabajando en conjunto con líderes en el sector de la biotecnología.

Muchos trastornos de salud mental, incluido el TEA, están fuertemente influenciados, a veces exclusivamente, por la variación genética individual. El desafío ha sido durante mucho tiempo determinar los tipos y grados de variación e influencia, que actualmente son difíciles, si no imposibles, de recapitular con precisión en los modelos celulares y animales existentes.

Las células madre pluripotentes inducidas por humanos generadas a partir del tejido del paciente proporcionan un recurso celular prometedor porque albergan patrones genómicos individuales de variación que contribuyen o causan estos trastornos. Sin embargo, un obstáculo importante ha sido que estas células generan hallazgos variables debido a diferencias adicionales en la composición genómica de las células del paciente, y las técnicas y enfoques experimentales utilizados para generar los tipos de células apropiados por diferentes laboratorios a menudo resultan en inconsistencias en la heterogeneidad de los tipos celulares. El enfoque adoptado por los investigadores de San Diego para superar estas limitaciones tiene dos vertientes. En primer lugar, introducen las variaciones genómicas relevantes para la enfermedad en un fondo genómico único y, en segundo lugar, las herramientas que están construyendo se replican en diferentes laboratorios antes de que se consideren lo suficientemente sólidas para su distribución pública.

"La reproducibilidad y la solidez son claves para los descubrimientos científicos, poder comparar hallazgos, saber que todos estamos mirando y hablando de los mismos datos para llegar a la misma conclusión", dijo uno de los investigadores principales del proyecto, Gene Yeo, profesor asociado de medicina celular y molecular en la Facultad de Medicina de UC San Diego y miembro fundador del Instituto de Medicina Genómica. “Esta es una subvención humilde. Es pragmático. La idea es construir herramientas computacionales y moleculares y recursos celulares que sean de código abierto, accesibles, que brinden resultados reproducibles y que sean fundamentalmente útiles para los científicos de células madre”.

La colaboración tripartita federal-académica-industrial, encabezada por Yeo, experto en análisis de células individuales y heterogeneidad, reunirá a algunos de los principales expertos en el campo del desarrollo de ensayos en el modelado celular:

• Alysson Muotri, profesora asociada en los Departamentos de Pediatría y Medicina Celular y Molecular de la Facultad de Medicina de UC San Diego, cuyo laboratorio creó el primer modelo de neurona autista (autismo en un plato) en 2010
• Larry Goldstein, Profesor Distinguido en los Departamentos de Neurociencia y Medicina Celular y Molecular de la Facultad de Medicina de UC San Diego y director del Programa de Células Madre de UC San Diego y del Centro Clínico de Células Madre de Sanford, cuya experiencia en ingeniería genética ayudó a crear el primer derivado de células madre , modelos de neuronas in vitro de la enfermedad de Alzheimer en 2012
• Shelley Halpain, profesora de la División de Ciencias Biológicas de UC San Diego
• eduardo callaway, Cátedra Audrey Geisel de Ciencias Biomédicas en el Instituto Salk de Estudios Biológicos, una autoridad en análisis de redes y sinapsis funcional

Estos líderes académicos y colegas colaborarán con las empresas de biotecnología BD Biosciences y Fluidigm Corporation, y juntos proporcionarán nuevas herramientas y tecnologías para llevar modelos y ensayos prometedores a la investigación preclínica y su eventual uso a gran escala.

Yeo señaló que una ventaja clave del proyecto es que cuatro de los cinco investigadores clave están ubicados en el Consorcio Sanford de Medicina Regenerativa. Estamos todos en el mismo edificio. Es terreno común. Nos vemos todo el tiempo”.

“Los métodos de células individuales son clave para la creación de herramientas estandarizadas basadas en células madre para satisfacer las necesidades críticas de salud mental. Fluidigm está encantado de trabajar con este grupo de científicos líderes. El laboratorio de Gene Yeo fue uno de nuestros primeros sitios de prueba del sistema C1TM que condujo al establecimiento de una instalación central de una sola célula en el Consorcio de Sanford”, dijo Robert C. Jones, Fluidigm, director de tecnología de genómica. “El entorno colaborativo abierto del Consorcio Sanford y la participación directa de la industria permitida en esta subvención de los NIH garantizarán que estas herramientas sean ampliamente útiles”.

El proyecto de investigación se titula formalmente Colaboración en ensayos celulares de autismo preclínico, firmas biológicas y análisis de redes. Los científicos lo llaman COPACABANA.