Osorio-Vasquez, V., Zhu, J., Lumibao, J.C., Lande, K., Peck, K.L., Stamp, M.K., Okhovat, S.R., Song, H., Ogawa, S., Kubota, C., Pantazopoulou, V., Dai, Y., Rock, A., Bottomley, C., Thomas, E., Hsu, J., Morales, A.H., Fowler, A., McGriff, T., Evensen, K.G., Larsen, S., Abdulla, M., Greer, P., Gibson, J., Downes, M., Evans, R., Lowy, A.M., Whitcomb, D.C., Zou, J., Molinolo, A., Oh, T.G., White, R., Bellin, M., Tiriac, H., Engle, D.D. Aus chronischer Pankreatitis stammende Organoide eröffnen neue Wege für präzise Therapien. (2025) bioRxiv. DOI: 10.1101/2024.10.30.620903

Dondi, C., Vogler, G., Gupta, A., Walls, S.M., Kervadec, A., Marchant, J., Romero, M.R., Diop, S., Goode, J., Thomas, J.B., Colas, A.R., Bodmer, R., Montminy, M., Ocorr, K. Der Nährstoffsensor CRTC und Sarcalumenin/thinman stellen einen alternativen Weg bei der Herzhypertrophie dar. (2024) Cell Reports. 43(8):114549. DOI: 10.1016/j.celrep.2024.114549

Thomas, S.T., Shin, Y., La Clair, J.J., Noel, J.P. Pflanzenbasierter CO-Entzug und -Speicherung als SiC. (2021) RSC Adv. 11(26):15512–15518. DOI: 10.1039/d1ra00954k

Wang, T., Wiater, E., Zhang, X., Thomas, J.B., Montminy, M. Crtc moduliert Fastenprogramme im Zusammenhang mit dem 1-C-Stoffwechsel und der Hemmung der Insulinsignalisierung. (2021) Verhandlungen der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 118(12). DOI: 10.1073/pnas.2024865118

Babski, H., Jovanic, T., Surel, C., Yoshikawa, S., Zwart, M.F., Valmier, J., Thomas, J.B., Enriquez, J., Carroll, P., Garcès, A. Eine GABAerge Maf-exprimierende Interneuron-Teilmenge reguliert die Geschwindigkeit der Fortbewegung bei Drosophila. (2019) Nature Communications. 10(1):4796. DOI: 10.1038/s41467-019-12693-6

Shen, R., Wang, B., Giribaldi, M.G., Ayres, J., Thomas, J.B., Montminy, M. Der neuronale energieempfindliche Signalweg fördert das Energiegleichgewicht durch Modulation der Krankheitsresistenz. (2016) Verhandlungen der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 113(23):E3307-14. DOI: 10.1073/pnas.1606106113

Long, H., Yoshikawa, S., Thomas, J.B. Entsprechende Aktivitäten von repulsiven Axon-Guidance-Rezeptoren. (2016) Journal of Neuroscience. 36(4):1140-1150. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.3406-15.2016

Yoshikawa, S., Long, H., Thomas, J.B. Eine Teilmenge von Interneuronen, die für die Lokomotion von Drosophila-Larven erforderlich sind. (2016) Molekulare und Zelluläre Neurowissenschaften. 70:22-29. DOI: 10.1016/j.mcn.2015.11.008

Read, R.D., Fenton, T.R., Gomez, G.G., Wykosky, J., Vandenberg, S.R., Babic, I., Iwanami, A., Yang, H., Cavenee, W.K., Mischel, P.S., Furnari, F.B., Thomas, J.B. Ein kinomweiter RNAi-Screen in Drosophila-Glia zeigt, dass die RIO-Kinasen die Zellproliferation und das Überleben durch TORC2-Akt-Signalwege bei Glioblastomen vermitteln. (2013) PLOS Genetics. 9(2). DOI: 10.1371/journal.pgen.1003253

Wang, B., Moya, N., Niessen, S., Hoover, H., Mihaylova, M.M., Shaw, R.J., Yates, J.R., Fischer, W.H., Thomas, J.B., Montminy, M. Ein hormonabhängiges Modul, das die Energiehomöostase reguliert. (2011) Zelle. 145(4):596-606. DOI: 10.1016/j.cell.2011.04.013

Sakurai, M., Aoki, T., Yoshikawa, S., Santschi, L.A., Saito, H., Endo, K., Ishikawa, K., Kimura, K., Ito, K., Thomas, J.B., Hama, C. Diferenziert exprimierte Drl und Drl-2 spielen gegensätzliche Rollen in der Wnt5-Signalübertragung während der Entwicklung des Geruchssystems von Drosophila. (2009) Journal of Neuroscience. 29(15):4972-4980. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.2821-08.2009

Read, R.D., Cavenee, W.K., Furnari, F.B., Thomas, J.B. Ein Drosophila-Modell für EGFR-Ras- und PI3K-abhängige humane Gliome. (2009) PLOS Genetics. 5(2). DOI: 10.1371/journal.pgen.1000374

Wang, B., Goode, J., Best, J., Meltzer, J., Schilman, P.E., Chen, J., Garza, D., Thomas, J.B., Montminy, M. Der Insulin-regulierte CREB-Koaktivator TORC fördert die Stressresistenz bei Drosophila. (2008) Zellstoffwechsel. 7(5):434-44. DOI: 10.1016/j.cmet.2008.02.010

Inaki, M., Yoshikawa, S., Thomas, J.B., Aburatani, H., Nase, A. Wnt4 ist ein lokaler repulsiver Faktor, der die synaptische Zielspezifität bestimmt. (2007) Current Biology. 17(18):1574-9. DOI: 10.1016/j.cub.2007.08.013

Hughes, C.L., Thomas, J.B. Ein sensorischer Rückkopplungskreis koordiniert die Muskelaktivität bei Drosophila. (2007) Molekulare und Zelluläre Neurowissenschaften. 35(2):383-396. DOI: 10.1016/j.mcn.2007.04.001

Boyle, M., Nighorn, A., Thomas, J.B. Der Drosophila Eph-Rezeptor steuert spezifische Axonverzweigungen von Mushroom-Body-Neuronen. (2006) Entwicklung. 133(9):1845-1854. DOI: 10.1242/dev.02353

Fradkin, L.G., Garriga, G., Salinas, P.C., Thomas, J.B., Yu, X., Zou, Y. Wnt-Signalweg in der Entwicklung neuronaler Schaltkreise. (2005) Journal of Neuroscience. 25(45):10376-10378. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.3429-05.2005

Labrador, J.P., O'keefe, D., Yoshikawa, S., McKinnon, R.D., Thomas, J.B., Bashaw, G.J. Der Homöobox-Transkriptionsfaktor even-skipped reguliert die Netrin-Rezeptorexpression zur Steuerung von dorsalen Motoneuronaxonen-Projektionen bei Drosophila. (2005) Current Biology. 15(15):1413-1419. DOI: 10.1016/j.cub.2005.06.058

Yoshikawa, S., Thomas, J.B. Sekretierte Moleküle der Zellsignalübertragung bei der Axonführung. (2004) Aktuelle Meinungen in der Neurobiologie. 14(1):45-50. DOI: 10.1016/j.conb.2004.01.005

Imondi, R., Thomas, J.B. Neurowissenschaften. Die Höhen und Tiefen der Wnt-Signalgebung. (2003) Wissenschaft. 302(5652):1903-1904. DOI: 10.1126/science.1092976

van Meyel, D.J., Thomas, J.B., Agulnick, A.D. SSDP-Proteine binden an LIM-interagierende Kofaktoren und regulieren die Aktivität von LIM-Homeodomain-Proteinkomplexen in vivo. (2003) Entwicklung. 130(9):1915-1925.

Yoshikawa, S., McKinnon, R.D., Kokel, M., Thomas, J.B. Wnt-vermittelte Axonführung über den Drosophila Derailed-Rezeptor. (2003) Natur. 422(6932):583-588. DOI: 10.1038/nature01522

Thor, S., Thomas, J.B. Spezifikation von Motoneuronen bei Würmern, Fliegen und Mäusen: konservierte und 'verlorene' Mechanismen. (2002) Current Opinion in Genetics & Development. 12(5):558-564.

Diagana, T.T., Thomas, U., Prokopenko, S.N., Xiao, B., Worley, P.F., Thomas, J.B. Mutation von Drosophila-Homer stört die Kontrolle der Lokomotionsaktivität und Verhaltensplastizität. (2002) Journal of Neuroscience. 22(2):428-436.

Herzig, M.C., Thor, S., Thomas, J.B., Reichert, H., Hirth, F. Expression und Funktion des LIM-Homeodomain-Proteins Apterous während der embryonalen Hirnentwicklung von Drosophila. (2001) Dev. Genes Evol. 211(11):545-554. DOI: 10.1007/s00427-001-0195-y

O'Keefe, D.D., Thomas, J.B. Drosophila Flügelentwicklung in Abwesenheit von dorsaler Identität. (2001) Entwicklung. 128(5):703-710.

Yoshikawa, S., Bonkowsky, J.L., Kokel, M., Shyn, S., Thomas, J.B. Der entgleiste Leitlinienrezeptor benötigt in vivo keine Kinaseaktivität. (2001) Journal of Neuroscience. 21(1):RC119.

van, Thomas, J.B. Chip ist ein essentieller Kofaktor für Apterous bei der Regulation der Axonführung bei Drosophila. (2000) Entwicklung. 127(9):1823-1831.

Jurata, L.W., Thomas, J.B., Pfaff, S.L. Transkriptionelle Mechanismen bei der Entwicklung der motorischen Kontrolle. (2000) Aktuelle Meinungen in der Neurobiologie. 10(1):72-9.

Bonkowsky, J.L., Yoshikawa, S., O'Keefe, D.D., Scully, A.L., Thomas, J.B. Axon-Routing über die Mittellinie, gesteuert durch den Drosophila Rezeptor Derailed. (1999) Natur. 402(6761):540-544. DOI: 10.1038/990122

Lilly, B., O'Keefe, D.D., Thomas, J.B., Stiefel, J. Das LIM-Homeodomain-Protein dLim1 definiert eine Unterklasse von Neuronen im embryonalen ventralen Nervenstrang von Drosophila. (1999) Mech. Dev. 88(2):195-205.

van Meyel, D.J., O'Keefe, D.D., Jurata, L.W., Thor, S., Gill, G.N., Thomas, J.B. Chip und Apterous interagieren physisch und bilden während der Entwicklung von Drosophila einen funktionellen Komplex. (1999) Molekulare Zelle. 4(2):259-265.

Scully, A.L., McKeown, M., Thomas, J.B. Isolierung und Charakterisierung von Dek, einer Drosophila EPH-Rezeptor-Proteinkinase. (1999) Molekulare und Zelluläre Neurowissenschaften. 13(5):337-347. DOI: 10.1006/mcne.1999.0752

Bonkowsky, J.L., Thomas, J.B. Zelltypspezifische modulare Regulation von derailed im Nervensystem von Drosophila. (1999) Mech. Dev. 82(1-2):181-184.

Thor, S., Andersson, S.G., Tomlinson, A., Thomas, J.B. Ein LIM-Homeodomain-Kombinationscode für die Auswahl von Motoneuronwegen. (1999) Natur. 397(6714):76-80. DOI: 10.1038/16275

Benveniste, R. J., Thor, S., Thomas, J.B., Taghert, P.H. Zelltypspezifische Regulation des Drosophila FMRF-NH2 Neuropeptid-Gens durch Apterous, einen LIM-Homeodomain-Transkriptionsfaktor. (1998) Entwicklung. 125(23):4757-4765.

Oates, A.C., Bonkovsky, J.L., Irvine, D.V., Kelly, L.E., Thomas, J.B., Wilks, A.F. Embryonale Expression und Aktivität von Doughnut, einem zweiten RYK-Homolog bei Drosophila. (1998) Mech. Dev. 78(1-2):165-169.

Callahan, C.A., Yoshikawa, S., Thomas, J.B. Axonverfolgung. (1998) Aktuelle Meinungen in der Neurobiologie. 8(5):582-586.

O'Keefe, D.D., Thor, S., Thomas, J.B. Funktion und Spezifität von LIM-Domänen im Nervensystem und der Flügelentwicklung von Drosophila. (1998) Entwicklung. 125(19):3915-3923.

Thomas, J.B. Axonengewinnung: Überqueren der Mittellinie. (1998) Current Biology. 8(3):R102-R104.

Thor, S., Thomas, J.B. Das Drosophila-Gen Islet steuert die Axonverfolgung und die Identität von Neurotransmittern. (1997) Neuron. 18(3):397-409.

Callahan, C.A., Bonkovsky, J.L., Scully, A.L., Thomas, J.B. Derailed ist für die Auswahl von Muskelansatzstellen bei Drosophila erforderlich. (1996) Entwicklung. 122(9):2761-2767.

Callahan, C.A., Muralidhar, M.G., Lundgren, S.E., Scully, A.L., Thomas, J.B. Steuerung der Auswahl neuronaler Bahnen durch ein Mitglied der Rezeptor-Protein-Tyrosinkinase-Familie bei Drosophila. (1995) Natur. 376(6536):171-174. DOI: 10.1038/376171a0

Lundgren, S.E., Callahan, C.A., Thor, S., Thomas, J.B. Kontrolle der neuronalen Pfadauswahl durch das Drosophila LIM-Homeodomänen-Gen apterous. (1995) Entwicklung. 121(6):1769-1773.

Blair, S.S., Brower, D.L., Thomas, J.B., Zavortink, M. Die Rolle von apterous bei der Kontrolle der dorsoventralen Kompartimentierung und der PS-Integrin-Genexpression in der sich entwickelnden Flügelde von Drosophila. (1994) Entwicklung. 120(7):1805-1815.

Callahan, C.A., Thomas, J.B. Tau-Beta-Galactosidase, ein axonales Fusionsprotein. (1994) Verhandlungen der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 91(13):5972-5976.

Muralidhar, M.G., Thomas, J.B. Das Drosophila-Gen bendless kodiert für ein neuronales Protein, das mit Ubiquitin-konjugierenden Enzymen verwandt ist. (1993) Neuron. 11(2):253-266.

Muralidhar, M.G., Callahan, C.A., Thomas, J.B. Zielgericht. (1993) Mech. Dev. 41(2-3):129-138.

Bourgouin, C., Lundgren, S.E., Thomas, J.B. Apterous ist ein Drosophila-LIM-Domänen-Gen, das für die Entwicklung einer Teilmenge embryonaler Muskeln erforderlich ist. (1992) Neuron. 9(3):549-561.

Thomas, J.B., Crews, S.T. Molekulare Genetik der neuronalen Entwicklung im Drosophila-Embryo. (1990) FASEB Journal. 4(8):2476-2482.

Kräne, S.T., Thomas, J.B., Goodman, C.S. Das Drosophila-Gen single-minded kodiert für ein Kernprotein mit Sequenzähnlichkeit zum Genprodukt von per. (1988) Zelle. 52(1):143-151.

Thomas, J.B., Crews, S.T., Goodman, C.S. Molekulare Genetik des Single-minded-Locus: Ein Gen, das an der Entwicklung des Nervensystems von Drosophila beteiligt ist. (1988) Zelle. 52(1):133-141.

Goodman, C.S., Bastiani, M.J., Doe, C.Q., du Lac, S., Helfand, S.L., Kuwada, J.Y., Thomas, J.B. Zellerkennung während der neuronalen Entwicklung. (1984) Wissenschaft. 225(4668):1271-1279.

Thomas, J.B., Bastiani, M.J., Bate, M., Goodman, C.S. Vom Grashüpfer zu Drosophila: ein gemeinsamer Plan für die neuronale Entwicklung. (1984) Natur. 310(5974):203-207.

Thomas, J.B., Wyman, R.J. Duplizierte neuronale Struktur bei Bithorax-Mutanten von Drosophila. (1984) Entwicklungsbiologie. 102(2):531-3.

Thomas, J.B., Wyman, R.J. Mutationen, die die synaptische Konnektivität zwischen identifizierten Neuronen bei Drosophila verändern. (1984) Journal of Neuroscience. 4(2):530-538.

Wyman, R.J., Thomas, J.B. Welche Gene sind notwendig, um eine identifizierte Synapse zu bilden? (1983) Cold Spring Harbor Symposia für Quantitative Biologie. 48 Pt 2:641-652.

Thomas, J.B., Wyman, R.J. Eine Mutation bei Drosophila verändert die normale Konnektivität zwischen zwei identifizierten Neuronen. (1982) Natur. 298(5875):650-651.

Wyman, R.J., Thomas, J.B. Die Mathematik der Mosaikanalyse. I: Die Beziehung zwischen Stürzen und Entfernung. (1982) Genetik. 100(4):659-676.

Koto, M., Tanouye, M.A., Ferrus, A., Thomas, J.B., Wyman, R.J. Die Morphologie des zervikalen Riesenfaserneurons von Drosophila. (1981) Gehirnforschung. 221(2):213-217.