Centre de choc Nathan de San Diego

Séquençage et analyse de cellule unique

Salk Institute for Biological Studies - San Diego Nathan Shock Center - Séquençage et analyse de cellules individuelles

Services de séquençage et de génomique


1) Préparation de la bibliothèque pour le séquençage en masse

Nous fournissons les services de préparation de bibliothèques suivants pour le séquençage en vrac d'ARN et d'ADN :

    • Bibliothèque d'ARNm Illumina Stranded
    • Librairie Illumina Total RNA-Seq
    • Bibliothèque d'ADN Nextera XT/Flex
    • Préparation de la bibliothèque NEB ChIP-Seq
    • Préparation d'ADNc Takara à très faible entrée RNA-Seq
    • Préparation d'échantillons sans PCR

2) Préparation de la bibliothèque pour le séquençage unicellulaire/nucléi (réservé aux boursiers locaux)

Nous fournissons les services de préparation de bibliothèques génomiques 10x suivants pour le séquençage d'une seule cellule et d'un seul noyau :

    • Cellule unique 3' v3.1
    • ATAC à cellule unique
    • Multiome unicellulaire
    • Cellule unique 5' VDJ v2

3) Séquençage Next-Gen

Nous fournissons une large gamme de services de séquençage en utilisant les séquenceurs Illumina suivants :

    • NovaSeq 6000
    • SuivantSeq 2000
    • MiniSeq
    • MiSeq

4) Expression génétique numérique avec le nCounter MAX

Nous fournissons des tests d'expression génique numériques robustes pour les échantillons d'ARN en faible quantité et/ou dégradés en utilisant le nanoString Système d'analyse nCounter MAX avec panels de gènes qui peut cibler jusqu'à 800 gènes.

5) Essais de transcriptomique et de protéomique spatiales de tissus entiers avec le profileur spatial numérique NanoString GeoMx (à venir en 2024)

Contact Core de séquençage de nouvelle génération : samplesubmission@salk.edu