Alan Saghatelian, Doctor en Filosofía

Profesor

Laboratorios de la Fundación Clayton para la Biología de los Péptidos

Presidencia Dr. Frederik Paulsen

Instituto Salk de Estudios Biológicos - Publicaciones

Todas las publicaciones


Vaughan, J.M., Pai, V.J., Miller, B., Vieira de Souza, E., Donaldson, C.J., Saghatelian, A. Péptido Secretado Derivado de Microproteínas que Estimula la Producción Celular de AMPc. (2026) Bioquímica. DOI: 10.1021/acs.biochem.5c00764

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Świrski, M.I., Tierney, J.A.S., Albà, M.M., Andreev, D.E., Aspden, J.L., Atkins, J.F., Bassani-Sternberg, M., Berry, M.J., Biffo, S., Boris-Lawrie, K., Borodovsky, M., Brierley, I., Brook, M., Brunet, M.A., Bujnicki, J.M., Caliskan, N., Calviello, L., Carvunis, A.R., Cate, J.H.D., Cenik, C., Chang, K.Y., Chen, Y., Chothani, S., Choudhary, J.S., Clark, P.L., Clauwaert, J., Cooley, L., Dassi, E., Dean, K., Diaz, J.J., Dieterich, C., Dikstein, R., Dinman, J.D., Dmitriev, S.E., Dontsova, O.A., Dunham, C.M., Eswarappa, S.M., Farabaugh, P.J., Faridi, P., Fierro-Monti, I., Firth, A.E., Gatfield, D., Gebauer, F., Gelfand, M.S., Gray, N.K., Green, R., Hill, C.H., Hou, Y.M., Hübner, N., Ignatova, Z., Ivanov, P., Iwasaki, S., Johnson, R., Jomaa, A., Jovanovic, M., Jungreis, I., Kellis, M., Kieft, J.S., Kochetov, A.V., Koonin, E.V., Korostelev, A.A., Kufel, J., Kulakovskiy, I.V., Kurian, L., Lafontaine, D.L.J., Larsson, O., Loughran, G., Lukeš, J., Mariotti, M., Martens-Uzunova, E.S., Martinez, T.F., Matsumoto, A., McManus, J., Medenbach, J., Melnikov, S.V., Menschaert, G., Merchante, C., Mikl, M., Miller, W.A., Mühlemann, O., Namy, O., Nedialkova, D.D., Nosek, J., Orchard, S., Ozretić, P., Pertea, M., Pervouchine, D.D., Romão, L., Ron, D., Roucou, X., Rubtsova, M.P., Ruiz-Orera, J., Saghatelian, A., Salzberg, S.L., Seale, L.A., Seoighe, C., Sergiev, P.V., Shah, P., Shirokikh, N., Slavoff, S.A., Sonenberg, N., Stasevich, T.J., Szczesny, R.J., Tamm, T., Tchórzewski, M., Topisirovic, I., Tremblay, M.L., Tuller, T., Ulitsky, I., Valášek, L.S., Van Damme, P., Viero, G., Vizcaino, J.A., Vogel, C., Wallace, E.W.J., Weissman, J.S., Westhof, E., Whiffin, N., Wilson, D.N., Xie, Z., Yewdell, J.W., Yordanova, M.M., Yu, C.H., Yurchenko, V., Zagrovic, B., , Valen, E., Baranov, P.V. Translon: un término único para regiones traducidas. (2025) Nature Methods. DOI: 10.1038/s41592-025-02810-3


Miller, B., de Souza, E.V., Pai, V.J., Kim, H., Vaughan, J.M., Lau, C.J., Diedrich, J.K., Saghatelian, A. ShortStop: un marco de aprendizaje automático para el descubrimiento de microproteínas. (2025) BMC Métodos. 2(1):16. DOI: 10.1186/s44330-025-00037-4

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Rocha, A.L., Schmedt, C., Perkins, G., Pinto, A., Diedrich, J.K., Shan, H., Plucińska, K., Vieira de Souza, E., Vaughan, J.M., Foster, M., Sampath, S.C., Sampath, S.C., Cohen, P., Ellisman, M.H., Saghatelian, A. Estructura y función mitocondrial anormales en tejido adiposo pardo de ratones knockout para SLC35A4-MP. (2025) Avances en Ciencia. 11(35):eads7381. DOI: 10.1126/sciadv.ads7381

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Jayatissa, A., Jaunbocus, N., Erkalo, B., Jiang, K., Zheng, S.J., Su, H., Yan, L., Choi, J.Y., Vaughan, J., Bacchiocchi, A., Na, Z., Cao, X., Halaban, R., Saghatelian, A., Craft, J., Chen, Y.G., Slavoff, S.A. La Microproteína ERVK3-1 Interactúa con el Complejo HUSH. (2025) Bioquímica. DOI: 10.1021/acs.biochem.5c00023

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Padre, V.J., Saghatelian, A. "Desvío" de la obesidad con metabolitos endógenos novedosos. (2025) Metabolismo Celular. 37(3):564-565. DOI: 10.1016/j.cmet.2025.02.005

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Pai, V.J., Shan, H., Donaldson, C., Vaughan, J., O'Connor, C., Liem, M., Pinto, A., Diedrich, J., Saghatelian, A. El cribado CRISPR-Cas9 revela microproteínas que regulan la proliferación de adipocitos y el metabolismo lipídico. (2025) bioRxiv. DOI: 10.1101/2025.03.21.644636

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Tan, D., Saghatelian, A. La medición, regulación y actividad biológica de las FAHFAs. (2025) Nature Chemical Biology. DOI: 10.1038/s41589-024-01827-7

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Pai, V.J., Lau, C.J., Garcia-Ruiz, A., Donaldson, C., Vaughan, J.M., Miller, B., De Souza, E.V., Pinto, A.M., Diedrich, J., Gavva, N.R., Yu, S., DeBoever, C., Horman, S.R., Saghatelian, A. Regulación de ARN codificante de microproteínas en células tratadas con estímulos proinflamatorios y profibróticos. (2024) BMC Genómica. 25(1):1034. DOI: 10.1186/s12864-024-10948-1

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Chaix, A., Lin, T., Ramms, B., Cutler, R.G., Le, T., Lopez, C., Miu, P., Pinto, A.F.M., Saghatelian, A., Playford, M.P., Mehta, N.N., Mattson, M.P., Gordts, P., Witztum, J.L., Panda, S. La alimentación con restricción de tiempo reduce la aterosclerosis en ratones LDLR KO, pero no en ratones con deleción de ApoE. (2024) Arterioscler Thromb Vasc Biol. DOI: 10.1161/ATVBAHA.124.320998

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Riecan, M., Domanska, V., Lupu, C., Patel, M., Vondrackova, M., Rossmeisl, M., Saghatelian, A., Lupu, F., Kuda, O. Diferencia dependiente del sexo y específica del tejido en el metabolismo de ésteres de ácidos grasos de ácidos grasos hidroxilados. (2024) Biochim Biophys Acta Mol Cell Biol Lipids.:159543 DOI: 10.1016/j.bbalip.2024.159543

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Vieira de Souza, E., L Bookout, A., Barnes, C.A., Miller, B., Machado, P., Basso, L.A., Bizarro, C.V., Saghatelian, A. Rp3: La proteogenómica asistida por perfilado de ribosomas mejora la cobertura y la confianza en el descubrimiento de microproteínas. (2024) Nature Communications. 15(1):6839. DOI: 10.1038/s41467-024-50301-4

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Zlitni, S., Bowden, S., Sberro, H., Torres, M.D.T., Vaughan, J.M., Pinto, A.F.M., Pinto, Y., Fernandez, D., Röst, H., Saghatelian, A., de la Fuente-Nunez, C., Bhatt, A.S. Control dual de detección de quórum en la biosíntesis de purinas impulsa la aptitud patógena de . (2024) bioRxiv. DOI: 10.1101/2024.08.13.607696

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Kim, D.I., Park, S., Park, S., Ye, M., Chen, J.Y., Kang, S.J., Jhang, J., Hunker, A.C., Zweifel, L.S., Caron, K.M., Vaughan, J.M., Saghatelian, A., Palmiter, R.D., Han, S. Sensor presináptico y silenciador de la transmisión peptidergica revelan que los neuropéptidos son los principales transmisores en el circuito del miedo pontino. (2024) Móvil. DOI: 10.1016/j.cell.2024.06.035

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Yan, S., Santoro, A., Niphakis, M.J., Pinto, A.M., Jacobs, C.L., Ahmad, R., Suciu, R.M., Fonslow, B.R., Herbst-Graham, R.A., Ngo, N., Henry, C.L., Herbst, D.M., Saghatelian, A., Kahn, B.B., Rosen, E.D. La inflamación causa resistencia a la insulina en ratones a través de la reducción mediada por el factor regulador de interferón 3 (IRF3) de los niveles de FAHFA. (2024) Nature Communications. 15(1):4605. DOI: 10.1038/s41467-024-48220-5

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Rocha, A.L., Pai, V., Perkins, G., Chang, T., Ma, J., Chu, Q., Vaughan, J.M., Diedrich, J.K., Ellisman, M.H., Saghatelian, A. Una microproteína de la membrana mitocondrial interna del marco de lectura abierto (ORF) aguas arriba de SLC35A4 regula el metabolismo celular. (2024) Revista de Biología Molecular.:168559 DOI: 10.1016/j.jmb.2024.168559

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Riecan, M., Domanska, V., Lupu, C., Patel, M., Vondrackova, M., Rossmeisl, M., Saghatelian, A., Lupu, F., Kuda, O. Diferencia sexual específica de tejido en el metabolismo de los ésteres de ácidos grasos de ácidos grasos hidroxilados. (2023) bioRxiv. DOI: 10.1101/2023.11.15.567158

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Xie, L., Bowman, M.E., Louie, G.V., Zhang, C., Ardejani, M.S., Huang, X., Chu, Q., Donaldson, C.J., Vaughan, J.M., Shan, H., Powers, E.T., Kelly, J.W., Lyumkis, D., Noel, J.P., Saghatelian, A. Bioquímica e Interacciones Proteicas del Microproteína CYREN. (2023) Bioquímica. DOI: 10.1021/acs.biochem.3c00397

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Martinez, T.F., Lyons-Abbott, S., Bookout, A.L., De Souza, E.V., Donaldson, C., Vaughan, J.M., Lau, C., Abramov, A., Baquero, A.F., Baquero, K., Friedrich, D., Huard, J., Davis, R., Kim, B., Koch, T., Mercer, A.J., Misquith, A., Murray, S.A., Perry, S., Pino, L.K., Sanford, C., Simon, A., Zhang, Y., Zipp, G., Bizarro, C.V., Shokhirev, M.N., Whittle, A.J., Searle, B.C., MacCoss, M.J., Saghatelian, A., Barnes, C.A. Perfilamiento de adipocitos marrones y blancos de ratón para identificar pequeños marcos de lectura abiertos (ORFs) y microproteínas funcionales metabólicamente relevantes. (2023) Metabolismo Celular. 35(1):166-183.e11. DOI: 10.1016/j.cmet.2022.12.004

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Miller, B., Kim, S.J., Mehta, H.H., Cao, K., Kumagai, H., Thumaty, N., Leelaprachakul, N., Jiao, H., Vaughan, J., Diedrich, J., Saghatelian, A., Arpawong, T.E., Crimmins, E.M., Ertekin-Taner, N., Tubi, M.A., Hare, E.T., Braskie, M.N., Décarie-Spain, L., Kanoski, S.E., Grodstein, F., Bennett, D.A., Zhao, L., Toga, A.W., Wan, J., Yen, K., Cohen, P. La variación del ADN mitocondrial en la enfermedad de Alzheimer revela una microproteína única llamada SHMOOSE. (2022) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038/s41380-022-01769-3

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Merlic, C.A., Aldrich, C.C., Albaneze-Walker, J., Saghatelian, A. Carbene Complexes in the Synthesis of Complex Natural Products: Total Synthesis of the Calphostins. (2000) Revista de la Sociedad Química Estadounidense. 122(13):3224-3225.


Educación

BS, Química, Universidad de California, Los Ángeles
Doctorado en Química, The Scripps Research Institute, La Jolla, California
Becario posdoctoral Merck de la Life Sciences Research Foundation, 2003


Afiliaciones


Premios y distinciones

  • Premio Endeavor de la Mark Foundation para la Investigación del Cáncer, 2022
  • Miembros de la Asociación Estadounidense para el Avance de la Ciencia, 2020
  • Becario de la Fundación Sloan, 2011
  • Programa de Becarios Searle, 2008
  • Premio New Innovator, Institutos Nacionales de Salud, 2007
  • Premio de Carrera del Fondo Burroughs Wellcome en Ciencias Biomédicas, 2005