Los científicos de Salk revelan el gen mutado más común en todos los cánceres

Los científicos de Salk revelan el gen mutado más común en todos los cánceres

El hallazgo muestra que algunas de las mutaciones más buscadas por la medicina no son tan comunes como se pensaba anteriormente

LA JOLLA—Durante los últimos quince años, los investigadores del cáncer han estado usando tecnología de secuenciación de ADN para identificar las mutaciones genéticas que causan diferentes formas de cáncer. Ahora, profesor asistente de Salk Eduardo Stites y su equipo de científicos informáticos han combinado información sobre mutaciones genéticas con datos de prevalencia del cáncer para revelar la base genética del cáncer en toda la población de pacientes con cáncer en los Estados Unidos.

El estudio, publicado en Nature Communications el 13 de octubre de 2021, revela con qué frecuencia se muta cada gen en el genoma dentro de la población de pacientes con cáncer. Los hallazgos podrían ayudar a guiar la investigación genética para desarrollar tratamientos más efectivos que los disponibles actualmente.

“El documento responde a una pregunta muy básica: ¿cuáles son los genes mutados con mayor frecuencia en el cáncer humano?”. dice Stites, quien también es médico y titular de la Cátedra de Desarrollo de la Fundación Hearst. “Sorprendentemente, esta pregunta no había sido respondida”.

Las mutaciones genéticas juegan un papel fundamental en el desarrollo y crecimiento de los cánceres. También pueden ser objeto de un tratamiento eficaz. Sin embargo, aunque muchos estudios han identificado las mutaciones involucradas en ciertos tipos de cáncer, como el cáncer de mama o el linfoma, nadie había logrado combinar los datos de una manera que pudiera revelar qué mutaciones son más comunes en toda la población de pacientes con cáncer. Cada cáncer es diferente, y esto hace que sea un desafío determinar qué genes causantes de cáncer y qué objetivos farmacológicos deben priorizarse para estudios adicionales.

En el nuevo estudio, el equipo de Stites combinó conjuntos de datos de estudios de cáncer genómicos y epidemiológicos para determinar qué porcentaje de todos los pacientes con cáncer tendrán algún gen mutado. Aunque esta tarea inicialmente parecía sencilla, pronto descubrieron por qué la pregunta no había sido respondida antes: los estudios genómicos y epidemiológicos no utilizan un sistema de denominación común para los distintos tipos de cáncer. Por ejemplo, algunos investigadores clasificaron los cánceres por ubicación en el cuerpo, mientras que otros los agruparon por tipo de tumor, y muchos usaron una combinación de los dos. Esto dificultó la alineación de los conjuntos de datos, lo cual fue fundamental para determinar qué tan comunes eran las diferentes mutaciones.

Para superar el desafío, los científicos analizaron cuidadosamente más de 200 estudios y revisaron y reclasificaron individualmente cada cáncer de acuerdo con un sistema de nombres consistente. Luego compararon los conjuntos de datos, teniendo en cuenta el hecho de que algunos tipos de cáncer son más comunes que otros. Cuando analizaron los datos, encontraron que algunas creencias generalizadas eran incorrectas. Por ejemplo, KRAS es un importante gen promotor del cáncer que se creía que estaba mutado en el 25 % de todos los cánceres; más bien, se encontró que estaba involucrado en solo alrededor del 11% de todos los cánceres. Esto fue parte de una tendencia en la que se descubrió que las mutaciones genéticas individuales eran menos comunes de lo que se pensaba anteriormente.

“Estos hallazgos hablan de la necesidad de reevaluar dónde las personas han estado enfocando su tiempo, atención y recursos”, dice Stites. “Deberíamos equilibrar los esfuerzos de investigación de manera más uniforme entre las diferentes causas genéticas del cáncer, y deberíamos equilibrar el desarrollo de nuevos tratamientos contra el cáncer de manera más uniforme entre las diferentes estrategias de tratamiento principales, porque el concepto de enfocarse en mutaciones específicas tendrá menos impacto de lo que ha sido. sido asumido.”

Otros autores del estudio incluyen a Gaurav Mendiratta, Meraj Aziz, David Liarakos y Melinda Tong de Salk y Eugene Ke de la Universidad de Virginia.

La investigación fue apoyada por Pioneer Fund, los Institutos Nacionales de Salud y Melanoma Research Alliance.

DOI: 10.1038 / s41467-021-26213-y