Nathan Shock Center San Diego

Sequenzierung und Einzelzellanalyse

Salk Institute for Biological Studies - San Diego Nathan Shock Center - Sequenzierung und Einzelzellanalyse

Sequenzierungs- und Genomik-Services


1) Bibliotheksvorbereitung für Bulk-Sequenzierung

Wir bieten folgende Bibliothekspräparationsdienste für Bulk-RNA- und DNA-Sequenzierung an:

    • Illumina Stranded mRNA-Bibliothek
    • Illumina Total RNA-Seq-Bibliothek
    • Nextera XT/Flex DNA-Bibliothek
    • NEB ChIP-Seq-Bibliothekspräparation
    • Takara Ultra-Low Input RNA-Seq cDNA Präparation
    • PCR-freie Probenvorbereitung

2) Bibliothekspräparation für Einzelzell-/Nuklei-Sequenzierung (nur für lokale Preisträger)

Wir bieten die folgenden 10x Genomics Library Preparation Services für Single-Cell- und Single-Nuclei-Sequenzierung an:

    • Single-cell 3’ v3.1
    • Einzelzell-ATAC
    • Einzelzell-Multiomik
    • Single-cell 5’ VDJ v2

3) Next-Gen-Sequenzierung

Wir bieten ein breites Spektrum an Sequenzierungsdienstleistungen unter Verwendung der folgenden Illumina-Sequenzierer an:

    • NovaSeq 6000
    • NextSeq 2000
    • MiniSeq
    • MiSeq

4) Digitale Genexpression mit dem nCounter MAX

Wir bieten robuste digitale Genexpressionstests für RNA-Proben in geringer Menge und/oder degradierter RNA unter Verwendung des nanoString nCounter MAX Analysesystem zusammen mit Gen-Panels das bis zu 800 Gene ansprechen kann.

5) Räumliche Transkriptomik- und Proteomik-Assays für das gesamte Gewebe mit dem NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler (erscheint 2024)

Next-Generation-Sequencing-Kernkontakt: samplesubmission@salk.edu