Zeng، Q.، Wang، W.، Tian، W.، Klein، A.، Bartlett، A.، Liu، H.، Nery، JR، Castanon، RG، Osteen، J.، Johnson، ND، Ding، W.، Chen، H.، Altshul، J.، Kenworthy، M.، Valadon، C.، Owens، W.، Wu، Z.، Amaral، ML، Zemke، NR، Song، Y.، Báez-Becerra، CT، Cho، S.، Chen، C.، Willier، J.، Cao، S.، Rink، J.، Lee، J.، Barcoma، A.، Arzavala، J.، Emerson، N.، Lu، YR، Ren، B.، Behrens، MM، إيكر ، جونيور إزالة مثيلة الترانسبوزون الخاصة بنوع الخلية وإعادة تشكيل نطاقات التفاعل الطوبولوجي في دماغ الفأر المسن. (2026) الخلية DOI: 10.1016 / j.cell.2026.02.015

Amaral، ML، Mamde، S.، Miller، M.، Hou، X.، Arzavala، J.، Osteen، J.، Johnson، ND، Smoot، EW، Yang، Q.، Eisner، E.، Zeng، Q.، Báez-Becerra، CT، Olness، J.، Kern، JC، Rink، J.، Barcoma، A.، Cho، S.، Cao، S.، Emerson, N., Lee, J., Willier, J., Loe, T., Jiao, H., Zu, S., Zhu, Q., Preissl, S., Wang, A., إيكر ، جونيور، بهرنز، م م، رين، ب. يكشف علم الجينوم الخلوي المفرد عن عدم استقرار الكروماتين المغاير واختلال وظيفة عامل النسخ أثناء شيخوخة دماغ الفأر. (2026) تقارير الخلية 45 (3): 117073. DOI: 10.1016 / j.celrep.2026.117073

Swift، J.، Wu، X.، Xu، J.، Procko، C.، Jain، T.، Illouz-Eliaz، N.، Nery، JR، Chory، J.، إيكر ، جونيور يؤدي الإجهاد إلى زيادة المرونة في ديناميكيات النسخ الجيني لشيخوخة الأوراق في نبات الأرابيدوبسيس ثاليانا. (2026) نباتات الطبيعة. DOI: 10.1038/s41477-026-02254-3

Zhang، W.، Ding، W.، Li، K.، Chang، L.، Klein، A.، Báez-Becerra، CT، Rink، JA، Bartlett، A.، Chen، H.، Schenker، N.، Johansen، N.، Mollenkopf، T.، Fu، Y.، Yang، X.، Liu، S.، Seng، C.، Miao، B.، Liu، T.، Zhu، Q.، Hodge، RD، Bakken، TE، Lein، ES، Hawrylycz، M.، Xu، X.، Behrens، MM، Ren، B.، إيكر ، جونيور، وانغ، ت.، لي، د. مورد متكامل للخلايا المفردة وعلم التخلق لتحليل مقارن للعقد القاعدية. (2026) com.bioRxiv. دوى: 10.64898 / 2026.01.29.702575

Wang, Z., Zu, S., Armand, EJ, Loe, TH, Rink, JA, Wu, W., Xie, Y., Chang, L., Zhu, C., Johnson, ND, Lee, J., Willier, JK, Cho, S., Cao, S., Barcoma, AS, Emerson, N., Liu, H., Wang, K., Gibbs, ZA, Gao, X., Xu, S.، قوه، D.، تو، Z.، لي، يي، إيكر ، جونيور، بهرنز، م م، رين، ب. أطلس جينومي متكامل أحادي الخلية يشرح الجينوم التنظيمي لدماغ الفأر البالغ. (2026) com.bioRxiv. دوى: 10.64898 / 2026.02.07.704075

تشانغ، L.، Li، K.، Xie، Y.، Zhong، G.، Rink، JA، Báez-Becerra، CT، Lie، A.، Indralingam، HS، Dong، K.، Loe، T.، Wang، Z.، Zu، S.، Kern، JC، Zhao، Z.، Boone، E.، Flores، J.، Monell، A.، Olness، J.، Barragan، C.، أوسجود، إي، أوينز، دبليو، شينكر-أحمد، ن.، تشانغ، دبليو، ليو، د.، باركوما، AS، ويلير، JK، كنوتسون، KW، روسو، KG، Liu، J.، Cho، S.، Arzavala، J.، Young، CK، Sundaram، GV، Manning، AC، Sanchez، Y.، Bikkina، A.، Berry، جيه، جاو، إكس، O'Connor, C., Liem, M., Marrin, MV, Rose, C., Alt, SN, Zhu, C., Zemke, NR, Ding, W., Klein, A., Fu, Y., Johansen, N., Bakken, TE, Hodge, RD, Keene, CD, Lein, ES, Li, D., Zhu, Q., Wang, T., Xu, X., إيكر ، جونيور، بهرنز، م م، رين، ب. تحليل متعدد الخلايا المفردة لحالة الكروماتين والترانسكريبتوم في العقد القاعدية البشرية. (2026) com.bioRxiv. دوى: 10.64898 / 2026.02.03.703645

Xie، Y.، Chang، L.، Zhong، G.، Rink، JA، Báez-Becerra، T.، Armand، E.، Ding، W.، Li، K.، Bonne، E.، Lie، A.، Indralingam، HS، Dong، K.، Loe، T.، Huang، B.، Wang، Z.، Barcoma، AS، Willier، JK، Knutson، KW، Liu، J.، Cho، S.، Cao، S.، Russo، KG، Young، CK، Arzavala، J.، Sanchez، Y.، Bikkina، A.، Schenker-Ahmed، N.، Kern، C.، Zhao، Z.، Klein، A.، Flores، J.، Tai، CY، Olness، J.، Monell، A.، Moghadami، S.، Barragan، C.، تشين، سي.، أوينز، دبليو، O'Connor, C., Liem, M., Marrin, MV, Rose, C., Alt, SN, Emerson, N., Osteen, J., Lucero, J., Li, D., Hodge, RD, Wang, T., Keene, CD, Xu, X., Zhu, Q., إيكر ، جونيور، بهرنز، م م، رين، ب. أطلس الخلية الواحدة لحالات النسخ والكروماتين يكشف عن البرامج التنظيمية في الدماغ البشري. (2026) com.bioRxiv. دوى: 10.64898 / 2026.02.02.703166

Ding، W.، Klein، A.، Báez-Becerra، CT، Rink، JA، Bartlett، A.، Zeng، Q.، Wang، R.، Castanon، RG، Nery، JR، Osgood، E.، Owens، W.، Petrella، A.، Chen، C.، Acerbo، AS، Barcoma، AS، Liu، J.، Russo، KG، Knutson، KW، Young، CK، Willier، JK، Barragan، C.، Arzavala، J.، Cho، S.، Altshul، J.، Chan، D.، Soma، E.، Luo، J.، Jain، M.، Velazquez، S.، Schenker-Ahmed، N.، Sundaram، GV، Manning، AC، Sanchez، Y.، Bikkina، A.، Fu، S.، أوكونور، سي، ليم، م.، Marrin، MV، Rose، C.، Alt، SN، Berry، J.، Kern، C.، Boone، E.، Tian، W.، Wu، Y.، Hariharan، M.، Fu، Y.، Xie، Y.، Li، K.، Chang، L.، Zhang، W.، Chen، H.، Johansen، N.، Zhao، Z.، Flores، J.، Tai، CY، Olness، J.، Zhu, Q., Hodge, RD, Bakken, TE, Lein, ES, Li, D., Wang, T., Xu, X., Ren, B., Behrens, MM, إيكر ، جونيور أطلس متعدد الوسائط للجينوم فوق الجيني أحادي الخلية وأطلس الجينوم ثلاثي الأبعاد للعقد القاعدية البشرية. (2026) com.bioRxiv. دوى: 10.64898 / 2026.02.12.705594

وانغ، دبليو، هاريهاران، إم، دينغ، دبليو، بارتليت، إيه، باراغان، سي، كاستانون، آر، وانغ، آر، روثنبرغ، في، سونغ، إتش، نيري، جيه آر، ألدريدج، إيه، ألتشول، جيه، كينوورثي، إم، ليو، إتش، تيان، دبليو، تشو، جيه، زينغ، كيو، تشين، إتش، وي، بي، غوندوز، آي بي، نوريل، تي، برودريك، تي جيه، ماكلين، إم تي، ساترويت، إل إل، بيرك، تي دبليو، بيتزولد، إي إيه، شين، إكس، وودز، سي دبليو، فاولر، في جي، روفين، إف، بانوويت، بي، بار، دي بي، بير، جيه إل، سميث، إيه كيه، سبوربيك، آر آر، فانجيتي، إس، راموس، آي، نودلمان، جي. سيلفون، إس سي، كاستيلينو، إف، والي، إيه إم، إيفانز، تي، مولر، إف، غرينليف، دبليو جيه، إيكر ، جونيور تُشكل العوامل الوراثية والبيئية بشكل مميز جينوم الخلايا المناعية البشرية. (2026) وراثة الطبيعة. DOI: 10.1038/s41588-025-02479-6

هي، سي، نارساي، آر، ليو، إل سي، تشانغ، واي، ين، إل، شو، جيه، شي، إم، شو، إتش، إيكر ، جونيور، لوسي، إم جي، وانغ، واي، بيركويتز، أو، ويلان، جيه. يشكل الأكسيداز البديل والإيثيلين حلقة تغذية أمامية إيجابية في الإشارات الرجعية للميتوكوندريا. (2026) مصنع كومون.101744 DOI: 10.1016/j.xplc.2026.101744

Berry، JV، Tran، BM، Wu، G.، Tan، Z.، Mendoza، E.، Kim، M.، Arat، Z.، Lin، PSH، Valenzuela، L.، Holmes، TC، Virovka، A.، Thaxton، M.، Nguyen، M.، Stein، S.، Sigaroudi، VR، De La Rosa، A.، Gawronski، B.، Silva، J.، غونزاليس، L.، Wright، S.، Wood، K.، Hui، GK، Anousaya، D.، Gangeddula، VR، Gama، N.، Gama، J.، Gross، T.، Bunney، B.، Stein، R.، Sequeira، PA، Mamdani، F.، Cartagena، P.، Bunney، WE، Lou، J.، Park، HL، Wilson، A.، Brooks، جلالة الملك، ألهوسن، V.، كروفورد، ج.، نايت، ج.م.، رين، ب.، إيكر ، ج.، بيرنز، إم إم، كين، سي دي، ستارك، سي، هيد، إي، يونغ، دبليو، مونوكي، إي، شو، إكس. برنامج شراء الدماغ التابع لشبكة أطلس خلايا مبادرة الدماغ بجامعة كاليفورنيا في إرفاين (BICAN) لمركز مشروع أطلس خلايا الدماغ البشري متعدد الأوميات. (2025) com.bioRxiv. دوى: 10.64898 / 2025.12.23.696304

مكمل، E.A.، ليو، H.، بيرنس، M.M.، إيكر ، جونيور إثراء نوع الخلية من الاختلالات الصبغية الجسدية في الدماغ الثديي. (2025) الخلايا العصبية. 113(17):2814-2821.e2. DOI: 10.1016/j.neuron.2025.08.006

Thistlethwaite, W., Vangeti, S., Cheng, WS, Agarwal, P., Cappuccio, A., Wang, W., Wei, B., Myers, R., Rubenstein, AB, Chawla, D., Hariharan, M., McClain, MT, Burke, TW, Kleinstein, SH, إيكر ، جونيور، وودز، سي دبليو، جرينليف، دبليو جيه، تشين، إكس، راموس، آي، زاسلافسكي، إي، إيفانز، تي جي، ترويانسكايا، أو جي، سيلفون، إس سي المشهد الجزيئي المناعي الفطري بعد الإصابة بفيروس الأنفلونزا البشري الخاضع للسيطرة. (2025) تقارير الخلية 44 (10): 116312. DOI: 10.1016 / j.celrep.2025.116312

Wang، W.، Berube، P.، Yang، B.، Castanon، R.، Bartlett، A.، Komandur، K.، Nery، JR، Barragan، C.، Kenworthy، M.، Valadon، C.، Altshul، J.، Petrella، A.، Chan، D.، Chen، C.، Acerbo، AS، Luo، J.، Jain، M.، Soma، E.، Chen، H.، Liem، M.، Marrin، M.، O'Connor، C.، Zemke، N.، Oakley، D.، Ren، B.، Hyman، BT، إيكر ، جونيور إعادة تنظيم الجينوم اللاجيني الخاص بمنطقة الدماغ وحالات الخلايا المتغيرة في مرض الزهايمر. (2025) com.bioRxiv. دوى: 10.1101 / 2025.09.29.678849

لي، تا، إيلوز-إلياز، ن.، نوبوري، تي، شو، جيه، جو، بي، نيري، جيه آر، إيكر ، جونيور أطلس نسخي مكاني أحادي الخلية لدورة حياة نبات أرابيدوبسيس. (2025) نباتات الطبيعة. DOI: 10.1038 / s41477-025-02072-Z

Illouz-Eliaz, N., Yu, J., Swift, J., Lande, K., Jow, B., Partida-Garcia, L., Tuang, ZK, Lee, TA, Yaaran, A., Gomez-Castanon, R., Owens, W., Bowman, CR, Osgood, E., Nery, JR, Nobori, T., Zait, Y., Burdman, S., إيكر ، جونيور يؤدي التعافي من الجفاف في النباتات إلى تنشيط مناعي خاص بحالة الخلية. (2025) طبيعة الاتصالات. 16(1):8095. DOI: 10.1038/s41467-025-63467-2

Zhang، S.، Shu، H.، Zhou، J.، Rubin-Sigler، J.، Yang، X.، Liu، Y.، Cooper-Knock، J.، Monte، E.، Zhu، C.، Tu ، س.، لي، ه.، تونغ، م.، إيكر ، جونيور، إيشيدا، JK، شين، Y.، تسنغ، J.، تساو، PS، سنايدر، MP تقوم درجات المخاطر المتعددة الجينات أحادية الخلية بتشريح التباين الخلوي والجزيئي للأمراض البشرية المعقدة. (2025) التكنولوجيا الحيوية الطبيعة. DOI: 10.1038/s41587-025-02725-6

يوهانسن، NJ، كيمبينك، N.، Zemke، NR، Somasundaram، S.، De Winter، S.، Hooper، M.، Dwivedi، D.، Lohia، R.، Wehbe، F.، Li، B.، Abaffyová، D.، Armand، EJ، De Man، J.، Ekşi، EC، Hecker، N.، Hulselmans، G.، Konstantakos, V., Mauduit, D., Mich, JK, Partel, G., Daigle, TL, Levi, BP, Zhang, K., Tanaka, Y., Gillis, J., Ting, JT, Ben-Simon, Y., Miller, J., إيكر ، جونيور، رن، ب.، أيرتس، إس.، لين، إس، تاسيك، ب.، باكن، تي إي تقييم أساليب التنبؤ بالمعززات الخاصة بنوع الخلية في القشرة الثديية. (2025) جينوم الخلية.:100879 DOI: 10.1016/j.xgen.2025.100879

Amaral، ML، Mamde، S.، Miller، M.، Hou، X.، Arzavala، J.، Osteen، J.، Johnson، ND، Smoot، EW، Yang، Q.، Eisner، E.، Zeng، Q.، Báez-Becerra، CT، Olness، J.، Kern، JC، Rink، J.، Barcoma، A.، Cho، S.، Cao، S.، Emerson, N., Lee, J., Willier, J., Loe, T., Jiao, H., Zu, S., Zhu, Q., Wang, A., إيكر ، جونيور، بهرنز، م م، رين، ب. يكشف علم الجينوم أحادي الخلية عن عدم استقرار الهيتروكروماتين وخلل في عوامل النسخ أثناء شيخوخة دماغ الفأر. (2025) com.bioRxiv. دوى: 10.1101 / 2025.04.21.649585

Lai، C.، Arzavala، J.، Pinto-Duarte، A.، Wang، S.، Li، J.، Liu، H.، Osteen، J.، Gomez Castanon، R.، Nery، J.، Powell، SB، إيكر ، جونيور، موكاميل، إي، بهرنس، إم إم يؤدي تنشيط المناعة الأمومية إلى تعطيل النضج الجيني والوظيفي للخلايا العصبية المثيرة القشرية (2025) com.bioRxiv. DOI: https://doi.org/10.1101/2025.04.28.651094

Zeng، Q.، Wei، T.، Klein، A.، Bartlett، A.، Liu، H.، Nery، JR، Castanon، R.، Osteen، J.، Johnson، ND، Wang، W.، Ding، W.، Chen، H.، Altshul، J.، Kenworthy، M.، Valadon، C.، Owens، W.، Wu، Z.، Amaral، ML، Song، بايز بيسيرا، تاتيانا، تشو، إس، تشين، سي، ويلير، جيه، كاو، إس، رينك، جيه، لي، جيه، باركوما، إيه، أرزافالا، جيه، إيمرسون، إن، لو، واي آر، رين، بي، بيرنس، مارجريتا، إيكر ، جونيور إزالة ميثيل العناصر القابلة للنقل الخاصة بنوع الخلية وإعادة تشكيل TAD في دماغ الفأر المتقدم في السن (2025) com.bioRxiv. دوى: https://doi.org/10.1101/2025.04.21.648266

تشو، جيه، وو، واي، ليو، إتش، تيان، دبليو، كاستانون، آر جي، بارتليت، إيه، تشانغ، زد، ياو، جي، شي، دي، كلوك، بي، ماركوت، إس، نيري، جيه آر، ليم، إم، كلافي، إن، بوغمان، إل، باراجان، سي، دريغو، راي، ويمر، إيه كيه، شي، إم، كوبر-نوك، جيه، تشانغ، إس، سنايدر، إم بي، بريسل، إس، رين، بي، أوكونور، سي، تشين، إس، لوه، سي، ديكسون، جيه آر، إيكر ، جونيور أطلس الخلية الواحدة في جسم الإنسان لتنظيم الجينوم ثلاثي الأبعاد وميثلة الحمض النووي. (2025) com.bioRxiv. دوى: 10.1101 / 2025.03.23.644697

تشو، جيه، لوه، سي، ليو، إتش، هيفل، إم جي، ستراوب، آر إي، كلاينمان، جي إي، هايد، تي إم، إيكر ، جونيور، واينبرجر، د، هان، س. التعلم العميق يستنتج حالات مثيلة الحمض النووي في الخلايا الفردية ويعزز اكتشاف التغيرات الجينية في مرض الفصام. (2025) جينوم الخلية.:100774 DOI: 10.1016/j.xgen.2025.100774

نوبوري، T.، مونيل، A.، لي، TA، ساكاتا، Y.، شيراهاما، S.، تشو، J.، نيري، JR، مين، A.، إيكر ، جونيور حالة نادرة من خلايا PRIMER في مناعة النبات. (2025) طبيعة. DOI: 10.1038 / s41586-024-08383-Z

ميلر، سي إن، جاريل هورتادو، إس، هاج، إم في، سارا يي، واي، سيمينك، إم، ألفاريز-مالدونادو، بي، بهنامي، إس، تشانغ، إل، سويفت، جيه، بابيكيان، أ.، يو، ج.، كولت، ك.، إيكر ، جونيور، مايكل، تي بي، لو، جا، بوش، دبليو. أظهر إحصاء النسخ أحادي النواة لجذر نبات أرابيدوبسيس الناضج أن MYB67 يتحكم في نضج خلايا اللحاء. (2025) الخلية التنموية. DOI: 10.1016 / j.devcel.2024.12.025

Yuan، Y.، Biswas، P.، Zemke، NR، Dang، K.، Wu، Y.، D'Antonio، M.، Xie، Y.، Yang، Q.، Dong، K.، Lau، PK، لي، د.، سينغ، سي، بارتوسيك، دبليو، بوكانان، جيه، لين، إل.، لانسيون، آر، وانغ، كيه، لي، إس، جيبس، ز.، إيكر ، ج.، فريزر، ك.، وانغ، تي.، بريسل، إس.، وانغ، أ.، أياغاري، آر.، رن، ب. تحليل الخلية الواحدة للجينوم الظاهري والهندسة الكروماتينية ثلاثية الأبعاد في شبكية العين البشرية. (2024) com.bioRxiv. دوى: 10.1101 / 2024.12.28.630634

Swift، J.، Luginbuehl، LH، Hua، L.، Schreier، TB، Donald، RM، Stanley، S.، Wang، N.، Lee، TA، Nery، JR، إيكر ، جونيور، هيبيرد، جيه إم يتيح التكيف المسبق لشبكات هوية الخلايا السلفية إمكانية التمثيل الضوئي الكربوني. (2024) طبيعة. DOI: 10.1038/s41586-024-08204-3

Heffel، MG، Zhou، J.، Zhang، Y.، Lee، DS، Hou، K.، Pastor-Alonso، O.، Abuhanna، KD، Galasso، J.، Kern، C.، Tai، CY، Garcia-Padilla، C.، Nafisi، M.، Zhou، Y.، Schmitt، AD، Li، T.، Haeussler، M.، Wick، B.، Zhang، MJ، Xie، F.، Ziffra، RS، Mukamel، EA، Eskin، E.، Nowakowski، TJ، Dixon، JR، Pasaniuc، B.، إيكر ، جونيور، تشو، كيو، بينتو، بي، باريديس، إم إف، لوه، سي. ديناميكيات متعددة الجينات ثلاثية الأبعاد متميزة زمنياً في الدماغ البشري النامي. (2024) طبيعة. DOI: 10.1038/s41586-024-08030-7

يوهانسن، NJ، كيمبينك، N.، Zemke، NR، Somasundaram، S.، De Winter، S.، Hooper، M.، Dwivedi، D.، Lohia، R.، Wehbe، F.، Li، B.، Abaffyová , D., Armand, EJ, De Man, J., Eksi, EC, Hecker, N., Hulselmans, G., Konstantakos, V., Mauduit, D., Mich, JK, Partel, G., Daigle, TL ، ليفي، بي بي، تشانغ، ك.، تاناكا، واي، جيليس، جيه، تينغ، جي تي، بن سيمون، واي، ميلر، جيه، إيكر ، جونيور، رن، ب.، أيرتس، إس.، لين، إس، تاسيك، ب.، باكن، تي إي تقييم أساليب التنبؤ بالمعززات الخاصة بنوع الخلية في قشرة الثدييات. (2024) com.bioRxiv. دوى: 10.1101 / 2024.08.21.609075

Denyer، T.، Wu، PJ، Colt، K.، Abramson، B.، Pang، Z.، Solansky، P.، Mamerto، A.، Nobori، T.، إيكر ، ج.، لام، إي، مايكل، تي بي، تيمرمانز، إم سي تميز توقيعات التعبير المكاني والبيئي المبسطة طحلب البط البسيط. (2024) أبحاث الجينوم. دوى: 10.1101 / غرام .279091.124

غونزاليس، إس، سويفت، جيه، ياران، أ، شو، جيه، ميلر، سي، إيلوز-إلياز، إن، نيري، جي آر، بوش، دبليو، زيت، واي، إيكر ، جونيور استجابات الأرابيدوبسيس النصية لإمكانات المياه المنخفضة باستخدام فحوصات اللوحة عالية الإنتاجية. (2024) إليفي. 12. DOI: 10.7554 / eLife.84747

تيان، دبليو، دينج، دبليو، شين، جيه، لي، دي، وانج، تي، إيكر ، جونيور BAllC و BAllCools: تنسيق وتشغيل فعال لبيانات مثيلة الحمض النووي للخلية الواحدة. (2024) المعلوماتية الحيوية. DOI: 10.1093/علم المعلومات الحيوية/btae404

Zhang، S.، Shu، H.، Zhou، J.، Rubin-Sigler، J.، Yang، X.، Liu، Y.، Cooper-Knock، J.، Monte، E.، Zhu، C.، Tu ، س.، لي، ه.، تونغ، م.، إيكر ، جونيور، إيشيدا، JK، شين، Y.، تسنغ، J.، تساو، PS، سنايدر، MP يكشف تفكك درجة المخاطر المتعددة الجينات في الخلايا المفردة عن عدم التجانس الخلوي والجزيئي للأمراض البشرية المعقدة. (2024) com.bioRxiv. دوى: 10.1101 / 2024.05.14.594252

شين، JF، ليو، H.، وانغ، BA، لو، C.، بارتليت، A.، كاستانون، R.، جونسون، ND، نيري، JR، أوستين، J.، لي، J.، ألتشول، J. ، كينورثي، إم.، فالادون، سي.، ليم، إم.، كلافي، إن.، أوكونور، سي.، سيكر، LA، إيكر ، جونيور, بيرنس، م م، مكمل، إي إيه التأثيرات الخاصة بنوع الخلية للعمر والجنس على الخلايا العصبية القشرية البشرية. (2024) الخلايا العصبية. دوى: 10.1016 / j.neuron.2024.05.013

Cao, M., Platre, M.P., Tsai, H.H., Zhang, L., Nobori, T., Armengot, L., Chen, Y., He, W., Brent, L., Coll, NS, إيكر ، جونيور، جيلدنر، ن.، بوش، دبليو. يقيد تنظيم IMA1 المكاني اكتساب الحديد الجذري على إدراك MAMP. (2024) طبيعة. DOI: 10.1038 / s41586-023-06891-y

تشو، جيه، لوه، سي، ليو، إتش، هيفل، إم جي، ستراوب، آر إي، كلاينمان، جي إي، هايد، تي إم، إيكر ، جونيور، واينبرجر، د، هان، س. scMeFormer: نموذج التعلم العميق القائم على المحولات لإسناد حالات مثيلة الحمض النووي في الخلايا المفردة يعزز اكتشاف التغيرات اللاجينية في مرض انفصام الشخصية. (2024) com.bioRxiv. دوى: 10.1101 / 2024.01.25.577200

Zhou, J., Zhang, Z., Wu, M., Liu, H., Pang, Y., Bartlett, A., Peng, Z., Ding, W., Rivkin, A., Lagos, WN, Williams ، E.، Lee، CT، Miyazaki، PA، Aldridge، A.، Zeng، Q.، Salinda، JLA، Claffey، N.، Liem، M.، Fitzpatrick، C.، Boggeman، L.، Yao، Z. , سميث، KA، تاسيك، B.، ألتشول، J.، كينورثي، MA، فالادون، C.، نيري، JR، كاستانون، RG، باتني، NS، Vu، M.، رشيد، M.، جاكوبس، M. , Ito, T., Osteen, J., Emerson, N., Lee, J., Cho, S., Rink, J., Huang, HH, Pinto-Duartec, A., Dominguez, B., سميث, JB ، أوكونور، سي، زنغ، إتش، تشين، إس، لي، كيه إف، موكاميل، إي إيه، جين، إكس، مارجريتا بيرنس، إم، إيكر ، جونيور، Callaway ، EM المراسلات على مستوى الدماغ لعلم اللاجينوم العصبي والإسقاطات البعيدة. (2023) طبيعة. 624(7991):355-365. DOI: 10.1038/s41586-023-06823-w

Zemke، NR، Armand، EJ، Wang، W.، Lee، S.، Zhou، J.، Li، YE، Liu، H.، Tian، W.، Nery، JR، Castanon، RG، Bartlett، A.، أوستين، JK، Li، D.، Zhuo، X.، Xu، V.، Chang، L.، Dong، K.، Indralingam، HS، Rink، JA، Xie، Y.، Miller، M.، Krienen، FM , Zhang, Q., Taskin, N., Ting, J., Feng, G., McCarroll, SA, Callaway, EM, Wang, T., Lein, ES, Behrens, MM, إيكر ، جونيور، رين ، ب. البرامج التنظيمية الجينية المحفوظة والمتباينة للقشرة المخية الحديثة للثدييات. (2023) طبيعة. 624(7991):390-402. DOI: 10.1038/s41586-023-06819-6

Zu، S.، Li، YE، Wang، K.، Armand، EJ، Mamde، S.، Amaral، ML، Wang، Y.، Chu، A.، Xie، Y.، Miller، M.، Xu، J. ., Wang, Z., Zhang, K., Jia, B., Hou, X., Lin, L., Yang, Q., Lee, S., Li, B., Kuan, S., Liu, H ., Zhou, J., Pinto-Duarte, A., Lucero, J., Osteen, J., Nunn, M., Smith, KA, Tasic, B., Yao, Z., Zeng, H., Wang, Z.، شانغ، J.، بيرنس، MM، إيكر ، جونيور، وانغ، أ.، بريسل، س.، رين، ب. تحليل خلية واحدة لإمكانية الوصول إلى الكروماتين في دماغ الفأر البالغ. (2023) طبيعة. 624(7991):378-389. DOI: 10.1038/s41586-023-06824-9

ليو، إتش، زينج، كيو، تشو، جيه، بارتليت، إيه، وانج، بي إيه، بيروب، بي، تيان، دبليو، كينورثي، إم، ألتشول، جيه، نيري، جيه آر، تشين، H.، Castanon، RG، Zu، S.، Li، YE، Lucero، J.، Osteen، JK، Pinto-Duarte، A.، Lee، J.، Rink، J.، Cho، S.، Emerson، N .، Nunn، M.، O'Connor، C.، Wu، Z.، Stoica، I.، Yao، Z.، Smith، KA، Tasic، B.، Luo، C.، Dixon، JR، Zeng، H .، رين، ب.، بيرنس، إم إم، إيكر ، جونيور ميثيل الحمض النووي أحادي الخلية والأطلس ثلاثي الأبعاد متعدد الأوميات لدماغ الفأر البالغ. (2023) طبيعة. 624(7991):366-377. DOI: 10.1038/s41586-023-06805-y

مكمل، E.A.، ليو، H.، بيرنس، M.M.، إيكر ، جونيور إثراء نوع الخلية من اختلال الصيغة الصبغية الجسدية في دماغ الثدييات. (2023) com.bioRxiv. دوى: 10.1101 / 2023.12.18.572285

رايخيل، ن.، إيكر ، جونيور، كوروزي، ج. تذكر فيليب ن. بنفي: رائد ذو رؤية في علم الأحياء النباتية ومعلم استثنائي. (2023) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 120 (45): e2317677120. DOI: 10.1073 / pnas.2317677120

تيان، دبليو، تشو، جيه، بارتليت، أ.، زينج، كيو، ليو، هـ، كاستانون، آر جي، كينورثي، إم، ألتشول، جيه، فالادون، سي، ألدريدج، أ، نيري ، JR، Chen، H.، Xu، J.، Johnson، ND، Lucero، J.، Osteen، JK، Emerson، N.، Rink، J.، Lee، J.، Li، YE، Siletti، K.، Liem, M., Claffey, N., O'Connor, C., Yanny, AM, Nyhus, J., Dee, N., Casper, T., Shapovalova, N., Hirschstein, D., Ding, SL, هودج، آر، ليفي، بي بي، كين، سي دي، لينارسون، إس، لين، إي، رين، بي، بيرنس، إم إم، إيكر ، جونيور مثيلة الحمض النووي أحادية الخلية وهندسة الجينوم ثلاثية الأبعاد في الدماغ البشري. رابط للنص الكامل المجاني https://doi.org/3/science.adf10.1126 [منشور] (2023) العلم. 382(6667):eadf5357. دوى: 10.1126/science.adf5357

Li، YE، Preissl، S.، Miller، M.، Johnson، ND، Wang، Z.، Jiao، H.، Zhu، C.، Wang، Z.، Xie، Y.، Poirion، O.، Kern، C.، Pinto-Duarte، A.، Tian، W.، Siletti، K.، Emerson، N.، Osteen، J.، Lucero، J.، Lin، L.، Yang، Q.، Zhu، Q.، Zemke، N.، Espinoza، S.، Yanny، AM، Nyhus، J.، Dee، N.، Casper، T.، Shapovalova، N.، Hirschstein، D.، Hodge، RD، Linnarsson، S.، Bakken، T.، ليفي، B.، Keene، CD، Shang، J.، Lein، E.، Wang، A.، Behrens، MM، إيكر ، جونيور، رين ، ب. أطلس مقارن لإمكانية الوصول إلى الكروماتين أحادي الخلية في الدماغ البشري. (2023) العلم. 382(6667):eadf7044. دوى: 10.1126/science.adf7044

تيان، دبليو، دينغ، دبليو، إيكر ، جونيور BAllC وBAllCools: تنسيق وتشغيل فعال لبيانات مثيلة الحمض النووي أحادية الخلية. (2023) com.bioRxiv. دوى: 10.1101 / 2023.09.22.559047

Xie، F.، Armand، EJ، Yao، Z.، Liu، H.، Bartlett، A.، Behrens، MM، Li، YE، Lucero، JD، Luo، C.، Nery، JR، Pinto-Duarte، A . ، Poirion ، OB ، Preissl ، S. ، Rivkin ، AC ، Tasic ، B. ، Zeng ، H. ، Ren ، B. إيكر ، جونيور، مكمل ، شرق تنظيم قوي للجينات المُحسِّن تم تحديده بواسطة النسخ أحادية الخلية والإبيجينومات. (2023) جينوم الخلية. 3 (7): 100342. DOI: 10.1016 / j.xgen.2023.100342

نوبوري ، ت. إيكر ، جونيور بعد غير مصاب؟ حل الحالات الخلوية للنباتات المعرضة لهجوم الممرض. (2023) طرق مندوب الخلية. 3 (7): 100538. DOI: 10.1016 / j.crmeth.2023.100538

نوبوري ، تي ، أوليفا ، إم ، ليستر ، آر ، إيكر ، جونيور تحليل التعبير الجيني المكاني ثلاثي الأبعاد أحادي الخلية في الأنسجة النباتية باستخدام PHYTOMap. (2023) نباتات الطبيعة. DOI: 10.1038/s41477-023-01439-4

Hawrylycz، M.، Martone، ME، Ascoli، GA، Bjaalie، JG، Dong، HW، Ghosh، SS، Gillis، J.، Hertzano، R.، Haynor، DR، Hof، PR، Kim، Y.، Lein، E. ، Liu ، Y. ، Miller ، JA ، Mitra ، PP ، Mukamel ، E. ، Ng ، L. ، Osumi-Sutherland ، D. ، Peng ، H. ، Ray ، PL ، Sanchez ، R. ، Regev ، A .، Ropelewski، A.، Scheuermann، RH، Tan، SZK، Thompson، CL، Tickle، T.، Tilgner، H.، Varghese، M.، Wester، B.، White، O.، Zeng، H.، Aevermann ، B.، Allemang، D.، Ament، S.، Athey، TL، Baker، C.، Baker، KS، Baker، PM، Bandrowski، A.، Banerjee، S.، Bishwakarma، P.، Carr، A. ، تشين ، إم ، تشودري ، آر ، كول ، جي ، كريسي ، إتش ، دورازي ، إف ، ديغاتانو ، كيه ، ديتشر ، بي ، دينج ، إس إل ، دولبيري ، تي ، إيكر ، جونيور، فانغ ، آر ، فيليون روبن ، جي سي ، فليس ، تي بي ، جي ، جي ، جيليسبي ، تي ، جوينز ، إن ، تشانغ ، جي كيو ، هالشينكو ، يو ، هاريس ، إن إل ، هيرب ، بي آر ، هينتيريان ، إتش .، Hood، G.، Horvath، S.، Huo، B.، Jarecka، D.، Jiang، S.، Khajouei، F.، Kiernan، EA، Kir، H.، Kruse، L.، Lee، C. ، Lelieveldt، B.، Li، Y.، Liu، H.، Liu، L.، Markuhar، A.، Mathews، J.، Mathews، KL، Mezias، C.، Miller، MI، Mollenkopf، T.، Mufti ، S.، Mungall، CJ، Orvis، J.، Puchades، MA، Qu، L.، Receveur، JP، Ren، B.، Sjoquist، N.، Staats، B.، Tward، D.، van Velthoven، CTJ ، Wang ، Q. ، Xie ، F. ، Xu ، H. ، Yao ، Z. ، Yun ، Z. ، Zhang ، YR ، Zheng ، WJ ، Zingg ، B. دليل للنظام الإيكولوجي لبيانات شبكة تعداد الخلايا لمبادرة BRAIN. (2023) علم الأحياء بلوس. 21 (6): e3002133. DOI: 10.1371 / journal.pbio.3002133

وانغ، دبليو، هاريهاران، إم، بارتليت، أ.، باراغان، سي، كاستانون، آر، روتنبرغ، في، سونغ، إتش، نيري، جيه، ألدريدج، إيه، ألتشول، جيه، Kenworthy، M.، Ding، W.، Liu، H.، Tian، W.، Zhou، J.، Chen، H.، Wei، B.، Gündüz، IB، Norell، T.، Broderick، TJ، McClain، MT، Satterwhite، LL، Burke، TW، Petzold، EA، Shen، X.، Woods، CW، Fowler، VG، Ruffin، F.، Panuwet، P.، Barr، DB، Beare، JL، Smith، AK، Spurbeck ، RR، Vangeti، S.، Ramos، I.، Nudelman، G.، Sealfon، SC، Castellino، F.، Walley، AM، Evans، T.، Müller، F.، Greenleaf، WJ، إيكر ، جونيور التوقيعات اللاجينومية للخلايا المناعية البشرية في الاستجابة للأمراض المعدية والتعرض للمواد الكيميائية. (2023) com.bioRxiv. دوى: 10.1101 / 2023.06.29.546792

Zemke، NR، Armand، EJ، Wang، W.، Lee، S.، Zhou، J.، Li، YE، Liu، H.، Tian، W.، Nery، JR، Castanon، RG، Bartlett، A.، أوستين ، جي كيه ، لي ، دي ، زهو ، إكس ، شو ، ف ، ميلر ، إم ، كريين ، إف إم ، زانج ، كيو ، تاسكين ، إن ، تينج ، جي ، فينج ، جي ، مكارول ، SA ، Callaway ، EM ، Wang ، T. ، Behrens ، MM ، Lein ، ES ، إيكر ، جونيور، رين ، ب. التحليل اللاجينومي للخلية المفردة المقارن لبرامج تنظيم الجينات في القشرة المخية الحديثة للقوارض والرئيسيات. (2023) com.bioRxiv. دوى: 10.1101 / 2023.04.08.536119

Liu، H.، Zeng، Q.، Zhou، J.، Bartlett، A.، Wang، BA، Berube، P.، Tian، W.، Kenworthy، M.، Altshul، J.، Nery، JR، Chen، H.، Castanon، RG، Zu، S.، Li، YE، Lucero، J.، Osteen، JK، Pinto-Duarte، A.، Lee، J.، Rink، J.، Cho، S.، Emerson، N . ، Nunn ، M. ، O'Connor ، C. ، Yao ، Z. ، Smith ، KA ، Tasic ، B. ، Zeng ، H. ، Luo ، C. ، Dixon ، JR ، Ren ، B. ، Behrens ، MM و إيكر ، جونيور ميثيلوم الحمض النووي أحادي الخلية وأطلس ثلاثي الأبعاد متعدد القوم لدماغ الفأر البالغ. (2023) com.bioRxiv. دوى: 10.1101 / 2023.04.16.536509

Yin، L.، Zander، M.، Huang، SC، Xie، M.، Song، L.، Saldierna Guzmán، JP، Hann، E.، Shanbhag، BK، Ng، S.، Jain، S.، Janssen، بي جيه، كلارك، إن إم، والي، جيه دبليو، بيدو، تي.، بار-جوزيف، زي.، ليوزي، إم جي، إيكر ، جونيور ديناميات عامل النسخ في التنظيم المتبادل لمسارات إشارات الهرمونات النباتية. (2023) com.bioRxiv. دوى: 10.1101 / 2023.03.07.531630

Procko، C.، Lee، T.، Borsuk، A.، Bargmann، BOR، Dabi، T.، Nery، JR، Estelle، M.، Baird، L.، O'Connor، C.، Brodersen، C.، إيكر ، جونيور، خوري ، ج. يكشف التنميط النسخي للخلية الورقية والخلية المفردة عن دور طبقة الحاجز في الحماية من الأشعة فوق البنفسجية. (2022) الخلية النباتية. DOI: 10.1093 / plcell / koac167

لي ، جيه ، بينتو دوارتي ، إيه ، زاندر ، إم ، كوكو ، إم إس ، لاي ، سي واي ، أوستين ، جي ، فانغ ، إل ، لو ، سي ، لوسيرو ، جي دي ، جوميز كاستانون ، آر. ، Nery ، JR ، Silva-Garcia ، I. ، Pang ، Y. ، Sejnowski ، TJ ، Powell ، SB ، إيكر ، جونيور، مكمل ، EA ، Behrens ، MM الضربة القاضية لـ Dnmt3a في الخلايا العصبية الاستثارية يضعف نضوج المشبك بعد الولادة ويزيد من تعديل الهيستون القمعي H3K27me3. (2022) إليفي. 11. DOI: 10.7554 / eLife.66909

Luo، C.، Liu، H.، Xie، F.، Armand، EJ، Siletti، K.، Bakken، TE، Fang، R.، Doyle، WI، Stuart، T.، Hodge، RD، Hu، L. ، وانغ ، با ، زانغ ، زد ، بريسل ، إس ، لي ، دي إس ، زو ، جي ، نيو ، سي ، كاستانون ، ر. ، بارتليت ، إيه ، ريفكين ، إيه ، وانج ، إكس ، لوسيرو ، J.، Nery، JR، Davis، DA، Mash، DC، Satija، R.، Dixon، JR، Linnarsson، S.، Lein، E.، Behrens، MM، Ren، B.، Mukamel، EA، إيكر ، جونيور النواة المفردة متعددة الأوميات تحدد تنوع الجينوم التنظيمي للخلايا القشرية البشرية. (2022) جينوم الخلية. 2 (3). DOI: 10.1016 / j.xgen.2022.100107

سويفت ، جيه ، جرينهام ، ك. إيكر ، جونيور، Coruzzi ، GM ، McClung ، CR بيولوجيا الوقت: الاستجابات الديناميكية لأنواع الخلايا للإشارات التنموية والساعة البيولوجية والبيئية. (2021) مجلة النبات. DOI: 10.1111 / tpj.15589

Liu، H.، Zhou، J.، Tian، W.، Luo، C.، Bartlett، A.، Aldridge، A.، Lucero، J.، Osteen، JK، Nery، JR، Chen، H.، Rivkin، A.، Castanon، RG، Clock، B.، Li، YE، Hou، X.، Poirion، OB، Preissl، S.، Pinto-Duarte، A.، O'Connor، C.، Boggeman، L.، Fitzpatrick ، C. ، Nunn ، M. ، Mukamel ، EA ، Zhang ، Z. ، Callaway ، EM ، Ren ، B. ، Dixon ، JR ، Behrens ، MM ، إيكر ، جونيور أطلس مثيلة الحمض النووي لدماغ الفأر بدقة خلية واحدة. (2021) طبيعة. 598(7879):120-128. DOI: 10.1038/s41586-020-03182-8

Zhang، Z.، Zhou، J.، Tan، P.، Pang، Y.، Rivkin، AC، Kirchgessner، MA، Williams، E.، Lee، CT، Liu، H.، Franklin، AD، Miyazaki، PA، Bartlett، A.، Aldridge، AI، Vu، M.، Boggeman، L.، Fitzpatrick، C.، Nery، JR، Castanon، RG، Rashid، M.، Jacobs، MW، Ito-Cole، T.، O ' كونور ، سي ، بينتو ديوارتيك ، إيه ، دومينغيز ، بي ، سميث ، جي بي ، نيو ، سي ، لي ، كيه إف ، جين ، إكس ، موكامل ، إي إيه ، بيرينز ، إم إم ، إيكر ، جونيور، Callaway ، EM التنوع اللاجينومي للخلايا العصبية الإسقاطية القشرية في دماغ الفأر. (2021) طبيعة. 598(7879):167-173. DOI: 10.1038/s41586-021-03223-w

Li، YE، Preissl، S.، Hou، X.، Zhang، Z.، Zhang، K.، Qiu، Y.، Poirion، OB، Li، B.، Chiou، J.، Liu، H.، Pinto- Duarte، A.، Kubo، N.، Yang، X.، Fang، R.، Wang، X.، Han، JY، Lucero، J.، Yan، Y.، Miller، M.، Kuan، S.، Gorkin ، D.، Gaulton، KJ، Shen، Y.، Nunn، M.، Mukamel، EA، Behrens، MM، إيكر ، جونيور، رين ، ب. أطلس للعناصر التنظيمية للجينات في مخ الفأر البالغ. (2021) طبيعة. 598(7879):129-136. DOI: 10.1038/s41586-021-03604-1

Yao، Z.، Liu، H.، Xie، F.، Fischer، S.، Adkins، RS، Aldridge، AI، Ament، SA، Bartlett، A.، Behrens، MM، Van den Berge، K.، Bertagnolli، D. ، de Bézieux ، HR ، Biancalani ، T. ، Booeshaghi ، AS ، Bravo ، HC ، Casper ، T. ، Colantuoni ، C. ، Crabtree ، J. ، Creasy ، H. ، Crichton ، K. ، Crow ، M. ، Dee، N.، Dougherty، EL، Doyle، WI، Dudoit، S.، Fang، R.، Felix، V.، Fong، O.، Giglio، M.، Goldy، J.، Hawrylycz، M.، Herb ، BR ، Hertzano ، R. ، Hou ، X. ، Hu ، Q. ، Kancherla ، J. ، Kroll ، M. ، Lathia ، K. ، Li ، YE ، Lucero ، JD ، Luo ، C. ، Mahurkar ، A. ، McMillen ، D. ، Nadaf ، NM ، Nery ، JR ، Nguyen ، TN ، Niu ، SY ، Ntranos ، V. ، Orvis ، J. ، Osteen ، JK ، Pham ، T. ، Pinto-Duarte ، A. ، Poirion ، O.، Preissl، S.، Purdom، E.، Rimorin، C.، Risso، D.، Rivkin، AC، Smith، K.، Street، K.، Sulc، J.، Svensson، V.، Tieu، M . ، Torkelson ، A. ، Tung ، H. ، Vaishnav ، ED ، Vanderburg ، CR ، van Velthoven ، C. ، Wang ، X. ، White ، OR ، Huang ، ZJ ، Kharchenko ، PV ، Pachter ، L. ، Ngai ، J.، Regev، A.، Tasic، B.، Welch، JD، Gillis، J.، Macosko، EZ، Ren، B.، إيكر ، جونيور، تسنغ ، هـ. ، مكمل ، إي أطلس الخلية النسخية والفوقية للقشرة الحركية الأولية للفأر. (2021) طبيعة. 598(7879):103-110. DOI: 10.1038/s41586-021-03500-8

Bakken، TE، Jorstad، NL، Hu، Q.، Lake، BB، Tian، W.، Kalmbach، BE، Crow، M.، Hodge، RD، Krienen، FM، Sorensen، SA، Eggermont، J.، Yao، Z.، Aevermann، BD، Aldridge، AI، Bartlett، A.، Bertagnolli، D.، Casper، T.، Castanon، RG، Crichton، K.، Daigle، TL، Dalley، R.، Dee، N.، Dembrow ، N.، Diep، D.، Ding، SL، Dong، W.، Fang، R.، Fischer، S.، Goldman، M.، Goldy، J.، Graybuck، LT، Herb، BR، Hou، X. ، Kancherla، J.، Kroll، M.، Lathia، K.، van Lew، B.، Li، YE، Liu، CS، Liu، H.، Lucero، JD، Mahurkar، A.، McMillen، D.، Miller ، JA، Moussa، M.، Nery، JR، Nicovich، PR، Niu، SY، Orvis، J.، Osteen، JK، Owen، S.، Palmer، CR، Pham، T.، Plongthongkum، N.، Poirion، O.، Reed، NM، Rimorin، C.، Rivkin، A.، Romanow، WJ، Sedeño-Cortés، AE، Siletti، K.، Somasundaram، S.، Sulc، J.، Tieu، M.، Torkelson، A .، Tung، H.، Wang، X.، Xie، F.، Yanny، AM، Zhang، R.، Ament، SA، Behrens، MM، Bravo، HC، Chun، J.، Dobin، A.، Gillis، J.، Hertzano، R.، Hof، PR، Höllt، T.، Horwitz، GD، Keene، CD، Kharchenko، PV، Ko، AL، Lelieveldt، BP، Luo، C.، Mukamel، EA، Pinto-Duarte، A.، Preissl، S.، Regev، A.، Ren، B.، Scheuermann، RH، Smith، K.، Spain، WJ، White، OR، Koch، C.، Hawrylycz، M.، Tasic، B.، Macosko، EZ، McCarroll، SA، Ting، JT، Zeng، H.، Zhang، K.، Feng، G.، إيكر ، جونيور، لينارسون ، س. ، لين ، إس التحليل الخلوي المقارن للقشرة الحركية في الإنسان والقرد القرد والفأر. (2021) طبيعة. 598(7879):111-119. DOI: 10.1038/s41586-021-03465-8

Farhy-Tselnicker، I.، Boisvert، MM، Liu، H.، Dowling، C.، Erikson، GA، Blanco-Suarez، E.، Farhy، C.، Shokhirev، MN، إيكر ، جونيور، ألين ، نيوجيرسي التعديل المعتمد على النشاط للجينات التي تنظم المشبك في الخلايا النجمية. (2021) إليفي. 10. DOI: 10.7554 / eLife.70514

Gouveia-Mageste، BC، Martins، LGC، Dal-Bianco، M.، Machado، JPB، da Silva، JCF، Kim، AY، Yazaki، J.، Dos Santos، AA، إيكر ، جونيورفونتس ، EPB يساهم بروتين syntaxin-6 الخاص بالنبات في المسار داخل الهيولى للفيروس البيجوموفير CabLCV. (2021) فيزياء النبات. 187 (1): 158-173. DOI: 10.1093 / plphys / kiab252

Willige، BC، Zander، M.، Yoo، CY، Phan، A.، Garza، RM، Trigg، SA، He، Y.، Nery، JR، Chen، H.، Chen، M.، إيكر ، جونيور، خوري ، ج. تؤدي عوامل التفاعل مع PHYTOCHROME إلى تشغيل ديناميكيات الكروماتين المستجيبة للبيئة في النباتات. (2021) وراثة الطبيعة. DOI: 10.1038/s41588-021-00882-3

روف زاموجسكي ، إف ، زانج ، زد ، زاموجسكي ، إم ، سميث ، جي آر ، مينديليف ، إن ، ليو ، إتش ، نودلمان ، جي ، موريواكي ، إم ، بينكاس ، إتش ، كاستانون ، آر جي ، ناير ، في دي ، سينارين ، إن ، أمبير ، ماس ، تشو ، إكس ، أونغارو ، إل ، التوفيلي ، سي ، شانغ ، جي ، نيري ، جي آر ، بارتليت ، إيه ، ألدريدج ، إيه ، جاين ، إن. . ، تشايلدز ، GV ، Troyanskaya ، OG ، إيكر ، جونيور، Turgeon، JL، Welt، CK، Bernard، DJ، Sealfon، SC نواة واحدة المشهد التنظيمي متعدد omics للغدة النخامية الفئران. (2021) طبيعة الاتصالات. 12(1):2677. DOI: 10.1038/s41467-021-22859-w

جاو ، سي ، ليو ، جيه ، كريبل ، أر ، بريسل ، إس ، لو ، سي ، كاستانون ، آر ، ساندوفال ، جي ، ريفكين ، إيه ، نيري ، جي آر ، بيرينز ، إم إم ، إيكر ، جونيور، رن ، ب. ، ويلش ، دينار تكامل متعدد الخلايا أحادية الخلية متكرر باستخدام التعلم عبر الإنترنت. (2021) التكنولوجيا الحيوية الطبيعة. DOI: 10.1038 / s41587-021-00867-x

Fang، R.، Preissl، S.، Li، Y.، Hou، X.، Lucero، J.، Wang، X.، Motamedi، A.، Shiau، AK، Zhou، X.، Xie، F.، Mukamel ، EA ، Zhang ، K. ، Zhang ، Y. ، Behrens ، MM ، إيكر ، جونيور، رين ، ب. تحليل شامل لبيانات تسلسل ATAC أحادية الخلية باستخدام SnapATAC. (2021) طبيعة الاتصالات. 12(1):1337. DOI: 10.1038/s41467-021-21583-9

de Mendoza، A.، Poppe، D.، Buckberry، S.، Pflueger، J.، Albertin، CB، Daish، T.، Bertrand، S.، de la Calle-Mustienes، E.، Gómez-Skarmeta، JL، نيري ، جونيور ، إيكر ، جونيور، Baer، B.، Ragsdale، CW، Grützner، F.، Escriva، H.، Venkatesh، B.، Bogdanovic، O.، Lister، R. ظهور نظام مثيلة غير CpG في الدماغ في الفقاريات. (2021) نات إيكول إيفول. DOI: 10.1038/s41559-020-01371-2

Michael، TP، Ernst، E.، Hartwick، N.، Chu، P.، Bryant، D.، Gilbert، S.، Ortleb، S.، Baggs، EL، Sree، KS، Appenroth، KJ، Fuchs، J. ، Jupe ، F. ، Sandoval ، JP ، Krasileva ، KV ، Borisjuk ، L. ، Mockler ، TC ، إيكر ، ج.، Martienssen، RA، Lam، E. الجينوم ونسخة الوقت من اليوم لتقليل الارتباط المورفولوجي مع فقدان الجين وتقليل التحكم في النمو. (2020) أبحاث الجينوم. دوى: 10.1101 / غرام .266429.120

ENCODE، Moore، JE، Purcaro، MJ، Pratt، HE، Epstein، CB، Shoresh، N.، Adrian، J.، Kawli، T.، Davis، CA، Dobin، A.، Kaul، R.، Halow، J . ، فان نوستراند ، EL ، Freese ، P. ، Gorkin ، DU ، Shen ، Y. ، He ، Y. ، Mackiewicz ، M. ، Pauli-Behn ، F. ، Williams ، BA ، Mortazavi ، A. ، Keller ، CA ، Zhang ، XO ، Elhajjajy ، SI ، Huey ، J. ، Dickel ، DE ، Snetkova ، V. ، Wei ، X. ، Wang ، X. ، Rivera-Mulia ، JC ، Rozowsky ، J. ، Zhang ، J. ، Chhetri ، SB، Zhang، J.، Victorsen، A.، White، KP، Visel، A.، Yeo، GW، Burge، CB، Lécuyer، E.، Gilbert، DM، Dekker، J.، Rinn، J.، Mendenhall ، م ، إيكر ، جونيور، Kellis، M.، Klein، RJ، Noble، WS، Kundaje، A.، Guigó، R.، Farnham، PJ، Cherry، JM، Myers، RM، Ren، B.، Graveley، BR، Gerstein، MB، Pennacchio ، LA، Snyder، MP، Bernstein، BE، Wold، B.، Hardison، RC، Gingeras، TR، Stamatoyannopoulos، JA، Weng، Z. موسوعات موسعة لعناصر الحمض النووي في جينومات الإنسان والفأر. (2020) طبيعة. 583(7818):699-710. DOI: 10.1038/s41586-020-2493-4

هي ، Y. ، Hariharan ، M. ، Gorkin ، DU ، Dickel ، DE ، Luo ، C. ، Castanon ، RG ، Nery ، JR ، Lee ، AY ، Zhao ، Y. ، Huang ، H. ، Williams ، BA ، Trout ، D. ، Amrhein ، H. ، Fang ، R. ، Chen ، H. ، Li ، B. ، Visel ، A. ، Pennacchio ، LA ، Ren ، B. إيكر ، جونيور ديناميات ميثيلوم الحمض النووي الزماني المكاني لجنين الفأر النامي. (2020) طبيعة. 583(7818):752-759. DOI: 10.1038/s41586-020-2119-x

Gorkin ، DU ، Barozzi ، I. ، Zhao ، Y. ، Zhang ، Y. ، Huang ، H. ، Lee ، AY ، Li ، B. ، Chiou ، J. ، Wildberg ، A. ، Ding ، B. ، Zhang ، B. ، Wang ، M. ، Strattan ، JS ، Davidson ، JM ، Qiu ، Y. ، Afzal ، V. ، Akiyama ، JA ، Plajzer-Frick ، ​​I. ، Novak ، CS ، Kato ، M. ، Garvin ، TH ، Pham، QT، Harrington، AN، Mannion، BJ، Lee، EA، Fukuda-Yuzawa، Y.، He، Y.، Preissl، S.، Chee، S.، Han، JY، Williams، BA، Trout، D. ، Amrhein ، H. ، Yang ، H. ، Cherry ، JM ، Wang ، W. ، Gaulton ، K. ، إيكر ، جونيور، شين ، واي. ، ديكل ، دي ، فيزل ، إيه ، بيناتشيو ، لوس أنجلوس ، رين ، ب. أطلس للمناظر الطبيعية للكروماتين الديناميكي في نمو جنين الفأر. (2020) طبيعة. 583(7818):744-751. DOI: 10.1038/s41586-020-2093-3

Wierbowski، SD، Vo، TV، Falter-Braun، P.، Jobe، TO، Kruse، LH، Wei، X.، Liang، J.، Meyer، MJ، Akturk، N.، Rivera-Erick، CA، Cordero، NA، Paramo، MI، Shayhidin، EE، Bertolotti، M.، Tippens، ND، Akther، K.، Sharma، R.، Katayose، Y.، Salehi-Ashtiani، K.، Hao، T.، Ronald، PC، إيكر ، جونيور، شويتزر ، PA ، كيكوتشي ، S. ، ميزونو ، H. ، Hill ، DE ، Vidal ، M. ، Moghe ، GD ، McCouch ، SR ، Yu ، H. يتيح خط أنابيب التسلسل المتوازي المتوازي على نطاق واسع إنشاء أول خريطة ORFeome والتفاعلية للأرز. (2020) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. دوي: شنومكس / pnas.10.1073

Kim، EJ، Zhang، Z.، Huang، L.، Ito-Cole، T.، Jacobs، MW، Juavinett، AL، Senturk، G.، Hu، M.، Ku، M.، إيكر ، جونيور، Callaway ، EM استخراج أنواع الخلايا العصبية المتميزة من داخل مجموعة مستمرة وراثياً. (2020) الخلايا العصبية. دوى: 10.1016 / j.neuron.2020.04.018

Lavery، LA، Ure، K.، Wan، YW، Luo، C.، Trostle، AJ، Wang، W.، Jin، H.، Lopez، J.، Lucero، J.، Durham، MA، Castanon، R. ، Nery ، JR ، Liu ، Z. ، Goodell ، M. ، إيكر ، جونيور، Behrens ، MM ، Zoghbi ، HY يؤدي فقدان المثيلة المعتمدة على Dnmt3a في الخلايا العصبية المثبطة إلى إضعاف الوظيفة العصبية من خلال آلية تؤثر على متلازمة ريت. (2020) إليفي. 9. DOI: 10.7554 / eLife.52981

Zander، M.، Lewsey، MG، Clark، NM، Yin، L.، Bartlett، A.، Saldierna Guzmán، JP، Hann، E.، Langford، AE، Jow، B.، Wise، A.، Nery، JR ، تشين ، هـ. ، بار جوزيف ، Z. ، والي ، جي دبليو ، سولانو ، R. ، إيكر ، جونيور إطار متكامل متعدد omics لاستجابة النبات لحمض الياسمين. (2020) نباتات الطبيعة. 6(3):290-302. DOI: 10.1038/s41477-020-0605-7

بوركو ، واي. ، سيلوزيكي ، أ ، زاندر ، إم ، بيدمال ، يو ، إيكر ، جونيور، خوري ، ج. تحدد المنشطات الكيميرية والمثبطات نشاط HY5 وتكشف عن آلية ردود فعل منظمة بالضوء. (2020) الخلية النباتية. 32 (2). DOI: 10.1105 / tpc.19.00772

ساساكي ، إي ، كاواكاتسو ، ت. ، إيكر ، جونيور، نوردبورغ ، م. الأليلات الشائعة لـ CMT2 و NRPE1 هي محددات رئيسية لاختلاف مثيلة CHH في Arabidopsis thaliana. (2019) علم الوراثة PLOS. 15 (12): e1008492. DOI: 10.1371 / journal.pgen.1008492

Ortigosa، A.، Fonseca، S.، Franco-Zorrilla، JM، Fernandez-Calvo، P.، Zander، M.، Lewsey، MG، García-Casado، G.، Fernández-Barbero، G.، إيكر ، جونيور، سولانو ، ر. تنظم عوامل نسخ مسار JA- MYC الاستجابات الضوئية من خلال استهداف التعبير الجيني HY5. (2019) مجلة النبات. DOI: 10.1111 / tpj.14618

Brigidi، GS، Hayes، MGB، Delos Santos، NP، Hartzell، AL، Texari، L.، Lin، PA، Bartlett، A.، إيكر ، جونيور، بينر ، سي ، هاينز ، إس ، بلودجود ، بي إل فك الشفرة الجينومية لإزالة الاستقطاب العصبي بواسطة مغاير NPAS4 الخاصة بالمحفزات. (2019) الخلية 179(2):373-391.e27. DOI: 10.1016/j.cell.2019.09.004

Van Moerkercke، A.، Duncan، O.، Zander، M.، Šimura، J.، Broda، M.، Vanden Bossche، R.، Lewsey، MG، Lama، S.، Singh، KB، Ljung، K.، إيكر ، جونيور، Goossens ، A. ، Millar ، AH ، Van Aken ، O. تنظم شبكة عامل النسخ المعتمدة على MYC2 / MYC3 / MYC4 التعبير الجيني المستجيب لرذاذ الماء ومستويات الجاسمونيت. (2019) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. دوي: شنومكس / pnas.10.1073

صالحين ، م ، لي ، ب ، تانغ ، م ، كاتز ، إي ، سونغ ، إل. إيكر ، جونيور، Kliebenstein ، DJ ، Estelle ، M. تتوسط بروتينات Aux / IAA الحساسة للأوكسين في تحمل الجفاف في نبات الأرابيدوبسيس من خلال تنظيم مستويات الجلوكوزينولات. (2019) طبيعة الاتصالات. 10(1):4021. DOI: 10.1038/s41467-019-12002-1

لي ، دي إس ، لو ، سي ، تشو ، جي ، تشاندران ، إس ، ريفكين ، إيه ، بارتليت ، إيه ، نيري ، جي آر ، فيتزباتريك ، سي ، أوكونور ، سي ، ديكسون ، جي آر ، إيكر ، جونيور التنميط المتزامن لهيكل الجينوم ثلاثي الأبعاد ومثيل الحمض النووي في خلايا بشرية واحدة. (2019) طرق الطبيعة. DOI: 10.1038 / s41592-019-0547-Z

Zander، M.، Willige، BC، He، Y.، Nguyen، TA، Langford، AE، Nehring، R.، Howell، E.، McGrath، R.، Bartlett، A.، Castanon، R.، Nery، JR ، تشين ، هـ. ، تشانغ ، زد ، جوبي ، إف ، ستيبانوفا ، إيه ، شميتز ، آر جيه ، لويس ، إم ، خوري ، ج. إيكر ، جونيور إسكات جيني لمنظم إجهاد نباتي متعدد الوظائف. (2019) إليفي. 8. DOI: 10.7554 / eLife.47835

Zhou، J.، Ma، J.، Chen، Y.، Cheng، C.، Bao، B.، Peng، J.، Sejnowski، TJ، Dixon، JR، إيكر ، جونيور مجموعة قوية أحادية الخلية Hi-C من خلال التضمين التلافي والعشوائي القائم على السير. (2019) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. دوي: شنومكس / pnas.10.1073

Kawakatsu ، T. ، إيكر ، جونيور تنوع وديناميكيات مثيلة الحمض النووي: الموارد اللاجينومية وأدوات تربية المحاصيل. (2019) تربية العلوم. 69 (2): 191-204. DOI: 10.1270 / jsbbs.19005

Luo، C.، Lee، QY، Wapinski، O.، Castanon، R.، Nery، JR، Mall، M.، Kareta، MS، Cullen، SM، Goodell، MA، Chang، HY، Wernig، M.، إيكر ، جونيور إعادة تشكيل مثيلة الحمض النووي العالمية أثناء إعادة البرمجة المباشرة للأرومات الليفية إلى الخلايا العصبية. (2019) إليفي. 8. DOI: 10.7554 / eLife.40197

Jupe، F.، Rivkin، AC، Michael، TP، Zander، M.، Motley، ST، Sandoval، JP، Slotkin، RK، Chen، H.، Castanon، R.، Nery، JR، إيكر ، جونيور البنية المعقدة والتأثير اللاجينومي لإدخال T-DNA للنبات. (2019) علم الوراثة PLOS. 15 (1): e1007819. DOI: 10.1371 / journal.pgen.1007819

هريت ، ج. ، جودريتش ، إل. ، لي ، سي ، وانج ، بكالوريوس ، ني ، ج. ، كوي ، إكس. ، مارتن ، إي إيه ، سيمينتال ، إي ، فرنانديز ، جيه ، ليو ، ماي ، نيري ، جي آر ، كاستانون ، R. ، كوهلي ، آر إم ، تريتياكوفا ، إن ، هي ، سي ، إيكر ، جونيور، جول ، إم ، بانينج ، ب. تربط OGT مجالًا C طرفيًا محفوظًا لـ TET1 لتنظيم نشاط TET1 والوظيفة في التطوير. (2018) إليفي. 7. DOI: 10.7554 / eLife.34870

لو ، سي ، هاجكوفا ، ب. إيكر ، جونيور مثيلة الحمض النووي الديناميكي: في المكان المناسب في الوقت المناسب. (2018) العلم. 361 (6409): 1336-1340. DOI: 10.1126 / science.aat6806

Sabagh، MF، Heng، JS، Luo، C.، Castanon، RG، Nery، JR، Rattner، A.، Goff، LA، إيكر ، جونيورناثانز ، ج. المناظر الطبيعية النسخية والجينية للخلايا البطانية الوعائية للجهاز العصبي المركزي والخلايا البطانية الوعائية غير التابعة للجهاز العصبي المركزي. (2018) إليفي. 7. DOI: 10.7554 / eLife.36187

Luo، C.، Rivkin، A.، Zhou، J.، Sandoval، JP، Kurihara، L.، Lucero، J.، Castanon، R.، Nery، JR، Pinto-Duarte، A.، Bui، B.، فيتزباتريك ، سي ، أوكونور ، سي ، روجا ، إس ، فان إيدن ، مي ، ديفيس ، دي إيه ، ماش ، دي سي ، بيرينز ، إم إم ، إيكر ، جونيور التنميط القوي لميثيلوم الحمض النووي أحادي الخلية باستخدام snmC-seq2. (2018) طبيعة الاتصالات. 9(1):3824. DOI: 10.1038/s41467-018-06355-2

Xie ، M. ، Chen ، H. ، Huang ، L. ، O'Neil ، RC ، Shokhirev ، MN ، إيكر ، جونيور تقوم شبكة النسخ الخلوي بوساطة B-ARR بتوجيه التنظيم المتقاطع للهرمونات وتطوير التصوير. (2018) طبيعة الاتصالات. 9(1):1604. DOI: 10.1038/s41467-018-03921-6

مايكل ، TP ، Jupe ، F. ، Bemm ، F. ، Motley ، ST ، Sandoval ، JP ، Lanz ، C. ، Loudet ، O. ، Weigel ، D. ، إيكر ، جونيور تجمع جينوم Arabidopsis thaliana عالي الالتصاق مع خلية تدفق نانوية واحدة. (2018) طبيعة الاتصالات. 9(1):541. DOI: 10.1038/s41467-018-03016-2

كارتر ، إيه سي ، تشانغ ، إتش واي ، تشيرش ، جي ، دومبكوفسكي ، أ. إيكر ، جونيورو Gil و E. و Giresi و PG و Greely و H. و Greenleaf و WJ و Hacohen و N. و He و C. و Hill و D. و Ko و J. و Kohane و I. و Kundaje و A. و Palmer ، M.، Snyder، MP، Tung، J.، Urban، A.، Vidal، M.، Wong، W. التحديات والتوصيات لعلم الوراثة الوراثي في ​​دقة الصحة. (2017) التكنولوجيا الحيوية الطبيعة. 35 (12): 1128-1132. DOI: 10.1038 / nbt.4030

إيكر ، جونيور، Geschwind، DH، Kriegstein، AR، Ngai، J.، Osten، P.، Polioudakis، D.، Regev، A.، Sestan، N.، Wickersham، IR، Zeng، H. اتحاد تعداد خلايا مبادرة الدماغ: الدروس المستفادة من إنشاء أطلس شامل لخلايا الدماغ. (2017) الخلايا العصبية. 96 (3): 542-557. DOI: 10.1016 / j.neuron.2017.10.007

هوانغ ، كارولاينا الجنوبية ، إيكر ، جونيور تجميع شبكات تنظيم رابطة الدول المستقلة معًا: رؤى من دراسات علم الوراثة في النباتات. (2017) مراجعات وايلي متعددة التخصصات. بيولوجيا النظم والطب. DOI: 10.1002 / wsbm.1411

Kawakatsu ، T. ، Nery ، JR ، Castanon ، R. ، إيكر ، جونيور إعادة تشكيل مثيلة الحمض النووي الديناميكي أثناء نمو البذور والإنبات. (2017) بيولوجيا الجينوم. 18(1):171. DOI: 10.1186/s13059-017-1251-x

Luo، C.، Keown، CL، Kurihara، L.، Zhou، J.، He، Y.، Li، J.، Castanon، R.، Lucero، J.، Nery، JR، Sandoval، JP، Bui، B . ، Sejnowski ، TJ ، Harkins ، TT ، Mukamel ، EA * ، Behrens ، MM * ، إيكر ، جونيور * تحدد ميثيلوم الخلية الواحدة الأنواع الفرعية العصبية والعناصر التنظيمية في قشرة الثدييات. (2017) العلم. 357 (6351): 600-604. DOI: 10.1126 / science.aan3351

بارتليت ، A. ، O'Malley ، RC ، Huang ، SC ، Galli ، M. ، Nery ، JR ، Gallavotti ، A. ، إيكر ، جونيور رسم خرائط مواقع ربط عامل النسخ على مستوى الجينوم باستخدام DAP-seq. (2017) بروتوكولات الطبيعة. 12 (8): 1659-1672. DOI: 10.1038 / nprot.2017.055

Trigg، SA، Garza، RM، MacWilliams، A.، Nery، JR، Bartlett، A.، Castanon، R.، Goubil، A.، Feeney، J.، O'Malley، R.، Huang، SC، Zhang، ZZ، Galli، M.، إيكر ، جونيور CrY2H-seq: مقايسة متعددة الإرسال على نطاق واسع لرسم خرائط تفاعلية ذات تغطية عميقة. (2017) طرق الطبيعة. 14 (8): 819-825. DOI: 10.1038 / nmeth.4343

Hsia، MM، O'Malley، R.، Cartwright، A.، Nieu، R.، Gordon، SP، Kelly، S.، Williams، TG، Wood، DF، Zhao، Y.، Bragg، J.، Jordan، م ، بولي ، م ، إيكر ، جونيور، جو ، واي. ، فوجل ، جي بي التسلسل والتحقق الوظيفي لمجموعة T-DNA Brachypodium distachyon. (2017) مجلة النبات. 91 (3): 361-370. DOI: 10.1111 / tpj.13582

Keown، CL، Berletch، JB، Castanon، R.، Nery، JR، Disteche، CM، إيكر ، جونيور، مكمل ، شرق علامات مثيلة الحمض النووي غير CG الخاصة بأليل مجالات الكروماتين النشط في دماغ الفأر الأنثوي. (2017) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 114 (14): E2882-E2890. DOI: 10.1073 / pnas.1611905114

حسين ، MS ، Kawakatsu ، T. ، Kim ، KD ، Zhang ، N. ، Nguyen ، CT ، Khan ، SM ، Batek ، JM ، Joshi ، T. ، Schmutz ، J. ، Grimwood ، J. ، Schmitz ، RJ ، Xu ، د. ، جاكسون ، سا ، إيكر ، جونيور، ستايسي ، ج. أنماط مثيلة الحمض النووي للسيتوزين المتباينة في خلية واحدة ، شعر جذر فول الصويا. (2017) فيتول جديد. 214 (2): 808-819. DOI: 10.1111 / nph.14421

هي ، Y. ، Gorkin ، DU ، Dickel ، DE ، Nery ، JR ، Castanon ، RG ، Lee ، AY ، Shen ، Y. ، Visel ، A. ، Pennacchio ، LA ، Ren ، B. إيكر ، جونيور تحسين تنبؤ العنصر التنظيمي بناءً على التوقيعات اللاجينومية المحلية الخاصة بالأنسجة. (2017) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 114 (9): E1633-E1640. DOI: 10.1073 / pnas.1618353114

شاني ، إي ، صالحين ، إم ، زانغ ، واي. ، سانشيز ، إس إي ، دوهرتي ، سي ، وانج ، آر ، مانجادو ، سي سي ، سونج ، إل ، تال ، آي ، بيسانتي ، أو. إيكر ، جونيور، Kay ، SA ، Pruneda-Paz ، J. ، Estelle ، M. يتطلب تحمل إجهاد النبات كوابح نسخ Aux / IAA حساسة للأكسين. (2017) علم الأحياء الحالي 27 (3): 437-444. DOI: 10.1016 / j.cub.2016.12.016

جيمينيز إيبانيز ، إس ، بوتر ، إم ، أورتيغوسا ، إيه ، غارسيا كاسادو ، جي ، تشيني ، إيه ، ليوسي ، إم جي ، إيكر ، جونيور، نتوكاكيس ، ف. ، سولانو ، ر. يتحكم JAZ2 في ديناميكيات الثغور أثناء الغزو البكتيري. (2017) فيتول جديد. 213 (3): 1378-1392. DOI: 10.1111 / nph.14354

نرساي ، آر ، سيكو ، دي ، شولتز ، دكتوراه في الطب ، إيكر ، جونيور، ليستر ، ر. ، ويلان ، ج. التغيرات الديناميكية والسريعة في الترنسكربيتوم والإبيجينوم أثناء الإنبات وفي نمو نباتات الأرز (Oryza sativa) تحت نقص الأكسجين وإعادة الأكسجة. (2017) مجلة النبات. 89 (4): 805-824. DOI: 10.1111 / tpj.13418

Ma، H.، O'Neil، RC، Marti Gutierrez، N.، Hariharan، M.، Zhang، ZZ، He، Y.، Cinnioglu، C.، Kayali، R.، Kang، E.، Lee، Y. ، Hayama ، T. ، Koski ، A. ، Nery ، J. ، Castanon ، R. ، Tippner-Hedges ، R. ، Ahmed ، R. ، Van Dyken ، C. ، Li ، Y. ، Olson ، S. ، Battaglia ، D. ، Lee ، DM ، Wu ، DH ، Amato ، P. ، Wolf ، DP ، إيكر ، جونيور، ميتاليبوف ، س. البويضات البشرية الوظيفية المتولدة عن طريق نقل جينومات الجسم القطبي. (2017) خلية الخلايا الجذعية. 20 (1): 112-119. DOI: 10.1016 / j.stem.2016.10.001

لو ، سي ، لانكستر ، ماساتشوستس ، كاستانون ، R. ، نيري ، جونيور ، كنوبليش ، جا ، إيكر ، جونيور العضويات الدماغية تلخص التواقيع اللاجينومية لدماغ الجنين البشري. (2016) تقارير الخلية 17 (12): 3369-3384. DOI: 10.1016 / j.celrep.2016.12.001

تشين ، سي إس ، بيلوسو ، بي ، سيدلازيك ، إف جي ، ناتستاد ، إم ، كونسيبسيون ، جي تي ، كلوم ، إيه ، دان ، سي ، أومالي ، آر ، فيغيروا بالديراس ، آر ، موراليس كروز ، A.، Cramer، GR، Delledonne، M.، Luo، C.، إيكر ، جونيور، كانتو ، د. ، الرتبة ، دكتور ، شاتز ، MC تجميع جينوم ثنائي الصبغة مرحلي مع تسلسل في الوقت الحقيقي لجزيء واحد. (2016) طرق الطبيعة. 13 (12): 1050-1054. DOI: 10.1038 / nmeth.4035

Song، L.، Huang، SC، Wise، A.، Castanon، R.، Nery، JR، Chen، H.، Watanabe، M.، Thomas، J.، Bar-Joseph، Z.، إيكر ، جونيور يحدد التسلسل الهرمي لعامل النسخ شبكة استجابة الإجهاد البيئي. (2016) العلم. 354 (6312). DOI: 10.1126 / science.aag1550

تشانغ ، إف ، كي ، ب ، وانغ ، إل ، تشاو ، ب ، رود ، إس ، ريغان ، إن دي ، إيكر ، جونيور، تشياو ، هـ. التنظيم المعتمد على EIN2 للأستلة للهيستون H3K14 والهيستون غير الكنسي H3K23 في إشارات الإيثيلين. (2016) طبيعة الاتصالات. ٨: ١٥٨٧٧. DOI: 7 / ncomms13018

Theunissen، TW، Friedli، M.، He، Y.، Planet، E.، O'Neil، RC، Markoulaki، S.، Pontis، J.، Wang، H.، Iouranova، A.، Imbeault، M.، Duc، J.، Cohen، MA، Wert، KJ، Castanon، R.، Zhang، Z.، Huang، Y.، Nery، JR، Drotar، J.، Lungjangwa، T.، Trono، D.، إيكر ، جونيور، يانيش ، ر. المعايير الجزيئية لتحديد حالة الإنسان الساذجة. (2016) خلية الخلايا الجذعية. 19 (4): 502-515. DOI: 10.1016 / j.stem.2016.06.011

O'Malley، RC، Huang، SC، Song، L.، Lewsey، MG، Bartlett، A.، Nery، JR، Galli، M.، Gallavotti، A.، إيكر ، جونيور تشكل ميزات Cistrome و Epicistrome المشهد التنظيمي للحمض النووي. (2016) الخلية 166 (6): 1598. DOI: 10.1016 / j.cell.2016.08.063

Walley ، JW ، Sartor ، RC ، Shen ، Z. ، Schmitz ، RJ ، Wu ، KJ ، Urich ، MA ، Nery ، JR ، Smith ، LG ، Schnable ، JC ، إيكر ، جونيور، بريجز ، سب تكامل شبكات omic في الأطلس التنموي للذرة. (2016) العلم. 353 (6301): 814-8. DOI: 10.1126 / science.aag1125

Kawakatsu ، T. ، Huang ، SC ، Jupe ، F. ، Sasaki ، E. ، Schmitz ، RJ ، Urich ، MA ، Castanon ، R. ، Nery ، JR ، Barragan ، C. ، He ، Y. ، Chen ، H. ، Dubin، M.، Lee، CR، Wang، C.، Bemm، F.، Becker، C.، O'Neil، R.، O'Malley، RC، Quarless، DX، Schork، NJ، Weigel، D. ، نوردبورغ ، م ، إيكر ، جونيور التنوع اللاجينومي في مجموعة عالمية من انضمام Arabidopsis thaliana. (2016) الخلية 166 (2): 492-505. DOI: 10.1016 / j.cell.2016.06.044

Yazaki، J.، Galli، M.، Kim، AY، Nito، K.، Aleman، F.، Chang، KN، Carvunis، AR، Quan، R.، Nguyen، H.، Song، L.، Alvarez، JM ، هوانغ ، إس إس ، تشين ، هـ. ، راماشاندران ، إن ، ألتمان ، إس. ، جوتيريز ، را ، هيل ، دي ، شرودر ، جي آي ، خوري ، جي ، لابير ، جي ، فيدال ، إم ، براون ، بي . ، إيكر ، جونيور تعيين شبكات تفاعل عامل النسخ باستخدام صفائف بروتين HaloTag. (2016) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 113 (29): E4238-47. DOI: 10.1073 / pnas.1603229113

أليمان ، إف ، يازاكي ، جي ، لي ، إم ، تاكاهاشي ، واي ، كيم ، إيه واي ، لي ، زي ، كينوشيتا ، تي ، إيكر ، جونيور، شرودر ، جي آي تفاعل متزايد من ABA لمستقبلات PYL6 ABA مع عامل النسخ MYC2: ارتباط مفترض لإشارات ABA و JA. (2016) التقارير العلمية. 6: 28941. DOI: 10.1038 / srep28941

Song ، L. ، Koga ، Y. ، إيكر ، جونيور تنميط أحداث ارتباط عامل النسخ عن طريق تسلسل الترسيب المناعي للكروماتين (ChIP-seq). (2016) البروتوكولات الحالية في بيولوجيا النبات. 1 (2): 293-306. DOI: 10.1002 / cppb.20014

O'Malley، RC، Huang، SS، Song، L.، Lewsey، MG، Bartlett، A.، Nery، JR، Galli، M.، Gallavotti، A.، إيكر ، جونيور تشكل ميزات Cistrome و Epicistrome المشهد التنظيمي للحمض النووي. (2016) الخلية 165 (5): 1280-92. DOI: 10.1016 / j.cell.2016.04.038

Prigge ، MJ ، Greenham ، K. ، Zhang ، Y. ، Santner ، A. ، Castillejo ، C. ، Mutka ، AM ، O'Malley ، RC ، إيكر ، جونيور، Kunkel ، BN ، Estelle ، M. إن بروتينات Arabidopsis Auxin Receptor F-Box AFB4 و AFB5 مطلوبة للاستجابة لأوكسين بيكلورام الاصطناعية. (2016) G3. 6 (5): 1383-90. DOI: 10.1534 / g3.115.025585

Kawakatsu ، T. ، Stuart ، T. ، Valdes ، M. ، Breakfield ، N. ، Schmitz ، RJ ، Nery ، JR ، Urich ، MA ، Han ، X. ، Lister ، R. ، Benfey ، PN ، إيكر ، جونيور أنماط فريدة من نوعها خاصة بنوع الخلية من مثيلة الحمض النووي في النسيج الإنشائي الجذري. (2016) نباتات الطبيعة. 2 (5): 16058. DOI: 10.1038 / nplants.2016.58

Bogdanović، O.، Smits، AH، de la Calle Mustienes، E.، Tena، JJ، Ford، E.، Williams، R.، Senanayake، U.، Schultz، MD، Hontelez، S.، van Kruijsbergen، I. ، رايون ، T. ، Gnerlich ، F. ، Carell ، T. ، Veenstra ، GJ ، Manzanares ، M. ، Sauka-Spengler ، T. ، إيكر ، جونيور، Vermeulen، M.، Gómez-Skarmeta، JL، Lister، R. إزالة ميثيل الحمض النووي النشط في المعززات خلال فترة النمط النمطي للفقاريات. (2016) وراثة الطبيعة. 48 (4): 417-26. DOI: 10.1038 / نانوغرام 3522

بيرجلسون ، ج. ، باكلر ، إس ، إيكر ، جونيور، نوردبورغ ، إم ، ويجل ، د. اقتراح بشأن أفضل الممارسات للتحقق من هوية المخزونات الجينية وتأثيرات المتغيرات الجينية. (2016) الخلية النباتية. 28 (3): 606-9. DOI: 10.1105 / tpc.15.00502

Mo، A.، Luo، C.، Davis، FP، Mukamel، EA، Henry، GL، Nery، JR، Urich، MA، Picard، S.، Lister، R.، Eddy، SR، Beer، MA، إيكر ، جونيورناثانز ، ج. المناظر الطبيعية اللاجينومية لقضبان الشبكية والمخاريط. (2016) إليفي. 5: e11613. DOI: 10.7554 / eLife.11613

Lewsey ، MG ، Hardcastle ، TJ ، Melnyk ، CW ، Molnar ، A. ، Valli ، A. ، Urich ، MA ، Nery ، JR ، Baulcombe ، DC ، إيكر ، جونيور تنظم الحمض النووي الريبي المحمول الصغير مثيلة الحمض النووي على مستوى الجينوم. (2016) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 113 (6): E801-10. DOI: 10.1073 / pnas.1515072113

سانشيز موت ، جي في ، هاين ، إتش ، فيدال ، إي ، موران ، إس ، سايولز ، إس ، ديلجادو موراليس ، آر ، شولتز ، دكتوراه في الطب ، أنسوليجا ، بي ، جارسيا إسبارسيا ، بي ، بونس - إسبينال ، إم ، دي لاجران ، إم إم ، دوبازو ، جيه ، رابانو ، إيه ، أفيلا ، جيه ، ديرسين ، إم ، لوت ، آي ، فيرير ، آي ، إيكر ، جونيور، إستيلر ، م. تُظهر ميثيلومات الحمض النووي البشري للأمراض التنكسية العصبية أنماطًا جينية مشتركة. (2016) ترجمة علم النفس. 6: e718. DOI: 10.1038 / tp.2015.214

Pedmale و UV و Huang و SS و Zander و M. و Cole و BJ و Hetzel و J. و Ljung و K. و Reis و PA و Sridevi و P. و Nito و K. و Nery و JR و إيكر ، جونيور، خوري ، ج. تتفاعل الكريبتوكرومات بشكل مباشر مع مساحيق التركيبات للتحكم في نمو النبات في الحد من الضوء الأزرق. (2016) الخلية 164(1-2):233-45. DOI: 10.1016/j.cell.2015.12.018

كيشور ، ك ، دي بريتيس ، س ، ليستر ، آر ، موريلي ، إم جي ، بيانكي ، ف ، أماتي ، ب. إيكر ، جونيور، بيليزولا ، م. methylPipe و compEpiTools: مجموعة من حزم R للتحليل التكاملي لبيانات epigenomics. (2015) المعلوماتية الحيوية BMC. 16:313. DOI: 10.1186/s12859-015-0742-6

Nagel ، DH ، Doherty ، CJ ، Pruneda-Paz ، JL ، Schmitz ، RJ ، إيكر ، جونيور، كاي ، سا يكشف التعرف على أهداف CCA1 على نطاق الجينوم عن شبكة ساعة موسعة في Arabidopsis. (2015) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 112 (34): E4802-10. DOI: 10.1073 / pnas.1513609112

Secco ، D. ، Wang ، C. ، Shou ، H. ، Schultz ، MD ، Chiarenza ، S. ، Nussaume ، L. ، إيكر ، جونيور، ويلان ، ج. ، ليستر ، ر. يؤدي التعبير الجيني الناجم عن الإجهاد إلى تغييرات عابرة في مثيلة الحمض النووي في العناصر المتكررة المجاورة. (2015) إليفي. 4. DOI: 10.7554 / eLife.09343

شولتز ، دكتوراه في الطب ، هي ، واي ، ويتاكر ، جي دبليو ، هاريهاران ، إم ، موكامل ، إي إيه ، ليونج ، دي ، راجاجوبال ، إن ، نيري ، جي آر ، أوريش ، ماساتشوستس ، تشين ، إتش ، لين ، إس ، لين ، واي ، جونغ ، آي ، شميت ، إيه دي ، سيلفاراج ، إس ، رين ، بي ، سيجنوفسكي ، تي جي ، وانج ، دبليو ، إيكر ، جونيور تكشف خرائط الإيبيجينوم في جسم الإنسان عن تباين مثيلة الحمض النووي غير الكنسي. (2015) طبيعة. 523 (7559): 212-6. DOI: 10.1038 / nature14465

Mo، A.، Mukamel، EA، Davis، FP، Luo، C.، Henry، GL، Picard، S.، Urich، MA، Nery، JR، Sejnowski، TJ، Lister، R.، Eddy، SR، إيكر ، جونيورناثانز ، ج. التوقيعات اللاجينومية للتنوع العصبي في دماغ الثدييات. (2015) الخلايا العصبية. 86 (6): 1369-84. DOI: 10.1016 / j.neuron.2015.05.018

لو ، سي ، إيكر ، جونيور علم التخلق. الوراثة اللاجينية الاستثنائية في الدماغ. (2015) العلم. 348 (6239): 1094-5. DOI: 10.1126 / science.aac5832

يا.، إيكر ، جونيور مثيلة غير CG في الجينوم البشري. (2015) المراجعة السنوية لعلم الجينوم وعلم الوراثة البشرية. 16: 55-77. DOI: 10.1146 / annurev-genom-090413-025437

Wu، J.، Okamura، D.، Li، M.، Suzuki، K.، Luo، C.، Ma، L.، He، Y.، Li، Z.، Benner، C.، Tamura، I.، Krause ، MN ، Nery ، JR ، Du ، T. ، Zhang ، Z. ، Hishida ، T. ، Takahashi ، Y. ، Aizawa ، E. ، Kim ، NY ، Lajara ، J. ، Guillen ، P. ، Campistol ، JM ، Esteban، CR، Ross، PJ، Saghatelian، A.، Ren، B.، إيكر ، جونيور، Izpisua Belmonte، JC تمنح الدولة متعددة القدرات البديلة أهلية خيالية بين الأنواع. (2015) طبيعة. 521 (7552): 316-21. DOI: 10.1038 / nature14413

Kida، YS، Kawamura، T.، Wei، Z.، Sogo، T.، Jacinto، S.، Shigeno، A.، Kushige، H.، Yoshihara، E.، Liddle، C.، إيكر ، جونيوريو ، آر تي ، أتكينز ، أر ، داونز ، إم ، إيفانز ، آر إم تتوسط أخطاء ERR مفتاحًا استقلابيًا مطلوبًا لإعادة برمجة الخلايا الجسدية إلى تعدد القدرات. (2015) خلية الخلايا الجذعية. 16 (5): 547-55. DOI: 10.1016 / j.stem.2015.03.001

Urich ، MA ، Nery ، JR ، Lister ، R. ، Schmitz ، RJ ، إيكر ، جونيور إعداد مكتبة MethylC-seq لتسلسل بيسلفيت الجينوم الكامل ذي الدقة الأساسية. (2015) بروتوكولات الطبيعة. 10 (3): 475-83. DOI: 10.1038 / nprot.2014.114

ليونغ ، د. ، جونغ ، آي ، راجاجوبال ، إن ، شميت ، أ. ، سيلفاراج ، إس ، لي ، أيه واي ، ين ، كا ، لين ، إس ، لين ، واي ، كيو ، واي ، شي ، W. ، Yue ، F. ، Hariharan ، M. ، Ray ، P. ، Kuan ، S. ، Edsall ، L. ، Yang ، H. ، Chi ، NC ، Zhang ، MQ ، إيكر ، جونيور، رين ، ب. تحليل تكاملي للإبيجينومات ذات النمط الفرداني عبر الأنسجة البشرية. (2015) طبيعة. 518 (7539): 350-354. DOI: 10.1038 / nature14217

Dixon، JR *، Jung، I. *، Selvaraj، S. *، Shen، Y.، Antosiewicz-Bourget، JE، Lee، AY، Ye، Z.، Kim، A.، Rajagopal، N.، Xie، W . ، Diao ، Y. ، Liang ، J. ، Zhao ، H. ، Lobanenkov ، VV ، إيكر ، جونيور، طومسون ، جا ، رين ، ب. إعادة تنظيم بنية الكروماتين أثناء تمايز الخلايا الجذعية. (2015) طبيعة. 518 (7539): 331-6. DOI: 10.1038 / nature14222

Kundaje، A.، Meuleman، W.، Ernst، J.، Bilenky، M.، Yen، A.، Heravi-Moussavi، A.، Kheradpour، P.، Zhang، Z.، Wang، J.، Ziller، MJ ، أمين ، ف. ، ويتاكر ، جي دبليو ، شولتز ، دكتوراه في الطب ، وارد ، إل دي ، ساركار ، إيه ، كوين ، جي ، ساندستروم ، رس ، إيتون ، ML ، وو ، واي سي ، بفينينج ، أر ، وانج ، إكس. ، كلاوسنيتسر ، M.، Liu، Y.، Coarfa، C.، Harris، RA، Shoresh، N.، Epstein، CB، Gjoneska، E.، Leung، D.، Xie، W.، Hawkins، RD، Lister، R. ، هونغ ، سي ، جاسكار ، بي ، مونغال ، إيه جيه ، مور ، آر ، تشواه ، إي ، تام ، إيه ، كانفيلد ، تي كيه ، هانسن ، آر إس ، كول ، آر ، سابو ، بي جي ، بانسال ، إم إس ، كارليس ، أ ، ديكسون ، جي آر ، فرح ، كيه إتش ، فيزي ، إس ، كارليش ، آر ، كيم ، أر ، كولكارني ، إيه ، لي ، دي ، لوودون ، آر ، إليوت ، جي ، ميرسر ، TR، Neph، SJ، Onuchic، V.، Polak، P.، Rajagopal، N.، Ray، P.، Sallari، RC، Siebenthall، KT، Sinnott-Armstrong، NA، Stevens، M.، Thurman، RE، Wu ، J.، Zhang، B.، Zhou، X.، Beaudet، AE، Boyer، LA، De Jager، PL، Farnham، PJ، Fisher، SJ، Haussler، D.، Jones، SJ، Li، W.، Marra ، MA، McManus، MT، Sunyaev، S.، Thomson، JA، Tlsty، TD، Tsai، LH، Wang، W.، Waterland، RA، Zhang، MQ، Chadwick، LH، Bernstein، BE، Costello، JF، إيكر ، جونيور، Hirst، M.، Meissner، A.، Milosavljevic، A.، Ren، B.، Stamatoyannopoulos، JA، Wang، T.، Kellis، M. تحليل تكاملي لـ 111 إبيجينومًا مرجعيًا بشريًا. (2015) طبيعة. 518 (7539): 317-30. DOI: 10.1038 / nature14248

O'Malley، RC، Barragan، CC، إيكر ، جونيور دليل المستخدم لمجموعات متحولة الإدراج في Arabidopsis T-DNA. (2015) طرق في علم الأحياء الجزيئي. 1284:323-42. DOI: 10.1007/978-1-4939-2444-8_16

Lin، S.، Lin، Y.، Nery، JR، Urich، MA، Breschi، A.، Davis، CA، Dobin، A.، Zaleski، C.، Beer، MA، Chapman، WC، Gingeras، TR، إيكر ، جونيورسنايدر النائب مقارنة المناظر الطبيعية النسخية بين أنسجة الإنسان والفأر. (2014) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 111 (48): 17224-9. DOI: 10.1073 / pnas.1413624111

Yu ، W. ، McIntosh ، C. ، Lister ، R. ، Zhu ، I. ، Han ، Y. ، Ren ، J. ، Landsman ، D. ، Lee ، E. ، Briones ، V. ، Terashima ، M. ، لايتي ، ر. إيكر ، جونيور، Muegge ، K. تكشف أنماط مثيلة الحمض النووي على نطاق الجينوم في متحولة LSH عن إلغاء قمع عناصر التكرار ومسارات الإسكات اللاجينية الزائدة عن الحاجة. (2014) أبحاث الجينوم. 24 (10): 1613-23. DOI: 10.1101 / gr.172015.114

Weirauch، MT، Yang، A.، Albu، M.، Cote، A.، Montenegro-Montero، A.، Drewe، P.، Najafabadi، HS، Lambert، SA، Mann، I.، Cook، K.، Zheng ، H. ، Goity ، A. ، van Bakel ، H. ، Lozano ، JC ، Galli ، M. ، Lewsey ، M. ، Huang ، E. ، Mukherjee ، T. ، Chen ، X. ، Reece-Hoyes ، JS ، Govindarajan، S.، Shaulsky، G.، Walhout، AJM، Bouget، FY، Ratsch، G.، Larrondo، LF، إيكر ، جونيور، هيوز ، TR تحديد واستدلال خصوصية تسلسل عامل النسخ حقيقية النواة. (2014) الخلية 158 (6): 1431-1443. DOI: 10.1016 / j.cell.2014.08.009

Weßling، R.، Epple، P.، Altmann، S.، He، Y.، Yang، L.، Henz، SR، McDonald، N.، Wiley، K.، Bader، KC، Gläßer، C.، Mukhtar، MS، Haigis، S.، Ghamsari، L.، Stephens، AE، إيكر ، جونيور، فيدال ، إم ، جونز ، جيه دي ، ماير ، كيه إف ، فير لورين فان ثيمات ، إي ، ويجل ، دي ، شولز ليفرت ، بي ، دانجل ، جي إل ، بانستروجا ، آر ، براون ، بي. الاستهداف المتقارب لشبكة بروتين مضيفة مشتركة بواسطة العوامل الممرضة من ثلاث ممالك للحياة. (2014) مضيف الخلية والميكروب. 16 (3): 364-75. DOI: 10.1016 / j.chom.2014.08.004

بوجانيم ، واي. ، ماركولاكي ، إس ، فان ويتمارشين ، إن ، هوك ، إتش ، وو ، تي ، جانز ، ك. ، أختار زيدي ، بي ، هي ، واي ، أبراهام ، بي جيه ، بوروبسكي ، دي. .، Kulenkampff، E.، Faddah، DA، Shi، L.، Gao، Q.، Sarkar، S.، Cohen، M.، Goldmann، J.، Nery، JR، Schultz، MD، إيكر ، جونيور، شياو ، A. ، يونغ ، RA ، Lansdorp ، PM ، Jaenisch ، R. تتأثر الإمكانات التنموية لـ iPSCs بشكل كبير بإعادة اختيار عامل البرمجة. (2014) خلية الخلايا الجذعية. 15 (3): 295-309. DOI: 10.1016 / j.stem.2014.07.003

كاتالا ، آر ، لوبيز كوبولو ، آر ، مار كاستيلانو ، إم ، أنجوستو ، تي ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، ساليناس ، ج. يربط بروتين Arabidopsis 14-3-3 RARE COLD INDUCIBLE 1A استجابة درجات الحرارة المنخفضة والتخليق الحيوي للإيثيلين لتنظيم تحمل التجميد والتأقلم مع البرودة. (2014) الخلية النباتية. 26 (8): 3326-42. DOI: 10.1105 / tpc.114.127605

برونيدا-باز ، جيه إل ، بريتون ، جي ، ناجيل ، دي إتش ، كانغ ، إس إي ، بونالدي ، ك ، دوهرتي ، سي جيه ، رافيلو ، إس ، جالي ، إم ، إيكر ، جونيور، كاي ، سا مورد مقياس الجينوم للتوصيف الوظيفي لعوامل نسخ أرابيدوبسيس. (2014) تقارير الخلية 8 (2): 622-32. DOI: 10.1016 / j.celrep.2014.06.033

Ma، H.، Morey، R.، O'Neil، RC، He، Y.، Daughtry، B.، Schultz، MD، Hariharan، M.، Nery، JR، Castanon، R.، Sabatini، K.، Thiagarajan ، RD، Tachibana، M.، Kang، E.، Tippner-Hedges، R.، Ahmed، R.، Gutierrez، NM، Van Dyken، C.، Polat، A.، Sugawara، A.، Sparman، M.، جوخال ، إس ، أماتو ، بي ، وولف ، دي بي ، إيكر ، جونيور، لوران ، إل سي ، ميتاليبوف ، س. شذوذ في الخلايا متعددة القدرات البشرية بسبب آليات إعادة البرمجة. (2014) طبيعة. 511 (7508): 177-83. DOI: 10.1038 / nature13551

Dinh، TT، Gao، L.، Liu، X.، Li، D.، Li، S.، Zhao، Y.، O'Leary، M.، Le، B.، Schmitz، RJ، Manavella، PA، Manavella ، P. ، Li ، S. ، Weigel ، D. ، Pontes ، O. ، إيكر ، جونيور، تشين ، إكس. يعزز DNA topoisomerase 1α إسكات نسخ العناصر القابلة للنقل من خلال مثيلة الحمض النووي وثنائي ميثيل هيستون ليسين 9 في Arabidopsis. (2014) علم الوراثة PLOS. 10 (7): e1004446. DOI: 10.1371 / journal.pgen.1004446

Yu ، W. ، Briones ، V. ، Lister ، R. ، McIntosh ، C. ، Han ، Y. ، Lee ، EY ، Ren ، J. ، Terashima ، M. ، Leighty ، RM ، إيكر ، جونيور، Muegge ، K. يرتبط نقص الميثيل CG في الخلايا الليفية الجنينية للفأر Lsh بتكوين de novo H3K4me1 وتغيير اللدونة الخلوية. (2014) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 111 (16): 5890-5. DOI: 10.1073 / pnas.1320945111

Looney، TJ، Zhang، L.، Chen، CH، Lee، JH، Chari، S.، Mao، FF، Pelizzola، M.، Zhang، L.، Lister، R.، Baker، SW، Fernandes، CJ، Gaetz ، J.، Foshay، KM، Clift، KL، Zhang، Z.، Li، WQ، Vallender، EJ، Wagner، U.، Qin، JY، Michelini، KJ، Bugarija، B.، Park، D.، Aryee، E. ، Stricker ، T. ، Zhou ، J. ، White ، KP ، Ren ، B. ، Schroth ، GP ، إيكر ، جونيور، شيانغ ، أ ف ب ، لان ، بت يكشف رسم الخرائط المنهجي للجينات المحتبسة عن طريق اندماج الخلية عن انتشار واستقرار إسكات الخلايا الجسدية بوساطة رابطة الدول المستقلة. (2014) أبحاث الجينوم. 24 (2): 267-80. DOI: 10.1101 / gr.143891.112

Wang ، T. ، Liu ، J. ، Shen ، L. ، Tonti-Filippini ، J. ، Zhu ، Y. ، Jia ، H. ، Lister ، R. ، Whitaker ، JW ، إيكر ، جونيور، ميلار ، آه ، رن ، ب ، وانغ ، و. STAR: حل متكامل لإدارة وتصور بيانات التسلسل. (2013) المعلوماتية الحيوية. 29 (24): 3204-10. DOI: 10.1093 / المعلوماتية الحيوية / btt558

شميتز ، آر جيه ، هي ، واي ، فالديس-لوبيز ، أو ، خان ، إس إم ، جوشي ، تي ، أوريش ، ماساتشوستس ، نيري ، جي آر ، ديرز ، بي ، شو ، دي ، ستايسي ، جي ، إيكر ، جونيور الوراثة على مستوى الإيبيجينوم لمتغيرات مثيلة السيتوزين في مجموعة فطرية مؤتلفة. (2013) أبحاث الجينوم. 23 (10): 1663-74. DOI: 10.1101 / gr.152538.112

Hua، Z.، Pool، JE، Schmitz، RJ، Schultz، MD، Shiu، SH، إيكر ، جونيور، Vierstra، RD تساهم البرمجة اللاجينومية في تطور الانجراف الجيني لعائلة بروتين F-Box الفائقة في نبات الأرابيدوبسيس. (2013) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 110 (42): 16927-32. DOI: 10.1073 / pnas.1316009110

Lister ، R. * ، Mukamel ، EA ، Nery ، JR ، Urich ، M. ، Puddifoot ، CA ، Johnson ، ND ، Lucero ، J. ، Huang ، Y. ، Dwork ، AJ ، Schultz ، MD ، Yu ، M. ، Tonti-Filippini، J.، Heyn، H.، Hu، S.، Wu، JC، Rao، A.، Esteller، M.، He، C.، Haghighi، FG، Sejnowski، TJ، Behrens، MM *، إيكر ، جونيور * إعادة التكوين اللاجينومي العالمي أثناء نمو دماغ الثدييات. (2013) العلم. 341 (6146): 1237905. DOI: 10.1126 / العلوم .1237905

Qiao، H.، Shen، Z.، Huang، SS، Schmitz، RJ، Urich، MA، Briggs، SP، إيكر ، جونيور الرد على المنظور: "قلق الانفصال: تحليل الانقسام الناجم عن الإيثيلين لـ EIN2". (2013) إشارات النبات والسلوك. 8 (8). دوى: 10.4161 / psb.25037

شفايتزر ، إف ، فرنانديز كالفو ، بي ، زاندر ، إم ، دييز دياز ، إم ، فونسيكا ، إس ، جلاوزر ، جي ، ليوسي ، إم جي ، إيكر ، جونيور، سولانو ، ر. ، ريموند ، ب. تعمل عوامل النسخ الحلزونية الحلزونية الأساسية لأرابيدوبسيس MYC2 و MYC3 و MYC4 على تنظيم التخليق الحيوي للجلوكوزينولات وأداء الحشرات وسلوك التغذية. (2013) الخلية النباتية. 25 (8): 3117-32. DOI: 10.1105 / tpc.113.115139

Chang، KN، Zhong، S.، Weirauch، MT، Hon، G.، Pelizzola، M.، Li، H.، Huang، SS، Schmitz، RJ، Urich، MA، Kuo، D.، Nery، JR، Qiao ، H. ، Yang ، A. ، Jamali ، A. ، Chen ، H. ، Ideker ، T. ، Ren ، B. ، Bar-Joseph ، Z. ، Hughes ، TR ، إيكر ، جونيور تؤدي استجابة النسخ الزمنية لغاز الإيثيلين إلى التنظيم المتقاطع لهرمون النمو في نبات الأرابيدوبسيس. (2013) إليفي. 2: e00675. DOI: 10.7554 / eLife.00675

Xie، W.، Schultz، MD، Lister، R.، Hou، Z.، Rajagopal، N.، Ray، P.، Whitaker، JW، Tian، S.، Hawkins، RD، Leung، D.، Yang، H .، Wang، T.، Lee، AY، Swanson، SA، Zhang، J.، Zhu، Y.، Kim، A.، Nery، JR، Urich، MA، Kuan، S.، Yen، CA، Klugman، S . ، Yu ، P. ، Suknuntha ، K. ، Propson ، NE ، Chen ، H. ، Edsall ، LE ، Wagner ، U. ، Li ، Y. ، Ye ، Z. ، Kulkarni ، A. ، Xuan ، Z. ، Chung ، WY ، Chi ، NC ، Antosiewicz-Bourget ، JE ، Slukvin ، I. ، Stewart ، R. ، Zhang ، MQ ، Wang ، W. ، Thomson ، JA ، إيكر ، جونيور، رين ، ب. التحليل اللاجيني للتمايز متعدد السلالات للخلايا الجذعية الجنينية البشرية. (2013) الخلية 153 (5): 1134-48. DOI: 10.1016 / j.cell.2013.04.022

Hill، K.، Mathews، DE، Kim، HJ، Street، IH، Wildes، SL، Chiang، YH، Mason، MG، Alonso، JM، إيكر ، جونيور، كيبر ، جي جي ، شالر ، جنرال إلكتريك التوصيف الوظيفي لمنظمات الاستجابة من النوع B في استجابة Arabidopsis cytokinin. (2013) فيزياء النبات. 162 (1): 212-24. دوى: 10.1104 / ص 112.208736

شميتز ، RJ ، شولتز ، MD ، Urich ، MA ، Nery ، JR ، Pelizzola ، M. ، Libiger ، O. ، Alix ، A. ، McCosh ، RB ، Chen ، H. ، Schork ، NJ ، إيكر ، جونيور أنماط التنوع اللاجينومي للسكان. (2013) طبيعة. 495 (7440): 193-8. DOI: 10.1038 / nature11968

إيكر ، جونيور محفز جيني لنضج الطماطم. (2013) التكنولوجيا الحيوية الطبيعة. 31 (2): 119-20. DOI: 10.1038 / nbt.2497

وودسون ، جي دي ، بيريز رويز ، جي إم ، شميتز ، آر جي ، إيكر ، جونيور، خوري ، ج. تتحكم إشارات رجعية بلاستيد بوساطة عامل سيغما في التعبير الجيني النووي. (2013) مجلة النبات. 73 (1): 1-13. DOI: 10.1111 / tpj.12011

O'Malley ، RC ، إيكر ، جونيور الاختلاف Epiallelic في Arabidopsis thaliana. (2012) ندوة كولد سبرينج هاربور حول علم الأحياء الكمي. 77: 135-45. DOI: 10.1101 / قدم مربع 2012.77.014571

فولمرز ، سي ، شميتز ، آر جيه ، ناثانسون ، جي ، يو ، جي ، إيكر ، جونيور، باندا ، س. تذبذبات الساعة البيولوجية لترميز البروتين والحمض النووي الريبي التنظيمي في إبيجينوم كبد الثدييات الديناميكية للغاية. (2012) استقلاب الخلية. 16 (6): 833-45. DOI: 10.1016 / j.cmet.2012.11.004

Beck، S.، Bernstein، BE، Campbell، RM، Costello، JF، Dhanak، D.، إيكر ، جونيور، Greally ، JM ، Issa ، JP ، Laird ، PW ، Polyak ، K. ، Tycko ، B. ، Jones ، PA ، AACR Cancer Epigenome Task Force مخطط لاتحاد إبيجينوم السرطان الدولي. تقرير من AACR Cancer Epigenome Task Force. (2012) ابحاث السرطان. 72(24):6319-24. DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-12-3658

شولتز ، دكتوراه في الطب ، شميتز ، آر جيه ، إيكر ، جونيور "تسوية" ساحة اللعب لتحليلات ميثيلوم الحمض النووي ذات الدقة أحادية القاعدة. (2012) الاتجاهات في علم الوراثة. 28 (12): 583-5. دوى: 10.1016 / j.tig.2012.10.012

Qiao، H.، Shen، Z.، Huang، SS، Schmitz، RJ، Urich، MA، Briggs، SP، إيكر ، جونيور المعالجة والتهريب الخلوي لاستجابة تحكم EIN2 المربوط بـ ER لغاز الإيثيلين. (2012) العلم. 338 (6105): 390-3. DOI: 10.1126 / العلوم .1225974

إيكر ، جونيور، Bickmore، WA، Barroso، I.، Pritchard، JK، Gilad، Y.، Segal، E. علم الجينوم: وأوضح الترميز. (2012) طبيعة. 489 (7414): 52-5. DOI: 10.1038 / 489052a

Dowen، RH، Pelizzola، M.، Schmitz، RJ، Lister، R.، Dowen، JM، Nery، JR، Dixon، JE، إيكر ، جونيور انتشار مثيلة الحمض النووي الديناميكي على نطاق واسع استجابة للإجهاد الحيوي. (2012) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 109 (32): E2183-91. DOI: 10.1073 / pnas.1209329109

Johnson، DB، Wang، C.، Xu، J.، Schultz، MD، Schmitz، RJ، إيكر ، جونيور، وانج ، ل. يعتبر عامل الإطلاق الأول غير ضروري في الإشريكية القولونية. (2012) البيولوجيا الكيميائية ACS. 7 (8): 1337-44. DOI: 10.1021 / cb300229q

Wierzbicki ، AT ، Cocklin ، R. ، Mayampurath ، A. ، Lister ، R. ، Rowley ، MJ ، Gregory ، BD ، إيكر ، جونيور، تانغ ، هـ. ، بيكارد ، سي إس العلاقات المكانية والوظيفية بين المواقع المرتبطة بـ Pol V ، و siRNAs المعتمدة على Pol IV ، وميثلة السيتوزين في Arabidopsis epigenome. (2012) الجينات والتنمية. 26 (16): 1825-36. دوى: 10.1101 / جاد 197772.112

بينغ ، إيكر ، جونيور الكشف عن مثيلة محددة الأليل من خلال نموذج إبيجينوم غير متجانس معمم. (2012) المعلوماتية الحيوية. 28 (12): i163-71. DOI: 10.1093 / المعلوماتية الحيوية / bts231

لي ، L. ، Ljung ، K. ، Breton ، G. ، Schmitz ، RJ ، Pruneda-Paz ، J. ، Cowing-Zitron ، C. ، Cole ، BJ ، Ivans ، LJ ، Pedmale ، UV ، Jung ، HS ، إيكر ، جونيور، كاي ، سا ، خوري ، ج. ربط إثارة المستقبلات الضوئية بالتغيرات في بنية النبات. (2012) الجينات والتنمية. 26 (8): 785-90. دوى: 10.1101 / جاد 187849.112

Kurihara، Y.، Schmitz، RJ، Nery، JR، Schultz، MD، Okubo-Kurihara، E.، Morosawa، T.، Tanaka، M.، Toyoda، T.، Seki، M.، إيكر ، جونيور تتطلب مراقبة 3 نصوص غير مشفرة FIERY1 و XRN3 في Arabidopsis. (2012) G3. 2 (4): 487-98. DOI: 10.1534 / g3.111.001362

شميتز ، RJ ، إيكر ، جونيور الاختلاف فوق الجيني والمتوالي في Arabidopsis thaliana. (2012) الاتجاهات في علوم النبات. 17 (3): 149-54. DOI: 10.1016 / j.tplants.2012.01.001

Hon، GC، Hawkins، RD، Caballero، OL، Lo، C.، Lister، R.، Pelizzola، M.، Valsesia، A.، Ye، Z.، Kuan، S.، Edsall، LE، Camargo، AA، ستيفنسون ، BJ ، إيكر ، جونيور، بافنا ، في ، ستراوسبرغ ، آر إل ، سيمبسون ، إيه جيه ، رين ، ب. ميثيل الحمض النووي العالمي مقترنًا بتشكيل مجال الكروماتين القمعي وإسكات الجينات في سرطان الثدي. (2012) أبحاث الجينوم. 22 (2): 246-58. DOI: 10.1101 / gr.125872.111

Hotto ، AM ، Schmitz ، RJ ، Fei ، Z. ، إيكر ، جونيور، ستيرن ، دي.بي. تنوع غير متوقع من الحمض النووي الريبي غير المشفر للكلوروبلاست كما تم الكشف عنه من خلال التسلسل العميق لنسخة أرابيدوبسيس. (2011) G3. 1 (7): 559-70. DOI: 10.1534 / g3.111.000752

Elling، U.، Taubenschmid، J.، Wirnsberger، G.، O'Malley، R.، Demers، SP، Vanhaelen، Q.، Shukalyuk، AI، Schmauss، G.، Schramek، D.، Schnuetgen، F.، فون ميلشنر ، هـ. إيكر ، جونيور، ستانفورد، WL، Zuber، J.، Stark، A.، Penninger، JM علم الوراثة إلى الأمام والعكس من خلال اشتقاق الخلايا الجذعية الجنينية للفأر الفرداني. (2011) خلية الخلايا الجذعية. 9 (6): 563-74. DOI: 10.1016 / j.stem.2011.10.012

شميتز ، RJ ، شولتز ، MD ، Lewsey ، MG ، O'Malley ، RC ، Urich ، MA ، Libiger ، O. ، Schork ، NJ ، إيكر ، جونيور يعد عدم الاستقرار الوراثي اللاجيني عبر الأجيال مصدرًا لمتغيرات مثيلة جديدة. (2011) العلم. 334 (6054): 369-73. DOI: 10.1126 / العلوم .1212959

Johnson، DB، Xu، J.، Shen، Z.، Takimoto، JK، Schultz، MD، Schmitz، RJ، Xiang، Z.، إيكر ، جونيور، بريجز ، سب ، وانغ ، ل. يسمح خروج المغلوب RF1 بدمج الريبوسوم للأحماض الأمينية غير الطبيعية في مواقع متعددة. (2011) بيولوجيا الطبيعة الكيميائية. 7 (11): 779-86. DOI: 10.1038 / nchembio.657

بيليزولا ، م. إيكر ، جونيور ميثيلوم الحمض النووي. (2011) FEBS Lett. 585 (13): 1994-2000. DOI: 10.1016 / j.febslet.2010.10.061

Mukhtar، MS، Carvunis، AR، Dreze، M.، Epple، P.، Steinbrenner، J.، Moore، J.، Tasan، M.، Galli، M.، Hao، T.، Nishimura، MT، Pevzner، SJ ، دونوفان ، سراج الدين ، غمساري ، إل ، سانثانام ، ب ، روميرو ، ف ، بولين ، إم إم ، جبريب ، إف ، جوتيريز ، بي جي ، تام ، إس ، موناتشيلو ، دي ، بوكسيم ، إم ، هاربورت ، CJ، McDonald، N.، Gai، L.، Chen، H.، He، Y.، European Union Effectoromics Consortium، Vandenhaute، J.، Roth، FP، Hill، DE، إيكر ، جونيور، فيدال ، إم ، بينون ، ج. ، براون ، بي ، دانجل ، جيه إل تتلاقى مؤثرات الضراوة المتطورة بشكل مستقل على محاور في شبكة نظام المناعة النباتية. (2011) العلم. 333 (6042): 596-601. DOI: 10.1126 / العلوم .1203659

اتحاد رسم الخرائط التفاعلية أرابيدوبسيس دليل على تطور الشبكة في خريطة تفاعلية أرابيدوبسيس. (2011) العلم. 333 (6042): 601-7. DOI: 10.1126 / العلوم .1203877

باستور ، وا ، باب ، يوج ، هوانغ ، واي. ، هندرسون ، إتش آر ، ليستر ، آر ، كو ، إم ، ماكلوغلين ، إم ، برودنو ، واي. ، ماهاباترا ، إس ، كابرانوف ، بي ، تاهيلياني ، إم. ، دالي ، جي كيو ، ليو ، XS ، إيكر ، جونيورميلوس ، بي إم ، أغاروال ، إس ، راو ، إيه. رسم خرائط على مستوى الجينوم لـ 5-هيدروكسي ميثيل سيتوزين في الخلايا الجذعية الجنينية. (2011) طبيعة. 473 (7347): 394-7. DOI: 10.1038 / nature10102

ليستر ، آر ، بيليزولا ، إم ، كيدا ، واي إس ، هوكينز ، آر دي ، نيري ، جي آر ، هون ، جي ، أنتوسيفيتش بورجيه ، جي ، أومالي ، آر ، كاستانون ، آر ، كلوجمان ، إس. ، داونز ، إم ، يو ، آر ، ستيوارت ، آر ، رين ، بي ، طومسون ، جا ، إيفانز ، آر إم ، إيكر ، جونيور النقاط الساخنة لإعادة البرمجة اللاجينومية الشاذة في الخلايا الجذعية التي يسببها الإنسان. (2011) طبيعة. 471 (7336): 68-73. DOI: 10.1038 / nature09798

برنشتاين ، بي ، ستاماتويانوبولوس ، جا ، كوستيلو ، جي إف ، رين ، ب ، ميلوسافلجيفيتش ، إيه ، ميسنر ، إيه ، كيليس ، إم ، مارا ، ماساتشوستس ، بيوديت ، أل ، إيكر ، جونيور، Farnham، PJ، Hirst، M.، Lander، ES، Mikkelsen، TS، Thomson، JA اتحاد رسم خرائط علم الوراثة اللاجيني لخريطة طريق المعاهد الوطنية للصحة. (2010) التكنولوجيا الحيوية الطبيعة. 28(10):1045-8. DOI: 10.1038/nbt1010-1045

Harris، RA، Wang، T.، Coarfa، C.، Nagarajan، RP، Hong، C.، Downey، SL، Johnson، BE، Fouse، SD، Delaney، A.، Zhao، Y.، Olshen، A.، بالينجر ، T. ، تشو ، X. ، فورسبيرج ، KJ ، Gu ، J. ، Echipare ، L. ، O'Geen ، H. ، Lister ، R. ، Pelizzola ، M. ، Xi ، Y. ، Epstein ، CB ، برنشتاين ، بي ، هوكينز ، آر دي ، رين ، بي ، تشونج ، واي ، جو ، إتش ، بوك ، سي ، جينيرك ، إيه ، زانج ، إم كيو ، هوسلر ، دي ، إيكر ، جونيور، Li، W.، Farnham، PJ، Waterland، RA، Meissner، A.، Marra، MA، Hirst، M.، Milosavljevic، A.، Costello، JF مقارنة بين الطرق المستندة إلى التسلسل لتوصيف مثيلة الحمض النووي وتحديد التعديلات اللاجينية أحادية الموازية. (2010) التكنولوجيا الحيوية الطبيعة. 28 (10): 1097-105. DOI: 10.1038 / nbt.1682

Boutrot ، F. ، Segonzac ، C. ، Chang ، KN ، Qiao ، H. ، إيكر ، جونيور، Zipfel ، C. ، Rathjen ، JP التحكم في النسخ المباشر لمستقبلات نبات الأرابيدوبسيس المناعي FLS2 بواسطة عوامل النسخ المعتمدة على الإيثيلين EIN3 و EIL1. (2010) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 107 (32): 14502-7. DOI: 10.1073 / pnas.1003347107

An، F.، Zhao، Q.، Ji، Y.، Li، W.، Jiang، Z.، Yu، X.، Zhang، C.، Han، Y.، He، W.، Liu، Y. تشانغ ، س. إيكر ، جونيور، قوه ، هـ. التثبيت الناجم عن الإيثيلين لـ ETHYLENE INSENSITIVE3 و EIN3-LIKE1 يتم توسطه عن طريق التحلل البروتيني لربط EIN3 F-box 1 و 2 الذي يتطلب EIN2 في Arabidopsis. (2010) الخلية النباتية. 22 (7): 2384-401. DOI: 10.1105 / tpc.110.076588

Atwell، S.، Huang، YS، Vilhjálmsson، BJ، Willems، G.، Horton، M.، Li، Y.، Meng، D.، Platt، A.، Tarone، AM، Hu، TT، Jiang، R. ، Muliyati، NW، Zhang، X.، Amer، MA، Baxter، I.، Brachi، B.، Chory، J.، Dean، C.، Debieu، M.، de Meaux، J.، إيكر ، جونيور، Faure، N.، Kniskern، JM، Jones، JD، Michael، T.، Nemri، A.، Roux، F.، Salt، DE، Tang، C.، Todesco، M.، Traw، MB، Weigel، D .، Marjoram، P.، Borevitz، JO، Bergelson، J.، Nordborg، M. دراسة الارتباط على مستوى الجينوم لـ 107 نمطًا ظاهريًا في سلالات أرابيدوبسيس ثاليانا الفطرية. (2010) طبيعة. 465 (7298): 627-31. DOI: 10.1038 / nature08800

إيكر ، جونيور التصفير في ميثيلوم الحمض النووي بدون BS. (2010) طرق الطبيعة. 7(6):435-7. DOI: 10.1038/nmeth0610-435

هوكينز ، آر دي ، هون ، جي سي ، لي ، إل كيه ، نجو ، كيو ، ليستر ، آر ، بيليزولا ، إم ، إدسال ، لي ، كوان ، إس ، لو ، واي ، كلوجمان ، إس ، أنتوسيفيتش بورجيه ، J.، Ye، Z.، Espinoza، C.، Agarwahl، S.، Shen، L.، Ruotti، V.، Wang، W.، Stewart، R.، Thomson، JA، إيكر ، جونيور، رين ، ب. المناظر الطبيعية اللاجينومية المتميزة للخلايا البشرية متعددة القدرات والالتزام بالنسب. (2010) خلية الخلايا الجذعية. 6 (5): 479-91. DOI: 10.1016 / j.stem.2010.03.018

O'Malley ، RC ، إيكر ، جونيور ربط التركيب الوراثي بالنمط الظاهري باستخدام مجموعة Arabidopsis unimutant. (2010) مجلة النبات. 61(6):928-40. DOI: 10.1111/j.1365-313X.2010.04119.x

Endres ، MW ، Gregory ، BD ، Gao ، Z. ، فورمان ، AW ، Mlotshwa ، S. ، Ge ، X. ، Pruss ، GJ ، إيكر ، جونيور، بومان ، إل إتش ، فانس ، ف. يتطلب مثبطان فيروسيان للنباتات يعملان على إسكات عامل نسخ المضيف المحفز بالإيثيلين RAV2 لمنع إسكات الحمض النووي الريبي. (2010) مسببات الأمراض PLOS. 6 (1): e1000729. DOI: 10.1371 / journal.ppat.1000729

ليستر ، آر ، بيليزولا ، إم ، دوين ، آر إتش ، هوكينز ، آر دي ، هون ، جي ، تونتي فيليبيني ، جي ، نيري ، جي آر ، لي ، إل ، يي ، زي ، نجو ، كيو إم ، إدسال ، L.، Antosiewicz-Bourget، J.، Stewart، R.، Ruotti، V.، Millar، AH، Thomson، JA، Ren، B.، إيكر ، جونيور تُظهر ميثيلوم الحمض النووي البشري عند الدقة الأساسية اختلافات جينية واسعة النطاق. (2009) طبيعة. 462 (7271): 315-22. DOI: 10.1038 / nature08514

Tsuchisaka ، A. ، Yu ، G. ، Jin ، H. ، Alonso ، JM ، إيكر ، جونيور، Zhang ، X. ، Gao ، S. ، Theologis ، A. ينظم التفاعل التوافقي بين الأشكال الإسوية 1-aminocyclopropane-1-carboxylate التخليق الحيوي للإيثيلين في Arabidopsis thaliana. (2009) علم الوراثة. 183 (3): 979-1003. DOI: 10.1534 / علم الوراثة .109.107102

97. ورشة عمل تورونتو الدولية لنشر البيانات Au، Birney، E.، Hudson، TJ، Green، ED، Gunter، C.، Eddy، S.، Rogers، J.، Harris، JR، Ehrlich، SD، Apweiler، R.، أوستن ، سي بي ، بيرجلوند ، إل ، بوبرو ، إم ، بونترا ، سي ، بروكس ، إيه جيه ، كامبون-تومسن ، إيه ، كارتر ، إن بي ، تشيشولم ، آر إل ، كونتريراس ، جي إل ، كوك ، آر إم ، كروسبي ، دبليو إل ، ديوار ، ك ، دوربين ، آر ، دايك ، سو ، إيكر ، جونيور، الإمام ، K. ، Feuk ، L. ، Gabriel ، SB ، Gallacher ، J. ، Gelbart ، WM ، Granell ، A. ، Guarner ، F. ، Hubbard ، T. ، Jackson ، SA ، Jennings ، JL ، Joly ، Y.، Jones، SM، Kaye، J.، Kennedy، KL، Knoppers، BM، Kyrpides، NC، Lowrance، WW، Luo، J.، MacKay، JJ، Martín-Rivera، L.، McCombie، WR، McPherson، JD، Miller، L.، Miller، W.، Moerman، D.، Mooser، V.، Morton، CC، Ostell، JM، Ouellette، BF، Parkhill، J.، Raina، PS، Rawlings، C.، Scherer، SE، Scherer، SW، Schofield، PN، Sensen، CW، Stodden، VC، Sussman، MR، Tanaka، T.، Thornton، J.، Tsunoda، T.، Valle، D.، Vuorio، EI، Walker، NM، والاس ، S. ، Weinstock ، G. ، Whitman ، WB ، Worley ، KC ، Wu ، C. ، Wu ، J. ، Yu ، J. مشاركة بيانات النشر المسبق. (2009) طبيعة. 461 (7261): 168-70. DOI: 10.1038 / 461168a

ليستر ، ر. إيكر ، جونيور العثور على القاعدة الخامسة: التسلسل على مستوى الجينوم لمثيلة السيتوزين. (2009) أبحاث الجينوم. 19 (6): 959-66. DOI: 10.1101 / gr.083451.108

Liljegren، SJ، Leslie، ME، Darnielle، L.، Lewis، MW، Taylor، SM، Luo، R.، Geldner، N.، Chory، J.، Randazzo، PA، Yanofsky، MF، إيكر ، جونيور تنظيم تهريب الأغشية وفصل الأعضاء عن طريق بروتين NEVERSHED ARF-GAP. (2009) تطوير. 136 (11): 1909-18. دوى: 10.1242 / ديف .033605

Dowen، RH، Engel، JL، Shao، F.، إيكر ، جونيور، ديكسون ، جي تستخدم عائلة من المؤثرات البكتيرية للبروتياز من النوع الثالث استراتيجيات تعتمد على الأسيل وتعتمد على أغشية البلازما. (2009) مجلة الكيمياء البيولوجية. 284 (23): 15867-79. DOI: 10.1074 / jbc.M900519200

ليستر ، ر. ، جريجوري ، ب. إيكر ، جونيور التالي هو الآن: تقنيات جديدة لتسلسل الجينوم ، والترانسكريبتومات ، وما بعدها. (2009) الرأي الحالي في بيولوجيا النبات. 12 (2): 107-18. دوى: 10.1016 / j.pbi.2008.11.004

Qiao ، H. ، Chang ، KN ، Yazaki ، J. ، إيكر ، جونيور يؤدي التفاعل بين بروتينات الإيثيلين و ETP1 / ETP2 F-box وتدهور EIN2 إلى تحفيز استجابات الإيثيلين في نبات الأرابيدوبسيس. (2009) الجينات والتنمية. 23 (4): 512-21. دوى: 10.1101 / جاد 1765709

هازن ، إس بي ، نايف ، إف ، كيسيل ، تي ، جيندرون ، جي إم ، تشين ، هـ. ، إيكر ، جونيور، Borevitz، JO، Kay، SA استكشاف المشهد النسخي لإيقاعات الساعة البيولوجية النباتية باستخدام صفائف تبليط الجينوم. (2009) بيولوجيا الجينوم. 10(2):R17. DOI: 10.1186/gb-2009-10-2-r17

Cusick ، ​​ME ، Yu ، H. ، Smolyar ، A. ، Venkatesan ، K. ، Carvunis ، AR ، Simonis ، N. ، Rual ، JF ، Borick ، ​​H. ، Braun ، P. ، Dreze ، M. ، Vandenhaute ، J .، Galli، M.، Yazaki، J.، Hill، DE، إيكر ، جونيور، روث ، إف بي ، فيدال ، إم. مجموعات بيانات تفاعل البروتين المنسقة بالأدب. (2009) طرق الطبيعة. 6 (1): 39-46. DOI: 10.1038 / nmeth.1284

غريغوري ، BD ، O'Malley ، RC ، Lister ، R. ، Urich ، MA ، Tonti-Filippini ، J. ، Chen ، H. ، Millar ، AH ، إيكر ، جونيور ارتباط بين استقلاب الحمض النووي الريبي وإسكات يؤثر على تطور نبات الأرابيدوبسيس. (2008) الخلية التنموية. 14 (6): 854-66. DOI: 10.1016 / j.devcel.2008.04.005

Lister ، R. ، O'Malley ، RC ، Tonti-Filippini ، J. ، Gregory ، BD ، Berry ، CC ، Millar ، AH ، إيكر ، جونيور خرائط ذات دقة أحادية القاعدة متكاملة للغاية للإبيجينوم في أرابيدوبسيس. (2008) الخلية 133 (3): 523-36. DOI: 10.1016 / j.cell.2008.03.029

جريجوري ، ب.د ، يازاكي ، ج. ، إيكر ، جونيور استخدام المصفوفات الدقيقة التبليطية لتحليل الجينوم الكامل في النباتات. (2008) مجلة النبات. 53(4):636-44. DOI: 10.1111/j.1365-313X.2007.03320.x

Hu، J.، Mitchum، MG، Barnaby، N.، Ayele، BT، Ogawa، M.، Nam، E.، Lai، WC، Hanada، A.، Alonso، JM، إيكر ، جونيور، سوين ، SM ، ياماغوتشي ، S. ، Kamiya ، Y. ، صن ، TP المواقع المحتملة لإنتاج الجبرلين النشط بيولوجيًا أثناء النمو التناسلي في نبات الأرابيدوبسيس. (2008) الخلية النباتية. 20 (2): 320-36. DOI: 10.1105 / tpc.107.057752

ليفار ، بي ، مونتي ، إي ، السعدي ، بي ، كارل ، سي ، ستورر ، إيه ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيورطائر السمان ف ينظم العامل المتفاعل مع نبات الأرابيدوبسيس PIF7 ، جنبًا إلى جنب مع PIF3 و PIF4 ، الاستجابات للضوء الأحمر المطول عن طريق تعديل مستويات phyB. (2008) الخلية النباتية. 20 (2): 337-52. DOI: 10.1105 / tpc.107.052142

Chekanova، JA، Gregory، BD، Reverdatto، SV، Chen، H.، Kumar، R.، Hooker، T.، Yazaki، J.، Li، P.، Skiba، N.، Peng، Q.، Alonso، J .، Brukhin، V.، Grossniklaus، U.، إيكر ، جونيوربيلوستوتسكي ، دا يكشف رسم الخرائط عالية الدقة على مستوى الجينوم للركائز الخارجية عن ميزات خفية في نسخة أرابيدوبسيس. (2007) الخلية 131 (7): 1340-53. DOI: 10.1016 / j.cell.2007.10.056

Yazaki، J.، Gregory، BD، إيكر ، جونيور رسم خرائط المناظر الطبيعية للجينوم باستخدام تقنية صفيف التبليط. (2007) الرأي الحالي في بيولوجيا النبات. 10 (5): 534-42. دوى: 10.1016 / j.pbi.2007.07.006

Kim، S.، Plagnol، V.، Hu، TT، Toomajian، C.، Clark، RM، Ossowski، S.، إيكر ، جونيور، ويجل ، د. ، نوردبورج ، م. إعادة التركيب واختلال التوازن في الأرابيدوبسيس thaliana. (2007) وراثة الطبيعة. 39 (9): 1151-5. DOI: 10.1038 / ng2115

Li ، H. ، He ، Z. ، Lu ، G. ، Lee ، SC ، Alonso ، J. ، إيكر ، جونيور، لوان ، س. يتفاعل مجال سيكلوفيلين WD40 مع هيستون H3 ويعمل في قمع الجينات وتكوين الأعضاء في نبات الأرابيدوبسيس. (2007) الخلية النباتية. 19 (8): 2403-16. DOI: 10.1105 / tpc.107.053579

Borevitz، JO، Hazen، SP، Michael، TP، Morris، GP، Baxter، IR، Hu، TT، Chen، H.، Werner، JD، Nordborg، M.، Salt، DE، Kay، SA، Chory، J. ، ويجل ، د. ، جونز ، دينار ، إيكر ، جونيور أنماط الجينوم الواسعة لتعدد الأشكال أحادي الميزة في Arabidopsis thaliana. (2007) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 104 (29): 12057-62. DOI: 10.1073 / pnas.0705323104

جينتري ، MS ، Dowen ، RH ، Worby ، CA ، ماتو ، S. ، إيكر ، جونيور، ديكسون ، جي يعبر الفوسفاتيز لافورين الحدود التطورية ويربط استقلاب الكربوهيدرات بأمراض الخلايا العصبية. (2007) مجلة بيولوجيا الخلية. 178 (3): 477-88. دوى: 10.1083 / jcb.200704094

Clark ، RM ، Schweikert ، G. ، Toomajian ، C. ، Ossowski ، S. ، Zeller ، G. ، Shinn ، P. ، Warthmann ، N. ، Hu ، TT ، Fu ، G. ، Hinds ، DA ، Chen ، H . ، فريزر ، كا ، هوسون ، دي إتش ، شولكوبف ، بي ، نوردبورج ، إم ، راتش ، جي ، إيكر ، جونيور، ويجل ، د. تعدد الأشكال المتسلسل المشترك الذي يشكل التنوع الجيني في Arabidopsis thaliana. (2007) العلم. 317 (5836): 338-42. DOI: 10.1126 / العلوم .1138632

بويج ، س. ، ميرا ، هـ. ، دورسي ، إي ، سانسينون ، ف ، أندريس كولاس ، إن ، جارسيا مولينا ، أ. ، بوركهيد ، جيه إل ، جوجولين ، كا ، عبد الغني ، سراج الدين ، ثييل ، دي جي ، إيكر ، جونيور، Pilon، M.، Peñarrubia، L. تمتلك النباتات العليا نوعين مختلفين من المرافقات النحاسية التي تشبه ATX1. (2007) الكيمياء الحيوية والبيوفيزيائية تبحث في الاتصالات. 354 (2): 385-90. DOI: 10.1016 / j.bbrc.2006.12.215

Swiezewski، S.، Crevillen، P.، Liu، F.، إيكر ، جونيور، جيرزمانوفسكي ، أ. ، دين ، سي. إسكات كروماتين صغير بوساطة الحمض النووي الريبي الموجه إلى المنطقة 3 من جين Arabidopsis الذي يشفر منظم النمو ، FLC. (2007) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 104 (9): 3633-8. DOI: 10.1073 / pnas.0611459104

O'Malley ، RC ، Alonso ، JM ، Kim ، CJ ، Leisse ، TJ ، إيكر ، جونيور طريقة PCR بوساطة ربط المحول لرسم الخرائط عالية الإنتاجية لإدراج T-DNA في جينوم Arabidopsis. (2007) بروتوكولات الطبيعة. 2 (11): 2910-7. DOI: 10.1038 / nprot.2007.425

Chilley، PM، Casson، SA، Tarkowski، P.، Hawkins، N.، Wang، KL، Hussey، PJ، Beale، M.، إيكر ، جونيور، ساندبرج ، جي كيه ، ليندسي ، ك. ينظم الببتيد POLARIS في نبات الأرابيدوبسيس نقل الأكسين ونمو الجذور من خلال التأثيرات على إشارات الإيثيلين. (2006) الخلية النباتية. 18 (11): 3058-72. DOI: 10.1105 / tpc.106.040790

هاتشيسون ، سي ، لي ، ج. ، أرغيسو ، سي ، غونزاليس ، إم ، لي ، إي ، لويس ، ميغاواط ، ماكسويل ، بي بي ، بيرديو ، تي دي ، شالر ، جي إي ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، كيبر ، جي بروتينات الأرابيدوبسيس هيستيدين فوسفوتانسفير هي منظمات إيجابية زائدة عن الحاجة لإشارات السيتوكينين. (2006) الخلية النباتية. 18 (11): 3073-87. DOI: 10.1105 / tpc.106.045674

Kim، SA، Punshon، T.، Lanzirotti، A.، Li، L.، Alonso، JM، إيكر ، جونيور، كابلان، J.، Guerinot، ML يتطلب توطين الحديد في بذور الأرابيدوبسيس ناقل غشاء فجوي VIT1. (2006) العلم. 314 (5803): 1295-8. DOI: 10.1126 / العلوم .1132563

Mori، IC، Murata، Y.، Yang، Y.، Munemasa، S.، Wang، YF، Andreoli، S.، Tiriac، H.، Alonso، JM، Harper، JF، إيكر ، جونيور، كواك ، جم ، شرودر ، جي وظيفة CDPKs CPK6 و CPK3 في تنظيم ABA لخلية الحراسة من النوع S- anion- و Ca (2 +) - القنوات المنفذة وإغلاق الثغور. (2006) علم الأحياء بلوس. 4 (10): e327. DOI: 10.1371 / journal.pbio.0040327

يوشيدا ، هـ. ، وانج ، كوالالمبور ، تشانغ ، سم ، موري ، ك. ، أوشيدا ، إي ، إيكر ، جونيور مطلوب تسلسل ACC synthase للتفاعل مع بروتينات عائلة ETO1 وزعزعة استقرار البروتينات المستهدفة. (2006) البيولوجيا الجزيئية النباتية. 62(3):427-37. DOI: 10.1007/s11103-006-9029-7

Olmedo، G.، Guo، H.، Gregory، BD، Nourizadeh، SD، Aguilar-Henonin، L.، Li، H.، An، F.، Guzman، P.، إيكر ، جونيور يشفر ETHYLENE-INSENSITIVE5 5 '-> 3' exoribonuclease المطلوب لتنظيم بروتينات F-box التي تستهدف EIN3 EBF1 / 2. (2006) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 103 (36): 13286-93. DOI: 10.1073 / pnas.0605528103

Zhang، X.، Yazaki، J.، Sundaresan، A.، Cokus، S.، Chan، SW، Chen، H.، Henderson، IR، Shinn، P.، Pellegrini، M.، Jacobsen، SE، إيكر ، جونيور رسم خرائط عالية الدقة على مستوى الجينوم وتحليل وظيفي لمثيل الحمض النووي في الأرابيدوبسيس. (2006) الخلية 126 (6): 1189-201. DOI: 10.1016 / j.cell.2006.08.003

Barr، SD، Ciuffi، A.، Leipzig، J.، Shinn، P.، إيكر ، جونيور، بوشمان ، فد اختيار موقع تكامل فيروس نقص المناعة البشرية: الاستهداف في الضامة وتأثيرات الطرق المختلفة للدخول الفيروسي. (2006) مول. هناك. 14 (2): 218-25. DOI: 10.1016 / j.ymthe.2006.03.012

تشين ، جي جي ، أولاه ، إتش ، تمبل ، بي ، ليانج ، جي ، جو ، جي ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، جونز ، آم يتوسط RACK1 استجابة متعددة للهرمونات وعمليات تنموية في نبات الأرابيدوبسيس. (2006) ياء إكسب. بوت. 57 (11): 2697-708. DOI: 10.1093 / jxb / erl035

Rudella، A.، Friso، G.، Alonso، JM، إيكر ، جونيور، فان Wijk ، KJ يؤدي تقليل تنظيم ClpR2 إلى انخفاض تراكم مركب البروتياز ClpPRS والعيوب في التكوُّن الحيوي للبلاستيدات الخضراء في نبات الأرابيدوبسيس. (2006) الخلية النباتية. 18 (7): 1704-21. DOI: 10.1105 / tpc.106.042861

ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور المضي قدمًا في الاتجاه المعاكس: التقنيات الجينية لتمكين الشاشات الفينومية على مستوى الجينوم في Arabidopsis. (2006) مراجعات الطبيعة علم الوراثة. 7 (7): 524-36. DOI: 10.1038 / nrg1893

Lewinski ، MK ، Yamashita ، M. ، Emerman ، M. ، Ciuffi ، A. ، Marshall ، H. ، Crawford ، G. ، Collins ، F. ، Shinn ، P. ، Leipzig ، J. ، Hannenhalli ، S. ، Berry ، نسخة، إيكر ، جونيور، بوشمان ، فد تكامل الحمض النووي الفيروسي: المحددات الفيروسية والخلوية لاختيار الموقع المستهدف. (2006) مسببات الأمراض PLOS. 2 (6): e60. DOI: 10.1371 / journal.ppat.0020060

Lariguet، P.، Schepens، I.، Hodgson، D.، Pedmale، UV، Trevisan، M.، Kami، C.، de Carbonnel، M.، Alonso، JM، إيكر ، جونيور، ليسكوم ، إي ، فانكهاوزر ، سي. PHYTOCHROME KINASE SUBSTRATE 1 هو بروتين ربط phototropin 1 المطلوب للاتجاه الضوئي. (2006) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 103 (26): 10134-9. DOI: 10.1073 / pnas.0603799103

Ciuffi، A.، Mitchell، RS، Hoffmann، C.، Leipzig، J.، Shinn، P.، إيكر ، جونيور، بوشمان ، فد اختيار موقع التكامل بواسطة النواقل المستندة إلى فيروس العوز المناعي البشري في تقسيم الأرومات الليفية الرئوية IMR-90 وإيقاف النمو. (2006) مول. هناك. 13 (2): 366-73. DOI: 10.1016 / j.ymthe.2005.10.009

Andrés-Colás، N.، Sancenón، V.، Rodríguez-Navarro، S.، Mayo، S.، Thiele، DJ، إيكر ، جونيور، Puig ، S. ، Peñarrubia ، L. يتفاعل أرابيدوبسيس من نوع P-type ATPase HMA5 المعدني الثقيل مع metallochaperones ويعمل في إزالة سموم النحاس من الجذور. (2006) مجلة النبات. 45(2):225-36. DOI: 10.1111/j.1365-313X.2005.02601.x

Ciuffi، A.، Llano، M.، Poeschla، E.، Hoffmann، C.، Leipzig، J.، Shinn، P.، إيكر ، جونيور، بوشمان ، ف. دور LEDGF / p75 في استهداف تكامل الحمض النووي لفيروس نقص المناعة البشرية. (2005) طب الطبيعة. 11 (12): 1287-9. DOI: 10.1038 / نانومتر 1329

Overvoorde ، PJ ، Okushima ، Y. ، Alonso ، JM ، Chan ، A. ، Chang ، C. ، إيكر ، جونيور، هيوز ، ب ، ليو ، أ ، أونوديرا ، سي ، كواتش ، هـ. ، سميث ، إيه ، يو ، جي ، اللاهوت ، أ. التحليل الجينومي الوظيفي لأفراد عائلة الجينات AUXIN / INDOLE-3-ACID في Arabidopsis thaliana. (2005) الخلية النباتية. 17 (12): 3282-300. DOI: 10.1105 / tpc.105.036723

Mason ، MG ، Mathews ، DE ، Argyros ، DA ، Maxwell ، BB ، Kieber ، JJ ، Alonso ، JM ، إيكر ، جونيور، شالر ، جنرال إلكتريك تتوسط منظمات الاستجابة المتعددة من النوع B في نقل إشارة السيتوكينين في نبات الأرابيدوبسيس. (2005) الخلية النباتية. 17 (11): 3007-18. DOI: 10.1105 / tpc.105.035451

Nagpal، P.، Ellis، CM، Weber، H.، Ploense، SE، Barkawi، LS، Guilfoyle، TJ، Hagen، G.، Alonso، JM، Cohen، JD، Farmer، EE، إيكر ، جونيور، ريد ، جي دبليو تعزز عوامل استجابة Auxin ARF6 و ARF8 إنتاج حمض الياسمين ونضج الأزهار. (2005) تطوير. 132 (18): 4107-18. دوى: 10.1242 / ديف .01955

Barr، SD، Leipzig، J.، Shinn، P.، إيكر ، جونيور، بوشمان ، فد استهداف التكامل عن طريق فيروس ساركوما ابيضاض الطيور وفيروس نقص المناعة البشرية في جينوم الدجاج. (2005) مجلة علم الفيروسات. 79(18):12035-44. DOI: 10.1128/JVI.79.18.12035-12044.2005

يوشيدا ، هـ. ، ناجاتا ، إم ، سايتو ، ك. ، وانج ، كوالالمبور ، إيكر ، جونيور يتفاعل Arabidopsis ETO1 بشكل خاص وينظم سلبًا النوع 2 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthases. (2005) بيولوجيا النبات BMC. 5:14. DOI: 10.1186/1471-2229-5-14

فيرنر ، دينار ، بوريفيتز ، جو ، أولينهاوت ، نيو هامبشاير ، إيكر ، جونيور، خوري ، ج. ، ويجل ، د. تباين FRIGIDA المستقل في وقت الإزهار لإدخال أرابيدوبسيس ثاليانا الطبيعي. (2005) علم الوراثة. 170 (3): 1197-207. DOI: 10.1534 / علم الوراثة .104.036533

هازن ، SP ، شولتز ، تي إف ، برونيدا باز ، جي إل ، بوريفيتز ، جو ، إيكر ، جونيور، كاي ، سا يشفر LUX ARRHYTHMO بروتين مجال Myb الضروري لإيقاعات الساعة البيولوجية. (2005) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 102 (29): 10387-92. DOI: 10.1073 / pnas.0503029102

ويلموث ، جي سي ، وانج ، إس ، تيواري ، إس بي ، جوشي ، إيه دي ، هاغن ، جي ، جيلفويل ، تي جي ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، ريد ، جي دبليو يعزز NPH4 / ARF7 و ARF19 توسع الأوراق وتكوين الجذر الجانبي الناجم عن الأكسين. (2005) مجلة النبات. 43(1):118-30. DOI: 10.1111/j.1365-313X.2005.02432.x

Lewinski ، MK ، Bisgrove ، D. ، Shinn ، P. ، Chen ، H. ، Hoffmann ، C. ، Hannenhalli ، S. ، Verdin ، E. ، Berry ، CC ، إيكر ، جونيور، بوشمان ، فد تحليل الجينوم على نطاق واسع للسمات الصبغية التي تثبط نسخ فيروس نقص المناعة البشرية. (2005) مجلة علم الفيروسات. 79(11):6610-9. DOI: 10.1128/JVI.79.11.6610-6619.2005

هازن ، إس بي ، بوريفيتز ، جو ، هارمون ، إف جي ، برونيدا-باز ، جي إل ، شولتز ، تي إف ، يانوفسكي ، إم جي ، ليليجرين ، إس جي ، إيكر ، جونيور، كاي ، سا رسم خرائط سريع للساعة اليومية والطفرات التنموية في نبات الأرابيدوبسيس. (2005) فيزياء النبات. 138 (2): 990-7. دوى: 10.1104 / ص 105.061408

Zhang، X.، Odom، DT، Koo، SH، Conkright، MD، Canettieri، G.، Best، J.، Chen، H.، Jenner، R.، Herbolsheimer، E.، Jacobsen، E.، Kadam، S . ، إيكر ، جونيور، Emerson، B.، Hogenesch، JB، Unterman، T.، Young، RA، Montminy، M. تحليل على مستوى الجينوم لشغل البروتين المرتبط بعنصر استجابة cAMP ، الفسفرة ، وتفعيل الجين المستهدف في الأنسجة البشرية. (2005) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 102 (12): 4459-64. DOI: 10.1073 / pnas.0501076102

فيرنر ، جيه دي ، بوريفيتز ، جو ، وارثمان ، إن. ، مدرب ، جي تي ، إيكر ، جونيور، خوري ، ج. ، ويجل ، د. يحدد رسم خرائط موضع السمات الكمية وتهجين صفيف الحمض النووي حذف FLM كسبب لتغير وقت الإزهار الطبيعي. (2005) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 102 (7): 2460-5. DOI: 10.1073 / pnas.0409474102

Ryu و JS و Kim و JI و Kunkel و T. و Kim و BC و Cho و DS و Hong و SH و Kim و SH و Fernández و AP و Kim و Y. و Alonso و JM و إيكر ، جونيور، ناجي ، ف. ، ليم ، بو ، سونغ ، ب. س ، شيفر ، إي ، نام ، هغ يتحكم الفوسفاتيز من النوع 5 الخاص بالفيتوكروم في تدفق إشارة الضوء من خلال تعزيز استقرار الفيتوكروم وتقارب محول الإشارة. (2005) الخلية 120 (3): 395-406. DOI: 10.1016 / j.cell.2004.12.019

Okushima، Y.، Overvoorde، PJ، Arima، K.، Alonso، JM، Chan، A.، Chang، C.، إيكر ، جونيور، هيوز ، ب ، لوي ، أ ، نغوين ، د ، أونوديرا ، سي ، كواتش ، إتش ، سميث ، إيه ، يو ، جي ، ثيولوجيس ، إيه. التحليل الجيني الوظيفي لأفراد عائلة جين عامل الاستجابة AUXIN في Arabidopsis thaliana: وظائف فريدة ومتداخلة لكل من ARF7 و ARF19. (2005) الخلية النباتية. 17 (2): 444-63. DOI: 10.1105 / tpc.104.028316

Mockler، TC، Chan، S.، Sundaresan، A.، Chen، H.، Jacobsen، SE، إيكر ، جونيور تطبيقات صفائف تبليط الحمض النووي لتحليل الجينوم الكامل. (2005) علم الجينوم. 85 (1): 1-15. دوى: 10.1016 / j.ygeno.2004.10.005

ليو ، جي ، هولوب ، إب ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، فوبرت ، بي آر مطلوب جين شبيه بأرابيدوبسيس NPR1 ، NPR4 ، لمقاومة الأمراض. (2005) مجلة النبات. 41(2):304-18. DOI: 10.1111/j.1365-313X.2004.02296.x

Prigge ، MJ ، Otsuga ، D. ، Alonso ، JM ، إيكر ، جونيور، دروز ، جي إن ، كلارك ، سراج الدين يمتلك أفراد عائلة جين السوستة المنزلية من الفئة الثالثة أدوار متداخلة ومضادة ومتميزة في تطوير نبات الأرابيدوبسيس. (2005) الخلية النباتية. 17 (1): 61-76. DOI: 10.1105 / tpc.104.026161

مونتي ، إي ، تيبيرمان ، جي إم ، السعدي ، بي ، كاتشوروفسكي ، كا ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، لي ، إكس ، تشانغ ، واي ، السمان ، ف يعمل عامل النسخ المتفاعل مع الفيتوكروم ، PIF3 ، مبكرًا وانتقائيًا وإيجابيًا في تطور البلاستيدات الخضراء الناجم عن الضوء. (2004) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 101 (46): 16091-8. DOI: 10.1073 / pnas.0407107101

شيبويا ، K. ، Barry ، KG ، Ciardi ، JA ، Loucas ، HM ، Underwood ، BA ، Nourizadeh ، S. ، إيكر ، جونيور، كلي ، HJ ، كلارك ، دي جي الدور المركزي لـ PhEIN2 في استجابات الإيثيلين خلال تطوير النبات في البطونية. (2004) فيزياء النبات. 136 (2): 2900-12. دوى: 10.1104 / ص 104.046979

بيندر ، بي إم ، مورتيمور ، لوس أنجلوس ، ستيبانوفا ، آن ، إيكر ، جونيور، بليكر ، أب استجابات النمو قصيرة المدى للإيثيلين في شتلات Arabidopsis مستقلة عن EIN3 / EIL1. (2004) فيزياء النبات. 136 (2): 2921-7. دوى: 10.1104 / ص 104.050393

Mockler، TC، Yu، X.، Shalitin، D.، Parikh، D.، Michael، TP، Liou، J.، Huang، J.، Smith، Z.، Alonso، JM، إيكر ، جونيور، خوري ، ج. ، لين ، سي. تنظيم وقت الإزهار في نبات الأرابيدوبسيس بواسطة بروتينات مجال التماثل K. (2004) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 101 (34): 12759-64. DOI: 10.1073 / pnas.0404552101

لي ، H. ، جونسون ، P. ، ستيبانوفا ، A. ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور تقارب مسارات الإشارات في التحكم في نمو الخلايا التفاضلية في Arabidopsis. (2004) الخلية التنموية. 7 (2): 193-204. DOI: 10.1016 / j.devcel.2004.07.002

ميتشل ، RS ، Beitzel ، BF ، Schroder ، AR ، Shinn ، P. ، Chen ، H. ، Berry ، CC ، إيكر ، جونيور، بوشمان ، فد تكامل الحمض النووي الفيروسي: يُظهر ASLV و HIV و MLV تفضيلات مميزة للموقع المستهدف. (2004) علم الأحياء بلوس. 2 (8): E234. DOI: 10.1371 / journal.pbio.0020234

Page، ML، Hamel، PP، Gabilly، ST، Zegzouti، H.، Perea، JV، Alonso، JM، إيكر ، جونيور، ثيج ، إس إم ، كريستنسن ، إس كيه ، ميرشانت ، إس. مطلوب متماثل من ناقلة ثاني كبريتيد الثيول بدائية النواة CcdA لتجميع مجمع السيتوكروم b6f في البلاستيدات الخضراء في الأرابيدوبسيس. (2004) مجلة الكيمياء البيولوجية. 279 (31): 32474-82. DOI: 10.1074 / jbc.M404285200

Wolyn ، DJ ، Borevitz ، JO ، Loudet ، O. ، Schwartz ، C. ، Maloof ، J. ، إيكر ، جونيور، بيري ، CC ، خوري ، ج. تم تحديد مواضع السمات الكمية للاستجابة للضوء من خلال الفاصل الزمني المركب ورسم خرائط مجموعة eXtreme في Arabidopsis thaliana. (2004) علم الوراثة. 167 (2): 907-17. DOI: 10.1534 / علم الوراثة .103.024810

Pfund ، C. ، Tans-Kersten ، J. ، Dunning ، FM ، Alonso ، JM ، إيكر ، جونيور، ألين ، سي ، بنت ، ع لا يعتبر فلاجيلين من أهم أسباب الدفاع في خلايا Ralstonia solanacearum أو المستخلصات المطبقة على Arabidopsis thaliana. (2004) التفاعلات الجزيئية للميكروبات النباتية. 17 (6): 696-706. DOI: 10.1094 / MPMI.2004.17.6.696

Chen ، JG ، Pandey ، S. ، Huang ، J. ، Alonso ، JM ، إيكر ، جونيورأسمان ، إس إم ، جونز ، آم يمكن أن يعمل GCR1 بشكل مستقل عن بروتين G غير المتجانسة استجابةً للبراسينوستيرويدات والجبريلين في إنبات بذور نبات الأرابيدوبسيس. (2004) فيزياء النبات. 135 (2): 907-15. دوى: 10.1104 / ص 104.038992

Tyler، L.، Thomas، SG، Hu، J.، Dill، A.، Alonso، JM، إيكر ، جونيور، صن، TP بروتينات ديلا وإنبات البذور التي ينظمها الجبريلين وتطور الأزهار في نبات الأرابيدوبسيس. (2004) فيزياء النبات. 135 (2): 1008-19. دوى: 10.1104 / ص 104.039578

وانغ ، كوالالمبور ، يوشيدا ، هـ. ، لورين ، سي ، إيكر ، جونيور تنظيم التخليق الحيوي لغاز الإيثيلين بواسطة بروتين Arabidopsis ETO1. (2004) طبيعة. 428 (6986): 945-50. DOI: 10.1038 / nature02516

نوفيلو ، إف ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، ساليناس ، ج. CBF2 / DREB1C هو منظم سلبي لتعبير CBF1 / DREB1B و CBF3 / DREB1A ويلعب دورًا مركزيًا في تحمل الإجهاد في Arabidopsis. (2004) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 101 (11): 3985-90. DOI: 10.1073 / pnas.0303029101

إلى ، JP ، Haberer ، G. ، Ferreira ، FJ ، Deruère ، J. ، Mason ، MG ، Schaller ، GE ، Alonso ، JM ، إيكر ، جونيور، كيبر ، جي تعتبر منظمات استجابة نبات الأرابيدوبسيس من النوع أ منظمات سلبية زائدة عن الحاجة لإشارات السيتوكينين. (2004) الخلية النباتية. 16 (3): 658-71. DOI: 10.1105 / tpc.018978

قوه ، هـ. إيكر ، جونيور مسار إشارات الإيثيلين: رؤى جديدة. (2004) الرأي الحالي في بيولوجيا النبات. 7 (1): 40-9.

بوريفيتز ، جو ، إيكر ، جونيور الجينوميات النباتية: الموجة الثالثة. (2004) المراجعة السنوية لعلم الجينوم وعلم الوراثة البشرية. 5: 443-77. DOI: 10.1146 / annurev.genom.5.061903.180017

قوه ، هـ. إيكر ، جونيور يتم التوسط في استجابات النبات لغاز الإيثيلين بواسطة SCF (EBF1 / EBF2) - التحلل البروتيني المعتمد على عامل النسخ EIN3. (2003) الخلية 115 (6): 667-77.

Lariguet ، P. ، Boccalandro ، HE ، Alonso ، JM ، إيكر ، جونيور، خوري ، ج. ، كاسال ، جي جيه ، فانكهاوزر ، سي. حلقة تنظيمية للنمو توفر التوازن للفيتوكروم أ. (2003) الخلية النباتية. 15 (12): 2966-78. DOI: 10.1105 / tpc.014563

كاتالا ، آر ، سانتوس ، إي ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، Martinez-Zapater، JM، Salinas، J. تؤدي الطفرات في ناقل Ca2 + / H + CAX1 إلى زيادة تعبير CBF / DREB1 واستجابة التأقلم البارد في نبات الأرابيدوبسيس. (2003) الخلية النباتية. 15 (12): 2940-51. DOI: 10.1105 / tpc.015248

مايكل ، تي بي ، سالومي ، بنسلفانيا ، يو ، هج ، سبنسر ، TR ، شارب ، إل ، ماكبيك ، ماساتشوستس ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، McClung، CR تُمنح اللياقة البدنية المحسّنة من خلال الاختلاف الطبيعي في الساعة اليومية. (2003) العلم. 302 (5647): 1049-53. DOI: 10.1126 / العلوم .1082971

Yamada، K.، Lim، J.، Dale، JM، Chen، H.، Shinn، P.، Palm، CJ، Southwick، AM، Wu، HC، Kim، C.، Nguyen، M.، Pham، P. ، Cheuk ، R. ، Karlin-Newmann ، G. ، Liu ، SX ، Lam ، B. ، Sakano ، H. ، Wu ، T. ، Yu ، G. ، Miranda ، M. ، Quach ، HL ، Tripp ، M. ، Chang ، CH ، Lee ، JM ، Toriumi ، M. ، Chan ، MM ، Tang ، CC ، Onodera ، CS ، Deng ، JM ، Akiyama ، K. ، Ansari ، Y. ، Arakawa ، T. ، Banh ، J. ، Banno، F.، Bowser، L.، Brooks، S.، Carninci، P.، Chao، Q.، Choy، N.، Enju، A.، Goldsmith، AD، Gurjal، M.، Hansen، NF، Hayashizaki، Y.، Johnson-Hopson، C.، Hsuan، VW، Iida، K.، Karnes، M.، Khan، S.، Koesema، E.، Ishida، J.، Jiang، PX، Jones، T.، Kawai، J.، Kamiya، A.، Meyers، C.، Nakajima، M.، Narusaka، M.، Seki، M.، Sakurai، T.، Satou، M.، Tamse، R.، Vaysberg، M.، Wallender، EK و Wong و C. و Yamamura و Y. و Yuan و S. و Shinozaki و K. و Davis و RW و Theologis و A. ، إيكر ، جونيور تحليل تجريبي للنشاط النسخي في جينوم نبات الأرابيدوبسيس. (2003) العلم. 302 (5646): 842-6. DOI: 10.1126 / العلوم .1088305

مونتي ، إي ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، Zhang ، Y. ، Li ، X. ، Young ، J. ، Austin-Phillips ، S. ، Quail ، PH يكشف عزل وتوصيف طفرات phyC في نبات الأرابيدوبسيس عن الحديث المتبادل المعقد بين مسارات إشارات فيتوكروم. (2003) الخلية النباتية. 15 (9): 1962-80.

ألونسو ، جي إم ، ستيبانوفا ، إيه إن ، ليسيه ، تي جيه ، كيم ، سي جيه ، تشين ، إتش ، شين ، بي ، ستيفنسون ، دي كيه ، زيمرمان ، جي ، باراجاس ، بي ، شيوك ، آر ، جادريناب ، سي ، هيلر ، سي ، جيسكي ، أ ، كويسيما ، إي ، مايرز ، سي سي ، باركر ، إتش ، بريدنيس ، إل ، أنصاري ، واي ، تشوي ، إن ، دين ، إتش ، جيرالت ، إم ، هازاري ، N.، Hom، E.، Karnes، M.، Mulholland، C.، Ndubaku، R.، Schmidt، I.، Guzman، P.، Aguilar-Henonin، L.، Schmid، M.، Weigel، D. ، كارتر ، دي ، مارشاند ، تي ، ريسو ، إي ، بروغدين ، دي ، زيكو ، إيه ، كروسبي ، دبليو إل ، بيري ، سي سي ، إيكر ، جونيور طفرات إدخال على مستوى الجينوم في نبات Arabidopsis thaliana. (2003) العلم. 301 (5633): 653-7. DOI: 10.1126 / العلوم .1086391

جونز ، آم ، إيكر ، جونيور، تشين ، ج إعادة تقييم دور البروتين G غير المتجانسة في اقتران الاستجابات الضوئية في نبات الأرابيدوبسيس. (2003) فيزياء النبات. 131 (4): 1623-7. دوى: 10.1104 / ص 102.017624

ألونسو ، جي إم ، ستيبانوفا ، إيه إن ، سولانو ، آر ، ويسمان ، إي ، فيراري ، إس ، أوسوبيل ، إف إم ، إيكر ، جونيور تم تحديد خمسة مكونات لمسار استجابة الإيثيلين في شاشة للطفرات الضعيفة غير الحساسة للإيثيلين في نبات الأرابيدوبسيس. (2003) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 100 (5): 2992-7. DOI: 10.1073 / pnas.0438070100

لاركن ، آر إم ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، خوري ، ج. GUN4 ، منظم تخليق الكلوروفيل والإشارات داخل الخلايا. (2003) العلم. 299 (5608): 902-6. DOI: 10.1126 / العلوم .1079978

ماكي ، د. ، بلخدير ، واي. ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، Dangl ، JL Arabidopsis RIN4 هو هدف لمؤثرات الفوعة من النوع الثالث AvrRpt2 وينظم المقاومة بوساطة RPS2. (2003) الخلية 112 (3): 379-89.

Ullah، H.، Chen، JG، Temple، B.، Boyes، DC، Alonso، JM، Davis، KR، إيكر ، جونيور، جونز ، آم تنظم الوحدة الفرعية بيتا لبروتين أرابيدوبسيس G بشكل سلبي انقسام الخلايا الناجم عن الأكسين وتؤثر على عمليات النمو المتعددة. (2003) الخلية النباتية. 15 (2): 393-409.

ستراند ، أ ، أسامي ، ت. ، ألونسو ، ج. ، إيكر ، جونيور، خوري ، ج. الاتصال بين البلاستيدات الخضراء والنواة الناجم عن تراكم Mg-protoporphyrinIX. (2003) طبيعة. 421 (6918): 79-83. DOI: 10.1038 / nature01204

Zhao ، Y. ، Hull ، AK ، Gupta ، NR ، Goss ، KA ، Alonso ، J. ، إيكر ، جونيورنورمانلي ، ج. ، خوري ، ج. ، سلينزا ، جيه إل التخليق الحيوي للأوكسين المعتمد على Trp في الأرابيدوبسيس: مشاركة السيتوكروم P450s CYP79B2 و CYP79B3. (2002) الجينات والتنمية. 16 (23): 3100-12. دوى: 10.1101 / جاد 1035402

Beachy ، R. ، Bennetzen ، JL ، Chassy ، BM ، Chrispeels ، M. ، Chory ، J. ، إيكر ، جونيورو Noel و JP و Kay و SA و Dean و C. و Lamb و C. و Jones و J. و Santerre و CR و Schroeder و JI و Umen و J. و Yanofsky و M. و Wessler و S. و Zhao و Y . ، باروت ، دبليو. وجهات نظر متباينة بشأن الأغذية المعدلة وراثيًا. (2002) التكنولوجيا الحيوية الطبيعة. 20 (12): 1195-6 ؛ رد المؤلف 1197. DOI: 10.1038 / nbt1202-1195

يوشيدا ، ر. ، هوبو ، ت. ، إيشيمورا ، ك. ، ميزوجوتشي ، ت. ، تاكاهاشي ، إف ، أرونسو ، ج. ، إيكر ، جونيور، شينوزاكي ، ك. مطلوب بروتين كيناز SnRK2 المنشط ABA للإشارة إلى إجهاد الجفاف في الأرابيدوبسيس. (2002) فسيولوجيا النبات والخلية. 43 (12): 1473-83.

فريدريشسن ، DM ، Nemhauser ، J. ، Muramitsu ، T. ، Maloof ، JN ، Alonso ، J. ، إيكر ، جونيور، فوريا ، م ، خوري ، ج. تشفر ثلاثة جينات استجابة مبكرة للبراسينوستيرويد زائدة عن الحاجة عوامل نسخ bHLH المفترضة المطلوبة للنمو الطبيعي. (2002) علم الوراثة. 162 (3): 1445-56.

شرودر ، دي إف ، جارتس ، إم ، ماكسويل ، بي بي ، كوك ، آر كيه ، كان ، جي إم ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، خوري ، ج. يتفاعل البروتين المرتبط بالحمض النووي 1 المنزوع الأيتيول 1 والبروتين المرتبط بالحمض النووي التالف XNUMX لتنظيم التكوُّن الضوئي لأرابيدوبسيس. (2002) علم الأحياء الحالي 12 (17): 1462-72.

Schröder، AR، Shinn، P.، Chen، H.، Berry، C.، إيكر ، جونيور، بوشمان ، ف. يفضل تكامل HIV-1 في الجينوم البشري الجينات النشطة والنقاط الساخنة المحلية. (2002) الخلية 110 (4): 521-9.

وانغ ، كوالالمبور ، لي ، هـ. ، إيكر ، جونيور شبكات التخليق الحيوي للإيثيلين والتشوير. (2002) الخلية النباتية. 14 ملحق: S131-51.

Zheng ، H. ، Bednarek ، SY ، Sanderfoot ، AA ، Alonso ، J. ، إيكر ، جونيور، رايخيل ، نيفادا NPSN11 هو بروتين SNARE مرتبط بلوح الخلية يتفاعل مع تركيب KNOLLE. (2002) فيزياء النبات. 129 (2): 530-9. دوى: 10.1104 / ص 003970

جاريلو ، جا ، غابريس ، إتش ، كابيل ، جيه ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، Cashmore، AR يتحكم NPL1 المرتبط بـ Phototropin في نقل البلاستيدات الخضراء الناجم عن الضوء الأزرق. (2001) طبيعة. 410 (6831): 952-4. DOI: 10.1038 / 35073622

جاريلو ، جا ، كابيل ، جيه ، تانغ ، آر إتش ، يانغ ، إتش كيو ، ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور، Cashmore، AR يتفاعل مكون ساعة أرابيدوبسيس اليومي مع كل من CRY1 و phyB. (2001) طبيعة. 410 (6827): 487-90. DOI: 10.1038 / 35068589

ألونسو ، جي إم ، إيكر ، جونيور مسار الإيثيلين: نموذج لإشارات الهرمونات النباتية والتفاعل معها. (2001) علوم. STKE. 2001 (70): re1. DOI: 10.1126 / stke.2001.70.re1

اللاهوت ، أ. إيكر ، جونيور، Palm ، CJ ، Federspiel ، NA ، Kaul ، S. ، White ، O. ، Alonso ، J. ، Altafi ، H. ، Araujo ، R. ، Bowman ، CL ، Brooks ، SY ، Buehler ، E. ، Chan ، A .، Chao، Q.، Chen، H.، Cheuk، RF، Chin، CW، Chung، MK، Conn، L.، Conway، AB، Conway، AR، Creasy، TH، Dewar، K.، Dunn، P. ، Etgu، P.، Feldblyum، TV، Feng، J.، Fong، B.، Fujii، CY، Gill، JE، Goldsmith، AD، Haas، B.، Hansen، NF، Hughes، B.، Huizar، L. ، هانتر ، جي إل ، جينكينز ، جي ، جونسون هوبسون ، سي ، خان ، إس ، كايكين ، إي ، كيم ، سي جي ، كو ، هل ، كريمينتسكايا ، آي ، كورتز ، دي بي ، كوان ، إيه ، لام ، B.، Langin-Hooper، S.، Lee، A.، Lee، JM، Lenz، CA، Li، JH، Li، Y.، Lin، X.، Liu، SX، Liu، ZA، Luros، JS، Maiti، R.، Marziali، A.، Militscher، J.، Miranda، M.، Nguyen، M.، Nierman، WC، Osborne، BI، Pai، G.، Peterson، J.، Pham، PK، Rizzo، M . ، روني ، T. ، رولي ، دي ، ساكانو ، إتش ، سالزبيرج ، إس إل ، شوارتز ، جي آر ، شين ، بي ، ساوثويك ، إيه إم ، صن ، إتش ، تالون ، إل جي ، تامبونجا ، جي ، توريومي ، MJ ، Town ، CD ، Utterback ، T. ، Van Aken ، S. ، Vaysberg ، M. ، Vysotskaia ، VS ، Walker ، M. ، Wu ، D. ، Yu ، G. ، Fraser ، CM ، Venter ، JC ، Davis ، RW تسلسل وتحليل الكروموسوم 1 لنبات Arabidopsis thaliana. (2000) طبيعة. 408 (6814): 816-20. DOI: 10.1038 / 35048500

ستيبانوفا ، AN ، إيكر ، جونيور إشارات الإيثيلين: من المسوخ إلى الجزيئات. (2000) الرأي الحالي في بيولوجيا النبات. 3 (5): 353-60.

خوري ، ج. إيكر ، جونيور، بريجز ، إس ، كابوش ، إم ، كوروزي ، جي إم ، كوك ، دي ، دانجل ، جي ، جرانت ، إس ، جيرينوت ، إم إل ، هينيكوف ، إس ، مارتينسن ، آر ، أوكادا ، كيه ، رايخيل ، نيفادا ، سومرفيل ، كر ، ويجل ، د. تقرير ورشة العمل التي ترعاها المؤسسة الوطنية للعلوم: الجينوميات الوظيفية "مشروع 2010" والنبات الافتراضي. مخطط لفهم كيفية بناء النباتات وكيفية تحسينها. (2000) فيزياء النبات. 123 (2): 423-6.

كوري ، سي ، ألونسو ، جي إم ، لو جين ، إم ، إيكر ، جونيور، بريات ، ج مشاركة NRAMP1 من Arabidopsis thaliana في نقل الحديد. (2000) مجلة الكيمياء الحيوية. 347 Pt 3 ، 749-55

راز ، ف. إيكر ، جونيور تنظيم النمو التفاضلي في الخطاف القمي لأرابيدوبسيس. (1999) تطوير. 126 (16): 3661-8.

Mozo ، T. ، Dewar ، K. ، Dunn ، P. ، إيكر ، جونيور، فيشر ، إس ، كلوسكا ، إس ، ليهراش ، إتش ، مارا ، إم ، مارتينسن ، آر ، ماير إيورت ، إس ، ألتمان ، تي. خريطة مادية كاملة تستند إلى BAC لجينوم Arabidopsis thaliana. (1999) وراثة الطبيعة. 22 (3): 271-5. DOI: 10.1038 / 10334

ألونسو ، جي إم ، هيراياما ، ت. ، رومان ، جي ، نوريزاده ، س. إيكر ، جونيور EIN2 ، محول ثنائي الوظيفة للإيثيلين واستجابات الإجهاد في Arabidopsis. (1999) العلم. 284 (5423): 2148-52.

Hirayama، T.، Kieber، JJ، Hirayama، N.، Kogan، M.، Guzman، P.، Nourizadeh، S.، Alonso، JM، Dailey، WP، Dancis، A.، إيكر ، جونيور RESPONSIVE-TO-ANTAGONIST1 ، ناقل نحاسي مرتبط بمرض Menkes / Wilson ، مطلوب لإشارات الإيثيلين في Arabidopsis. (1999) الخلية 97 (3): 383-93.

Solano ، R. ، Stepanova ، A. ، Chao ، Q. ، إيكر ، جونيور الأحداث النووية في إشارات الإيثيلين: سلسلة نسخية بوساطة ETHYLENE-INSENSITIVE3 و ETHYLENE-RESPONSE-FACTOR1. (1998) الجينات والتنمية. 12 (23): 3703-14.

Kwok ، SF ، Solano ، R. ، Tsuge ، T. ، Chamovitz ، DA ، إيكر ، جونيور، ماتسوي ، إم ، دينغ ، إكس دبليو توجد متجانسات Arabidopsis لمُنشِط c-Jun في شكل أحادي وفي مجمع COP9 ، وتتأثر وفرتها بشكل تفاضلي بطفرات الشرطي / det / fus pleiotropic. (1998) الخلية النباتية. 10 (11): 1779-90.

سولانو ، ر. إيكر ، جونيور غاز الإيثيلين: الإدراك والتأشير والاستجابة. (1998) الرأي الحالي في بيولوجيا النبات. 1 (5): 393-8.

Hua، J.، Sakai، H.، Nourizadeh، S.، Chen، QG، Bleecker، AB، إيكر ، جونيور، مايرويتز ، إم EIN4 و ERS2 هما عضوان في عائلة الجينات المفترضة لمستقبلات الإيثيلين في نبات الأرابيدوبسيس. (1998) الخلية النباتية. 10 (8): 1321-32.

جونسون ، العلاقات العامة ، إيكر ، جونيور مسار تحويل إشارة غاز الإيثيلين: منظور جزيئي. (1998) المراجعة السنوية لعلم الوراثة. 32: 227-54. DOI: 10.1146 / annurev.genet.32.1.227

إيكر ، جونيور تسلسل الجينوم. الجينات تتفتح من عشب. (1998) طبيعة. 391 (6666): 438-9. DOI: 10.1038 / 35030

إيكر ، جونيور BRI- تشويه المسار إلى الأحداث التي تشير إلى هرمون الستيرويد في النباتات. (1997) الخلية 90 (5): 825-7.

تشاو ، كيو ، روتنبرغ ، إم ، سولانو ، آر ، رومان ، جي ، تيرزاغي ، دبليو ، إيكر ، جونيور تفعيل مسار الاستجابة لغاز الإيثيلين في نبات الأرابيدوبسيس بواسطة البروتين النووي ETHYLENE-INSENSITIVE3 والبروتينات ذات الصلة. (1997) الخلية 89 (7): 1133-44.

موليجان ، RM ، Chory ، J. ، إيكر ، جونيور الإشارات في النباتات. (1997) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 94 (7): 2793-5.

ليمان ، أ ، بلاك ، ر. إيكر ، جونيور مطلوب HOOKLESS1 ، وهو جين استجابة للإيثيلين ، لاستطالة الخلايا التفاضلية في نبات الأرابيدوبسيس. (1996) الخلية 85 (2): 183-94.

جودمان ، جلالة الملك ، إيكر ، جونيور، دين ، سي. جينوم Arabidopsis thaliana. (1995) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 92 (24): 10831-5.

رومان ، ج. إيكر ، جونيور التحليل الجيني لاستجابة إجهاد الشتلات للإيثيلين في نبات الأرابيدوبسيس. (1995) فيلوس. عبر. R. Soc. لوند. ، ب ، بيول. علوم. 350 (1331): 75-81. DOI: 10.1098 / rstb.1995.0140

إيكر ، جونيور مسار تحويل إشارة الإيثيلين في النباتات. (1995) العلم. 268 (5211): 667-75.

Roman، G.، Lubarsky، B.، Kieber، JJ، Rothenberg، M.، إيكر ، جونيور التحليل الجيني لتوصيل إشارة الإيثيلين في Arabidopsis thaliana: خمسة مواقع متحولة جديدة مدمجة في مسار استجابة الإجهاد. (1995) علم الوراثة. 139 (3): 1393-409.

بيل ، سي جيه ، إيكر ، جونيور تخصيص 30 موقع ساتلي دقيق لخريطة ربط Arabidopsis. (1994) علم الجينوم. 19 (1): 137-44. DOI: 10.1006 / geno.1994.1023

Kieber ، JJ ، إيكر ، جونيور غاز الإيثيلين: لم يعد ينضج فقط! (1993) الاتجاهات في علم الوراثة. 9 (10): 356-62.

كيبر ، جي جي ، روتنبرغ ، إم ، رومان ، جي ، فيلدمان ، كا ، إيكر ، جونيور CTR1 ، وهو منظم سلبي لمسار استجابة الإيثيلين في Arabidopsis ، يشفر عضوًا من عائلة raf من بروتين كينازات. (1993) الخلية 72 (3): 427-41.

عازمة ، AF ، إينيس ، RW ، إيكر ، جونيور، Staskawicz ، BJ تطور المرض في Arabidopsis thaliana غير الحساسة للإيثيلين المصابة بمسببات الأمراض Pseudomonas و Xanthomonas الخبيثة والفتاكة. (1992) التفاعلات الجزيئية للميكروبات النباتية. 5 (5): 372-8.

شندلر ، يو ، مينكينز ، إيه إي ، بيكمان ، إتش. إيكر ، جونيور، Cashmore، AR التغاير بين بروتينات Arabidopsis GBF bZIP الخاضعة للتنظيم الخفيف والمعبر عنها في كل مكان. (1992) مجلة EMBO. 11 (4): 1261-73.

أوينز ، دبليو جي ، بيل ، سي جيه ، دونيلي ، بي جي ، دن ، بي ، ماتالانا ، إي. إيكر ، جونيور رسم خرائط الجينوم باستخدام المستنسخات الراسية: الجوانب النظرية. (1991) علم الجينوم. 11 (4): 799-805.

شندلر ، يو. إيكر ، جونيور، Cashmore، AR بروتين ربط Arabidopsis thaliana G-box مشابه لبروتين سحاب ليسين القمح المعروف باسم HBP-1. (1991) سيمب. شركة إكسب. بيول. 45: 211-8.

غوزمان ، ب. إيكر ، جونيور استغلال الاستجابة الثلاثية لأرابيدوبسيس لتحديد المسوخات المرتبطة بالإيثيلين. (1990) الخلية النباتية. 2 (6): 513-23. DOI: 10.1105 / tpc.2.6.513

مونيا ، بب ، هاسكل ، كم ، إيكر ، جونيور، إيكر ، دي جي ، كروك ، ST رسم الخرائط الكروموسومية لعائلة الجينات يوبيكويتين في Saccharomyces cerevisiae عن طريق الرحلان الكهربائي للهلام النبضي. (1989) بحوث الأحماض النووية. 17 (9): 3611-2.

غوزمان ، ب. إيكر ، جونيور تطوير طرق كبيرة للحمض النووي للنباتات: الاستنساخ الجزيئي لأجزاء كبيرة من نبات الأرابيدوبسيس والحمض النووي للجزر في الخميرة. (1988) بحوث الأحماض النووية. 16 (23): 11091-105.

إيكر ، جونيور، ديفيس ، RW يتم تنظيم جينات الدفاع عن النبات بواسطة الإيثيلين. (1987) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 84 (15): 5202-6.

إيكر ، جونيور، ديفيس ، RW تثبيط التعبير الجيني في الخلايا النباتية عن طريق التعبير عن الحمض النووي الريبي المضاد للحساسية. (1986) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 83 (15): 5372-6.

إيكر ، جونيور، كودلر ، إل. ، هايمان ، أر دبليو التباين في بنية الحمض النووي لفيروس الحماق النطاقي. (1984) التدخل. 21 (1): 25-37.

بيتشيني ، ب. إيكر ، جونيور، جروس ، سي ، هايمان ، أر دبليو رسم خرائط الحمض النووي لفيروس varicella-zoster المقترن المعزول من مرضى القوباء المنطقية. (1983) انسيت. 2 (8361): 1223-5.

هايمان ، RW ، إيكر ، جونيور، متوتر ، RB الحمض النووي الريبي لفيروس الحماق النطاقي في العقد الثلاثية التوائم البشرية. (1983) انسيت. 2 (8354): 814-6.

إيكر ، جونيور، هايمان ، RW يوجد الحمض النووي لفيروس الحماق النطاقي في شكل اثنين من الايزومرات. (1982) وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية. 79 (1): 156-60.

إيكر ، جونيور، هايمان ، RW يختلف الحمض النووي للقاح الفيروس النطاقي الحماقي عن الحمض النووي للفيروس الأبوي. (1981) مجلة علم الفيروسات. 40 (1): 314-8.

إيكر ، جونيور، هايمان ، RW تحليل الانقطاعات في العمود الفقري لفسفوديستر الحمض النووي لفيروس الهربس البسيط. (1981) علم الفيروسات. 110 (1): 213-6.

إيكر ، جونيور، هايمان ، RW المتغيرات التي قد تؤثر على نمط الترسيب القلوي للحمض النووي لفيروس الهربس البسيط. (1981) قوس. فيرول. 68(3-4):221-8.