Waitt Advanced Biophotonics 센터

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Salk Institute for Biological Studies - Waitt Advanced Biophotonics Center - 연구

2023 간행물


모든 간행물


Zhou, J., Zhang, Z., Wu, M., Liu, H., Pang, Y., Bartlett, A., Peng, Z., Ding, W., Rivkin, A., Lagos, W.N., Williams , E., Lee, C.T., Miyazaki, P.A., Aldridge, A., Zeng, Q., Salinda, J.L.A., Claffey, N., Liem, M., Fitzpatrick, C., Boggeman, L., Yao, Z. , Smith, K.A., Tasic, B., Altshul, J., Kenworthy, M.A., Valadon, C., Nery, J.R., Castanon, R.G., Patne, N.S., Vu, M., Rashid, M., Jacobs, M. , Ito, T., Osteen, J., Emerson, N., Lee, J., Cho, S., Rink, J., Huang, H.H., Pinto-Duartec, A., Dominguez, B., Smith, J.B. , O'Connor, C., Zeng, H., Chen, S., Lee, K.F., Mukamel, E.A., Jin, X., Margarita Behrens, M., Ecker, J.R., Callaway, E.M. 신경 후성유전학과 원거리 투영의 뇌 전반에 걸친 대응. (2023) 자연. 624(7991):355-365. DOI: 10.1038/s41586-023-06823-w

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Zemke, N.R., Armand, E.J., Wang, W., Lee, S., Zhou, J., Li, Y.E., Liu, H., Tian, ​​W., Nery, J.R., Castanon, R.G., Bartlett, A., Osteen, J.K., Li, D., Zhuo, X., Xu, V., Chang, L., Dong, K., Indralingam, H.S., Rink, J.A., Xie, Y., Miller, M., Krienen, F.M. , Zhang, Q., Taskin, N., Ting, J., Feng, G., McCarroll, S.A., Callaway, E.M., Wang, T., Lein, E.S., Behrens, M.M., Ecker, J.R., Ren, B. 포유류 신피질의 보존되고 다양한 유전자 조절 프로그램. (2023) 자연. 624(7991):390-402. DOI: 10.1038/s41586-023-06819-6

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Patiño, M., 라고스, W.N., Patne, N.S., Miyazaki, P.A., Bhamidipati, S.K., Collman, F., Callaway, E.M. 시냅스 후 세포 유형과 시냅스 거리는 시냅스 해상도에서 측정된 단일 시냅스 광견병 바이러스 확산의 효율성을 결정하지 않습니다. (2023) 엘라이프. 12. DOI: 10.7554/eLife.89297

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Chung, B., Zia, M., Thomas, KA, Michaels, JA, Jacob, A., Pack, A., Williams, MJ, Nagapudi, K., Teng, LH, Arrambide, E., Ouellette, L. , Oey, N., Gibbs, R., Anschutz, P., Lu, J., Wu, Y., Kashefi, M., Oya, T., Kersten, R., Mosberger, AC, O'Connell, S ., Wang, R., Marques, H., Mendes, AR, Lenschow, C., Kondakath, G., Kim, JJ, Olson, W., Quinn, KN, Perkins, P., Gatto, G., Thanawalla , A., Coltman, S., Kim, T., Smith, T., Binder-Markey, B., Zaback, M., Thompson, CK, Giszter, S., Person, A., Goulding, M., Azim, E., Thakor, N., O'Connor, D., Trimmer, B., Lima, SQ, Carey, MR, Pandarinath, C., Costa, RM, Pruszynski, JA, Bakir, M., Sober, SJ 고화질 근육 기록을 위한 Myomatrix 어레이. (2023) 엘라이프. 12. DOI: 10.7554/eLife.88551

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Lainscsek, C., Salami, P., Carvalho, VR, Mendes, EMAM, Fan, M., Cash, SS, Sejnowski, TJ 발작 중 뇌 활동에 대한 네트워크 모티브 지연 차등 분석. (2023) 혼돈. 33(12). DOI: 10.1063/5.0165904

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Garrison, MA, Zhang, Y., Bae, T., Cherskov, A., Emery, SB, Fasching, L., Jones, A., Moldovan, JB, Molitor, C., Pochareddy, S., Peters, MA , Shin, JH, Wang, Y., Yang, X., Akbarian, S., Chess, A., Gage, FH, Gleeson, JG, Kidd, JM, McConnell, M., Mills, RE, Moran, JV, Park, PJ, Sestan, N., Urban, AE, Vaccarino, FM, Walsh, CA, Weinberger, DR, Wheelan, SJ, Abyzov, A. 신경 정신 질환에 대한 Brain Somatic mosaicism Network의 게놈 데이터 리소스. (2023) 과학 데이터. 10(1):813. DOI: 10.1038/s41597-023-02645-7

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Tsuda, B., 리치몬드, BJ, Sejnowski, TJ 순환 신경망을 사용하여 인간과 원숭이 간의 전략 차이를 탐색합니다. (2023) PLOS 전산 생물학. 19(11):e1011618. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1011618

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Manole, A., Wong, T., Rhee, A., Novak, S., Chin, SM, Tsimring, K., Paucar, A., Williams, A., Newmeyer, TF, Schafer, ST, Rosh, I ., Kaushik, S., Hoffman, R., Chen, S., Wang, G., Snyder, M., Cuervo, AM, Andrade, L., Manor, U., Lee, K., Jones, JR, 스턴, S., Marchetto, MC, 게이지, FH NGLY1 돌연변이는 인간 뉴런에서 단백질 응집을 유발합니다. (2023) 세포 보고서 42(12):113466. DOI: 10.1016/j.celrep.2023.113466

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Alvarez-Kuglen, M., Rodriguez, D., Qin, H., Ninomiya, K., Fiengo, L., Farhy, C., Hsu, WM, Havas, A., Feng, GS, Roberts, AJ, Anderson , RM, Serrano, M., Adams, PD, Sharpee, TO, Terskikh, AV 이미징 기반 염색질 및 후성유전적 연령인 ImAge는 노화와 회춘을 정량화합니다. (2023) 해상도 평방. DOI: 10.21203/rs.3.rs-3479973/v1

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Jorstad, NL, Close, J., Johansen, N., Yanny, AM, Barkan, ER, Travaglini, KJ, Bertagnolli, D., Campos, J., Casper, T., Crichton, K., Dee, N. , Ding, SL, Gelfand, E., Goldy, J., Hirschstein, D., Kiick, K., Kroll, M., Kunst, M., Lathia, K., Long, B., Martin, N., McMillen, D., Pham, T., Rimorin, C., Ruiz, A., Shapovalova, N., Shehata, S., Siletti, K., Somasundaram, S., Sulc, J., Tieu, M., Torkelson, A., Tung, H., Callaway, EM, Hof, PR, Keene, CD, Levi, BP, Linnarsson, S., Mitra, PP, Smith, K., Hodge, RD, Bakken, TE, Lein, ES 전사체 세포구조는 인간 신피질 조직의 원리를 드러냅니다. (2023) 과학. 382(6667):eadf6812. DOI: 10.1126/science.adf6812

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Lainscsek, C., 멘데스, EMAM, Salgado, GHO, Sejnowski, TJ 로렌츠형 시스템의 미분 형식의 고유성을 보존하는 변환입니다. (2023) 혼돈. 33(10). DOI: 10.1063/5.0156237

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Klug, JR, Yan, X., Hoffman, HA, Engelhardt, MD, 오사카다, F., Callaway, EM, Jin, X. 선조체의 직접 및 간접 경로에 대한 비대칭 피질 투영은 활동을 뚜렷하게 제어합니다. (2023) 바이오Rxiv. DOI : 10.1101 / 2023.10.02.560589

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Daboussi, L., Costaguta, G., Gullo, M., Jasinski, N., Pessino, V., O'Leary, B., Lettieri, K., Driscoll, S., Pfaff, SL Mitf는 신경 복구를 유도하는 축삭 무결성의 슈반 세포 센서입니다. (2023) 세포 보고서 42(11):113282. DOI: 10.1016/j.celrep.2023.113282

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가르시아, GC, Gupta, K., Bartol, TM, Sejnowski, TJ, Rangamani, P. 미토콘드리아 형태는 ATP 생산 속도를 결정합니다. (2023) J Gen Physiol. 155(9). DOI: 10.1085/jgp.202213263

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Globig, AM, Zhao, S., Roginsky, J., Maltez, VI, Guiza, J., Avina-Ochoa, N., Heeg, M., Araujo Hoffmann, F., Chaudhary, O., Wang, J. , Senturk, G., Chen, D., O'Connor, C., Pfaff, S., Germain, RN, Schalper, KA, Emu, B., Kaech, SM β-아드레날린 수용체는 교감 신경을 T 세포 고갈과 연결시킵니다. (2023) 자연. DOI: 10.1038/s41586-023-06568-6

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Li, JS, Sarma, AA, Sejnowski, TJ, 도일, JC 피질의 지각-행동 루프의 내부 피드백은 빠르고 정확한 행동을 가능하게 합니다. (2023) 미합중국 국립 과학 아카데미 회보. 120(39):e2300445120. DOI: 10.1073/pnas.2300445120

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Wang, H., Dey, O., Lagos, WN, Behnam, N., Callaway, EM, Stafford, BK 마우스 시각 피질의 4층에 방향 및 방향 선택적 망막 신호를 전달하는 평행 경로. (2023) 바이오Rxiv. DOI : 10.1101 / 2023.09.18.558281

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Mizrahi, L., Choudhary, A., Ofer, P., Goldberg, G., Milanesi, E., Kelsoe, JR, Gurwitz, D., Alda, M., Gage, FH, Stern, S. 림프모세포양 세포주에서 발현되는 면역글로불린 유전자는 양극성 장애 환자에서 리튬 반응을 분별하고 예측합니다. (2023) 분자 정신과. DOI : 10.1038 / s41380-023-02183-Z

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Traxler, L., Lucciola, R., Herdy, JR, 존스, JR, Mertens, J., Gage, FH 노화 및 연령 관련 질병의 신경 세포 상태 이동 및 운명 손실. (2023) Nat 레브 뉴롤. DOI: 10.1038/s41582-023-00815-0

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Schafer, ST, Mansour, AA, Schlachetzki, JCM, Pena, M., Ghassemzadeh, S., Mitchell, L., Mar, A., Quang, D., Stumpf, S., Ortiz, IS, Lana, AJ, 백찬, 자갈, 알, 글래스, 씨케이, 님머잔, 에이, 게이지, FH 인간 미세아교세포 표현형을 연구하기 위한 생체 내 신경면역 오가노이드 모델. (2023) 세포. 186(10):2111-2126.e20. DOI: 10.1016/j.cell.2023.04.022

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Arlotta, P., 게이지, FH 신경 오가노이드와 정신 질환을 이해하고 치료하기 위한 탐구. (2023) 생물 정신과. 93(7):588-589. DOI: 10.1016/j.biopsych.2023.01.021


Zemke, NR, Armand, EJ, Wang, W., Lee, S., Zhou, J., Li, YE, Liu, H., Tian, ​​W., Nery, JR, Castanon, RG, Bartlett, A., Osteen, JK, Li, D., Zhuo, X., Xu, V., Miller, M., Krienen, FM, Zhang, Q., Taskin, N., Ting, J., Feng, G., McCarroll, SA, Callaway, EM, Wang, T., Behrens, MM, Lein, ES, Ecker, JR, Ren, B. 설치류 및 영장류 신피질에서 유전자 조절 프로그램의 비교 단일 세포 후성유전체 분석. (2023) 바이오Rxiv. DOI : 10.1101 / 2023.04.08.536119

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Kobayashi, Y., Shigyo, M., Platoshyn, O., Marsala, S., Kato, T., Takamura, N., Yoshida, K., Kishino, A., Bravo-Hernandez, M., Juhas, S ., Juhasova, J., Studenovska, H., Proks, V., Driscoll, SP, Glenn, TD, Pfaff, SL, Ciacci, JD, Marsala, M. 확장 가능한 Sendai-Virus-Reprogrammed Human iPSC-Neuronal Precursors: 쥐 및 성인 돼지의 이식 후 안전성 특성. (2023) 세포 이식. 32:9636897221107009. DOI: 10.1177/09636897221107009

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Mishra, HK, Wei, H., Rohr, KE, Ko, I., Nievergelt, CM, Maihofer, AX, Shilling, PD, Alda, M., Berrettini, WH, Brennand, KJ, Calabrese, JR, Coryell, WH , Frye, M., Gage, F., Gershon, E., McInnis, MG, Nurnberger, J., Oedegaard, KJ, Zandi, PP, Kelsoe, JR, McCarthy, MJ 리튬 반응성 양극성 장애의 섬유아세포 모델에서 세포 생존에 대한 일주기 시계 유전자의 기여. (2023) Eur Neuropsychopharmacol. 74:1-14. DOI: 10.1016/j.euroneuro.2023.04.009

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Shekhtmeyster, P., Duarte, D., Carey, EM, Ngo, A., Gao, G., Olmstead, JA, Nelson, NA, Nimmerjahn, A. 행동하는 쥐의 척수에서 분절 영상화. (2023) 자연 생명 공학. DOI: 10.1038/s41587-023-01700-3

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Kempermann, G., Song, H., Gage, FH 해마의 성인 신경 발생. (2023) 해마. DOI: 10.1002/hipo.23525


Shekhtmeyster, P., Carey, EM, Duarte, D., Ngo, A., Gao, G., Nelson, NA, Clark, CL, Nimmerjahn, A. 행동하는 쥐의 척수에서 다중 층류 이미징. (2023) 네이처 커뮤니케이션즈. 14(1):1427. DOI: 10.1038/s41467-023-36959-2

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Zador, A., Escola, S., Richards, B., Ölveczky, B., Bengio, Y., Boahen, K., Botvinick, M., Chklovskii, D., Churchland, A., Clopath, C., DiCarlo, J., Ganguli, S., Hawkins, J., Körding, K., Koulakov, A., LeCun, Y., Lillicrap, T., Marblestone, A., Olshausen, B., Pouget, A., Savin, C., Sejnowski, T., Simoncelli, E., Solla, S., Sussillo, D., Tolias, AS, Tsao, D. NeuroAI를 통해 차세대 인공 지능을 촉진합니다. (2023) 네이처 커뮤니케이션즈. 14(1):1597. DOI: 10.1038/s41467-023-37180-x

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Niemsiri, V., Rosenthal, SB, Nievergelt, CM, Maihofer, AX, Marchetto, MC, Santos, R., Shekhtman, T., Alliey-Rodriguez, N., Anand, A., Balaraman, Y., Berrettini, WH, Bertram, H., Burdick, KE, Calabrese, JR, Calkin, CV, Conroy, C., Coryell, WH, DeModena, A., Eyler, LT, Feeder, S., Fisher, C., Frazier, N ., Frye, MA, Gao, K., Garnham, J., Gershon, ES, Goes, FS, Goto, T., Harrington, GJ, Jakobsen, P., Kamali, M., Kelly, M., Leckband, SG, Lohoff, FW, McCarthy, MJ, McInnis, MG, Craig, D., Millett, CE, Mondimore, F., Morken, G., Nurnberger, JI, Donovan, CO, Øedegaard, KJ, Ryan, K., Schinagle, M., Shilling, PD, Slaney, C., Stapp, EK, Stautland, A., Tarwater, B., Zandi, PP, Alda, M., Fisch, KM, Gage, FH, Kelsoe, JR 초점 부착은 양극성 장애의 리튬 반응과 관련이 있습니다: 네트워크 기반 다중 오믹스 분석의 증거. (2023) 분자 정신과. DOI: 10.1038/s41380-022-01909-9

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Little, JC, Kaaronen, RO, Hukkinen, JI, Xiao, S., Sharpee, T., Farid, AM, Nilchiani, R., Barton, CM 지구 시스템에서 인류세 시스템으로: 상호의존적인 사회적 도전을 위한 진화, 시스템 시스템, 수렴 패러다임. (2023) 환경과학기술. DOI : 10.1021 / acs.est.2c06203

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Ren, X., Liu, S., Virlogeux, A., Kang, SJ, Brusch, J., Liu, Y., Dymecki, SM, Han, S., Goulding, M., Acton, D. 기계적 가려움증에 대한 필수 척수주위경로의 확인. (2023) 신경. DOI : 10.1016 / j.neuron.2023.03.013

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Hayashi, M., Gullo, M., Senturk, G., Di Costanzo, S., Nagasaki, SC, Kageyama, R., Imayoshi, I., Goulding, M., Pfaff, SL, Gatto, G. 흥분성 뉴런과 억제성 뉴런의 척추 시너지 효과는 동측 신체 움직임을 조정합니다. (2023) 바이오Rxiv. DOI : 10.1101 / 2023.03.21.533603

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세이노프스키, TJ 대규모 언어 모델 및 역 튜링 테스트. (2023) 신경계산.:1-34 DOI: 10.1162/neco_a_01563

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Parylak, SL, Qiu, F., Linker, SB, Gallina, IS, Lim, CK, Preciado, D., McDonald, AH, Zhou, X., Gage, FH 신경 활동 관련 전사는 성숙한 치상 과립 세포에 비해 미성숙에서 둔화됩니다. (2023) 해마. DOI: 10.1002/hipo.23515

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Yang, JY, O'Connell, TF, Hsu, WM, Bauer, MS, Dylla, KV, Sharpee, TO, Hong, EJ 천연 소스의 냄새 관계를 중심으로 파리 뇌의 후각 표현을 재구성합니다. (2023) 바이오Rxiv. DOI : 10.1101 / 2023.02.15.528627

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Bermperidis, T., Schafer, S., Gage, FH, Sejnowski, T., Torres, EB 질병 관련 유전자를 사용한 확률론적 전사체 궤적의 동적 심문은 신경 및 정신 장애의 뚜렷한 기원을 밝힙니다. (2023) 신경 과학의 개척자. 16:884707. DOI: 10.3389/fnins.2022.884707

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Fischer, KB, Collins, HK, Pang, Y., Roy, DS, Zhang, Y., Feng, G., Li, SJ, Kepecs, A., Callaway, EM 신경 회로 추적을 위한 전행성 단순 헤르페스 바이러스 균주 H129의 단일 시냅스 제한. (2023) Journal of Comparative Neurology. DOI: 10.1002/cne.25451

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Perez-Garcia, G., Bicak, M., Haure-Mirande, JV, Perez, GM, Otero-Pagan, A., Gama Sosa, MA, De Gasperi, R., Sano, M., Barlow, C., Gage, FH, 판독 헤드, B., Ehrlich, ME, Gandy, S., 엘더, GA 경구 활성 mGluR838/2 수용체 길항제 프로드러그인 BCI-3은 타우병증의 PS19 MAPT 마우스 모델에서 학습 행동 결함을 구제합니다. (2023) Neurosci 레트.:137080 DOI: 10.1016/j.neulet.2023.137080

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왕, M., 게이지, FH, Schafer, ST 뇌 오가노이드의 성숙도와 세포 복잡성을 강화하기 위한 이식 전략. (2023) 생물 정신과. DOI : 10.1016 / j.biopsych.2023.01.004

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