Waitt Advanced Biophotonics 센터

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Salk Institute for Biological Studies - Waitt Advanced Biophotonics Center - 연구

2019 간행물


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피셔, KB, 콜린스, HK, 캘러웨이, EM 재조합 효소 의존성 AAV 벡터로부터의 비표적 발현원 및 크로스오버 무감각 ATG-out 벡터로의 완화. (2019) 미합중국 국립 과학 아카데미 회보. 116(52):27001–27010. DOI: 10.1073/pnas.1915974116

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Marsala, M., Kamizato, K., Tadokoro, T., Navarro, M., Juhas, S., Juhasova, J., Marsala, S., Studenovska, H., Proks, V., Hazel, T., 조헤, K., 카키노하나, M., 드리스콜, S., 토마스, G., 파프, S., 시아치, J. 성체 면역결핍 쥐에서 피하 전달 후 신경 줄기 세포에 의한 척추 실질 점유. (2019) 줄기 세포 중개 의학. DOI: 10.1002/sctm.19-0156

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Garcia, GC, Bartol, TM, Phan, S., Bushong, EA, Perkins, G., Sejnowski, TJ, Ellisman, MH, Skupin, A. 미토콘드리아 형태는 시냅스에서 에너지 버퍼링을 위한 메커니즘을 제공합니다. (2019) 과학적 보고서. 9(1):18306. DOI: 10.1038/s41598-019-54159-1

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Jullié, D., Stoeber, M., Sibarita, JB, Zieger, HL, Bartol, TM, Arttamangkul, S., Sejnowski, TJ, Hosy, E., von Zastrow, M. 신경조절제 수용체에 대한 개별 시냅스전 소포 주기. (2019) 신경. DOI : 10.1016 / j.neuron.2019.11.016

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Reichenstein, I., Eitan, C., Diaz-Garcia, S., Haim, G., Magen, I., Siany, A., Hoye, ML, Rivkin, N., Olender, T., Toth, B. , Ravid, R., Mandelbaum, AD, Yanowski, E., Liang, J., Rymer, JK, Levy, R., Beck, G., Ainbinder, E., Farhan, SMK, Lennox, KA, Bode, NM , Behlke, MA, Möller, T., Saxena, S., Moreno, CAM, Costaguta, G., van Eijk, KR, Phatnani, H., Al-Chalabi, A., Başak, AN, van den Berg, LH , Hardiman, O., Landers, JE, Mora, JS, Morrison, KE, Shaw, PJ, Veldink, JH, Pfaff, SL, Yizhar, O., Gross, C., Brown, RH, Ravits, JM, Harms, MB, 밀러, TM, 혼스타인, E. 인간 유전학 및 신경병리학은 miR-218과 근위축성 측삭 경화증 병태생리학 사이의 연관성을 제안합니다. (2019) 과학 번역 의학. 11(523). DOI: 10.1126/scitranslmed.aav5264

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Pharris, MC, Patel, NM, VanDyk, TG, Bartol, TM, Sejnowski, TJ, Kennedy, MB, Stefan, MI, Kinzer-Ursem, TL CaMKII Dodecamer의 다중 상태 모델은 자동 인산화 유지에서 Calmodulin의 역할을 제안합니다. (2019) PLOS 전산 생물학. 15(12):e1006941. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1006941

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Bravo-Hernandez, M., Tadokoro, T., Navarro, MR, Platoshyn, O., Kobayashi, Y., Marsala, S., Miyanohara, A., Juhas, S., Juhasova, J., Skalnikova, H. , Tomori, Z., Vanicky, I., Studenovska, H., Proks, V., Chen, P., Govea-Perez, N., Ditsworth, D., Ciacci, JD, Gao, S., Zhu, W ., Ahrens, ET, Driscoll, SP, Glenn, TD, McAlonis-Downes, M., Da Cruz, S., Pfaff, SL, Kaspar, BK, Cleveland, DW, Marsala, M. AAV9의 척추 subpial 전달은 광범위한 유전자 침묵을 가능하게 하고 ALS에서 운동신경원 변성을 차단합니다. (2019) 자연 의학. DOI: 10.1038/s41591-019-0674-1

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Lainscsek, C., Rungratsameetaweemana, N., 캐시, SS, Sejnowski, TJ 피질 키메라 상태는 간질 발작을 예측합니다. (2019) 혼돈. 29(12):121106. DOI: 10.1063/1.5139654

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Ruiz-Martínez, , Bartol, TM, Sejnowski, TJ, Tartakovsky, DM 반응-확산 시스템을 위한 확률적 자가 조정 하이브리드 알고리즘. (2019) 화학 물리학 저널. 151(24):244117. DOI: 10.1063/1.5125022

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Zhu, Z., Mesci, P., Bernatchez, JA, Gimple, RC, Wang, X., Schafer, ST, Wettersten, HI, Beck, S., Clark, AE, Wu, Q., Prager, BC, Kim , LJY, Dhanwani, R., Sharma, S., Garancher, A., Weis, SM, Mack, SC, Negraes, PD, Trujillo, CA, Penalva, LO, Feng, J., Lan, Z., Zhang, R., Wessel, AW, Dhawan, S., Diamond, MS, Chen, CC, Wechsler-Reya, RJ, Gage, FH, Hu, H., Siqueira-Neto, JL, Muotri, AR, Cheresh, DA, Rich , JN Zika 바이러스는 SOX2-인테그린 αβ 축을 통해 교모세포종 줄기 세포를 표적으로 합니다. (2019) 세포 줄기 세포. 26(2):187-204. DOI: 10.1016/j.stem.2019.11.016

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Siddharth, S., Jung, TP, Sejnowski, TJ 정서적 멀티미디어 콘텐츠가 뇌파도 및 얼굴 표정에 미치는 영향. (2019) 과학적 보고서. 9(1):16295. DOI: 10.1038/s41598-019-52891-2

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De la Fuente, IM, Bringas, C., Malaina, I., Regner, B., Pérez-Samartín, A., Boyano, MD, Fedetz, M., López, JI, Pérez-Yarza, G., Cortes, JM, Sejnowski, T. 핵은 XNUMX차원 환경에서 아메바의 이동 궤적에 크게 영향을 미치지 않습니다. (2019) 과학적 보고서. 9(1):16369. DOI: 10.1038/s41598-019-52716-2

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Nott, A., Holtman, IR, Coufal, NG, Schlachetzki, JCM, Yu, M., Hu, R., Han, CZ, Pena, M., Xiao, J., Wu, Y., Keulen, Z. , Pasillas, MP, O'Connor, C., Nickl, CK, Schafer, ST, Shen, Z., Rissman, RA, Brewer, JB, Gosselin, D., Gonda, DD, Levy, ML, Rosenfeld, MG, McVicker, G., Gage, FH, Ren, B., 유리, CK 뇌 세포 유형별 인핸서-프로모터 상호 작용 맵 및 질병 위험 연관성. (2019) 과학. 366(6469):1134-1139. DOI: 10.1126/science.aay0793

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Patriarchi, T., Cho, JR, Merten, K., Marley, A., Broussard, GJ, Liang, R., Williams, J., Nimmerjahn, A., von Zastrow, M., Gradinaru, V., Tian , L. 유전적으로 인코딩된 지표를 사용하여 시공간 해상도가 높은 이미징 신경 조절기. (2019) 자연 프로토콜. 14(12):3471–3505. DOI: 10.1038/s41596-019-0239-2

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Vadodaria, KC, 존스, JR, 링커, S., 게이지, FH 유도만능줄기세포를 이용한 뇌질환 모델링. (2019) 콜드 스프링 하버 생물학의 관점. DOI: 10.1101/cshperspect.a035659

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Sharpee, TO, Berkowitz, JA 정보 보존 모집단 벡터를 사용하여 신경 반응을 행동에 연결 (2019) 행동 과학의 현재 의견. 29:37-44. DOI: https://doi.org/10.1016/j.cobeha.2019.03.004

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Litvina, E., Adams, A., Barth, A., Bruchez, M., Carson, J., Chung, JE, Dupre, KB, Frank, LM, Gates, KM, Harris, KM, Joo, H., William Lichtman, J., Ramos, KM, Sejnowski, T., Trimmer, JS, White, S., Koroshetz, W. BRAIN 이니셔티브: 커뮤니티를 위한 최첨단 도구 및 리소스. (2019) Journal of Neuroscience. 39(42):8275-8284. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.1169-19.2019

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Kim, R., Li, Y., Sejnowski, TJ 기능적 스파이킹 순환 신경망을 구성하기 위한 간단한 프레임워크입니다. (2019) 미합중국 국립 과학 아카데미 회보. DOI : 10.1073 / pnas.1905926116

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Lainscsek, C., Gonzalez, CE, Sampson, AL, 현금, SS, Sejnowski, TJ 교차 역학 지연 미분 분석을 이용한 피질 발작 역학의 인과 관계 탐지. (2019) 혼돈. 29(10):101103. DOI: 10.1063/1.5126125

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Stern, S., Sarkar, A., Stern, T., Mei, A., Mendes, APD, Stern, Y., Goldberg, G., Galor, D., Nguyen, T., Randolph-Moore, L. , Kim, Y., Rouleau, G., Bang, A., Alda, M., Santos, R., Marchetto, MC, Gage, FH 양극성 장애 환자에서 유래한 CA3 및 치상회 해마 뉴런의 과흥분성의 기초가 되는 메커니즘. (2019) 생물 정신과. DOI : 10.1016 / j.biopsych.2019.09.018

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Paixão, S., Loschek, L., Gaitanos, L., Alcalà Morales, P., Goulding, M., Klein, R. 미세 터치 및 교정 운동 운동을 매개하는 등쪽 기둥 돌출에 기여하는 척추 뉴런의 식별. (2019) 신경. 104(4):749-764. DOI: 10.1016/j.neuron.2019.08.029

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Hafner, G., Witte, M., Guy, J., Subhashini, N., Fenno, LE, Ramakrishnan, C., Kim, YS, Deisseroth, K., Callaway, EM, Oberhuber, M., Conzelmann, KK , 스타이거, JF Barrel Cortex에서 Parvalbumin-Expressing GABAergic 뉴런의 뇌 전체 구심 입력을 매핑하면 로컬 및 장거리 회로 모티프가 나타납니다. (2019) 세포 보고서 28(13):3450-3461.e8. DOI: 10.1016/j.celrep.2019.08.064

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Cugno, A., Bartol, TM, Sejnowski, TJ, Iyengar, R., Rangamani, P. 수지상 척추의 두 번째 메신저 역학의 기하학적 원리. (2019) 과학적 보고서. 9(1):11676. DOI: 10.1038/s41598-019-48028-0

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Amatya, DN, Linker, SB, Mendes, APD, Santos, R., Erikson, G., Shokhirev, MN, Zhou, Y., Sharpee, T., Gage, FH, Marchetto, MC, Kim, Y. 자폐 스펙트럼 장애의 신경 분화 동안 동적 전기적 복잡성이 감소합니다. (2019) 줄기 세포 보고서. DOI: 10.1016/j.stemcr.2019.08.001

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샤피, TO 신경 회로의 쌍곡선 기하학에 대한 주장. (2019) 신경 생물학의 현재 견해. 58:101-104. DOI: 10.1016/j.conb.2019.07.008

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Juavinett, AL, Kim, EJ, Collins, HC, Callaway, EM 마우스 측면 후부 시상 뉴런과 시각 피질 투영 대상 사이의 체계적인 지형 관계. (2019) Journal of Comparative Neurology. 528(1):95-107. DOI: 10.1002/cne.24737

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왕, HP, 가르시아, JW, Sabottke, CF, Spencer, D., Sejnowski, TJ Feedforward thalamocortical 연결성은 감각 경로에서 자극 타이밍 정보를 보존합니다. (2019) Journal of Neuroscience. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.3165-17.2019

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Acton, D., Ren, X., Di Costanzo, S., Dalet, A., Bourane, S., Bertocchi, I., Eva, C., Goulding, M. 척수 신경펩티드 Y1 수용체 발현 뉴런은 기계적 가려움증에 필수적인 흥분 경로를 형성합니다. (2019) 세포 보고서 28(3):625-639.e6. DOI: 10.1016/j.celrep.2019.06.033

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벨, M., 바르톨, T., Sejnowski, T., Rangamani, P. 수지상 척추 기하학 및 척추 장치 조직은 칼슘의 시공간 역학을 지배합니다. (2019) J. Gen.Physiol. DOI: 10.1085/jgp.201812261

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Quraishi, IH, Stern, S., Mangan, KP, Zhang, Y., Ali, SR, Mercier, MR, Marchetto, MC, McLachlan, MJ, Jones, EM, Gage, FH, Kaczmarek, LK 간질 관련 KCNT1 돌연변이는 슬랙 K 전류를 증가시켜 인간 iPSC 유래 뉴런의 흥분성을 향상시킵니다. (2019) Journal of Neuroscience. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.1628-18.2019

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Pinto-Duarte, A., Roberts, AJ, Ouyang, K., Sejnowski, TJ 유형 2 IP 수용체의 부족으로 인한 원격 메모리 손상. (2019) 아교세포. DOI: 10.1002/glia.23679

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스턴, S., 링커, S., Vadodaria, KC, Marchetto, MC, Gage, FH 정신 질환에서 약물 치료에 대한 반응 예측. (2019) 초점 (미국 정신과 출판). 17(3):294-307. DOI: 10.1176/appi.focus.17304

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Vadodaria, KC, Ji, Y., Skime, M., Paquola, A., Nelson, T., Hall-Flavin, D., Fredlender, C., Heard, KJ, Deng, Y., Le, AT, Dave , S., Fung, L., Li, X., Marchetto, MC, Weinshilboum, R., Gage, FH 체외에서 환자 유래 뉴런을 사용하여 우울증의 치료 저항성을 연구합니다. (2019) 분자 정신과. 24(6):775. DOI: 10.1038/s41380-019-0424-2


Sommer, A., Marxreiter, F., Krach, F., Fadler, T., Grosch, J., Maroni, M., Graef, D., Eberhardt, E., Riemenschneider, MJ, Yeo, GW, Kohl, Z., Xiang, W., Gage, FH, Winkler, J., Prots, I., 위너, B. Th17 림프구는 파킨슨병의 인간 iPSC 기반 모델에서 신경 세포 사멸을 유도합니다. (2019) 세포 줄기 세포. 24(6):1006. DOI: 10.1016/j.stem.2019.04.019


Nelson, NA, Wang, X., Cook, D., Carey, EM, Nimmerjahn, A. 행동하는 동물의 척수 활동 이미징. (2019) 실험 신경학. 230:112974. DOI: 10.1016/j.expneurol.2019.112974

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Zhou, J., Ma, J., Chen, Y., Cheng, C., Bao, B., Peng, J., Sejnowski, TJ, Dixon, JR, Ecker, JR 컨볼루션 및 랜덤 워크 기반 대치에 의한 강력한 단일 셀 Hi-C 클러스터링. (2019) 미합중국 국립 과학 아카데미 회보. DOI : 10.1073 / pnas.1901423116

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Oakley, BA, Sejnowski, TJ 세계에서 가장 인기 있는 MOOC 중 하나를 만들면서 배운 것. (2019) NPJ 과학 학습. 4:7. DOI: 10.1038/s41539-019-0046-0

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Garg, AK, Li, P., Rashid, MS, Callaway, EM 색상과 방향은 영장류의 기본 시각 피질에서 공동으로 코딩되고 공간적으로 구성됩니다. (2019) 과학. 364(6447):1275-1279. DOI: 10.1126/science.aaw5868

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Ernst, OK, Bartol, TM, Sejnowski, TJ, Mjolsness, E. 공간 동적 Boltzmann 분포를 사용하는 반응 확산 시스템에서 모멘트 폐쇄를 학습합니다. (2019) Phys 목사 E. 99(6-1):063315. DOI: 10.1103/PhysRevE.99.063315

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Herdy, J., Schafer, S., Kim, Y., Ansari, Z., Zangwill, D., Ku, M., Paquola, A., Lee, H., Mertens, J., Gage, FH 섬유모세포의 뉴런으로의 전환을 최적화하기 위한 전사적으로 풍부한 신호 전달 경로의 화학적 조절. (2019) 엘라이프. 8. DOI: 10.7554/eLife.41356

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Das, A., Sexton, D., Lainscsek, C., 캐시, SS, Sejnowski, TJ 간질 발작 동안 관찰되지 않은 입력으로 인간 전기 피질 기록에서 뇌 연결 특성화. (2019) 신경계산.:1-56 DOI: 10.1162/neco_a_01205

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왕, M., 장, L., 게이지, FH 인간유도만능줄기세포를 이용한 신경정신질환 모델링 (2019) 단백질 및 세포. 11(1):45-59. DOI: 10.1007/s13238-019-0638-8

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Schafer, ST, 게이지, FH 뇌의 신경 세포가 전립선 종양을 침범합니다. (2019) 자연. 569(7758):637-638. DOI: 10.1038/d41586-019-01461-7


게이지, FH 포유 동물의 성인 신경 발생. (2019) 과학. 364(6443):827-828. DOI: 10.1126/science.aav6885


Siddharth, Patel, AN, Jung, TP, Sejnowski, TJ 실제 응용을 위한 웨어러블 다중 모드 바이오 센싱 시스템. (2019) IEEE 트랜스 바이오메드 공학 66(4):1137-1147. DOI: 10.1109/TBME.2018.2868759

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Tapia, JJ, Saglam, AS, 체코어, J., Kuczewski, R., Bartol, TM, Sejnowski, TJ, Faeder, JR MCell-R: 입자 해상도 네트워크 프리 공간 모델링 프레임워크. (2019) 분자 생물학의 방법. 1945:203-229. DOI: 10.1007/978-1-4939-9102-0_9

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Gatto, G., 스미스, KM, 로스, SE, 굴딩, M. 체감각 시스템의 신경 다양성: 세포 유형과 기능 사이의 격차 해소. (2019) 신경 생물학의 현재 견해. 56:167-174. DOI: 10.1016/j.conb.2019.03.002

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Osseward, PJ, Pfaff, SL 척수의 세포 유형 및 회로 모듈. (2019) 신경 생물학의 현재 견해. 56:175-184. DOI: 10.1016/j.conb.2019.03.003

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Berkowitz, JA, 샤피, TO 큰 신경 인구에 의해 전달되는 정보 정량화. (2019) 신경계산.:1-33 DOI: 10.1162/neco_a_01193

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McBride, EG, Lee, SJ, Callaway, EM 마우스 일차 시각 피질에서 시각 공간 선택 및 이동의 로컬 및 글로벌 영향. (2019) 현재 생물학. 29(10):1592-1605. DOI: 10.1016/j.cub.2019.03.065

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Nudell, V., Wei, H., Nievergelt, C., Maihofer, AX, Shilling, P., Alda, M., Berrettini, WH, Brennand, KJ, Calabrese, JR, Coryell, WH, Covault, JM, Frye , MA, Gage, F., Gershon, E., McInnis, MG, Nurnberger, JI, Oedegaard, KJ, Shekhtman, T., Zandi, PP, Kelsoe, JR, McCarthy, MJ 온도에 대한 일주기 리듬의 동조는 양극성 장애 및 칼슘 채널에 대한 가능한 링크가 있는 환자의 섬유아세포에서 진폭 결함을 나타냅니다. (2019) 분자신경정신의학. 5(2):115-124. DOI: 10.1159/000497354

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왕, M., 장, L., 게이지, FH 소교세포, 보체 및 정신분열증. (2019) 자연 신경 과학. 22(3):333-334. DOI: 10.1038/s41593-019-0343-1


Farrelly, LA, Thompson, RE, Zhao, S., Lepack, AE, Lyu, Y., Bhanu, NV, Zhang, B., Loh, YE, Ramakrishnan, A., Vadodaria, KC, Heard, KJ, Erikson, G., Nakadai, T., Bastle, RM, Lukasak, BJ, Zebroski, H., Alenina, N., Bader, M., Berton, O., Roeder, RG, Molina, H., Gage, FH, Shen , L., Garcia, BA, Li, H., Muir, TW, Maze, I. 히스톤 세로토닐화는 H3K4me3에 대한 TFIID 결합을 향상시키는 허용 변형입니다. (2019) 자연. DOI: 10.1038/s41586-019-1024-7

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Bohaciakova, D., Hruska-Plochan, M., Tsunemoto, R., Gifford, WD, Driscoll, SP, Glenn, TD, Wu, S., Marsala, S., Navarro, M., Tadokoro, T., Juhas , S., Juhasova, J., Platoshyn, O., Piper, D., Sheckler, V., Ditsworth, D., Pfaff, SL, Marsala, M. ES 전구체에서 인간 다능성 임상 등급 신경 줄기 세포를 분리하기 위한 확장 가능한 솔루션입니다. (2019) 줄기 세포 연구 및 치료. 10(1):83. DOI: 10.1186/s13287-019-1163-7

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Vadodaria, KC, Ji, Y., Skime, M., Paquola, AC, Nelson, T., Hall-Flavin, D., Heard, KJ, Fredlender, C., Deng, Y., Elkins, J., Dani , K., Le, AT, Marchetto, MC, Weinshilboum, R., Gage, FH SSRI 내성 주요 우울 장애 환자 유래 뉴런의 변경된 세로토닌 성 회로. (2019) 분자 정신과. DOI: 10.1038/s41380-019-0377-5

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Bonanomi, D., Valenza, F., Chivatakarn, O., Sternfeld, MJ, Driscoll, SP, Aslanian, A., Lettieri, K., Gullo, M., Badaloni, A., Lewcock, JW, Hunter, T ., 파프, SL p190RhoGAP는 경쟁 신호를 필터링하여 축삭 안내 충돌을 해결합니다. (2019) 신경. DOI : 10.1016 / j.neuron.2019.02.034

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Marchetto, MC, Hrvoj-Mihic, B., Kerman, BE, Yu, DX, Vadodaria, KC, Linker, SB, Narvaiza, I., Santos, R., Denli, AM, Mendes, AP, Oefner, R., Cook, J., McHenry, L., Grasmick, JM, Heard, K., Fredlender, C., Randolph-Moore, L., Kshirsagar, R., Xenitopoulos, R., Chou, G., Hah, N. , Muotri, AR, Padmanabhan, K., Semendeferi, K., Gage, FH 인간, 침팬지 및 보노보 신경 세포의 종별 성숙 프로파일. (2019) 엘라이프. 8. DOI: 10.7554/eLife.37527

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Aimon, S., Katsuki, T., Jia, T., Grosenick, L., Broxton, M., Deisseroth, K., Sejnowski, TJ, Greenspan, RJ 자극과 행동에 대한 반응 동안 성인 Drosophila의 빠른 거의 전체 뇌 이미징. (2019) 플로스 생물학. 17(2):e2006732. DOI: 10.1371/journal.pbio.2006732

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Lainscsek, C., Sampson, AL, Kim, R., Thomas, ML, Man, K., Lainscsek, X., Swerdlow, NR, Braff, DL, Sejnowski, TJ, Light, GA 정신 분열증에서 감각 처리 기능 장애의 기본이 되는 비선형 역학. (2019) 미합중국 국립 과학 아카데미 회보. 116(9):3847-3852. DOI: 10.1073/pnas.1810572116

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Bennett, C., Gale, SD, Garrett, ME, Newton, ML, Callaway, EM, Murphy, GJ, Olsen, SR 고차원의 시상 회로는 생쥐의 시각적 정보의 병렬 흐름을 전달합니다. (2019) 신경. 102(2):477-492. DOI: 10.1016/j.neuron.2019.02.010

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Lucassen, PJ, Toni, N., Kempermann, G., Frisen, J., Gage, FH, Swaab, DF 인간 신경 발생의 한계 - 정말? (2019) 분자 정신과. DOI: 10.1038/s41380-018-0337-5

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Schafer, ST, Paquola, ACM, Stern, S., Gosselin, D., Ku, M., Pena, M., Kuret, TJM, Liyanage, M., Mansour, AA, Jaeger, BN, Marchetto, MC, Glass , CK, Mertens, J., 게이지, FH 병리학 적 프라이밍은 자폐증 주제 파생 뉴런에서 발달 유전자 네트워크 이질성을 유발합니다. (2019) 자연 신경 과학. DOI : 10.1038 / s41593-018-0295-x

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