グラハム・マクヴィッカー博士

准教授
遺伝学研究室
統合生物学研究室

ソーク生物学研究所 - グラハム・マクヴィッカー博士

最新の研究


課題

遺伝的変異として知られる人間の遺伝的差異が、人々をユニークなものにしています。遺伝子変異は髪や目の色などの形質に影響を与え、健康と病気の両方を促進する可能性があります。現在、何千もの遺伝子変異がヒトの病気に関連していると考えられています。しかし、これらの変異体のほとんどは「非コーディング」であり、遺伝子(タンパク質をコードするゲノムの部分)の外側にあるため、これらの変異体のほとんどの機能は不明であり、決定することが困難です。現在の研究では、これらの変異体は遺伝子を直接改変するのではなく、改変することによって遺伝子発現に影響を与えることが示唆されています。 いつ 遺伝子はオフになったりオンになったりして、 さまざまな細胞タイプや条件で生成されるタンパク質の量。複雑なヒト疾患の遺伝的基盤を理解するには、これらの非コード遺伝子変異が遺伝子発現の制御をどのように変化させるかを理解することが不可欠です。

アプローチ

グラハム マクビッカーの研究室では、実験的アプローチとコンピューター解析を組み合わせることにより、人間の遺伝的変異が遺伝子制御にどのような影響を与えるかを研究しています。研究室の実験側は、ゲノムの CRISPR 摂動、およびクロマチン構造と遺伝子発現を決定するゲノムアッセイを専門としています。研究室の計算側は、統計と機械学習の手法を使用した人間の遺伝的変異と大規模な実験データセットの分析を専門としています。


革新と発見

博士研究員として、マクビッカー氏は、ヒトゲノム内のヒストンマーク量的形質遺伝子座 (QTL) を特定する最初の研究を発表しました。QTL は、ヒトの個体間のヒストン修飾の違いに関連する遺伝的変異です。彼はまた、対立遺伝子特異的発現を分析し、分子の量的形質を発見するためのソフトウェア パッケージ (WASP と呼ばれる) を開発しました。彼の研究室では、これを使用して、がんゲノムで再発性調節異常のある遺伝子を発見しました。

McVicker の研究室は、CRISPR を活用してゲノムの非コード部分をスキャンして重要な制御機能を見つける技術と分析方法を開発しました。彼らはまた、これらの方法を使用して、T 細胞の遺伝子発現に影響を与える重要な制御配列を発見します。

現在の研究では、マクビッカーの研究室は機械学習を使用して、ヒトゲノム内の非コード遺伝子変異の調節機能を予測しています。

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ご支援のお願い

教育

ブリティッシュコロンビア大学コンピューターサイエンス学士
ワシントン大学ゲノム科学博士号
シカゴ大学博士研究員
スタンフォード大学博士研究員


賞と優等生

  • 国立ヒトゲノム研究所ゲノムイノベーター賞、2021年
  • 分子生物進化学会大学院生旅行賞、2009年
  • 自然科学工学研究評議会大学院奨学金、2005 年
  • ブリティッシュ コロンビア大学優秀学生イニシアチブ奨学金、1997 年

プロフィール

ウェブサイト

http://mcvicker.salk.edu/

お問い合わせ

gmcvicker@salk.edu