2024 年 8 月 27 日
ソーク研究所のがん、健康な老化、免疫生物学、神経科学などの重要な分野での研究は、機械学習や人工知能などの複数の機関の協力やデータ集約型の手法にますます依存しており、最先端のネットワークインフラストラクチャが必要です。
ラホヤ—ソーク研究所は、研究協力者間の科学データ転送を強化する最先端の高速ネットワークであるソーク科学ネットワーク(SciNET)を立ち上げました。これは、ソークの バイオコンピューティングイニシアチブは、機械学習や人工知能など、生物科学におけるますますデータ集約的な研究がもたらす課題に対処するために必要な資金、テクノロジー、専門知識を提供することを目的としています。
「ソーク サイエンス ネットワークは単なる技術のアップグレードではありません。当研究所の科学者と世界中の研究協力者を結ぶ架け橋なのです」とソーク最高情報責任者のジェリー シーハンは言います。「この高速ネットワークにより、データ転送が可能な限りシームレスかつ迅速になり、より深く生産的な科学的パートナーシップが促進されます。」
新しいネットワークは、米国エネルギー省の Science DMZ アーキテクチャを活用して高速データ高速道路を構築し、大量のデータ転送が迅速かつ確実に行われるようにします。Science DMZ は、電子メール、Web ブラウジング、ビデオ会議などの日常的なインターネット使用から科学データ トラフィックを分離する特殊なアーキテクチャです。これにより、単一細胞ゲノム パイプラインや高解像度画像データなどの大量のデータ転送が迅速かつ安全に完了します。ネットワークには高度なセキュリティ対策が組み込まれており、機密性の高い研究データを保護しながら、リモート コンピューティング リソースや共同プラットフォームへのシームレスなアクセスを可能にします。
SciNetがいかにしてインパクトの大きい研究を可能にするかの一例を挙げます。2022年にソーク教授は ジョゼフ・エッカー および研究教授 マルガリータ・ベーレンス 研究所は、国立衛生研究所から同研究所史上最大の助成金 77 万ドルを受け取り、マルチオミック ヒト脳細胞アトラス センターを設立しました。このプロジェクトの目的は、ヒトの脳を構成する細胞をこれまでにない分子レベルで詳細に記述し、脳細胞をより正確なサブタイプに分類し、脳内の各細胞の位置を正確に特定することです。さらに、チームはこれらの特徴が人間の生涯にわたってどのように変化するかを追跡します。
これは、健康時と病気時の両方で脳がどのように機能するかをより深く理解する素晴らしい機会だとエッカー氏は言う。しかし、このプロジェクト 20 つで、彼の研究室は 4.3 ペタバイトの生データを生成すると見積もっている。これは高解像度の写真約 XNUMX 億枚に相当する。
「ソーク サイエンス ネットワークの立ち上げは、私たちの研究にとって変革の瞬間です」とエッカー氏は言います。「マルチオミック ヒト脳細胞アトラスのような野心的なプロジェクトに着手するにあたり、SciNet は膨大なデータセットをシームレスに転送して分析できるようにします。この高度なネットワークは単なるツールではありません。科学者が世界規模で協力し、脳の分子構造に関する新たな知見を解き明かすための重要なプラットフォームなのです。」
Salk Science Network 接続は 100 ギガバイト/秒で動作し、カリフォルニア州の教育ネットワーク コンソーシアムの高性能研究サービスに入る前に、サンディエゴ スーパーコンピュータ センターのデータ センターへの出口を提供します。この設定により、Internet2 を含む地域、国内、および国際研究ネットワークへの高速な直接アクセスと、AWS、Google、Azure などの商用クラウド プロバイダーへの直接アクセスが提供されます。
「デジタルデータは現代の生物学研究の生命線であり、大量のデータを効率的に転送して分析する能力は変革的な科学にとって非常に重要です」とソーク研究所の最高科学責任者は述べています。 ヤン・カールセダー、教授でありドナルド・アンド・ダーレン・シャイリー教授職の保持者。「ソーク科学ネットワークは膨大なデータセットの迅速な転送を促進し、生のデータを画期的な洞察に変換するのに役立つでしょう。」
詳細については、以下のサイトをご覧ください。
通信局
電話:(858)453-4100
press@salk.edu
生命そのものの秘密を解き明かすことが、ソーク研究所の原動力です。 受賞歴のある世界クラスの科学者からなる当社のチームは、神経科学、がん研究、老化、免疫生物学、植物生物学、計算生物学などの分野で知識の限界を押し広げています。 最初の安全で効果的なポリオ ワクチンの開発者であるジョナス ソークによって設立されたこの研究所は、独立した非営利研究組織であり、建築上のランドマークでもあります。選択により小規模で、本質的に親密で、どんな困難にも恐れることはありません。