José Noel, PhD

Profesor y director

Centro Jack H. Skirball de Biología Química y Proteómica

Silla Arthur y Julie Woodrow

Instituto Salk de Estudios Biológicos - Publicaciones

todas las publicaciones


Chen, A., Re, R.N., Davis, T.D., Tran, K., Moriuchi, Y.W., Wu, S., La Clair, J.J., Louie, G.V., Bowman, M.E., Clarke, D.J., Mackay, CL, Campopiano, DJ., Noel, J.P., Burkart, MD Visualización de la interfaz de la biosíntesis de biotina y ácidos grasos a través de sondas SuFEx. (2024) Revista de la Sociedad Química Estadounidense. DOI: 10.1021 / jacs.3c10181

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Aiyer, S., Baldwin, PR, Tan, SM, Shan, Z., Oh, J., Mehrani, A., Bowman, ME, Louie, G., Passos, DO, Đorđević-Marquardt, S., Mietzsch, M., Hull, JA, Hoshika, S., Barad, BA, Grotjahn, DA, McKenna, R., Agbandje-McKenna, M., Benner, SA, Noel, J.A.P., Wang, D., Tan, YZ, Lyumkis, D. Superar la atenuación de la resolución durante la recopilación de datos crio-EM inclinados. (2024) Nature Communications. 15(1):389. DOI: 10.1038/s41467-023-44555-7

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Nartey, CM, Koo, HJ, Laurendon, C., Shaik, HZ, O'maille, P., Noel, J.P., Morcos, F. La información coevolutiva captura funciones catalíticas y revela funciones divergentes de las conexiones entre dominios de terpeno sintasa. (2024) Bioquímica. DOI: 10.1021 / acs.biochem.3c00578

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Xie, L., Bowman, ME, Louie, GV, Zhang, C., Ardejani, MS, Huang, X., Chu, Q., Donaldson, CJ, Vaughan, JM, Shan, H., Powers, ET, Kelly , JW, Lyumkis, D., Noel, J.P., Saghatelian, A. Bioquímica e interacciones proteicas de la microproteína CYREN. (2023) Bioquímica. DOI: 10.1021 / acs.biochem.3c00397

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Jiang, Z., Chen, A., Chen, J., Sekhon, A., Louie, GV, Noel, J.P., La Clair, JJ, Burkart, MD La cerulenina enmascarada permite un entrecruzamiento selectivo de proteínas en dos sitios. (2023) Ciencias químicas. 14(39):10925-10933. DOI: 10.1039/d3sc02864j

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Chen, A., Mindrebo, JT, Davis, TD, Kim, WE, Katsuyama, Y., Jiang, Z., Ohnishi, Y., Noel, J.P., Burkart, MD Las sondas de reticulación basadas en mecanismos capturan la cetosintasa FabB de Escherichia coli en estados catalíticos conformacionalmente distintos. (2022) Acta Crystallogr D Struct Biol. 78 (Pt 9): 1171-1179. DOI: 10.1107/S2059798322007434

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Chen, PY, Adak, S., Chekan, JR, Liscombe, DK, Miyanaga, A., Bernhardt, P., Diethelm, S., Fielding, EN, George, JH, Miles, ZD, Murray, LAM, Steele, TS, Invierno, JM, Noel, J.P., Moore, BS Base Estructural De Las Enzimas De La Familia Haloperoxidasa Dependientes De Vanadio Estereoespecíficas En La Biosíntesis De Napiraradiomicina. (2022) Bioquímica. DOI: 10.1021 / acs.biochem.2c00338

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Aiyer, S., Strutzenberg, TS, Bowman, ME, Noel, J.P., Lyumkis, D. Recopilación de datos crio-EM de una sola partícula con inclinación de escenario usando Leginon. (2022) Júpiter.(185) DOI: 10.3791/64136

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Mindrebo, JT, Chen, A., Kim, WE, Re, RN, Davis, TD, Noel, J.P., Burkart, MD Estructura y análisis mecanísticos del mecanismo de activación de las cetosintasas alargadas. (2021) Catálogo ACS. 11(12):6787-6799. DOI: 10.1021/acscatal.1c00745

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Thomas, ST, Shin, Y., La Clair, JJ, Noel, J.P. Reducción y almacenamiento de CO basado en plantas como SiC. (2021) RSC Adv. 11(26):15512-15518. DOI: 10.1039/d1ra00954k

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Mindrebo, JT, Misson, LE, Johnson, C., Noel, J.P., Burkart, MD Mapeo De La Actividad De La Proteína Transportadora De Acilo: Alargamiento De La Interacción De La Cetosintasa En La Biosíntesis De Ácidos Grasos. (2020) Bioquímica. DOI: 10.1021 / acs.biochem.0c00605

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Misson, LE, Mindrebo, JT, Davis, TD, Patel, A., McCammon, JA, Noel, J.P., Burkart, MD La plasticidad interfacial facilita la alta velocidad de reacción de FAS malonil-CoA:ACP transacilasa, FabD. (2020) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. DOI: 10.1073 / pnas.2009805117

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Chekan, JR, McKinnie, SMK, Noel, J.P., Moore, BS La biosíntesis de neurotoxinas de algas reutiliza el pliegue estructural de la terpeno ciclasa en una -preniltransferasa. (2020) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. DOI: 10.1073 / pnas.2001325117

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Mindrebo, JT, Patel, A., Kim, WE, Davis, TD, Chen, A., Bartholow, TG, La Clair, JJ, McCammon, JA, Noel, J.P., Burkart, MD Mecanismo de activación de alargamiento de β-cetoacil-ACP sintasas. (2020) Nature Communications. 11(1):1727. DOI: 10.1038/s41467-020-15455-x

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Lynch, JH, Qian, Y., Guo, L., Maoz, I., Huang, XQ, García, AS, Louie, G., Bowman, ME, Noel, J.P., Morgan, JA, Dudareva, N. Modulación de la formación de auxinas por la ruta biosintética de fenilalanina citosólica. (2020) Naturaleza Química Biología. DOI: 10.1038/s41589-020-0519-8

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Vickery, CR, McCulloch, IP, Sonnenschein, EC, Beld, J., Noel, J.P., Burkart, MD Disección de sintasas modulares a través de la inhibición: un enfoque químico y genético complementario. (2020) Cartas de Química Bioorgánica y Medicinal. 30(2):126820. DOI: 10.1016/j.bmcl.2019.126820

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Burke, JR, La Clair, JJ, Philippe, RN, Pabis, A., Corbella, M., Jez, JM, Cortina, GA, Kaltenbach, M., Bowman, ME, Louie, GV, Woods, KB, Nelson, AT, Tawfik, DS, Kamerlín, SCL, Noel, J.P. Activación de sustrato bifuncional a través de un residuo de arginina impulsa la catálisis en isomerasas de chalcona (2019) Catálisis ACS. 9(9):8388−8396. DOI: https://doi.org/10.1021/acscatal.9b01926

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Seto, Y., Yasui, R., Kameoka, H., Tamiru, M., Cao, M., Terauchi, R., Sakurada, A., Hirano, R., Kisugi, T., Hanada, A., Umehara, M., Seo, E., Akiyama, K., Burke, J., Takeda-Kamiya, N., Li, W., Hirano, Y., Hakoshima, T., Mashigu Chi, K., Noel, J.P., Kyozuka, J., Yamaguchi, S. Percepción y desactivación de estrigolactona por un receptor de hidrolasa DWARF14. (2019) Nature Communications. 10(1):191. DOI: 10.1038/s41467-018-08124-7

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Henry, LK, Thomas, ST, Widhalm, JR, Lynch, JH, Davis, TC, Kessler, SA, Bohlmann, J., Noel, J.P., Dudareva, N. Contribución del fosfato de isopentenilo al metabolismo de los terpenoides vegetales. (2018) Plantas de la naturaleza. DOI: 10.1038 / s41477-018, 0220-z

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Kaltenbach, M., Burke, JR, Dindo, M., Pabis, A., Munsberg, FS, Rabin, A., Kamerlin, SCL, Noel, J.P., Tawfik, DS Evolución de la chalcona isomerasa de un ancestro no catalítico. (2018) Naturaleza Química Biología. DOI: 10.1038/s41589-018-0042-3

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Vickery, CR, Cárdenas, J., Bowman, M., Burkart, MD, Da Silva, NA, Noel, J.P. Un enfoque acoplado in vitro/in vivo para diseñar una PKS heteróloga de tipo III para mejorar la biosíntesis de policétidos en Saccharomyces cerevisiae. (2018) Biotecnología y Bioingeniería. DOI: 10.1002/bit.26564

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Kersten, RD, Lee, S., Fujita, D., Pluskal, T., Kram, S., Smith, JE, Iwai, T., Noel, J.P., Fujita, M., Weng, JK Una sesquiterpeno sintasa de bourbonano de algas rojas definida por análisis XRD de esponja cristalina acoplada a RMN a escala de microgramos. (2017) Revista de la Sociedad Química Estadounidense. DOI: 10.1021 / jacs.7b09452

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Wu, CC, Baiga, TJ, Downes, M., La Clair, JJ, Atkins, AR, Richard, SB, Fan, W., Stockley-Noel, TA, Bowman, ME, Noel, J.P., Evans, Reino Unido Base estructural para la ligadura específica del receptor δ activado por el proliferador de peroxisomas. (2017) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 114(13):E2563-E2570. DOI: 10.1073/pnas.1621513114

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Levsh, O., Chiang, YC, Tung, CF, Noel, J.P., Wang, Y., Weng, JK Los estados conformacionales dinámicos dictan la selectividad hacia el sustrato nativo en una aciltransferasa permisiva al sustrato. (2016) Bioquímica. 55(45):6314-6326. DOI: 10.1021/acs.biochem.6b00887

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Koo, HJ, Vickery, CR, Xu, Y., Louie, GV, O'Maille, PE, Bowman, M., Nartey, CM, Burkart, MD, Noel, J.P. Potencial biosintético de sesquiterpeno sintasas: perfiles de productos de premnaspirodieno sintasa de beleño egipcio y mutantes relacionados. (2016) Revista de antibióticos. 69(7):524-33. DOI: 10.1038/ja.2016.68

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El Gamal, A., Agarwal, V., Diethelm, S., Rahman, I., Schorn, MA, Sneed, JM, Louie, GV, Whalen, KE, Mincer, TJ, Noel, J.P., Pablo, VJ, Moore, BS Biosíntesis de tetrabromopirrol de asentamiento de coral en bacterias marinas por un par de enzimas brominasa-tioesterasa adaptadas de forma única. (2016) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 113(14):3797-802. DOI: 10.1073/pnas.1519695113

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Ma, D., Li, X., Guo, Y., Chu, J., Fang, S., Yan, C., Noel, J.P., Liu, H. El criptocromo 1 interactúa con PIF4 para regular el alargamiento del hipocótilo mediado por altas temperaturas en respuesta a la luz azul. (2016) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 113(1):224-9. DOI: 10.1073/pnas.1511437113

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Rising, KA, Crenshaw, CM, Koo, HJ, Subramanian, T., Chehade, KA, Starks, C., Allen, KD, Andres, DA, Spielmann, HP, Noel, J.P., Chappell, J. Formación de un alcaloide macrocíclico novedoso a partir del anilinogeranil difosfato análogo de farnesil difosfato no natural por 5-epi-aristoloqueno sintasa. (2015) ACS Biología Química. 10(7):1729-36. DOI: 10.1021/acschembio.5b00145

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Pan, H., Zhou, R., Louie, GV, Mühlemann, JK, Bomati, EK, Bowman, ME, Dudareva, N., Dixon, RA, Noel, J.P., Wang, X. Estudios estructurales de cinamoil-CoA reductasa y cinamil-alcohol deshidrogenasa, enzimas clave de la biosíntesis de monolignol. (2014) Célula vegetal. 26(9):3709-27. DOI: 10.1105/tpc.114.127399

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Vickery, CR, Kosa, NM, Casavant, EP, Duan, S., Noel, J.P., Burkart, MD Estructura, bioquímica e inhibición de 4'-fosfopanteteinil transferasas esenciales de dos especies de micobacterias. (2014) ACS Biología Química. 9(9):1939-44. DOI: 10.1021/cb500263p

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Procko, C., Crenshaw, CM, Ljung, K., Noel, J.P., Chori, J. Se requiere auxina generada por cotiledón para el crecimiento de hipocotilo inducido por sombra en Brassica rapa. (2014) Fisiología de las plantas. 165(3):1285-1301. DOI: 10.1104/pp.114.241844

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Bomati, EK, Haley, JE, Noel, J.P., Deheyn, DD Comparación espectral y estructural entre proteínas fluorescentes verdes brillantes y tenues en Amphioxus. (2014) Informes Científicos. 4:5469. DOI: 10.1038/srep05469

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Hoppmann, C., Lacey, VK, Louie, GV, Wei, J., Noel, J.P., Wang, L. Aminoácidos de clic fotoconmutables que codifican genéticamente en Escherichia coli y células de mamíferos. (2014) Angewandte Chemie. 53(15):3932-6. DOI: 10.1002/anie.201400001

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Beld, J., Sonnenschein, CE, Vickery, CR, Noel, J.P., Burkart, MD Las fosfopanteteiniltransferasas: catálisis de una modificación postraduccional crucial para la vida. (2014) Informes de productos naturales. 31(1):61-108. DOI: 10.1039/c3np70054b

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Schorn, M., Zettler, J., Noel, J.P., Dorrestein, PC, Moore, BS, Kayser, L. Base genética para la biosíntesis de la clase farmacéuticamente importante de inhibidores del proteasoma epoxicetona. (2014) ACS Biología Química. 9(1):301-9. DOI: 10.1021/cb400699p

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Teufel, R., Miyanaga, A., Michaudel, Q., Stull, F., Louie, G., Noel, J.P., Baran, PS, Palfey, B., Moore, BS La oxidación dual mediada por flavina controla un reordenamiento enzimático de tipo Favorskii. (2013) Naturaleza. 503 (7477): 552-556. DOI: 10.1038/naturaleza12643

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Stewart, C., Vickery, CR, Burkart, MD, Noel, J.P. Confluencia de biología estructural y química: policétido sintasas de plantas como biocatalizadores para un futuro de base biológica. (2013) Opinión actual en biología vegetal. 16(3):365-72. DOI: 10.1016/j.pbi.2013.02.004

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Elleder, D., Baiga, TJ, Russell, RL, Naughton, JA, Hughes, SH, Noel, J.P., Joven, JA Identificación de un inhibidor de 3-aminoimidazo[1,2-a]piridina de la transcriptasa inversa del VIH-1. (2012) Revista de Virología. 9:305. DOI: 10.1186/1743-422X-9-305

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Noel, J.P., Dellas, N., Faraldos, JA, Zhao, M., Hess, BA, Smentek, L., Coates, RM, O'Maille, PE Elucidación estructural de las vías de ciclación cisoide y transoide de una sesquiterpeno sintasa utilizando 2-fluorofarnesil difosfatos. (2010) ACS Biología Química. 5(4):377-92. DOI: 10.1021/cb900295g

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Educación

BS, Química, Universidad de Pittsburgh en Johnstown
PhD, Química y Bioquímica, Universidad Estatal de Ohio
Becario postdoctoral, Universidad de Yale
Becario postdoctoral, Fundación Nacional de Ciencias
Becario postdoctoral, Institutos Nacionales de Salud


Afiliaciones


Premios y honores

  • Miembro de la Asociación Estadounidense para el Avance de la Ciencia, 2012
  • Investigador del Instituto Médico Howard Hughes, 2005
  • Becario de biotecnología de Monsanto, 1989
  • Becario presidencial, 1988