Rusty Gage, doctorado

Profesor

Laboratorio de Genética

Cátedra Vi y John Adler de Investigación sobre Enfermedades Neurodegenerativas Relacionadas con la Edad

Calibrador oxidado
Instituto Salk de Estudios Biológicos - Publicaciones

Publicaciones Seleccionadas


Schafer, ST, Mansour, AA, Schlachetzki, JCM, Pena, M., Ghassemzadeh, S., Mitchell, L., Mar, A., Quang, D., Stumpf, S., Ortiz, IS, Lana, AJ, Baek, C., Zaghal, R., Glass, CK, Nimmerjahn, A., calibre, FH Un modelo de organoide neuroinmune in vivo para estudiar fenotipos de microglía humana. (2023) Cell. 186(10):2111-2126.e20. DOI: 10.1016/j.cell.2023.04.022

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Herdy, JR, Traxler, L., Agarwal, RK, Karbacher, L., Schlachetzki, JCM, Boehnke, L., Zangwill, D., Galasko, D., Glass, CK, Mertens, J., calibre, FH El aumento de la senescencia posmitótica en las neuronas humanas envejecidas es una característica patológica de la enfermedad de Alzheimer. (2022) Célula madre celular. 29(12):1637-1652.e6. DOI: 10.1016/j.stem.2022.11.010

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Marchetto, MC, Hrvoj-Mihic, B., Kerman, BE, Yu, DX, Vadodaria, KC, Linker, SB, Narvaiza, I., Santos, R., Denli, AM, Mendes, AP, Oefner, R., Cook, J., McHenry, L., Grasmick, JM, Heard, K., Fredlender, C., Randolph-Moore, L., Kshirsagar, R., Xenitopoulos, R., Chou, G., Hah, N. , Muotri, AR, Padmanabhan, K., Semendeferi, K., calibre, FH Perfiles de maduración específicos de especie de células neurales humanas, de chimpancé y de bonobo. (2019) Elife. 8. DOI: 10.7554/eLife.37527

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Franks, TM, Benner, C., Narvaiza, I., Marchetto, MC, Young, JM, Malik, HS, calibre, FH, Hetzer, MW Evolución de un regulador transcripcional a partir de una nucleoporina transmembrana. (2016) Genes y desarrollo. 30(10):1155-71. DOI: 10.1101/gad.280941.116

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calibre, FH Neurogénesis adulta en el giro dentado humano. (2025) Hipocampo. 35(1):e23655. DOI: 10.1002/hipo.23655

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Pașca, SP, Arlotta, P., Bateup, HS, Camp, JG, Cappello, S., calibre, FH, Knoblich, JA, Kriegstein, AR, Lancaster, MA, Ming, GL, Novarino, G., Okano, H., Parmar, M., Park, IH, Reiner, O., Song, H., Studer, L., Takahashi, J., Temple, S., Testa, G., Treutlein, B., Vaccarino, FM, Vanderhaeghen, P., Young-Pearse, T. Un marco para estudios de organoides neuronales, ensambleides y trasplantes. (2024) Naturaleza. DOI: 10.1038/s41586-024-08487-6

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Hijo, G., Na, Y., Kim, Y., Hijo, JH, Clemenson, GD, Schafer, ST, Yoo, JY, Parylak, SL, Paquola, A., Do, H., Kim, D., Ahn, I., Ju, M., Kang, CS, Ju, Y., Jung, E., McDonald, AH, Park, Y., Kim, G., Paik, SB, Hur, J., Kim, J ., Han, YM, Lee, SH, calibre, FH, Kim, JS, Han, J. miR-124 coordina los reguladores metabólicos que actúan en las primeras etapas de la neurogénesis humana. (2024) Biología de las Comunicaciones. 7(1):1393. DOI: 10.1038/s42003-024-07089-2

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Minhas, PS, Jones, JR, Latif-Hernandez, A., Sugiura, Y., Durairaj, AS, Wang, Q., Mhatre, SD, Uenaka, T., Crapser, J., Conley, T., Ennerfelt, H., Jung, YJ, Liu, L., Prasad, P., Jenkins, BC, Ay, YA, Matrongolo, M., Goodman, R., Newmeyer, T., Heard, K., Kang, A., Wilson, EN, Yang, T., Ullian, EM, Serrano, GE, Beach, TG, Wernig, M., Rabinowitz, JD, Suematsu, M., Longo, FM, McReynolds, MR, calibre, FH, Andreasson, KI Restaurar el metabolismo de la glucosa en el hipocampo rescata la cognición en las patologías de la enfermedad de Alzheimer. (2024) Ciencia. 385(6711):eabm6131. DOI: 10.1126/ciencia.abm6131

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Schmidt, TT, Tyer, C., Rughani, P., Haggblom, C., Jones, JR, Dai, X., Frazer, KA, calibre, FH, Juul, S., Hickey, S., Karlseder, J. La secuenciación de telómeros de lectura larga de alta resolución revela mecanismos dinámicos en el envejecimiento y el cáncer. (2024) Nature Communications. 15(1):5149. DOI: 10.1038/s41467-024-48917-7

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Phang, HJ, Heimler, SR, Scandalis, LM, Wing, D., Moran, R., Nichols, JF, Moreno, D., Shadel, GS, calibre, FH, Molina, AJA Protocolo para la cohorte clínica del Centro Nathan Shock de San Diego: un nuevo recurso para estudios del envejecimiento humano. (2024) BMJ abierto. 14(6):e082659. DOI: 10.1136/bmjopen-2023-082659

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Herdy, JR, Mertens, J., calibre, FH La senescencia neuronal puede impulsar el envejecimiento cerebral. ENLACE AL TEXTO COMPLETO GRATUITO https://www.science.org/stoken/author-tokens/ST-1962/full [Publicado] (2024) Ciencia. 384(6703):1404-1406. DOI: 10.1126/ciencia.adi3450

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Minhas, PS, Jones, JR, Latif-Hernandez, A., Sugiura, Y., Durairaj, AS, Uenaka, T., Wang, Q., Mhatre, SD, Liu, L., Conley, T., Ennerfelt, H., Jung, YJ, Prasad, P., Jenkins, BC, Goodman, R., Newmeyer, T., Heard, K., Kang, A., Wilson, EN, Ullian, EM, Serrano, GE, Beach, TG, Rabinowitz, JD, Wernig, M., Suematsu, M., Longo, FM, McReynolds, MR, calibre, FH, Andreasson, KI Restaurar el metabolismo de la glucosa en el hipocampo rescata la cognición en las patologías de la enfermedad de Alzheimer. (2024) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2024.06.23.598940

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Stern, S., Zhang, L., Wang, M., Wright, R., Rosh, I., Hussein, Y., Stern, T., Choudhary, A., Tripathi, U., Reed, P., Sadis, H., Nayak, R., Shemen, A., Agarwal, K., Cordeiro, D., Peles, D., Hang, Y., Mendes, APD, Baul, TD, Roth, JG, Coorapati, S ., Boks, MP, McCombie, WR, Hulshoff Pol, H., Brennand, KJ, Réthelyi, JM, Kahn, RS, Marchetto, MC, calibre, FH Los gemelos monocigóticos discordantes en cuanto a esquizofrenia difieren en la maduración y la transmisión sináptica. (2024) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038/s41380-024-02561-1

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Tripathi, U., Rosh, I., Ben Ezer, R., Nayak, R., Hussein, Y., Choudhary, A., Djamus, J., Manole, A., Houlden, H., calibre, FH, popa, s. Genes ECM regulados positivamente y mayor actividad sináptica en neuronas DA humanas con Parkinson con mutaciones PINK1/PRKN. (2024) Enfermedad de Parkinson NPJ. 10(1):103. DOI: 10.1038/s41531-024-00715-0

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Podvin, S., Jones, J., Kang, A., Goodman, R., Reed, P., Lietz, CB, Then, J., Lee, KC, Eyler, LT, Jeste, DV, calibre, FH, Gancho, V. El modelo neuronal iN humano de esquizofrenia muestra una desregulación de la cromogranina B y las firmas de transmisores de neuropéptidos relacionados. (2024) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038 / s41380-024-02422-x

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Toda, T., Bedrosian, TA, Schafer, ST, Cuoco, MS, Linker, SB, Ghassemzadeh, S., Mitchell, L., Whiteley, JT, Novaresi, N., McDonald, AH, Gallina, IS, Yoon, H., Hester, ME, Peña, M., Lim, C., Suljic, E., AlFatah Mansour, A., Boulard, M., Parylak, SL, calibre, FH Los elementos nucleares intercalados durante mucho tiempo protegen a los progenitores neuronales de una diferenciación precoz. (2024) Informes de celda. 43(2):113774. DOI: 10.1016/j.celrep.2024.113774

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Wang, M., Zhang, L., Novak, SW, Yu, J., Gallina, IS, Xu, LL, Lim, CK, Fernandes, S., Shokhirev, MN, Williams, AE, Saxena, MD, Coorapati, S., Parylak, SL, Quintero, C., Molina, E., Andrade, LR, Manor, U., calibre, FH Diversificación morfológica y maduración funcional de astrocitos humanos en organoides corticales enriquecidos en glía trasplantados en cerebro de ratón. (2024) Biotecnología de la naturaleza. DOI: 10.1038/s41587-024-02157-8

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Garrison, MA, Jang, Y., Bae, T., Cherskov, A., Emery, SB, Fasching, L., Jones, A., Moldovan, JB, Molitor, C., Pochareddy, S., Peters, MA , Shin, JH, Wang, Y., Yang, X., Akbarian, S., Chess, A., calibre, FH, Gleeson, JG, Kidd, JM, McConnell, M., Mills, RE, Moran, JV, Park, PJ, Sestan, N., Urban, AE, Vaccarino, FM, Walsh, CA, Weinberger, DR, Wheelan, SJ , Abyzov, A. Recursos de datos genómicos de la Red de Mosaicismo Somático Cerebral para enfermedades neuropsiquiátricas. (2023) Datos de ciencia. 10(1):813. DOI: 10.1038/s41597-023-02645-7

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Manole, A., Wong, T., Rhee, A., Novak, S., Chin, SM, Tsimring, K., Paucar, A., Williams, A., Newmeyer, TF, Schafer, ST, Rosh, I ., Kaushik, S., Hoffman, R., Chen, S., Wang, G., Snyder, M., Cuervo, AM, Andrade, L., Manor, U., Lee, K., Jones, JR, Stern, S., Marchetto, MC, calibre, FH Las mutaciones de NGLY1 provocan agregación de proteínas en las neuronas humanas. (2023) Informes de celda. 42(12):113466. DOI: 10.1016/j.celrep.2023.113466

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Mizrahi, L., Choudhary, A., Ofer, P., Goldberg, G., Milanesi, E., Kelsoe, JR, Gurwitz, D., Alda, M., calibre, FH, popa, s. Los genes de inmunoglobulina expresados ​​en líneas celulares linfoblastoides distinguen y predicen la respuesta al litio en pacientes con trastorno bipolar. (2023) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038 / s41380-023, 02183-z

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Traxler, L., Lucciola, R., Herdy, JR, Jones, JR, Mertens, J., calibre, FH Cambios en el estado de las células neuronales y pérdida del destino en el envejecimiento y las enfermedades relacionadas con la edad. (2023) Nat Rev Neurol. DOI: 10.1038/s41582-023-00815-0

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Schafer, ST, Mansour, AA, Schlachetzki, JCM, Pena, M., Ghassemzadeh, S., Mitchell, L., Mar, A., Quang, D., Stumpf, S., Ortiz, IS, Lana, AJ, Baek, C., Zaghal, R., Glass, CK, Nimmerjahn, A., calibre, FH Un modelo de organoide neuroinmune in vivo para estudiar fenotipos de microglía humana. (2023) Cell. 186(10):2111-2126.e20. DOI: 10.1016/j.cell.2023.04.022

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Mishra, HK, Wei, H., Rohr, KE, Ko, I., Nievergelt, CM, Maihofer, AX, Shilling, PD, Alda, M., Berrettini, WH, Brennand, KJ, Calabrese, JR, Coryell, WH , Frye, M., calibre, f., Gershon, E., McInnis, MG, Nurnberger, J., Oedegaard, KJ, Zandi, PP, Kelsoe, JR, McCarthy, MJ Contribuciones de los genes del reloj circadiano a la supervivencia celular en modelos de fibroblastos del trastorno bipolar sensible al litio. (2023) Eur Neuropsychopharmacol. 74:1-14. DOI: 10.1016/j.euroneuro.2023.04.009

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Kempermann, G., Canción, H., calibre, FH Neurogénesis adulta en el hipocampo. (2023) Hipocampo. DOI: 10.1002/hipo.23525


Niemsiri, V., Rosenthal, SB, Nievergelt, CM, Maihofer, AX, Marchetto, MC, Santos, R., Shekhtman, T., Alliey-Rodriguez, N., Anand, A., Balaraman, Y., Berrettini, WH, Bertram, H., Burdick, KE, Calabrese, JR, Calkin, CV, Conroy, C., Coryell, WH, DeModena, A., Eyler, LT, Feeder, S., Fisher, C., Frazier, N ., Frye, MA, Gao, K., Garnham, J., Gershon, ES, Goes, FS, Goto, T., Harrington, GJ, Jakobsen, P., Kamali, M., Kelly, M., Leckband, SG, Lohoff, FW, McCarthy, MJ, McInnis, MG, Craig, D., Millett, CE, Mondimore, F., Morken, G., Nurnberger, JI, Donovan, CO, Øedegaard, KJ, Ryan, K., Schinagle, M., Shilling, PD, Slaney, C., Stapp, EK, Stautland, A., Tarwater, B., Zandi, PP, Alda, M., Fisch, KM, calibre, FH, Kelsoe, JR La adhesión focal se asocia con la respuesta al litio en el trastorno bipolar: evidencia de un análisis multiómico basado en redes. (2023) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038/s41380-022-01909-9

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Parylak, SL, Qiu, F., Linker, SB, Gallina, IS, Lim, CK, Preciado, D., McDonald, AH, Zhou, X., calibre, FH La transcripción relacionada con la actividad neuronal se atenúa en las células granulares dentadas inmaduras en comparación con las maduras. (2023) Hipocampo. DOI: 10.1002/hipo.23515

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Bermperidis, T., Schafer, S., calibre, FH, Sejnowski, T., Torres, EB El interrogatorio dinámico de las trayectorias del transcriptoma estocástico utilizando genes asociados a enfermedades revela distintos orígenes de trastornos neurológicos y psiquiátricos. (2023) Fronteras en neurociencia. 16:884707. DOI: 10.3389/fnins.2022.884707

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Pérez-García, G., Bicak, M., Haure-Mirande, JV, Pérez, GM, Otero-Pagan, A., Gama Sosa, MA, De Gasperi, R., Sano, M., Barlow, C., calibre, FH, Readhead, B., Ehrlich, ME, Gandy, S., Elder, GA BCI-838, un profármaco antagonista del receptor mGluR2/3 activo por vía oral, rescata los déficits de comportamiento de aprendizaje en el modelo de tauopatía del ratón PS19 MAPT. (2023) Neurosci Lett.:137080 DOI: 10.1016/j.neulet.2023.137080

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Wang, M., calibre, FH, Schafer, ST Estrategias de trasplante para mejorar la madurez y la complejidad celular en organoides cerebrales. (2023) Psiquiatría biológica. DOI: 10.1016 / j.biopsych.2023.01.004

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Herdy, JR, Traxler, L., Agarwal, RK, Karbacher, L., Schlachetzki, JCM, Boehnke, L., Zangwill, D., Galasko, D., Glass, CK, Mertens, J., calibre, FH El aumento de la senescencia posmitótica en las neuronas humanas envejecidas es una característica patológica de la enfermedad de Alzheimer. (2022) Célula madre celular. 29(12):1637-1652.e6. DOI: 10.1016/j.stem.2022.11.010

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Fu, C., Ngo, J., Zhang, S., Lu, L., Miron, A., Schafer, S., calibre, FH, Jin, F., Schumacher, FR, Wynshaw-Boris, A. El nuevo análisis correlativo identifica múltiples variaciones genómicas que afectan a ASD con macrocefalia. (2022) Genética Molecular Humana. DOI: 10.1093/hmg/ddac300

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Wilson, MN, Thunemann, M., Liu, X., Lu, Y., Puppo, F., Adams, JW, Kim, JH, Ramezani, M., Pizzo, DP, Djurovic, S., Andreassen, OA, Mansur, AA, calibre, FH, Muotri, AR, Devor, A., Kuzum, D. El seguimiento multimodal de organoides corticales humanos implantados en ratones revela una conexión funcional con la corteza visual. (2022) Nature Communications. 13(1):7945. DOI: 10.1038/s41467-022-35536-3

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Linker, SB, Narvaiza, I., Hsu, JY, Wang, M., Qiu, F., Mendes, APD, Oefner, R., Kottilil, K., Sharma, A., Randolph-Moore, L., Mejia , E., Santos, R., Marchetto, MC, calibre, FH Regulación específica de humanos de la maduración neuronal identificada por transcriptómica entre primates. (2022) Biología actual. DOI: 10.1016 / j.cub.2022.09.028

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Pașca, SP, Arlotta, P., Bateup, HS, Camp, JG, Cappello, S., calibre, FH, Knoblich, JA, Kriegstein, AR, Lancaster, MA, Ming, GL, Muotri, AR, Park, IH, Reiner, O., Song, H., Studer, L., Temple, S., Testa, G., Treutlein, B., Vaccarino, FM Un consenso de nomenclatura para organoides y assembloids del sistema nervioso. (2022) Naturaleza. 609(7929):907-910. DOI: 10.1038/s41586-022-05219-6

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Stern, S., Lau, S., Manole, A., Rosh, I., Percia, MM, Ben Ezer, R., Shokhirev, MN, Qiu, F., Schafer, S., Mansour, AA, Mangan, KP, Stern, T., Ofer, P., Stern, Y., Diniz Mendes, AP, Djamus, J., Moore, LR, Nayak, R., Laufer, SH, Aicher, A., Rhee, A., Wong, TL, Nguyen, T., Linker, SB, Winner, B., Freitas, BC, Jones, E., Sagi, I., Bardy, C., Brice, A., Winkler, J., Marchetto, MC , calibre, FH Actividad sináptica reducida y vías de matriz extracelular desreguladas en neuronas del cerebro medio de pacientes con enfermedad de Parkinson. (2022) Enfermedad de Parkinson NPJ. 8(1):103. DOI: 10.1038/s41531-022-00366-z

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Traxler, L., Herdy, JR, Stefanoni, D., Eichhorner, S., Pelucchi, S., Szücs, A., Santagostino, A., Kim, Y., Agarwal, RK, Schlachetzki, JCM, Glass, CK , Lagerwall, J., Galasko, D., calibre, FH, D'Alessandro, A., Mertens, J. La transformación metabólica similar a la de Warburg subyace a la degeneración neuronal en la enfermedad de Alzheimer esporádica. (2022) Metabolismo Celular. DOI: 10.1016 / j.cmet.2022.07.014

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van Niekerk, EA, Kawaguchi, R., Marques de Freria, C., Groeniger, K., Marchetto, MC, Dupraz, S., Bradke, F., Geschwind, DH, calibre, FH, Tuszynski, MH Los métodos para cultivar neuronas adultas del SNC revelan un efecto acondicionador del SNC. (2022) Métodos de representación celular. 2(7):100255. DOI: 10.1016/j.crmeth.2022.100255

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Bae, T., Fasching, L., Wang, Y., Shin, JH, Suvakov, M., Jang, Y., Norton, S., Dias, C., Mariani, J., Jourdon, A., Wu , F., Panda, A., Pattni, R., Chahine, Y., Yeh, R., Roberts, RC, Huttner, A., Kleinman, JE, Hyde, TM, Straub, RE, Walsh, CA, , Urban, AE, Leckman, JF, Weinberger, DR, Vaccarino, FM, Abyzov, A., Walsh, CA, Park, PJ, Sestan, N., Weinberger, D., Moran, JV, calibre, FH, Vaccarino, FM, Gleeson, J., Mathern, G., Courchesne, E., Roy, S., Chess, AJ, Akbarian, S., Bizzotto, S., Coulter, M., Dias, C., D 'Gama, A., Ganz, J., Hill, R., Huang, AY, Khoshkhoo, S., Kim, S., Lee, A., Lodato, M., Maury, EA, Miller, M., Borges -Monroy, R., Rodin, R., Zhou, Z., Bohrson, C., Chu, C., Cortes-Ciriano, I., Dou, Y., Galor, A., Gulhan, D., Kwon, M., Luquette, J., Sherman, M., Viswanadham, V., Jones, A., Rosenbluh, C., Cho, S., Langmead, B., Thorpe, J., Erwin, J., Jaffe, A., McConnell, M., Narurkar, R., Paquola, A., Shin, J., Straub, R., Abyzov, A., Bae, T., Jang, Y., Wang, Y., Molitor, C., Peters, M., Linker, S., Reed, P., Wang, M., Urban, A., Zhou, B., Zhu, X., Pattni, R., Serres Amero, A., Juan , D., Lobon, I., Marques-Bonet, T., Solis Moruno, M., Garcia Perez, R., Povolotskaya, I., Soriano, E., Antaki, D., Averbuj, D., Ball, L., Breuss, M., Yang, X., Chung, C., Emery, SB, Flasch, DA, Kidd, JM, Kopera, HC, Kwan, KY, Mills, RE, Moldovan, JB, Sun, C. , Zhao, X., Zhou, W., Frisbie, TJ, Cherskov, A., Fasching, L., Jourdon, A., Pochareddy, S., Scuderi, S. El análisis de mutaciones somáticas en 131 cerebros humanos revela hipermutabilidad asociada con el envejecimiento. (2022) Ciencia. 377(6605):511-517. DOI: 10.1126/ciencia.abm6222

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Heard, KJ, Shokhirev, MN, Becronis, C., Fredlender, C., Zahid, N., Le, AT, Ji, Y., Skime, M., Nelson, T., Hall-Flavin, D., Weinshilboum , r, calibre, FH, Vadodaria, KC El cortisol crónico afecta diferencialmente a los astrocitos derivados de células madre de pacientes con trastorno depresivo mayor. (2021) Transl Psiquiatría. 11(1):608. DOI: 10.1038/s41398-021-01733-9

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Gorbunova, V., Seluanov, A., Mita, P., McKerrow, W., Fenyö, D., Boeke, JD, Linker, SB, calibre, FH, Kreiling, JA, Petrashen, AP, Woodham, TA, Taylor, JR, Helfand, SL, Sedivy, JM El papel de los elementos retrotransponibles en el envejecimiento y las enfermedades asociadas a la edad. https://rdcu.be/ct1i3 Texto completo proporcionado por la iniciativa de intercambio de contenido Springer Nature SharedIt [Publicado] (2021) Naturaleza. 596(7870):43-53. DOI: 10.1038/s41586-021-03542-y

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Shadel, GS, Adams, PD, Berggren, WT, Diedrich, JK, Diffenderfer, KE, calibre, FH, Hah, N., Hansen, M., Hetzer, MW, Molina, AJA, Manor, U., Marek, K., O'Keefe, DD, Pinto, AFM, Sacco, A., Sharpee, TO, Shokriev, MN, Zambetti, S. El Nathan Shock Center de San Diego: abordar la heterogeneidad del envejecimiento. (2021) Gerociencia. DOI: 10.1007 / s11357-021-00426-x

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Johnston, S., Parylak, S., Kim, S., Mac, N., Lim, C., Gallina, I., Bloyd, C., Newberry, A., Saavedra, CD, Novak, O., Goncalves , JT, calibre, FH, Shtrahman, M. AAV elimina la neurogénesis en el hipocampo murino adulto. (2021) Elife. 10. DOI: 10.7554/eLife.59291

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