Centro de Biofotónica Avanzada de Waitt

Investigación

Instituto Salk de Estudios Biológicos - Centro de Biofotónica Avanzada Waitt - Investigación

PUBLICACIONES 2018


Huang, T., Lin, SH, Malewicz, NM, Zhang, Y., Zhang, Y., Goulding, M., LaMotte, RH, Ma, Q. Identificar las vías requeridas para los comportamientos de afrontamiento asociados con el dolor sostenido. (2018) Naturaleza. 565(7737):86-90. DOI: 10.1038/s41586-018-0793-8

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Toyama, BH, Arrojo E Drigo, R., Lev-Ram, V., Ramachandra, R., Deerinck, TJ, Lechene, C., Ellisman, MH, Hetzer, MW La visualización de proteínas de larga vida revela un mosaico de la edad dentro de los núcleos de las células posmitóticas. (2018) Revista de Biología Celular. DOI: 10.1083/jcb.201809123

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Fleischer, JG, Schulte, R., Tsai, HH, Tyagi, S., Ibarra, A., Shokhirev, MN, Huang, L., Hetzer, MW, Navlakha, S. Predicción de la edad a partir del transcriptoma de fibroblastos dérmicos humanos. (2018) Biología del genoma. 19(1):221. DOI: 10.1186/s13059-018-1599-6

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Kim, Y., Vadodaria, KC, Lenkei, Z., Kato, T., Gage, FH, Marchetto, MC, Santos, R. MITOCONDRIA, METABOLISMO Y MECANISMOS REDOX EN TRASTORNOS PSIQUIÁTRICOS. (2018) Antioxidantes y Señalización Redox. DOI: 10.1089/ar.2018.7606

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McCarthy, MJ, Wei, H., Nievergelt, CM, Stautland, A., Maihofer, AX, Welsh, DK, Shilling, P., Alda, M., Alliey-Rodriguez, N., Anand, A., Andreasson, OA, Balaraman, Y., Berrettini, WH, Bertram, H., Brennand, KJ, Calabrese, JR, Calkin, CV, Claasen, A., Conroy, C., Coryell, WH, Craig, DW, D'Arcangelo, N., Demodena, A., Djurovic, S., Feeder, S., Fisher, C., Frazier, N., Frye, MA, Gage, FH, Gao, K., Garnham, J., Gershon, ES, Glazer, K., Goes, F., Goto, T., Harrington, G., Jakobsen, P., Kamali, M., Karberg, E., Kelly, M., Leckband, SG, Lohoff, F., McInnis , MG, Mondimore, F., Morken, G., Nurnberger, JI, Obral, S., Oedegaard, KJ, Ortiz, A., Ritchey, M., Ryan, K., Schinagle, M., Schoeyen, H. , Schwebel, C., Shaw, M., Shekhtman, T., Slaney, C., Stapp, E., Szelinger, S., Tarwater, B., Zandi, PP, Kelsoe, JR El cronotipo y los ritmos circadianos celulares predicen la respuesta clínica al tratamiento de mantenimiento con litio en pacientes con trastorno bipolar. (2018) Neuropsicofarmacología. DOI: 10.1038/s41386-018-0273-8

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Suh, H., Zhou, QG, Fernandez-Carasa, I., Clemenson, GD, Pons-Espinal, M., Ro, EJ, Marti, M., Raya, A., Gage, FH, Consiglio, A. Etiquetado a largo plazo de células madre neurales del hipocampo mediante un vector lentiviral. (2018) Fronteras en neurociencia molecular. 11:415. DOI: 10.3389/fnmol.2018.00415

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Buchwalter, A., Kaneshiro, JM, Hetzer, MW Entrenamiento desde el margen: la periferia nuclear en la regulación del genoma. (2018) Nature Reviews Genética. DOI: 10.1038/s41576-018-0063-5

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Dhande, OS, Stafford, BK, Franke, K., El-Danaf, R., Percival, KA, Phan, AH, Li, P., Hansen, BJ, Nguyen, PL, Berens, P., Taylor, WR, Callaway, E., Euler, T., Huberman, AD Huella digital molecular de células ganglionares retinianas selectivas en la dirección de encendido y apagado en todas las especies y relevancia para los circuitos visuales de los primates. (2018) Journal of Neuroscience. DOI: 10.1523 / JNEUROSCI.1784-18.2018

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Kuhn, HG, Toda, T., Gage, FH Neurogénesis del hipocampo en adultos: una historia sobre la mayoría de edad. (2018) Journal of Neuroscience. DOI: 10.1523 / JNEUROSCI.2144-18.2018

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Reddy, G., Wong-Ng, J., Celani, A., Sejnowski, TJ, Vergassola, M. Planeador volando a través del aprendizaje de refuerzo en el campo. (2018) Naturaleza. DOI: 10.1038/s41586-018-0533-0

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Eftekharzadeh, B., Daigle, JG, Kapinos, LE, Coyne, A., Schiantarelli, J., Carlomagno, Y., Cook, C., Miller, SJ, Dujardin, S., Amaral, AS, Grima, JC, Bennett, RE, Tepper, K., DeTure, M., Vanderburgh, CR, Corjuc, BT, DeVos, SL, Gonzalez, JA, Chew, J., Vidensky, S., Gage, FH, Mertens, J., Troncoso , J., Mandelkow, E., Salvatella, X., Lim, RYH, Petrucelli, L., Wegmann, S., Rothstein, JD, Hyman, BT La proteína tau interrumpe el transporte nucleocitoplasmático en la enfermedad de Alzheimer. (2018) Neuron. 99(5):925-940.e7. DOI: 10.1016/j.neuron.2018.07.039

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Choi, SH, Bylykbashi, E., Chatila, ZK, Lee, SW, Pulli, B., Clemenson, GD, Kim, E., Rompala, A., Oram, MK, Asselin, C., Aronson, J., Zhang, C., Miller, SJ, Lesinski, A., Chen, JW, Kim, DY, van Praag, H., Spiegelman, BM, Gage, FH, Tanzi, RE La neurogénesis adulta combinada y el BDNF imitan los efectos del ejercicio sobre la cognición en un modelo de ratón con Alzheimer. (2018) Ciencia. 361 (6406). DOI: 10.1126/ciencia.aan8821

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Mertens, J., Reid, D., Lau, S., Kim, Y., Gage, FH Envejecimiento en un plato: neuronas derivadas de iPSC e inducidas directamente para estudiar el envejecimiento cerebral y las enfermedades neurodegenerativas relacionadas con la edad. (2018) Revisión Anual de Genética. 52:271-293. DOI: 10.1146/annurev-genet-120417-031534

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McCloskey, A., Ibarra, A., Hetzer, MW Tpr regula el número total de complejos de poros nucleares por núcleo celular. (2018) Genes y desarrollo. 32:1321-1331. DOI: 10.1101/gad.315523.118

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Sejnowski, T. El profeta que predijo nuestro futuro. (2018) Cerebro: una revista de neurología. 141(9):2820-2822. DOI: 10.1093/cerebro/awy212


Jaeger, BN, Linker, SB, Parylak, SL, Barron, JJ, Gallina, IS, Saavedra, CD, Fitzpatrick, C., Lim, CK, Schafer, ST, Lacar, B., Jessberger, S., Gage, FH Una nueva firma transcripcional evocada por el entorno predice la reactividad en neuronas de gránulos dentados únicos. (2018) Nature Communications. 9(1):3084. DOI: 10.1038/s41467-018-05418-8

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Zhang, Y., Liu, S., Zhang, YQ, Goulding, M., Wang, YQ, Ma, Q. Mecanismos de temporización subyacentes al control de puerta por inhibición de avance. (2018) Neuron. 99(5):941-955.e4. DOI: 10.1016/j.neuron.2018.07.026

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van den Hurk, M., Erwin, JA, Yeo, GW, Gage, FH, Bardy, C. Protocolo Patch-Seq para analizar la electrofisiología, la morfología y el transcriptoma de neuronas individuales completas derivadas de células madre pluripotentes humanas. (2018) Fronteras en neurociencia molecular. 11:261. DOI: 10.3389/fnmol.2018.00261

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Zhou, Y., Smith, BH, Sharpee, TO Geometría hiperbólica del espacio olfativo. (2018) Avances de la ciencia. 4(8):eaaq1458. DOI: 10.1126/sciadv.aaq1458

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Sommer, A., Maxreiter, F., Krach, F., Fadler, T., Grosch, J., Maroni, M., Graef, D., Eberhardt, E., Riemenschneider, MJ, Yeo, GW, Kohl, Z., Xiang, W., Gage, FH, Winkler, J., Prots, I., Winner, B. Los linfocitos Th17 inducen la muerte de células neuronales en un modelo humano de enfermedad de Parkinson basado en iPSC. (2018) Célula madre celular. 23(1):123-131.e6. DOI: 10.1016/j.stem.2018.06.015

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Linker, SB, Hsu, JY, Pfaff, A., Amatya, D., Ko, SM, Voter, S., Wong, Q., Gage, FH BrainImageR: análisis de conjuntos de genes espaciotemporales que hacen referencia al cerebro humano. (2018) Bioinformática. DOI: 10.1093/bioinformática/bty618

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Ernst, OK, Bartol, T., Sejnowski, T., Mjolsness, E. Aprendizaje de distribuciones dinámicas de Boltzmann como modelos reducidos de cinética química espacial. (2018) J Química Física. 149 (3): 034107. DOI: 10.1063/1.5026403

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Haas, KT, Compans, B., Letellier, M., Bartol, TM, Grillo-Bosch, D., Sejnowski, TJ, Sainlos, M., Choquet, D., Thoumine, O., Hosy, E. La alineación sináptica pre-post a través de neuroligina-1 sintoniza la eficiencia de transmisión sináptica. (2018) Elife. 7. DOI: 10.7554/eLife.31755

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Siddharth, Jung, TP, Sejnowski, TJ Enfoque multimodal para la computación afectiva. (2018) Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc. 2018:291-294. DOI: 10.1109/EMBC.2018.8512320

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Kronenberg, ZN, Fiddes, IT, Gordon, D., Murali, S., Cantsilieris, S., Meyerson, OS, Underwood, JG, Nelson, BJ, Chaisson, MJP, Dougherty, ML, Munson, KM, Hastie, AR , Diekhans, M., Hormozdiari, F., Lorusso, N., Hoekzema, K., Qiu, R., Clark, K., Raja, A., Welch, AE, Sorensen, M., Baker, C., Fulton, RS, Armstrong, J., Graves-Lindsay, TA, Denli, AM, Hoppe, ER, Hsieh, P., Hill, CM, Pang, AWC, Lee, J., Lam, ET, Dutcher, SK, Gage , FH, Warren, WC, Shendure, J., Haussler, D., Schneider, VA, Cao, H., Ventura, M., Wilson, RK, Paten, B., Pollen, A., Eichler, EE Análisis comparativo de alta resolución de genomas de grandes simios. (2018) Ciencia. 360 (6393). DOI: 10.1126/ciencia.aar6343

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Krishnan, GP, Rosen, BQ, Chen, JY, Muller, L., Sejnowski, TJ, Cash, SS, Halgren, E., Bazhenov, M. La conectividad laminar talamocortical e intracortical determina las propiedades del huso del sueño. (2018) PLOS Biología Computacional. 14(6):e1006171. DOI: 10.1371/diario.pcbi.1006171

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Ueno, M., Nakamura, Y., Li, J., Gu, Z., Niehaus, J., Maezawa, M., Crone, SA, Goulding, M., Baccei, ML, Yoshida, Y. Los circuitos corticoespinales de las cortezas sensorial y motora regulan de manera diferencial los movimientos especializados a través de distintas interneuronas espinales. (2018) Informes de celda. 23(5):1286-1300.e7. DOI: 10.1016/j.celrep.2018.03.137

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Sarkar, A., Mei, A., Paquola, ACM, Stern, S., Bardy, C., Klug, JR, Kim, S., Neshat, N., Kim, HJ, Ku, M., Shokhirev, MN , Adamowicz, DH, Marchetto, MC, Jappelli, R., Erwin, JA, Padmanabhan, K., Shtrahman, M., Jin, X., Gage, FH La generación eficiente de neuronas CA3 a partir de células madre pluripotentes humanas permite modelar la conectividad del hipocampo in vitro. (2018) Célula madre celular. 22(5):684-697.e9. DOI: 10.1016/j.stem.2018.04.009

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Strnadel, J., Carromeu, C., Bardy, C., Navarro, M., Platoshyn, O., Glud, AN, Marsala, S., Kafka, J., Miyanohara, A., Kato, T., Tadokoro , T., Hefferan, MP, Kamizato, K., Yoshizumi, T., Juhas, S., Juhasova, J., Ho, CS, Kheradmand, T., Chen, P., Bohaciakova, D., Hruska-Plochan , M., Todd, AJ, Driscoll, SP, Glenn, TD, Pfaff, SL, Klima, J., Ciacci, J., Curtis, E., Gage, FH, Bui, J., Yamada, K., Muotri , AR, Marsala, M. Supervivencia de precursores neurales derivados de iPSC singénicos y alogénicos después del injerto espinal en minipigs. (2018) Ciencia Translational Medicine. 10(440). DOI: 10.1126/scitranslmed.aam6651

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Stern, S., Linker, S., Vadodaria, KC, Marchetto, MC, Gage, FH Predicción de la respuesta al tratamiento farmacológico en trastornos psiquiátricos. (2018) Biología Abierta. 8(5). DOI: 10.1098/rsob.180031

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Kim, Y., Zheng, X., Ansari, Z., Bunnell, MC, Herdy, JR, Traxler, L., Lee, H., Paquola, ACM, Blithikioti, C., Ku, M., Schlachetzki, JCM , Winkler, J., Edenhofer, F., Glass, CK, Paucar, AA, Jaeger, BN, Pham, S., Boyer, L., Campbell, BC, Hunter, T., Mertens, J., Gage, FH Los defectos del envejecimiento mitocondrial surgen en las neuronas humanas reprogramadas directamente debido a su perfil metabólico. (2018) Informes de celda. 23(9):2550-2558. DOI: 10.1016/j.celrep.2018.04.105

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Patriarchi, T., Cho, JR, Merten, K., Howe, MW, Marley, A., Xiong, WH, Folk, RW, Broussard, GJ, Liang, R., Jang, MJ, Zhong, H., Dombeck , D., von Zastrow, M., Nimmerjahn, A., Gradinaru, V., Williams, JT, Tian, ​​L. Imágenes neuronales ultrarrápidas de la dinámica de la dopamina con sensores diseñados genéticamente codificados. (2018) Ciencia. DOI: 10.1126/ciencia.aat4422

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Mansour, AA, Gonçalves, JT, Bloyd, CW, Li, H., Fernandes, S., Quang, D., Johnston, S., Parylak, SL, Jin, X., Gage, FH Un modelo in vivo de organoides cerebrales humanos funcionales y vascularizados. (2018) Biotecnología de la naturaleza. DOI: 10.1038/nbt.4127

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Luo, L., Callaway, EM, Svoboda, K. Disección genética de circuitos neuronales: una década de progreso. (2018) Neuron. 98(2):256-281. DOI: 10.1016/j.neurona.2018.03.040

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Toda, T., Parylak, SL, Linker, SB, Gage, FH El papel de la neurogénesis del hipocampo adulto en la salud y la enfermedad del cerebro. (2018) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038/s41380-018-0036-2

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Kempermann, G., Gage, FH, Aigner, L., Song, H., Curtis, MA, Thuret, S., Kuhn, HG, Jessberger, S., Frankland, PW, Cameron, HA, Gould, E., Hen, R., Abrous, DN, Toni, N., Schinder, AF, Zhao, X., Lucassen, PJ, Frisén, J. Neurogénesis humana adulta: evidencia y preguntas pendientes. (2018) Célula madre celular. DOI: 10.1016 / j.stem.2018.04.004

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Ruiz-Martínez, , Bartol, TM, Sejnowski, TJ, Tartakovsky, DM Modelos eficientes de polimerización aplicados al ensamble de anillos FtsZ en . (2018) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. DOI: 10.1073 / pnas.1719391115

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Moldakarimov, S., Bazhenov, M., Feldman, DE, Sejnowski, TJ Las redes estructuradas admiten ondas viajeras escasas en la corteza somatosensorial de roedores. (2018) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. DOI: 10.1073 / pnas.1710202115

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Wang, X., Pinto-Duarte, A., Behrens, MM, Zhou, X., Sejnowski, TJ La ketamina moduló de forma independiente la potencia y el acoplamiento de fase de las oscilaciones theta en ratones hipomórficos Sp4. (2018) Más uno. 13(3):e0193446. DOI: 10.1371/journal.pone.0193446

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Mo, Z., Zhao, X., Liu, H., Hu, Q., Chen, XQ, Pham, J., Wei, N., Liu, Z., Zhou, J., Burgess, RW, Pfaff, SL, Caskey, CT, Wu, C., Bai, G., Yang, XL Interacción aberrante GlyRS-HDAC6 vinculada a déficits de transporte axonal en la neuropatía de Charcot-Marie-Tooth. (2018) Nature Communications. 9(1):1007. DOI: 10.1038/s41467-018-03461-z

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Gatto, G., Goulding, M. Control de la locomoción: los circuitos del tronco encefálico satisfacen la necesidad de velocidad. (2018) Biología actual. 28(6):R256-R259. DOI: 10.1016/j.cub.2018.01.068

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Muller, L., Chavane, F., Reynolds, J., Sejnowski, TJ Ondas viajeras corticales: mecanismos y principios computacionales. (2018) Nature Reviews Neuroscience. DOI: 10.1038/nr.2018.20

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Bedrosian, TA, Quayle, C., Novaresi, N., Gage, FH La experiencia de vida temprana impulsa la variación estructural de los genomas neuronales en ratones. (2018) Ciencia. 359(6382):1395-1399. DOI: 10.1126/ciencia.aah3378

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Zhang, Y., Kastner, DB, Baccus, SA, Sharpee, TO Transmisión de información óptima mediante la superposición de mosaicos de células retinales. (2018) Proc Conf Inf Sci Sist. 2018. DOI: 10.1109/ciss.2018.8362310

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Zheng, Y., Shen, W., Zhang, J., Yang, B., Liu, YN, Qi, H., Yu, X., Lu, SY, Chen, Y., Xu, YZ, Li, Y ., Gage, FH, Mi, S., Yao, J. Inactivación de genes específica y eficiente basada en la interferencia CRISPR en el cerebro. (2018) Neurociencia de la naturaleza. DOI: 10.1038/s41593-018-0077-5

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Kaya, C., Cheng, MH, Block, ER, Bartol, TM, Sejnowski, TJ, Sorkin, A., Faeder, JR, Bahar, I. Las heterogeneidades en la estructura axonal y la distribución del transportador reducen la eficiencia de la recaptación de dopamina. (2018) eNeuro. 5(1). DOI: 10.1523/ENEURO.0298-17.2017

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Bromer, C., Bartol, TM, Bowden, JB, Hubbard, DD, Hanka, DC, González, PV, Kuwajima, M., Mendenhall, JM, Parker, PH, Abraham, WC, Sejnowski, TJ, Harris, KM La potenciación a largo plazo amplía el contenido de información de las sinapsis del giro dentado del hipocampo. (2018) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. DOI: 10.1073 / pnas.1716189115

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Vadodaria, KC, Amatya, DN, Marchetto, MC, Gage, FH Modelado de trastornos psiquiátricos utilizando neuronas derivadas de células madre de pacientes: un camino a seguir. (2018) Medicina Genómica. 10(1):1. DOI: 10.1186/s13073-017-0512-3

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Wang, M., Él, Y., Sejnowski, TJ, Yu, X. Las señales astrocíticas de Ca2+ dependientes del estado cerebral se acoplan a señales BOLD-fMRI tanto positivas como negativas. (2018) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. DOI: 10.1073 / pnas.1711692115

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Hayashi, M., Hinckley, CA, Driscoll, SP, Moore, NJ, Levine, AJ, Hilde, KL, Sharma, K., Pfaff, SL Matrices graduadas de subtipos de interneuronas espinales y supraespinales V2a subyacen al control motor de las extremidades anteriores y posteriores. (2018) Neuron. DOI: 10.1016 / j.neuron.2018.01.023

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Sharpee, TO (2018) Enciclopedias de investigación de Oxford, Neurociencia.:1-23 DOI: doi.org/10.1093/acrefore/9780190264086.013.110

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