Centro de Biofotónica Avanzada de Waitt

Investigación

Instituto Salk de Estudios Biológicos - Centro de Biofotónica Avanzada Waitt - Investigación

PUBLICACIONES 2017


Koch, SC, Del Barrio, MG, Dalet, A., Gatto, G., Günther, T., Zhang, J., Seidler, B., Saur, D., Schüle, R., Goulding, M. Las interneuronas espinales RORβ bloquean la transmisión sensorial durante la locomoción para asegurar una marcha fluida al caminar. (2017) Neuron. DOI: 10.1016 / j.neuron.2017.11.011

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Franks, TM, McCloskey, A., Shokirev, M., Benner, C., Rathore, A., Hetzer, MW Nup98 recluta el complejo Wdr82-Set1A/COMPASS a los promotores para regular la trimetilación de H3K4 en las células progenitoras hematopoyéticas. (2017) Genes y desarrollo. 31(22):2222-2234. DOI: 10.1101/gad.306753.117

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Jaeger, BN, Parylak, SL, Gage, FH Mecanismos de acción de los flavonoides dietéticos en la función neuronal y la neuroinflamación. (2017) Aspectos Moleculares de la Medicina. DOI: 10.1016/j.mam.2017.11.003

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Callaway, EM, Garg, Alaska Tecnología cerebral: Neuronas grabadas en masa. (2017) Naturaleza. 551(7679):172-173. DOI: 10.1038/551172a


Toda, T., Gage, FH Revisión: la neurogénesis adulta contribuye a la plasticidad del hipocampo. (2017) Investigación de células y tejidos. DOI: 10.1007/s00441-017-2735-4

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Curchoe, CL, Manor, U. Constricción de orgánulos de membrana mediada por el citoesqueleto de actina a través del andamiaje del retículo endoplásmico. (2017) ACS Biomater Sci Ing. 3(11):2727-2732. DOI: 10.1021/acsbiomaterials.6b00802

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O'Donnell, C., Gonçalves, JT, Portera-Cailliau, C., Sejnowski, TJ Más allá del desequilibrio de excitación/inhibición en modelos multidimensionales de cambios en el circuito neuronal en trastornos cerebrales. (2017) Elife. 6. DOI: 10.7554/eLife.26724

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Snijders, C., de Nijs, L., Baker, DG, Hauger, RL, van den Hove, D., Kenis, G., Nievergelt, CM, Boks, MP, Vermetten, E., Gage, FH, Rutten, BPF MicroRNAs en el Trastorno de Estrés Postraumático. (2017) Temas Actuales en Neurociencias del Comportamiento. DOI: 10.1007/7854_2017_32

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Atencio, CA, Sharpee, TO Procesamiento de campo receptivo multidimensional por neuronas corticales auditivas primarias de gato. (2017) Neurociencia. 359:130-141. DOI: 10.1016/j.neurociencia.2017.07.003

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Topol, A., Zhu, S., Hartley, BJ, English, J., Hauberg, ME, Tran, N., Rittenhouse, CA, Simone, A., Ruderfer, DM, Johnson, J., Readhead, B. , Hadas, Y., Gochman, PA, Wang, YC, Shah, H., Cagney, G., Rapoport, J., Gage, FH, Dudley, JT, Sklar, P., Mattheisen, M., Cotter, D ., Colmillo, G., Brennand, KJ Desregulación de miRNA-9 en un subconjunto de células progenitoras neurales derivadas de pacientes con esquizofrenia. (2017) Informes de celda. 20(10):2525. DOI: 10.1016/j.celrep.2017.08.073


Wu, J., Capelli, P., Bouvier, J., Goulding, M., Arber, S., Fortin, G. Un circuito neuronal de núcleo V0 para la inspiración. (2017) Nature Communications. 8(1):544. DOI: 10.1038/s41467-017-00589-2

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Toda, T., Hsu, JY, Linker, SB, Hu, L., Schafer, ST, Mertens, J., Jacinto, FV, Hetzer, MW, Gage, FH Nup153 interactúa con Sox2 para habilitar la regulación génica bimodal y el mantenimiento de las células progenitoras neurales. (2017) Célula madre celular. 21:618–634. DOI: 10.1016/j.tallo.2017.08.012

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Shahsavani, M., Pronk, RJ, Falk, R., Lam, M., Moslem, M., Linker, SB, Salma, J., Day, K., Schuster, J., Anderlid, BM, Dahl, N ., Gage, FH, Falk, A. Un modelo in vitro de lisencefalia: ampliando el papel de DCX durante la neurogénesis. (2017) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038 / mp.2017.175

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Koch, SC, Acton, D., Goulding, M. Circuitos espinales para el tacto, el dolor y la picazón. (2017) Revisión anual de fisiología. DOI: 10.1146/annurev-fisiol-022516-034303

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Sharpee, TO Sobre la textura, la forma y los movimientos oculares de fijación. (2017) Opinión actual en neurobiología. 46:228-233. DOI: 10.1016/j.conb.2017.09.002

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Li, Y., Wang, F., Chen, Y., Cichocki, A., Sejnowski, T. Los efectos de las entradas audiovisuales para resolver el problema del cóctel en el cerebro humano: un estudio de fMRI. (2017) Corteza cerebral .:1-15 DOI: 10.1093/cerca/bhx235

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Buchwalter, A., Hetzer, MW Expansión nucleolar y traducción elevada de proteínas en el envejecimiento prematuro. (2017) Nature Communications. 8(1):328. DOI: 10.1038/s41467-017-00322-z

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Holter, KE, Kehlet, B., Devor, A., Sejnowski, TJ, Dale, AM, Omholt, SW, Ottersen, OP, Nagelhus, EA, Mardal, KA, Pettersen, KH El transporte intersticial de solutos en el neuropilo reconstruido en 3D se produce por difusión en lugar de por flujo masivo. (2017) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. DOI: 10.1073 / pnas.1706942114

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Vadodaria, KC, Stern, S., Marchetto, MC, Gage, FH Serotonina en psiquiatría: modelado de enfermedades in vitro utilizando neuronas derivadas de pacientes. (2017) Investigación de células y tejidos. DOI: 10.1007/s00441-017-2670-4

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Linker, SB, Marchetto, MC, Narvaiza, I., Denli, AM, Gage, FH Examen de retrotransposones no LTR en el contexto del cerebro de primates en evolución. (2017) BMC Biología. 15(1):68. DOI: 10.1186/s12915-017-0409-z

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Luo, C., Keown, CL, Kurihara, L., Zhou, J., He, Y., Li, J., Castanon, R., Lucero, J., Nery, JR, Sandoval, JP, Bui, B ., Sejnowski, TJ, Harkins, TT, Mukamel, EA*, Behrens, MM*, Ecker, JR* Los metilomas unicelulares identifican subtipos neuronales y elementos reguladores en la corteza de los mamíferos. (2017) Ciencia. 357(6351):600-604. DOI: 10.1126/ciencia.aan3351

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Graydon, CW, Manor, U., Kindt, KS Movilidad de la cinta in vivo y rotación de chuletón en las sinapsis de células ciliadas de pez cebra. (2017) Informes Científicos. 7(1):7467. DOI: 10.1038/s41598-017-07940-z

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Lainscsek, C., Weyhenmeyer, J., Cash, SS, Sejnowski, TJ Análisis diferencial de retardo de convulsiones en datos de electrocorticografía multicanal. (2017) Computación neuronal.:1-38 DOI: 10.1162/neco_a_01009

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Lin, TW, Das, A., Krishnan, GP, Bazhenov, M., Sejnowski, TJ Covarianza diferencial: una nueva clase de métodos para estimar la conectividad dispersa a partir de grabaciones neuronales. (2017) Computación neuronal.:1-52 DOI: 10.1162/neco_a_01008

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Kaardal, JT, Theunissen, FE, Sharpee, TO Un método de bajo rango para caracterizar cálculos neuronales de alto nivel. (2017) Fronteras en Neurociencia Computacional. 11:68. DOI: 10.3389/fncom.2017.00068

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Newkirk, SJ, Lee, S., Grandi, FC, Gaysinskaya, V., Rosser, JM, Vanden Berg, N., Hogarth, CA, Marchetto, MCN, Muotri, AR, Griswold, MD, Ye, P., Bortvin , A., Gage, FH, Boeke, JD, An, W. La vía piRNA intacta previene la movilización de L1 en la meiosis masculina. (2017) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 114(28):E5635-E5644. DOI: 10.1073/pnas.1701069114

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Lainscsek, C., Muller, LE, Sampson, AL, Sejnowski, TJ Derivación analítica de efectos espectrales no lineales y artefactos de escala 1/f en el procesamiento de señales de datos del mundo real. (2017) Computación neuronal. 29(7):2004-2020. DOI: 10.1162/NECO_a_00979

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Veit, J., Hakim, R., Jadi, MP, Sejnowski, TJ, Adesnik, H. Sincronización de la banda gamma cortical a través de interneuronas de somatostatina. (2017) Neurociencia de la naturaleza. 20(7):951-959. DOI: 10.1038/nn.4562

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Hurtado-López, J., Ramírez-Moreno, DF, Sejnowski, TJ Circuitos neuronales de toma de decisiones que median comportamientos sociales: un modelo de red de atracción. (2017) Revista de Neurociencia Computacional. DOI: 10.1007/s10827-017-0654-8

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Sharpee, TO Optimización de la capacidad de información neuronal a través de la discretización. (2017) Neuron. 94(5):954-960. DOI: 10.1016/j.neurona.2017.04.044

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Rowekamp, ​​RJ, Sharpee, TO Supresión de orientación cruzada en el área visual V2. (2017) Nature Communications. 8:15739. DOI: 10.1038/ncomms15739

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Santos, R., Vadodaria, KC, Jaeger, BN, Mei, A., Lefcochilos-Fogelquist, S., Mendes, APD, Erikson, G., Shokhirev, M., Randolph-Moore, L., Fredlender, C. , Dave, S., Oefner, R., Fitzpatrick, C., Pena, M., Barron, JJ, Ku, M., Denli, AM, Kerman, BE, Charnay, P., Kelsoe, JR, Marchetto, MC , calibre, FH Diferenciación de astrocitos sensibles a la inflamación a partir de progenitores gliales generados a partir de células madre pluripotentes inducidas por humanos. (2017) Informes de células madre. 8(6):1757-1769. DOI: 10.1016/j.stemcr.2017.05.011

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Gosselin, D., Skola, D., Coufal, NG, Holtman, IR, Schlachetzki, JCM, Sajti, E., Jaeger, BN, O'Connor, C., Fitzpatrick, C., Pasillas, MP, Pena, M ., Adair, A., Gonda, DD, Levy, ML, Ransohoff, RM, Gage, FH, Glass, CK Una red transcripcional dependiente del entorno especifica la identidad de la microglía humana. (2017) Ciencia. 356 (6344). DOI: 10.1126/ciencia.aal3222

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Cheng, L., Duan, B., Huang, T., Zhang, Y., Chen, Y., Britz, O., Garcia-Campmany, L., Ren, X., Vong, L., Lowell, BB , Goulding, M., Wang, Y., Ma, Q. Identificación de circuitos espinales implicados en el dolor mecánico dinámico provocado por el tacto. (2017) Neurociencia de la naturaleza. 20(6):804-814. DOI: 10.1038/nn.4549

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Marchetto, MC, Belinson, H., Tian, ​​Y., Freitas, BC, Fu, C., Vadodaria, K., Beltrao-Braga, P., Trujillo, CA, Mendes, APD, Padmanabhan, K., Nunez, Y., Ou, J., Ghosh, H., Wright, R., Brennand, K., Pierce, K., Eichenfield, L., Pramparo, T., Eyler, L., Barnes, CC, Courchesne, E ., Geschwind, DH, Gage, FH, Wynshaw-Boris, A., Muotri, AR Proliferación y redes alteradas en células neuronales derivadas de individuos autistas idiopáticos. (2017) Psiquiatría Molecular. 22(6):820-835. DOI: 10.1038/mp.2016.95

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Ishii, S., Torii, M., Son, AI, Rajendraprasad, M., Morozov, YM, Kawasawa, YI, Salzberg, AC, Fujimoto, M., Brennand, K., Nakai, A., Mezger, V. , Gage, FH, Rakic, P., Hashimoto-Torii, K. Las variaciones en los defectos cerebrales resultan del mosaicismo celular en la activación de la señalización del choque térmico. (2017) Nature Communications. 8:15157. DOI: 10.1038/ncomms15157

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McConnell, MJ, Moran, JV, Abyzov, A., Akbarian, S., Bae, T., Cortes-Ciriano, I., Erwin, JA, Fasching, L., Flasch, DA, Freed, D., Ganz, J., Jaffe, AE, Kwan, KY, Kwon, M., Lodato, MA, Mills, RE, Paquola, ACM, Rodin, RE, Rosenbluh, C., Sestan, N., Sherman, MA, Shin, JH, Song, S., Straub, RE, Thorpe, J., Weinberger, DR, Urban, AE, Zhou, B., Gage, FH, Lehner, T., Senthil, G., Walsh, CA, Chess, A., Courchesne, E., Gleeson, JG, Kidd, JM, Park, PJ, Pevsner, J., Vaccarino, FM Intersección de diversos genomas neuronales y enfermedad neuropsiquiátrica: The Brain Somatic Mosaicism Network. (2017) Ciencia. 356 (6336). DOI: 10.1126/ciencia.aal1641

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Peterson, DA, Sejnowski, TJ Una hipótesis de circuito dinámico para la patogénesis del blefaroespasmo. (2017) Fronteras en Neurociencia Computacional. 11:11. DOI: 10.3389/fncom.2017.00011

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Das, A., Sampson, AL, Lainscsek, C., Muller, L., Lin, W., Doyle, JC, Cash, SS, Halgren, E., Sejnowski, TJ Interpretación de la matriz de precisión y su aplicación en la estimación de la conectividad cerebral escasa durante los husos del sueño a partir de grabaciones de electrocorticografía humana. (2017) Computación neuronal. 29(3):603-642. DOI: 10.1162/NECO_a_00936

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Kim, Y., Santos, R., Gage, FH, Marchetto, MC Mecanismos moleculares del trastorno bipolar: avances y desafíos futuros. (2017) Fronteras en Neurociencia Celular. 11:30. DOI: 10.3389/fncel.2017.00030

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Ramsay, L., Marchetto, MC, Caron, M., Chen, SH, Busche, S., Kwan, T., Pastinen, T., Gage, FH, Bourque, G. Expresión conservada de transcritos no codificantes derivados de transposones en células madre de primates. (2017) BMC Genómica. 18(1):214. DOI: 10.1186/s12864-017-3568-y

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Stern, S., Santos, R., Marchetto, MC, Mendes, AP, Rouleau, GA, Biesmans, S., Wang, QW, Yao, J., Charnay, P., Bang, AG, Alda, M., calibre, FH Las neuronas derivadas de pacientes con trastorno bipolar se dividen en subpoblaciones de neuronas intrínsecamente diferentes, lo que predice la capacidad de respuesta de los pacientes al litio. (2017) Psiquiatría Molecular. DOI: 10.1038 / mp.2016.260

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Flynn, JR, Conn, VL, Boyle, KA, Hughes, DI, Watanabe, M., Velasquez, T., Goulding, MD, Callister, RJ, Graham, BA Propiedades anatómicas y moleculares de neuronas propioespinales descendentes largas en ratones. (2017) Fronteras en Neuroanatomía. 11:5. DOI: 10.3389/fnana.2017.00005

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Sternfeld, MJ, Hinckley, CA, Moore, NJ, Pankratz, MT, Hilde, KL, Driscoll, SP, Hayashi, M., Amin, ND, Bonanomi, D., Gifford, WD, Sharma, K., Goulding, M ., Pfaff, SL Mecanismos de control de velocidad y segmentación caracterizados en circuitos rítmicamente activos creados a partir de neuronas espinales producidas a partir de células madre embrionarias marcadas genéticamente. (2017) Elife. 6. DOI: 10.7554/eLife.21540

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Tufail, Y., Cook, D., Fourgeaud, L., Powers, CJ, Merten, K., Clark, CL, Hoffman, E., Ngo, A., Sekiguchi, KJ, O'Shea, CC, Lemke, G., Nimmerjahn, A. La exposición a la fosfatidilserina controla las respuestas inmunes innatas virales por Microglia. (2017) Neuron. 93(3):574-586.e8. DOI: 10.1016/j.neuron.2016.12.021

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Adamowicz, DH, Roy, S., Salmón, DP, Galasko, DR, Hansen, LA, Masliah, E., Gage, FH La α-sinucleína del hipocampo en la demencia con cuerpos de Lewy contribuye al deterioro de la memoria y es consistente con la propagación de la patología. (2017) Journal of Neuroscience. 37(7):1675-1684. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.3047-16.2016

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Sarkar, A., Marchetto, MC, Gage, FH Actividad sináptica: un actor emergente en la esquizofrenia. (2017) Investigación del cerebro. 1656:68-75. DOI: 10.1016/j.brainres.2015.12.028

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Paquola, ACM, Erwin, JA, Gage, FH Información sobre el papel del mosaicismo somático en el cerebro. (2017) Opinión actual en biología de sistemas. 1:90-94. DOI: 10.1016/j.coisb.2016.12.004

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Yao, PJ, Manor, U., Petralia, RS, Brose, RD, Wu, RT, Ott, C., Wang, YX, Charnoff, A., Lippincott-Schwartz, J., Mattson, MP La activación de la vía del erizo sónico aumenta la abundancia y actividad mitocondrial en las neuronas del hipocampo. (2017) Biología molecular de la célula. 28(3):387-395. DOI: 10.1091/mbc.E16-07-0553

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Juavinett, AL, Nauhaus, I., Garrett, ME, Zhuang, J., Callaway, EM Identificación automatizada de áreas visuales del ratón con imágenes de señales intrínsecas. (2017) Protocolos de la naturaleza. 12(1):32-43. DOI: 10.1038/nprot.2016.158

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O'Donnell, C., Gonçalves, JT, Whiteley, N., Portera-Cailliau, C., Sejnowski, TJ El modelo de seguimiento de población: un modelo estadístico simple y escalable para datos de población neuronal. (2017) Computación neuronal. 29(1):50-93. DOI: 10.1162/NECO_a_00910

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