Centro de Biofotónica Avanzada de Waitt

Investigación

Instituto Salk de Estudios Biológicos - Centro de Biofotónica Avanzada Waitt - Investigación

PUBLICACIONES 2015


Geeven, G., Zhu, Y., Kim, BJ, Bartholdy, BA, Yang, SM, Macfarlan, TS, Gifford, WD, Pfaff, SL, Verstegen, MJ, Pinto, H., Vermunt, MW, Creyghton, MP , Wijchers, PJ, Stamatoyannopoulos, JA, Skoultchi, AI, de Laat, W. Cambios en el compartimento local y alteraciones del paisaje regulatorio en células empobrecidas en histona H1. (2015) Biología del genoma. 16:289. DOI: 10.1186/s13059-015-0857-0

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Harrison, BJ, Venkat, G., Hutson, T., Rau, KK, Bunge, MB, Mendell, LM, Gage, FH, Johnson, RD, Hill, C., Rouchka, EC, Moon, L., Petruska, JC Cambios transcripcionales en los ganglios sensoriales asociados con el brote colateral del axón aferente primario en un modelo de dermatoma preservado. (2015) Datos Genómicos. 6:249-52. DOI: 10.1016/j.gdata.2015.10.005

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Amin, ND, Bai, G., Klug, JR, Bonanomi, D., Pankratz, MT, Gifford, WD, Hinckley, CA, Sternfeld, MJ, Driscoll, SP, Dominguez, B., Lee, KF, Jin, X ., Pfaff, SL La pérdida de microRNA-218 específico de motoneurona provoca insuficiencia neuromuscular sistémica. (2015) Ciencia. 350(6267):1525-9. DOI: 10.1126/ciencia.aad2509

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Kim, EJ, Juavinett, AL, Kyubwa, EM, Jacobs, MW, Callaway, EM Tres tipos de neuronas corticales de la capa 5 que difieren en la conectividad y función de todo el cerebro. (2015) Neuron. 88(6):1253-1267. DOI: 10.1016/j.neurona.2015.11.002

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Brennand, KJ, Marchetto, MC, Benvenisty, N., Brüstle, O., Ebert, A., Izpisua Belmonte, JC, Kaykas, A., Lancaster, MA, Livesey, FJ, McConnell, MJ, McKay, RD, Morrow , EM, Muotri, AR, Panchision, DM, Rubin, LL, Sawa, A., Soldner, F., Song, H., Studer, L., Temple, S., Vaccarino, FM, Wu, J., Vanderhaeghen , P., Gage, FH, Jaenisch, R. Creación de células neuronales específicas del paciente para el estudio in vitro de trastornos cerebrales. (2015) Informes de células madre. 5(6):933-45. DOI: 10.1016/j.stemcr.2015.10.011

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Veltz, R., Sejnowski, TJ Forzamiento periódico de redes estabilizadas por inhibición: resonancias no lineales y acoplamiento de amplitud de fase. (2015) Computación neuronal. 27(12):2477-509. DOI: 10.1162/NECO_a_00786

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Mertens, J., Paquola, AC, Ku, M., Hatch, E., Böhnke, L., Ladjevardi, S., McGrath, S., Campbell, B., Lee, H., Herdy, JR, Gonçalves, JT, Toda, T., Kim, Y., Winkler, J., Yao, J., Hetzer, MW, Gage, FH Las neuronas humanas reprogramadas directamente retienen las firmas transcriptómicas asociadas al envejecimiento y revelan defectos nucleocitoplasmáticos relacionados con la edad. (2015) Célula madre celular. 17(6):705-18. DOI: 10.1016/j.tallo.2015.09.001

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Bartol, TM, Bromer, C., Kinney, J., Chirillo, MA, Bourne, JN, Harris, KM, Sejnowski, TJ Límite superior nanoconectómico en la variabilidad de la plasticidad sináptica. (2015) Elife. 4:e10778. DOI: 10.7554/eLife.10778

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Kim, HJ, Denli, AM, Wright, R., Baul, TD, Clemenson, GD, Morcos, AS, Zhao, C., Schafer, ST, Gage, FH, Kagalwala, MN REST regula la diferenciación neuronal autónoma no celular y la maduración de las células progenitoras neurales a través de la secretogranina II. (2015) Journal of Neuroscience. 35(44):14872-84. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.4286-14.2015

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Pan, FC, Brissova, M., Powers, AC, Pfaff, S., Wright, CV La inactivación del gen de la diabetes neonatal permanente Mnx1 cambia las células β productoras de insulina a un destino similar al δ y revela una capacidad proliferativa facultativa en las células β envejecidas. (2015) Desarrollo. 142(21):3637-48. DOI: 10.1242/desv.126011

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Mertens, J., Wang, QW, Kim, Y., Yu, DX, Pham, S., Yang, B., Zheng, Y., Diffenderfer, KE, Zhang, J., Soltani, S., Eames, T ., Schafer, ST, Boyer, L., Marchetto, MC, Nurnberger, JI, Calabrese, JR, Ødegaard, KJ, McCarthy, MJ, Zandi, PP, Alda, M., Alba, M., Nievergelt, CM, , Mi, S., Brennand, KJ, Kelsoe, JR, Gage, FH, Yao, J. Respuestas diferenciales al litio en neuronas hiperexcitables de pacientes con trastorno bipolar. (2015) Naturaleza. 527 (7576): 95-9. DOI: 10.1038/naturaleza15526

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Bourane, S., Duan, B., Koch, SC, Dalet, A., Britz, O., Garcia-Campmany, L., Kim, E., Cheng, L., Ghosh, A., Ma, Q. , Goulding, M. Control de puerta de picor mecánico por una subpoblación de interneuronas de la médula espinal. (2015) Ciencia. 350(6260):550-4. DOI: 10.1126/ciencia.aac8653

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He, W., Bai, G., Zhou, H., Wei, N., White, NM, Lauer, J., Liu, H., Shi, Y., Dumitru, CD, Lettieri, K., Shubayev, V., Jordanova, A., Guergueltcheva, V., Griffin, PR, Burgess, RW, Pfaff, SL, Yang, XL La neuropatía CMT2D está relacionada con la actividad de unión neomórfica de la glicil-tRNA sintetasa. (2015) Naturaleza. 526 (7575): 710-4. DOI: 10.1038/naturaleza15510

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Bartol, TM, Keller, DX, Kinney, JP, Bajaj, CL, Harris, KM, Sejnowski, TJ, Kennedy, MB Reconstitución computacional de los transitorios de calcio de la columna vertebral a partir de proteínas individuales. (2015) Neurociencias sinápticas frontales. 7:17. DOI: 10.3389/fnsyn.2015.00017

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Denli, AM, Narvaiza, I., Kerman, BE, Pena, M., Benner, C., Marchetto, MC, Diedrich, JK, Aslanian, A., Ma, J., Moresco, JJ, Moore, L., Hunter, T., Saghatelian, A., Gage, FH El ORF0 específico de primates contribuye a la diversidad mediada por retrotransposones. (2015) Cell. 163(3):583-93. DOI: 10.1016/j.cell.2015.09.025

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Mu, Y., Zhao, C., Toni, N., Yao, J., Gage, FH Funciones distintas de los receptores NMDA en diferentes etapas del desarrollo de células granulares en el cerebro adulto. (2015) Elife. 4:e07871. DOI: 10.7554/eLife.07871

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Britz, O., Zhang, J., Grossmann, KS, Dyck, J., Kim, JC, Dymecki, S., Gosgnach, S., Goulding, M. Una asimetría definida genéticamente subyace al control inhibitorio de los movimientos locomotores flexores-extensores. (2015) Elife. 4. DOI: 10.7554/eLife.04718

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Wang, X., Pinto-Duarte, A., Behrens, MM, Zhou, X., Sejnowski, TJ Caracterización de potenciales relacionados con eventos epidurales espacio-temporales para modelos de ratón de trastornos psiquiátricos. (2015) Informes Científicos. 5:14964. DOI: 10.1038/srep14964

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Barnes, SA, Pinto-Duarte, A., Kappe, A., Zembrzycki, A., Metzler, A., Mukamel, EA, Lucero, J., Wang, X., Sejnowski, TJ, Markou, A.*, Behrens, MM* La interrupción de mGluR5 en interneuronas positivas para parvalbúmina induce características centrales de trastornos del neurodesarrollo. (2015) Psiquiatría Molecular. 20(10):1161-72. DOI: 10.1038/mp.2015.113

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Pawar, K., Cummings, BJ, Thomas, A., Shea, LD, Levine, A., Pfaff, S., Anderson, AJ Los puentes de biomateriales permiten la regeneración y el reingreso de los axones del tracto corticoespinal en la médula espinal caudal después de una SCI: Asociación con la recuperación de la función de las extremidades anteriores. (2015) Biomateriales. 65:1-12. DOI: 10.1016/j.biomateriales.2015.05.032

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Tashiro, A., Zhao, C., Suh, H., Gage, FH Preparación y uso de vectores retrovirales para el etiquetado, la obtención de imágenes y la manipulación genética de células. (2015) Protocolos de Cold Spring Harbor. 2015(10):883-8. DOI: 10.1101/pdb.top086363

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Tashiro, A., Zhao, C., Suh, H., Gage, FH Análisis de la motilidad de la columna vertebral de células granulares recién nacidas en cortes de cerebro agudo. (2015) Protocolos de Cold Spring Harbor. 2015(10):934-6. DOI: 10.1101/pdb.prot086397

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Tashiro, A., Zhao, C., Suh, H., Gage, FH Obtención de imágenes de células granulares de recién nacidos en secciones fijas. (2015) Protocolos de Cold Spring Harbor. 2015(10):932-3. DOI: 10.1101/pdb.prot086389

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Tashiro, A., Zhao, C., Suh, H., Gage, FH Purificación e Inyección de Vectores Retrovirales. (2015) Protocolos de Cold Spring Harbor. 2015(10):925-31. DOI: 10.1101/pdb.prot086371

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Ori, A., Toyama, BH, Harris, MS, Bock, T., Iskar, M., Bork, P., Ingolia, NT, Hetzer, MW, Beck, M. Los análisis integrados de transcriptoma y proteoma revelan un deterioro del proteoma específico de órganos en ratas viejas. (2015) Sistemas celulares. 1(3):224-37. DOI: 10.1016/j.cels.2015.08.012

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González, OC, Krishnan, GP, Chauvette, S., Timofeev, I., Sejnowski, T., Bazhenov, M. Modelado de epileptogénesis dependiente de la edad mediante escalado sináptico homeostático diferencial. (2015) Journal of Neuroscience. 35(39):13448-62. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.5038-14.2015

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Prescott, SL, Srinivasan, R., Marchetto, MC, Grishina, I., Narvaiza, I., Selleri, L., Gage, FH, Swigut, T., Wysocka, J. Divergencia potenciadora y evolución reguladora cis en la cresta neural humana y de chimpancé. (2015) Cell. 163(1):68-83. DOI: 10.1016/j.cell.2015.08.036

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Hinckley, CA, Alaynick, WA, Gallarda, BW, Hayashi, M., Hilde, KL, Driscoll, SP, Dekker, JD, Tucker, HO, Sharpee, TO, Pfaff, SL Los circuitos locomotores espinales se desarrollan utilizando reglas jerárquicas basadas en la posición e identidad de las neuronas motoras. (2015) Neuron. 87(5):1008-21. DOI: 10.1016/j.neurona.2015.08.005

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Kempermann, G., Song, H., Gage, FH Neurogénesis en el hipocampo adulto. (2015) Perspectivas de Cold Spring Harbor en biología. 7(9):a018812. DOI: 10.1101/cshperspect.a018812

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Jovičić, A., Mertens, J., Boeynaems, S., Bogaert, E., Chai, N., Yamada, SB, Paul, JW, Sun, S., Herdy, JR, Bieri, G., Kramer, NJ , Gage, FH, Van Den Bosch, L., Robberecht, W., Gitler, AD Los modificadores de la toxicidad repetida del dipéptido C9orf72 conectan los defectos de transporte nucleocitoplasmático con FTD/ALS. (2015) Neurociencia de la naturaleza. 18(9):1226-9. DOI: 10.1038/nn.4085

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Firth, AL, Menon, T., Parker, GS, Qualls, SJ, Lewis, BM, Ke, E., Dargitz, CT, Wright, R., Khanna, A., Gage, FH, Verma, IM Corrección de genes funcionales para fibrosis quística en células epiteliales de pulmón generadas a partir de iPSC de pacientes. (2015) Informes de celda. 12(9):1385-90. DOI: 10.1016/j.celrep.2015.07.062

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Wang, J., Telese, F., Tan, Y., Li, W., Jin, C., He, X., Basnet, H., Ma, Q., Merkurjev, D., Zhu, X., Liu, Z., Zhang, J., Ohgi, K., Taylor, H., White, RR, Tazearslan, C., Suh, Y., Macfarlan, TS, Pfaff, SL, Rosenfeld, MG LSD1n es una desmetilasa H4K20 que regula la formación de memoria a través del control de elongación transcripcional. (2015) Neurociencia de la naturaleza. 18(9):1256-64. DOI: 10.1038/nn.4069

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Deng, W., Gage, FH El efecto de las células granulares dentadas nacidas en adultos inmaduros sobre el comportamiento hiponeofágico está relacionado con sus funciones en el aprendizaje y la memoria. (2015) Fronteras en Neurociencia de Sistemas. 9:34. DOI: 10.3389/fnsys.2015.00034

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Coggan, JS, Sejnowski, TJ, Prescott, SA La cooperación entre sitios remotos de picos ectópicos permite iniciar y mantener la posdescarga en diferentes lugares. (2015) Revista de Neurociencia Computacional. 39(1):17-28. DOI: 10.1007/s10827-015-0562-8

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Manor, U., Bartholomew, S., Golani, G., Christenson, E., Kozlov, M., Higgs, H., Spudich, J., Lippincott-Schwartz, J. Una isoforma anclada en la mitocondria de la proteína espiral nucleadora de actina regula la división mitocondrial. (2015) Elife. 4. DOI: 10.7554/eLife.08828

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Eh, D., Sejnowski, TJ Espectro de leyes de potencia para movimientos curvos de la mano. (2015) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 112(29):E3950-8. DOI: 10.1073/pnas.1510208112

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Han, J., Sarkar, A., Gage, FH MIR137: grandes impactos a partir de pequeños cambios. (2015) Neurociencia de la naturaleza. 18(7):931-3. DOI: 10.1038/nn.4045


Schultz, MD, He, Y., Whitaker, JW, Hariharan, M., Mukamel, EA, Leung, D., Rajagopal, N., Nery, JR, Urich, MA, Chen, H., Lin, S., Lin, Y., Jung, I., Schmitt, AD, Selvaraj, S., Ren, B., Sejnowski, TJ, Wang, W., Ecker, JR Los mapas del epigenoma del cuerpo humano revelan una variación no canónica de la metilación del ADN. (2015) Naturaleza. 523 (7559): 212-6. DOI: 10.1038/naturaleza14465

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Lee, H., Kim, M., Kim, N., Macfarlan, T., Pfaff, SL, Mastick, GS, Song, MR La señalización de Slit y Semaphorin gobernada por los factores de transcripción Islet posiciona los somas de las neuronas motoras dentro del tubo neural. (2015) Neurología Experimental. 269:17-27. DOI: 10.1016/j.expneurol.2015.03.024

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Zhao, C., Jou, J., Wolff, LJ, Sun, H., Gage, FH La morfogénesis de la columna vertebral en las células granulares recién nacidas está regulada de manera diferencial en las capas moleculares externa y media. (2015) Revista de Neurología Comparada. 523(10):1588. DOI: 10.1002/cne.23800


Krzisch, M., Temprana, SG, Mongiat, LA, Armida, J., Schmutz, V., Virtanen, MA, Kocher-Braissant, J., Kraftsik, R., Vutskits, L., Conzelmann, KK, Bergami, M., Gage, FH, Schinder, AF, Toni, N. Los astrocitos preexistentes forman procesos perisinápticos funcionales en las neuronas generadas en el hipocampo adulto. (2015) Estructura y función del cerebro. 220(4):2027-42. DOI: 10.1007/s00429-014-0768-y

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Orly, G., Manor, U., Gov, NS Un modelo biofísico para la geometría de escalera de Stereocilia. (2015) Más uno. 10(7):e0127926. DOI: 10.1371/journal.pone.0127926

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Mo, A., Mukamel, EA, Davis, FP, Luo, C., Henry, GL, Picard, S., Urich, MA, Nery, JR, Sejnowski, TJ, Lister, R., Eddy, SR, Ecker, JR, Nathans, J. Firmas epigenómicas de diversidad neuronal en el cerebro de mamíferos. (2015) Neuron. 86(6):1369-84. DOI: 10.1016/j.neurona.2015.05.018

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Jacinto, FV, Benner, C., Hetzer, MW La nucleoporina Nup153 regula la pluripotencialidad de las células madre embrionarias a través del silenciamiento génico. (2015) Genes y desarrollo. 29(12):1224-38. DOI: 10.1101/gad.260919.115

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Kerman, BE, Kim, HJ, Padmanabhan, K., Mei, A., Georges, S., Joens, MS, Fitzpatrick, JA, Jappelli, R., Chandross, KJ, August, P., Gage, FH Formación de mielina in vitro utilizando células madre embrionarias. (2015) Desarrollo. 142(12):2213-25. DOI: 10.1242/desv.116517

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Nimmerjahn, A., Bergles, DE Registro a gran escala de la actividad de los astrocitos. (2015) Opinión actual en neurobiología. 32:95-106. DOI: 10.1016/j.conb.2015.01.015

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Johnson, T., Bartol, T., Sejnowski, T., Mjolsness, E. Reducción de modelos para la cinética de reacción estocástica de CaMKII en sinapsis mediante dinámicas de correlación limitadas por gráficos. (2015) Phys Biol. 12(4):045005. DOI: 10.1088/1478-3975/12/4/045005

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Mukherjee, S., Hsieh, WL, Smith, N., Goulding, M., Heikenfeld, J. Píxeles electrocinéticos con tintas biprimarias para pantallas a color y ventanas inteligentes con ajuste de temperatura de color. (2015) Opción de aplicación 54 (17): 5603 5609-.

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Escotilla, EM, Hetzer, MW Cromotripsis. (2015) Biología actual. 25(10):R397-9. DOI: 10.1016/j.cub.2015.02.033


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Izpisua Belmonte, JC, Callaway, EM, Caddick, SJ, Churchland, P., Feng, G., Homanics, GE, Lee, KF, Leopold, DA, Miller, CT, Mitchell, JF, Mitalipov, S., Moutri, AR, Movshon, JA, Okano, H., Reynolds, JH, Ringach, D., Sejnowski, TJ, Silva, AC, Strick, PL, Wu, J., Zhang, F. Cerebros, genes y primates. (2015) Neuron. 86(3):617-31. DOI: 10.1016/j.neurona.2015.03.021

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Bardy, C., van den Hurk, M., Eames, T., Marchand, C., Hernández, RV, Kellogg, M., Gorris, M., Galet, B., Palomares, V., Brown, J. , Bang, AG, Mertens, J., Böhnke, L., Boyer, L., Simon, S., Gage, FH Medio neuronal que apoya las funciones sinápticas básicas y la actividad de las neuronas humanas in vitro. (2015) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 112(20):E2725-34. DOI: 10.1073/pnas.1504393112

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Jorgenson, LA, Newsome, WT, Anderson, DJ, Bargmann, CI, Brown, EN, Deisseroth, K., Donoghue, JP, Hudson, KL, Ling, GS, MacLeish, PR, Marder, E., Normann, RA, Sanes, JR, Schnitzer, MJ, Sejnowski, TJ, Tanque, DW, Tsien, RY, Ugurbil, K., Wingfield, JC La iniciativa BRAIN: desarrollo de tecnología para catalizar el descubrimiento de la neurociencia. (2015) Filosofía Trans. R. Soc. Lond., B, Biol. ciencia 370 (1668). DOI: 10.1098/rstb.2014.0164

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Calhoun, AJ, Tong, A., Pokala, N., Fitzpatrick, JA, Sharpee, TO, Chalasani, SH Mecanismos neurales para evaluar la variabilidad ambiental en Caenorhabditis elegans. (2015) Neuron. 86(2):428-41. DOI: 10.1016/j.neurona.2015.03.026

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Pei, L., Mu, Y., Leblanc, M., Alaynick, W., Barish, GD, Pankratz, M., Tseng, TW, Kaufman, S., Liddle, C., Yu, RT, Downes, M ., Pfaff, SL, Auwerx, J., Gage, FH, Evans, RM Dependencia de la función del hipocampo en el metabolismo mitocondrial regulado por ERRγ. (2015) Metabolismo Celular. 21(4):628-36. DOI: 10.1016/j.cmet.2015.03.004

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Adamowicz, DH, Mertens, J., Gage, FH Enfermedad de Alzheimer: ¿etapas distintas en el declive neurogénico? (2015) Psiquiatría biológica. 77(8):680-2. DOI: 10.1016/j.biopsych.2015.02.021


Amador-Arjona, A., Cimadamore, F., Huang, CT, Wright, R., Lewis, S., Gage, FH, Terskikh, AV SOX2 prepara el paisaje epigenético en precursores neuronales que permiten la activación génica adecuada durante la neurogénesis del hipocampo. (2015) Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. 112(15):E1936-45. DOI: 10.1073/pnas.1421480112

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Schafer, ST, Han, J., Pena, M., von Bohlen y Halbach, O., Peters, J., Gage, FH La proteína adaptadora Wnt ATP6AP2 regula múltiples etapas de la neurogénesis del hipocampo adulto. (2015) Journal of Neuroscience. 35(12):4983-98. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.4130-14.2015

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Li, PH, Gauthier, JL, Schiff, M., Sher, A., Ahn, D., Field, GD, Greschner, M., Callaway, EM, Litke, AM, Chichilnisky, EJ Identificación anatómica de células registradas extracelularmente en grabaciones multielectrodo a gran escala. (2015) Journal of Neuroscience. 35(11):4663-4675. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.3675-14.2015

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Gómez-Cavazos, JS, Hetzer, MW La nucleoporina gp210/Nup210 controla la diferenciación muscular mediante la regulación de la homeostasis de la envoltura nuclear/ER. (2015) Revista de Biología Celular. 208(6):671-81. DOI: 10.1083/jcb.201410047

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Lainscsek, C., Sejnowski, TJ Análisis diferencial de retardo de series temporales. (2015) Computación neuronal. 27(3):594-614. DOI: 10.1162/NECO_a_00706

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Clemenson, GD, Lee, SW, Deng, W., Barrera, VR, Iwamoto, KS, Fanselow, MS, Gage, FH El enriquecimiento rescata el déficit de discriminación contextual asociado al shock inmediato. (2015) Hipocampo. 25(3):385-92. DOI: 10.1002/hipo.22380

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Lainscsek, C., Hernández, ME, Poizner, H., Sejnowski, TJ Análisis diferencial de retardo de datos electroencefalográficos. (2015) Computación neuronal. 27(3):615-27. DOI: 10.1162/NECO_a_00656

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Brennand, K., Savas, JN, Kim, Y., Tran, N., Simone, A., Hashimoto-Torii, K., Beaumont, KG, Kim, HJ, Topol, A., Ladran, I., Abdelrahim , M., Matikainen-Ankney, B., Chao, SH, Mrksich, M., Rakic, P., Fang, G., Zhang, B., Yates, JR, Gage, FH Diferencias fenotípicas en hiPSC NPC derivados de pacientes con esquizofrenia. (2015) Psiquiatría Molecular. 20(3):361-8. DOI: 10.1038/mp.2014.22

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