Professor
Labor für Computational Neurobiology
Labor für Integrative Biologie
Edwin K. Hunter Stuhl
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Praturu, A., Sharpee, TO Adaptive Dateneinbettung für gekrümmte Räume. (2024) iWissenschaft. 27(12):111266. DOI: 10.1016/j.isci.2024.111266
Alvarez-Kuglen, M., Ninomiya, K., Qin, H., Rodriguez, D., Fiengo, L., Farhy, C., Hsu, WM, Kirk, B., Havas, A., Feng, GS, Roberts, AJ, Anderson, RM, Serrano, M., Adams, PD, Sharpee, TO, Terskikh, AV ImAge quantifiziert Alterung und Verjüngung. (2024) Nat Altern. DOI: 10.1038/s43587-024-00685-1
Alvarez-Kuglen, M., Rodriguez, D., Qin, H., Ninomiya, K., Fiengo, L., Farhy, C., Hsu, WM, Havas, A., Feng, GS, Roberts, AJ, Anderson , RM, Serrano, M., Adams, PD, Sharpee, TO, Terskikh, AV Bildgebendes Chromatin und epigenetisches Alter, ImAge, quantifiziert Alterung und Verjüngung. (2023) Res. qm. DOI: 10.21203/rs.3.rs-3479973/v1
Little, JC, Kaaronen, RO, Hukkinen, JI, Xiao, S., Sharpee, T., Farid, AM, Nilchiani, R., Barton, CM Erdsysteme zu anthropozänen Systemen: Ein evolutionäres System-von-Systems-Konvergenzparadigma für voneinander abhängige gesellschaftliche Herausforderungen. (2023) Umwelt-Sci-Technol. DOI: 10.1021/acs.est.2c06203
Yang, JY, O'Connell, TF, Hsu, WM, Bauer, MS, Dylla, KV, Sharpee, TO, Hong, EJ Umstrukturierung olfaktorischer Repräsentationen im Fliegengehirn anhand von Geruchsbeziehungen in natürlichen Quellen. (2023) bioRxiv. DOI: 10.1101 / 2023.02.15.528627
Zhang, H., Rich, PD, Lee, AK, Sharpee, TO Die räumlichen Darstellungen des Hippocampus weisen eine hyperbolische Geometrie auf, die sich mit der Erfahrung erweitert. (2022) Nature Neurologie. DOI: 10.1038/s41593-022-01212-4
Ghaninia, M., Zhou, Y., Knauer, AC, Schiestl, FP, Sharpee, TO, Smith, BH Hyperbolische Duftstoffmischungen als Grundlage für eine effizientere Signalübertragung zwischen Blütenpflanzen und Bienen. (2022) Plus eins. 17(7):e0270358. DOI: 10.1371/journal.pone.0270358
Zhou, Y., Sharpee, TO Verwendung von Global t-SNE zur Erhaltung der Intercluster-Datenstruktur. (2022) Neuronale Berechnung.:1-15 DOI: 10.1162/neco_a_01504
Nowotny, T., van Albada, SJ, Fellous, JM, Haas, JS, Jolivet, RB, Metzner, C., Sharpee, T. Leitartikel: Fortschritte in der Computational Neuroscience. (2022) Grenzen der Computational Neuroscience. 15:824899. DOI: 10.3389/fncom.2021.824899
Shadel, GS, Adams, PD, Berggren, WT, Diedrich, JK, Diffenderfer, KE, Gage, FH, Hah, N., Hansen, M., Hetzer, MW, Molina, AJA, Manor, U., Marek, K ., O'Keefe, DD, Pinto, AFM, Sacco, A., Sharpee, TO, Shokriev, MN, Zambetti, S. Das San Diego Nathan Shock Center: Bekämpfung der Heterogenität des Alterns. (2021) Gerowissenschaften. DOI: 10.1007 / s11357-021-00426-x
Hsu, WM, Kastner, DB, Baccus, SA, Sharpee, TO Wie hemmende Neuronen die Informationsübertragung unter Schwellenmodulation erhöhen. (2021) Zellenberichte 35(8):109158. DOI: 10.1016/j.celrep.2021.109158
Zhou, Y., Sharpee, TO Hyperbolische Geometrie der Genexpression. (2021) iWissenschaft. 24(3):102225. DOI: 10.1016/j.isci.2021.102225
Sharpee, TO, Berkowitz, JA Verknüpfung neuronaler Reaktionen mit Verhalten mit informationserhaltenden Populationsvektoren (2019) Aktuelle Meinung in den Verhaltenswissenschaften. 29:37-44. DOI: https://doi.org/10.1016/j.cobeha.2019.03.004
Amatya, DN, Linker, SB, Mendes, APD, Santos, R., Erikson, G., Shokhirev, MN, Zhou, Y., Sharpee, T., Gage, FH, Marchetto, MC, Kim, Y. Die dynamische elektrische Komplexität wird während der neuronalen Differenzierung bei Autismus-Spektrum-Störungen reduziert. (2019) Stammzellberichte. DOI: 10.1016/j.stemcr.2019.08.001
Sharpee, TO Ein Argument für hyperbolische Geometrie in neuronalen Schaltkreisen. (2019) Aktuelle Meinung in Neurobiologie. 58:101-104. DOI: 10.1016/j.conb.2019.07.008
Berkowitz, JA, Sharpee, TO Quantifizierung der von großen neuronalen Populationen übermittelten Informationen. (2019) Neuronale Berechnung.:1-33 DOI: 10.1162/neco_a_01193
Zhou, Y., Smith, BH, Sharpee, TO Hyperbolische Geometrie des Geruchsraums. (2018) Fortschritte in der Wissenschaft 4(8):eaaq1458. DOI: 10.1126/sciadv.aaq1458
Zhang, Y., Kastner, DB, Baccus, SA, Sharpee, TO Optimale Informationsübertragung durch überlappende Netzhautzellmosaike. (2018) Proc Conf Inf Sci Syst. 2018. DOI: 10.1109/ciss.2018.8362310
Sharpee, TO (2018) Oxford Research Encyclopedias, Neurowissenschaften.:1-23 DOI: doi.org/10.1093/acrefore/9780190264086.013.110
Atencio, CA, Sharpee, TO Mehrdimensionale rezeptive Feldverarbeitung durch primäre auditorische kortikale Neuronen von Katzen. (2017) Neurowissenschaften. 359:130-141. DOI: 10.1016/j.neuroscience.2017.07.003
Sharpee, TO Über Textur, Form und fixierende Augenbewegungen. (2017) Aktuelle Meinung in Neurobiologie. 46:228-233. DOI: 10.1016/j.conb.2017.09.002
Kaardal, JT, Theunissen, FE, Sharpee, TO Eine Low-Rank-Methode zur Charakterisierung hochwertiger neuronaler Berechnungen. (2017) Grenzen der Computational Neuroscience. 11:68. DOI: 10.3389/fncom.2017.00068
Sharpee, TO Optimierung der neuronalen Informationskapazität durch Diskretisierung. (2017) Neuron. 94(5):954-960. DOI: 10.1016/j.neuron.2017.04.044
Rowekamp, RJ, Sharpee, TO Querorientierungsunterdrückung im Sichtbereich V2. (2017) Nature Communications. 8:15739. DOI: 10.1038/ncomms15739
Sharpee, TO Plastizität zur Rettung. (2016) Neuron. 92(5):935-936. DOI: 10.1016/j.neuron.2016.11.042
Kuczala, A., Sharpee, TO Eigenwertspektren großer korrelierter Zufallsmatrizen. (2016) Phys Rev. E. 94(5-1):050101. DOI: 10.1103/PhysRevE.94.050101
Sharpee, TO Wie invariante Merkmalsselektivität in Cortex erreicht wird. (2016) Vordere synaptische Neurosci. 8:26. DOI: 10.3389/fnsyn.2016.00026
Sharpee, TO Ein genauer Blick auf die Elektrosensorik. (2016) Elife. 5. DOI: 10.7554/eLife.16209
Zhang, Y., Sharpee, TO Ein robustes Feedforward-Modell des olfaktorischen Systems. (2016) PLOS Computational Biology. 12(4):e1004850. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1004850
Aljadeff, J., Renfrew, D., Vegué, M., Sharpee, TO Niedrigdimensionale Dynamik strukturierter Zufallsnetzwerke. (2016) Phys Rev. E. 93(2):022302. DOI: 10.1103/PhysRevE.93.022302
Hinckley, CA, Alaynick, WA, Gallarda, BW, Hayashi, M., Hilde, KL, Driscoll, SP, Dekker, JD, Tucker, HO, Sharpee, TO, Pfaff, SL Die Schaltkreise des Bewegungsapparates der Wirbelsäule entwickeln sich nach hierarchischen Regeln, die auf der Position und Identität des Motoneurons basieren. (2015) Neuron. 87(5):1008-21. DOI: 10.1016/j.neuron.2015.08.005
Calhoun, AJ, Tong, A., Pokala, N., Fitzpatrick, JA, Sharpee, TO, Chalasani, SH Neuronale Mechanismen zur Bewertung der Umweltvariabilität bei Caenorhabditis elegans. (2015) Neuron. 86(2):428-41. DOI: 10.1016/j.neuron.2015.03.026
Aljadeff, J., Stern, M., Sharpee, T. Übergang zum Chaos in zufälligen Netzwerken mit zelltypspezifischer Konnektivität. (2015) Physik. Rev. Lett. 114(8):088101. DOI: 10.1103/PhysRevLett.114.088101
Kastner, DB, Baccus, SA, Sharpee, TO Kritische und äußerst informative Kodierung zwischen neuronalen Populationen in der Netzhaut. (2015) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 112(8):2533-8. DOI: 10.1073/pnas.1418092112
Calhoun, AJ, Chalasani, SH, Sharpee, TO Maximal informative Nahrungssuche durch Caenorhabditis elegans. (2014) Elife. 3. DOI: 10.7554/eLife.04220
Sharpee, TO Auf dem Weg zur funktionellen Klassifizierung neuronaler Typen. (2014) Neuron. 83(6):1329-34. DOI: 10.1016/j.neuron.2014.08.040
Sharpee, TO Die Funktion bestimmt die Struktur in komplexen neuronalen Netzen. (2014) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 111(23):8327-8. DOI: 10.1073/pnas.1407198111
Sharpee, TO, Calhoun, AJ, Chalasani, SH Informationstheorie der Anpassung in Neuronen, Verhalten und Stimmung. (2014) Aktuelle Meinung in Neurobiologie. 25:47-53. DOI: 10.1016/j.conb.2013.11.007
Morris, R., Sancho-Martinez, I., Sharpee, TO, Izpisua Belmonte, JC Mathematische Ansätze zur Modellierung von Entwicklung und Neuprogrammierung. (2014) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 111(14):5076-82. DOI: 10.1073/pnas.1317150111
Aljadeff, J., Segev, R., Berry, MJ, Sharpee, TO Spike löste Kovarianz in stark korrelierten Gaußschen Reizen aus. (2013) PLOS Computational Biology. 9(9):e1003206. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1003206
Sharpee, TO Computergestützte Identifizierung rezeptiver Felder. (2013) Jahresrückblick der Neurowissenschaften. 36:103-20. DOI: 10.1146/annurev-neuro-062012-170253
Sharpee, TO, Kouh, M., Reynolds, JH Kompromiss zwischen Krümmungsabstimmung und Positionsinvarianz im visuellen Bereich V4. (2013) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 110(28):11618-23. DOI: 10.1073/pnas.1217479110
Kaardal, J., Fitzgerald, JD, Berry, MJ, Sharpee, TO Identifizierung funktionaler Grundlagen für mehrdimensionale neuronale Berechnungen. (2013) Neuronale Berechnung. 25(7):1870-90. DOI: 10.1162/NECO_a_00465
Nandy, AS, Sharpee, TO, Reynolds, JH, Mitchell, JF Die Feinstruktur des Shape-Tunings im Bereich V4. (2013) Neuron. 78(6):1102-15. DOI: 10.1016/j.neuron.2013.04.016
Saremi, S., Sejnowski, TJ, Sharpee, TO Doppel-Gabor-Filter sind unabhängige Komponenten kleiner translationinvarianter Bildfelder. (2013) Neuronale Berechnung. 25(4):922-39. DOI: 10.1162/NECO_a_00418
Jeanne, JM, Sharpee, TO, Gentner, TQ Assoziatives Lernen verbessert die Populationskodierung durch Umkehrung interneuronaler Korrelationsmuster. (2013) Neuron. 78(2):352-63. DOI: 10.1016/j.neuron.2013.02.023
Eickenberg, M., Rowekamp, RJ, Kouh, M., Sharpee, TO Charakterisierung der Reaktionen translationinvarianter Neuronen auf natürliche Reize: maximal informative invariante Dimensionen. (2012) Neuronale Berechnung. 24(9):2384-421. DOI: 10.1162/NECO_a_00330
Atencio, CA, Sharpee, TO, Schreiner, CE Die Dimensionalität des rezeptiven Feldes nimmt vom auditorischen Mittelhirn bis zum Kortex zu. (2012) Journal für Neurophysiologie. 107(10):2594-603. DOI: 10.1152/jn.01025.2011
Sharpee, TO Adaptive Schalter in Schaltkreisen des Mittelhirns. (2012) Neuron. 73(1):6-7. DOI: 10.1016/j.neuron.2011.12.017
Fitzgerald, JD, Rowekamp, RJ, Sincich, LC, Sharpee, TO Dimensionsreduktion zweiter Ordnung unter Verwendung von Minimum- und Maximum-Mutual-Information-Modellen. (2011) PLOS Computational Biology. 7(10):e1002249. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002249
Sharpee, TO, Nagel, KI, Doupe, AJ Zweidimensionale Anpassung im auditorischen Vorderhirn. (2011) Journal für Neurophysiologie. 106(4):1841-61. DOI: 10.1152/jn.00905.2010
Sharpee, TO, Atencio, CA, Schreiner, CE Hierarchische Darstellungen im auditorischen Kortex. (2011) Aktuelle Meinung in Neurobiologie. 21(5):761-7. DOI: 10.1016/j.conb.2011.05.027
Rowekamp, RJ, Sharpee, TO Analyse mehrkomponentiger rezeptiver Felder neuronaler Reaktionen auf natürliche Reize. (2011) Netzwerk. 22(1-4):45-73. DOI: 10.3109/0954898X.2011.566303
Fitzgerald, JD, Sincich, LC, Sharpee, TO Minimale Modelle mehrdimensionaler Berechnungen. (2011) PLOS Computational Biology. 7(3):e1001111. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1001111
Jeanne, JM, Thompson, JV, Sharpee, TO, Gentner, TQ Entstehung erlernter kategorialer Darstellungen innerhalb eines auditorischen Vorderhirnschaltkreises. (2011) Journal of Neuroscience. 31(7):2595-606. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.3930-10.2011
Imaizumi, K., Priebe, NJ, Sharpee, TO, Cheung, SW, Schreiner, CE Kodierung zeitlicher Informationen nach Zeitpunkt, Geschwindigkeit und Ort im auditorischen Kortex von Katzen. (2010) Plus eins. 5(7):e11531. DOI: 10.1371/journal.pone.0011531
Gallarda, BW, Sharpee, TO, Pfaff, SL, Alaynick, WA Definieren rhythmischer Burst-Muster des Bewegungsapparats mithilfe einer kontinuierlichen Wavelet-Transformation. (2010) Ann. NY Acad. Sci. 1198:133-9. DOI: 10.1111/j.1749-6632.2010.05437.x
Atencio, CA, Sharpee, TO, Schreiner, CE Hierarchische Berechnung im kanonischen auditorischen Kortikaliskreislauf. (2009) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 106(51):21894-9. DOI: 10.1073/pnas.0908383106
Fitzgerald, JD, Sharpee, TO Maximal informative paarweise Interaktionen in Netzwerken. (2009) Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys. 80(3 Pt 1):031914. DOI: 10.1103/PhysRevE.80.031914
Liu, YS, Stevens, CF, Sharpee, TO Vorhersehbare Unregelmäßigkeiten in den rezeptiven Feldern der Netzhaut. (2009) Proceedings der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten von Amerika. 106(38):16499-504. DOI: 10.1073/pnas.0908926106
Sincich, LC, Horton, JC, Sharpee, TO Bewahrung von Informationen bei der neuronalen Übertragung. (2009) Journal of Neuroscience. 29(19):6207-16. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.3701-08.2009
Sharpee, TO, Victor, JD Die kontextuelle Modulation der V1-Rezeptionsfelder hängt von ihrer räumlichen Symmetrie ab. (2009) Zeitschrift für Computational Neuroscience. 26(2):203-18. DOI: 10.1007/s10827-008-0107-5
Kouh, M., Sharpee, TO Schätzung linear-nichtlinearer Modelle mithilfe von Renyi-Divergenzen. (2009) Netzwerk. 20(2):49-68. DOI: 10.1080/09548980902950891
Atencio, CA, Sharpee, TO, Schreiner, CE Kooperative Nichtlinearitäten in auditorischen kortikalen Neuronen. (2008) Neuron. 58(6):956-66. DOI: 10.1016/j.neuron.2008.04.026
Sharpee, TO, Miller, KD, Stryker, MP Zur Bedeutung der statischen Nichtlinearität bei der Schätzung räumlich-zeitlicher neuronaler Filter mit natürlichen Reizen. (2008) Journal für Neurophysiologie. 99(5):2496-509. DOI: 10.1152/jn.01397.2007
Clifford, CW, Webster, MA, Stanley, GB, Stocker, AA, Kohn, A., Sharpee, TO, Schwartz, O. Visuelle Anpassung: neuronale, psychologische und rechnerische Aspekte. (2007) Sehforschung. 47(25):3125-31. DOI: 10.1016/j.visres.2007.08.023
Sharpee, TO Vergleich von Informations- und Varianzmaximierungsstrategien zur Charakterisierung der Selektivität neuronaler Merkmale. (2007) Stat Med. 26(21):4009-31. DOI: 10.1002/sim.2931
Sharpee, T., Bialek, W. Neuronale Entscheidungsgrenzen für maximale Informationsübertragung. (2007) Plus eins. 2(7):e646. DOI: 10.1371/journal.pone.0000646
Sharpee, TO, Sugihara, H., Kurgansky, AV, Rebrik, SP, Stryker, MP, Miller, KD Adaptive Filterung verbessert die Informationsübertragung im visuellen Kortex. (2006) Natur. 439(7079):936-42. DOI: 10.1038/nature04519
Victor, JD, Mechler, F., Repucci, MA, Purpura, KP, Sharpee, T. Reaktionen von V1-Neuronen auf zweidimensionale Hermite-Funktionen. (2006) Journal für Neurophysiologie. 95(1):379-400. DOI: 10.1152/jn.00498.2005
Sharpee, T., Sugihara, H., Kurgansky, AV, Rebrik, S., Stryker, MP, Miller, KD Untersuchung der Merkmalsselektivität von Neuronen im primären visuellen Kortex mit natürlichen Reizen. (2004) Proc SPIE Int Soc Opt Eng.(5467): 212-222
Sharpee, T., Rust, NC, Bialek, W. Analyse neuronaler Reaktionen auf natürliche Signale: maximal informative Dimensionen. (2004) Neuronale Berechnung. 16(2):223-50. DOI: 10.1162/089976604322742010
Dykman, MI, Sharpee, T., Platzman, PM Verstärkung des Tunnelns aus einem korrelierten 2D-Elektronensystem durch einen Mehrelektronen-Rückstoß vom Mössbauer-Typ in einem Magnetfeld. (2001) Physik. Rev. Lett. 86(11):2408-11. DOI: 10.1103/PhysRevLett.86.2408
Barabash-Sharpee, T., Dykman, MI, Platzman, PM Tunneln quer zu einem Magnetfeld und sein Auftreten in korrelierten 2D-Elektronensystemen. (2000) Physik. Rev. Lett. 84(10):2227-30. DOI: 10.1103/PhysRevLett.84.2227
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MS, Physik, Ukrainische Nationaluniversität, Kiew, Ukraine
PhD, Physik, Michigan State University
Sloan-Swartz Postdoktorand, University of California, San Francisco