Gemeinsame Ressourcen und Kerne
Fortschrittlicher biophotonischer Kern
Der Advanced Biophotonics Core bietet Bildgebungs- und Analyseinstrumente sowie technisches und kollaboratives Supportpersonal für fortgeschrittene Licht- und Elektronenmikroskopie biologischer Systeme. Mitglieder des Krebszentrums nutzen die Einrichtung für Hochdurchsatz-Bildgebungstests, hochauflösende Bildgebung der Dynamik lebender Zellen und Gewebe, hochauflösende Mikroskopie, große 3D-Volumenbildgebung von Geweben, elektronenmikroskopische Analyse der subzellulären Morphologie und Proteinverteilung sowie automatisierte Computerbilder Verarbeitung, Visualisierung und Analyse. Der Kern verfolgt und entwickelt außerdem aktiv neue hochmoderne Bildgebungs- und Analysemethoden, um den Bedürfnissen der Forscher des Krebszentrums besser gerecht zu werden, wie z. B. kryokorrelative Licht- und Elektronenmikroskopie, Lichtblattbildgebung von gereinigtem und expandiertem Gewebe und maschinelles Lernen basierte Verarbeitung, Segmentierung und Analyse von Licht- und Elektronenmikroskopbildern.
Durchflusszytometrie-Kern
Der Flow Cytometry Core bietet Salk-Forschern Zugang zu modernsten Durchflusszytometrie-Instrumenten, hochwertigen Dienstleistungen und fachkundiger Beratung bei der Konzeption und Durchführung von durchflussbasierten Experimenten. Die Einrichtung ist mit zwei vom Personal betriebenen fluoreszenzaktivierten Zellsortierern (FACS) und drei Analysegeräten ausgestattet, die für den unabhängigen Betrieb zur Verfügung stehen. Schulungen und Support für Benutzer aller Erfahrungsstufen sind im Core verfügbar. Das Personal der Einrichtung fördert eine kollaborative Umgebung und ist bestrebt, den Forschern des Krebszentrums eine leicht zugängliche, umfassende Ressource zur Verfügung zu stellen, und bemüht sich, neue Strömungstechnologien oder -anwendungen zu identifizieren, die für Core-Benutzer nützlich sein werden.
Sequenzierungskern der nächsten Generation
Die Mission des Next Generation Sequencing Core besteht darin, hochmoderne Genomforschung zu ermöglichen. Zur Unterstützung der Forschungsbemühungen des Krebszentrums am Salk zielt der Kern insbesondere darauf ab, Folgendes bereitzustellen: 1) kostengünstige und schnelle Hochdurchsatz-Sequenzierungsdienste, 2) fachkundige Unterstützung bei der experimentellen Gestaltung, 3) die Entwicklung neuartiger Methoden, um Spitzenleistungen zu ermöglichen Sequenzierungstechnologien, 4) Vorbereitung und Qualitätskontrolle von Sequenzierungsbibliotheken und 5) Schulungsdienste für Mitglieder des Krebszentrums in der Bibliotheksvorbereitung oder anderen Methoden, die für Sequenzierungsprojekte der nächsten Generation erforderlich sind.
Gentransfer, Targeting und Therapeutika, viraler Vektorkern
Virale Vektoren werden üblicherweise verwendet, um genetisches Material an Zielzellen zu transportieren, sowohl in vitro und in vivo. Sie stellen auch attraktive Kandidaten dar in vivo Gentherapie. Es bestehen jedoch erhebliche Sicherheitsbedenken bei der Arbeit mit und der Herstellung von viralen Vektoren in Forschungsqualität. Diese Sicherheitsprobleme verschärfen sich, wenn einzelne Forschungslabore mit der Einrichtung und Aufrechterhaltung ihrer eigenen Sicherheitsinfrastruktur und -protokolle beauftragt werden. Um diese Bedenken auszuräumen, hat das Salk Institute eine zentrale Ressource eingerichtet, nämlich den Viral Vector Core. Der Kern produziert und pflegt eine umfangreiche Bibliothek häufig verwendeter viraler Bestandsvektoren. Darüber hinaus bietet das Core kundenspezifische Design- und Produktionsdienstleistungen für mehrere Arten viraler Vektoren an, darunter Lentivirus, Retrovirus, Adenovirus, Adeno-assoziiertes Virus, G-deletierte Tollwut und vesikuläres Stomatitisvirus.
Integrative Genomik und Bioinformatik-Kern
Der Integrative Genomics and Bioinformatics Core bietet analytische, rechnerische und technische Dienstleistungen für alle Aspekte der Genomik- und Bioinformatikforschung, die von Mitgliedern des Salk Cancer Center durchgeführt wird. Im Zeitalter von Big Data in der Biologie ist die bioinformatische Analyse von entscheidender Bedeutung, um aus großen und verrauschten Hochdurchsatzdaten biologische Erkenntnisse abzuleiten. Das Ziel des Core bestand darin, den Mitgliedern des Krebszentrums Zugang zu modernster Bioinformatik-Expertise und -Unterstützung zu verschaffen. Die Mitarbeiter des Core unterstützen die Mitglieder des Krebszentrums bei der integrativen Analyse von Sequenzierungsdatensätzen, stellen Software und Tools bereit, mit denen Mitglieder des Krebszentrums ihre eigenen Analysen durchführen können, bieten Schulungen zur Softwarenutzung an und entwickeln maßgeschneiderte Tools und Pipelines für hochmoderne Analysen.
Massenspektrometrie-Kern: Proteomik und Metabolomik
Der Mass Spectrometry Core bietet Mitgliedern des Cancer Center Unterstützung bei ihren proteomischen, metabolomischen und individuellen Peptidsyntheseanforderungen. Der Kern bietet fachkundige Beratung in Bezug auf die Gestaltung, Durchführung und Analyse einer breiten Palette von Experimenten, darunter: Proteinidentifizierung, Proteinquantifizierung, Identifizierung posttranslationaler Modifikationen, sezernierte Protein-/Peptidanalyse, ungezielte Lipidomics-Profilierung, gezielte Lipidomics und Metabolomik, Galle Säureanalyse, Aminosäurequantifizierung, Fettsäureanalyse und kundenspezifische Peptidsynthese. Die Kernmitarbeiter arbeiten ständig daran, neue Analysetechniken in diesen sich schnell entwickelnden Bereichen zu implementieren und unterstützen gleichzeitig Forscher bei der Datenanalyse, Manuskript- und Fördervorbereitung.
Transgener Kern
Das Hauptziel des Transgenic Core besteht darin, Mitgliedern des Krebszentrums und anderen Forschern am Salk Institute Zugang zu Spitzentechnologien für die Erstellung genetisch veränderter Mausmodelle zu verschaffen. Diese transgenen Mäuselinien stellen wichtige genetische Werkzeuge dar, die es Forschern ermöglichen, menschliche Krankheiten zu modellieren, bestimmte Gene zu analysieren und funktionell zu manipulieren und potenzielle therapeutische Interventionen zu testen. Um dieses Ziel zu erreichen, bietet der Transgenic Core hochmoderne Genombearbeitungsdienste sowie Dienste an, die zur Erzeugung und Pflege transgener Mäuse erforderlich sind.